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基于TCGA数据库分析EME1基因在肾细胞癌中的表达及临床意义
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作者 张晓洋 李东旭 +2 位作者 史巧玉 喻明霞 江振华 《分子诊断与治疗杂志》 2025年第10期2034-2037,共4页
目的基于癌症基因图谱数据库(TCGA),对必需减数分裂核酸内切酶1(EME1)基因在肾细胞癌(RCC)中的表达、临床病理特征和预后相关性进行分析。方法在TCGA数据库下载RCC患者的基因表达数据和临床病理信息,使用Wilcoxon检验比较RCC组织与正常... 目的基于癌症基因图谱数据库(TCGA),对必需减数分裂核酸内切酶1(EME1)基因在肾细胞癌(RCC)中的表达、临床病理特征和预后相关性进行分析。方法在TCGA数据库下载RCC患者的基因表达数据和临床病理信息,使用Wilcoxon检验比较RCC组织与正常组织中EME1基因的表达差异。利用卡方检验、Kolmogorov-Smirnov检验、逻辑回归、Kaplan-Meier曲线和Cox回归分析EME1与RCC患者的临床预后关系。使用基因富集分析预测EME1可能参与的分子信号通路。结果RCC组织中EME1的表达量显著高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05)。EME1 mRNA的表达水平与患者的年龄(P<0.05)、性别(P<0.05)、肿瘤分级(P<0.05)、T分期(P<0.05)、M分期(P<0.05,)和N分期(P<0.05)均有关。高表达组患者的总体生存率比低表达组更差(P<0.05)。多因素Cox回归分析表明,EME1(HR=1.51,95%CI:1.24~1.84,P<0.05)可作为肾细胞癌的独立预后因子。GSEA结果显示,EME1高表达主要参与同源重组、细胞周期、DNA复制、P53信号通路和错配修复等分子信号通路。结论EME1在肾细胞癌患者中高表达,并与预后相关,可能成为肾细胞癌的新型分子标志物。 展开更多
关键词 eme1 肾细胞癌 TCGA数据库 GSEA 信号通路
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子宫内膜癌中EME1基因表达及潜在机制的生物信息学分析
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作者 李瑞 张文艺 +1 位作者 应彦祺 鲁笑钦 《河南医学研究》 CAS 2022年第10期1740-1745,共6页
目的通过生物信息方法探索子宫内膜癌中减数分裂结构特异性核酸内切酶1(EME1)基因的表达及作用机制。方法利用多个数据库分析子宫内膜癌中EME1的表达及预后;利用蛋白质互作网络寻找EME1关联基因;通过分析启动子甲基化水平、基因拷贝数... 目的通过生物信息方法探索子宫内膜癌中减数分裂结构特异性核酸内切酶1(EME1)基因的表达及作用机制。方法利用多个数据库分析子宫内膜癌中EME1的表达及预后;利用蛋白质互作网络寻找EME1关联基因;通过分析启动子甲基化水平、基因拷贝数变异、潜在转录因子探索EME1在子宫内膜癌中的潜在作用机制。结果EME1在子宫内膜癌中高表达,与患者总生存率、无复发生存率相关。BRCA1、TOP3A、RAD51、SLX4、ERCC4、MUS81、EXO1、RMI1、RMI2、BLM等10个编码基因与EME1关系密切,涉及霍利迪连接体、DNA修复、范可尼贫血途径等。ESR1蛋白可能是EME1潜在转录因子,与EME1启动子存在潜在结合位点。结论EME1可能在子宫内膜癌中起重要作用,10个编码基因和1个潜在转录因子可能涉及到EME1的具体作用机制。这些可能为未来子宫内膜癌患者的精准治疗提供研究基础。 展开更多
关键词 生物信息学 子宫内膜癌 eme1基因
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Effect of EME1 exon variant Ile350Thr on risk and early onset of breast cancer in southern Chinese women 被引量:3
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作者 Jianwei Zhao Lin Liu +4 位作者 Anqing Zhang Qin Chen Wenxiang Fang Lizhi Zeng Jiachun Lu 《The Journal of Biomedical Research》 CAS 2013年第3期193-201,共9页
Essential meiotic endonuclease 1 homolog 1 (EME1) is a key DNA repair protein that participates in the rec- ognition and repair of DNA double-strand breaks. Deficiency of the EME1 gene can lead to spontaneous genomi... Essential meiotic endonuclease 1 homolog 1 (EME1) is a key DNA repair protein that participates in the rec- ognition and repair of DNA double-strand breaks. Deficiency of the EME1 gene can lead to spontaneous genomic instability and thus contribute to tumorgenesis. We hypothesized that the exon variants of EME1 confer genetic susceptibility to breast cancer. In a case-control study of 748 breast cancer patients and 778 normal controls, we analyzed the association between two exon variants of EME! (i.e.,Ile350Thr: rs12450550T 〉 C and Glu69Asp: rs3760413T 〉 G) and breast cancer risk. We found that compared to the common lie/lie genotype, the Thr variant genotypes (Thr/lle + Thr/Thr) conferred a 1.47-fold increased risk of breast cancer (OR=1.47, 95% CI=I. 13-1.92). The variant Ile350Thr was also associated with early onset of breast cancer (r = -0.116, P = 0.002). The mean age of onset was 44.4 years for Thr/Thr genotype carders and 46.5 years for Thr/lle genotype carriers, which was significantly lower than that (49.4 years) for Ile/Ile genotype carriers (P = 0.006). Moreover, no significant as- sociation was observed between the Glu69Asp variant and breast cancer risk. Our findings suggest that the EME1 variant Ile350Thr contributes to an increased risk and early onset of breast cancer. 展开更多
关键词 eme1 exon variant breast cancer early onset
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DNA损伤修复基因Eme1在肿瘤发生及放化疗调控中作用的研究进展 被引量:1
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作者 邓于红 徐祖敏 《山东医药》 CAS 2019年第7期102-105,共4页
DNA损伤修复基因异常表达可致DNA损伤修复的失调,进而引起基因组的不稳定,最终可能导致肿瘤的发生发展。DNA损伤修复基因也能够一定程度地修复肿瘤细胞放化疗引起的DNA损伤,这也是肿瘤治疗过程中放化疗耐受的一个原因。Eme1作为DNA损伤... DNA损伤修复基因异常表达可致DNA损伤修复的失调,进而引起基因组的不稳定,最终可能导致肿瘤的发生发展。DNA损伤修复基因也能够一定程度地修复肿瘤细胞放化疗引起的DNA损伤,这也是肿瘤治疗过程中放化疗耐受的一个原因。Eme1作为DNA损伤修复基因之一,现已发现其遗传变异与多种肿瘤的发生相关,且可能在肿瘤放化疗敏感性调控中发挥作用,对Eme1进行深入研究有望获得新的肿瘤标志物和治疗靶点。近年来在对Eme1的研究中发现该基因的遗传变异可能使肿瘤易感性增加,且Eme1介导的DNA损伤修复可能导致肿瘤治疗过程中对放疗和化疗不敏感。 展开更多
关键词 eme1基因 DNA损伤 肿瘤 放化疗敏感性
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下调EMS1/cortactin对人高转移潜能肝癌细胞株迁移和内吞的影响 被引量:3
5
作者 周家名 陈莉 +3 位作者 叶蕴瑶 孙树刚 王桂兰 吴圆圆 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1235-1238,1242,共5页
目的观察下调人高转移潜能肝癌细胞株(MHCC-97H)中EMS1/cortactin对细胞迁移和内吞的影响,探讨EMS1/cortac-tin在细胞内可能存在的功能。方法构建靶向EMS1的shRNA真核表达质粒(EMS1-PSilencer4.1-GFP-shRNA,EMS1-shR-NA);通过Lipofectam... 目的观察下调人高转移潜能肝癌细胞株(MHCC-97H)中EMS1/cortactin对细胞迁移和内吞的影响,探讨EMS1/cortac-tin在细胞内可能存在的功能。方法构建靶向EMS1的shRNA真核表达质粒(EMS1-PSilencer4.1-GFP-shRNA,EMS1-shR-NA);通过Lipofectamine 2000处理后将EMS1-shRNA转染MHCC-97H细胞,免疫荧光显微镜下观察转染效率;采用RT-qPCR和Westen blot分别检测EMS1 mRNA和cortactin蛋白表达水平;利用划痕、Transwell小室实验、转铁蛋白(transferrin,Tfn)内吞实验分别研究细胞迁移和内吞作用。结果成功构建EMS1-shRNA。免疫荧光显微镜下见转染细胞中明显的绿色荧光蛋白(green fluorescence protein,GFP),荧光强度在48 h达到峰值,其转染效率达84.76%。与未处理组相比,转染EMS1-shRNA细胞中EMS1 mRNA水平下降至19.00%,cortactin蛋白水平下降至36.74%、细胞相对迁移距离下降至55.52%、相对穿膜细胞数下降至27.79%、细胞内吞荧光标记Tfn水平显著减弱(P均<0.05)。结论下调EMS1/cortactin后,MHCC-97H细胞迁移、内吞能力明显下降,提示EMS1/cortactin与原发性肝癌(primary human heptatocellular,HCC)转移的生物学行为有关。 展开更多
关键词 MHCC-97H细胞 EMS1 CORTACTIN 核酸干扰 迁移 内吞
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EMS1蛋白在胃癌组织中的表达及临床意义 被引量:3
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作者 李晓杰 林敏 +1 位作者 刘重元 谢海龙 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第3期323-326,共4页
背景与目的:研究表明EMS1(chromosome eleven,band q13,mammarytumour and squamous cell carcinoma-associated gene1)与多种恶性肿瘤的发生、发展及转移相关。本研究旨在探讨EMS1蛋白在胃癌、胃上皮内瘤变和正常胃粘膜组织中的表达。... 背景与目的:研究表明EMS1(chromosome eleven,band q13,mammarytumour and squamous cell carcinoma-associated gene1)与多种恶性肿瘤的发生、发展及转移相关。本研究旨在探讨EMS1蛋白在胃癌、胃上皮内瘤变和正常胃粘膜组织中的表达。方法:采用免疫组化SP法,分别检测20例正常胃粘膜、38例胃上皮内瘤变和146例胃癌组织中EMS1蛋白的表达。结果:EMS1蛋白表达定位于细胞浆;正常胃粘膜EMS1蛋白阳性率20.0%(4/20),胃上皮内瘤变中阳性率68.4%(26/38),胃癌中阳性率89.7%(131/146);EMS1蛋白在胃癌中的表达高于胃上皮内瘤变及正常胃粘膜(P<0.001),胃上皮内瘤变与正常胃粘膜差异亦具有显著性(P<0.001)。早期胃癌阳性率为60.9%(14/23),低于进展期胃癌的95.1%(117/123),差异有统计学意义(P<0.001);伴淋巴结转移组EMS1蛋白阳性率为96.8%(91/94),与无淋巴结转移组的77.0%(40/52)相比差异有显著性(P<0.001);而与患者性别、年龄以及肿瘤大小、分化无关。结论:EMS1蛋白高表达与胃癌发生、淋巴结转移及临床分期有关。 展开更多
关键词 胃肿瘤 EMS1蛋白 免疫组化
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路德维希肠杆菌EM1对二氯喹啉酸和Cd2+复合污染的修复 被引量:3
7
作者 徐淑霞 杜文涛 +3 位作者 王晓雅 张继冉 赵培 吴坤 《中国环境科学》 EI CAS CSSCI CSCD 北大核心 2017年第8期3159-3165,共7页
为解决稻田水体环境中农药与重金属的复合污染问题,利用扫描电镜、傅里叶红外光谱等分析技术,研究了路德维希肠杆菌(Enterobacter ludwigii)EM1对二氯喹啉酸-Cd^(2+)复合污染的修复机理.结果表明,EM1能在以二氯喹啉酸为单一碳源的条件下... 为解决稻田水体环境中农药与重金属的复合污染问题,利用扫描电镜、傅里叶红外光谱等分析技术,研究了路德维希肠杆菌(Enterobacter ludwigii)EM1对二氯喹啉酸-Cd^(2+)复合污染的修复机理.结果表明,EM1能在以二氯喹啉酸为单一碳源的条件下对Cd^(2+)进行吸附.在温度为35℃,p H为6.0的条件下培养7d,EM1对50mg/L的二氯喹啉酸和Cd^(2+)的降解及吸附率达到最大,分别为30%和60%.扫描电镜结果表明,复合修复过程中菌体形态发生变化,菌体表面分泌大量胞外聚合物.红外扫描分析显示,胁迫条件下菌体细胞壁结构并未发生变化,菌株降解二氯喹啉酸和吸附Cd^(2+)的过程主要与菌体表面的羟基、酰胺基、糖环中的C-O-C及脂肪族化合物有关. 展开更多
关键词 二氯喹啉酸 CD 路德维希肠杆菌EM1 吸附 复合污染
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肝细胞癌中EMS1蛋白的表达 被引量:2
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作者 李晓杰 胡玉林 +1 位作者 谢志斌 谢海龙 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期188-190,共3页
目的探讨EMS1蛋白表达与肝癌发生、发展及临床病理特征的关系。方法采用免疫组化SP法,对78例肝癌组织、其中68例附癌旁肝组织和8例正常肝组织中EMS1蛋白表达进行检测。结果EMS1蛋白表达定位于细胞的胞质,着色呈黄色至棕黄色。肝癌中阳... 目的探讨EMS1蛋白表达与肝癌发生、发展及临床病理特征的关系。方法采用免疫组化SP法,对78例肝癌组织、其中68例附癌旁肝组织和8例正常肝组织中EMS1蛋白表达进行检测。结果EMS1蛋白表达定位于细胞的胞质,着色呈黄色至棕黄色。肝癌中阳性表达率89.69%,高于癌旁及正常肝组织30.26%(P<0.001);无肝硬化肝癌阳性表达率73.91%,低于伴有肝硬化95.56%(P<0.05);伴静脉内癌栓组94.12%与无静脉内癌栓组70.59%差异有显著性(P<0.05);随着组织分级的增高(分化程度的降低),阳性表达率明显增高,其差异有显著性(P<0.05);而与性别、年龄、肿瘤大小无关。结论EMS1蛋白高表达与肝癌发生、肝硬化、静脉内癌栓及组织学分级相关。 展开更多
关键词 肝肿瘤 肝细胞癌 EMS1蛋白 免疫组织化学
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沉默EMS1/cortactin基因对肝癌HepG2细胞迁移、侵袭和细胞周期的影响 被引量:2
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作者 周家名 陈莉 +2 位作者 王桂兰 秦婧 吴圆圆 《基础医学与临床》 CSCD 2016年第12期1664-1669,共6页
目的研究原发性肝癌(HCC)Hep G2细胞中EMS1/cortactin的表达与定位,探讨其功能特性。方法 RTq PCR、免疫荧光法检测EMS1基因和cortactin(EMS1编码蛋白)表达,共聚焦显微镜观察cortactin定位,并以人正常肝细胞L02为对照。将靶向EMS1的质粒... 目的研究原发性肝癌(HCC)Hep G2细胞中EMS1/cortactin的表达与定位,探讨其功能特性。方法 RTq PCR、免疫荧光法检测EMS1基因和cortactin(EMS1编码蛋白)表达,共聚焦显微镜观察cortactin定位,并以人正常肝细胞L02为对照。将靶向EMS1的质粒EMS1-shRNA转染Hep G2,并以CCK8法、流式细胞周期检测、划痕和Transwell小室实验检测细胞增殖、周期、迁移和侵袭能力。结果 Hep G2中EMS1 mRNA水平为LO2的10.5倍;cortactin在Hep G2中高表达,并聚集于细胞膜下皮质区,L02中cortactin弥散分布在胞质中。与未处理组相比,转染EMS1-shRNA组Hep G2中EMS1 mRNA水平下降68.00%,cortactin水平下降52.80%,细胞增殖能力下降9.50%,S期比例下降37.89%,迁移能力下降45.40%,侵袭能力下降64.91%(均P<0.05)。结论 EMS1/cortactin主要与Hep G2细胞迁移和侵袭相关。 展开更多
关键词 EMS1/cortactin 定位 迁移 侵袭 RNA干扰
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RNA干扰EMS1基因表达对人胃癌MGC803细胞增殖和迁移的影响 被引量:2
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作者 侯素平 童细焱 谢海龙 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期1317-1322,共6页
目的探讨RNA干扰EMS1基因表达对人胃癌MGC803细胞增殖和迁移的影响。方法为检测下调EMS1基因表达后MGC803细胞功能的变化,运用平皿集落形成实验检测其增殖能力;流式细胞仪分析细胞周期和凋亡;Transwell迁移和侵袭实验观察细胞迁移和侵... 目的探讨RNA干扰EMS1基因表达对人胃癌MGC803细胞增殖和迁移的影响。方法为检测下调EMS1基因表达后MGC803细胞功能的变化,运用平皿集落形成实验检测其增殖能力;流式细胞仪分析细胞周期和凋亡;Transwell迁移和侵袭实验观察细胞迁移和侵袭能力的变化。结果下调MGC803细胞中EMS1基因表达后,MGC803细胞增殖、迁移和侵袭能力受到抑制,与对照组相比差异有显著性(P<0.05),而对细胞周期和凋亡无明显影响。结论 RNA干扰EMS1基因可抑制胃癌MGC803细胞的增殖和迁移侵袭能力。 展开更多
关键词 RNA干扰 EMS1基因 增殖 迁移
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EMS1基因与肿瘤 被引量:4
11
作者 林敏 谢海龙 苏琦 《国际病理科学与临床杂志》 CAS 2005年第6期481-484,共4页
EMS1基因(chromosom e eleven,band q13,m amm ary tumour and squamous cell carc inom a-assoc iated gene1)定位于人类染色体11q13。该基因编码产物cortactin(cortical actin-b ind ing prote in)是一种位于细胞皮质区的肌动蛋白结... EMS1基因(chromosom e eleven,band q13,m amm ary tumour and squamous cell carc inom a-assoc iated gene1)定位于人类染色体11q13。该基因编码产物cortactin(cortical actin-b ind ing prote in)是一种位于细胞皮质区的肌动蛋白结合蛋白,参与细胞骨架系统的调控,细胞外信号转导以及细胞黏附等过程。研究表明EMS1基因与许多肿瘤的侵袭和转移有关。 展开更多
关键词 EMS1基因 肿瘤 转移
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大洋与大陆板内典型EM1型玄武岩的成因联系和区别 被引量:2
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作者 王小均 陈立辉 刘建强 《矿物岩石地球化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期237-247,共11页
前人基于大洋玄武岩的放射成因同位素组成定义了DMM、HIMU、EM1和EM2等地幔端元组分。然而,自"EM1"这一概念被提出以来,有关其成因的激烈争论持续不断,EM1因此被认为是最"神秘莫测"的地幔组分。对比研究大洋和大陆... 前人基于大洋玄武岩的放射成因同位素组成定义了DMM、HIMU、EM1和EM2等地幔端元组分。然而,自"EM1"这一概念被提出以来,有关其成因的激烈争论持续不断,EM1因此被认为是最"神秘莫测"的地幔组分。对比研究大洋和大陆板内的EM1型玄武岩可为探讨EM1组分的属性和成因提供新的制约。本文总结了笔者最近针对典型EM1型玄武岩的研究进展,比较了南太平洋EM1型洋岛玄武岩(Pitcairn)和中国东北EM1型钾质玄武岩的元素和Mg-Sr-Nd-Pb-Hf同位素地球化学特征,阐述了这两类EM1型玄武岩在成因上的联系和区别。 展开更多
关键词 EM1 洋岛玄武岩:Pitcairn 钾质玄武岩 镁同位素 含碳酸盐沉积物
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EMS1蛋白在食管鳞状细胞癌组织中的表达及其临床意义
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作者 宋珑 胡建国 +1 位作者 霍继荣 李亭 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期396-399,共4页
目的探讨EMS1(mammary tumour and squamous cell carcinoma-associated gene 1)蛋白在食管鳞状细胞癌组织中的表达及其临床意义。方法应用免疫组织化学SP法检测74例食管鳞状细胞癌组织中EMS1蛋白的表达,分析其与临床病理因素的关系。结... 目的探讨EMS1(mammary tumour and squamous cell carcinoma-associated gene 1)蛋白在食管鳞状细胞癌组织中的表达及其临床意义。方法应用免疫组织化学SP法检测74例食管鳞状细胞癌组织中EMS1蛋白的表达,分析其与临床病理因素的关系。结果 EMS1蛋白定位于细胞胞浆及细胞膜下或胞浆皮质区。EMS1蛋白在食管鳞状细胞癌组织中的表达率(74.3%)明显高于其在癌旁组织中的表达率(31.1%),差异有显著性(P<0.01)。EMS1蛋白表达与食管鳞状细胞癌的浸润深度、淋巴结转移及临床TNM分期密切相关(P<0.05或P<0.01)。而与患者的年龄、性别、肿瘤大小及组织分化程度无关(P>0.05)。结论 EMS1蛋白是食管鳞状细胞癌发展、侵袭和转移的重要生物标志物。对判断食管鳞状细胞癌的淋巴结转移和其生物学行为以及临床预后具有较高的临床应用价值。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌 侵袭转移 EMS1蛋白 免疫组织化学
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乳腺癌组织中EMS1 mRNA检测的临床意义
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作者 盛建 徐青 +1 位作者 陈锦鹏 何志贤 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2010年第4期327-331,共5页
目的:通过检测EMS1基因在乳腺癌组织中的表达,结合乳腺癌分子分型及各项临床病理参数,分析EMS1 mRNA表达水平在乳腺癌组织检测中的临床意义。方法:采用RT-PCR法检测94例乳腺癌及癌旁组织EMS1mRNA相对含量,以乳腺癌癌旁组织EMS1 mRNA的... 目的:通过检测EMS1基因在乳腺癌组织中的表达,结合乳腺癌分子分型及各项临床病理参数,分析EMS1 mRNA表达水平在乳腺癌组织检测中的临床意义。方法:采用RT-PCR法检测94例乳腺癌及癌旁组织EMS1mRNA相对含量,以乳腺癌癌旁组织EMS1 mRNA的相对表达量均值为界限,乳腺癌组织分为高表达组和低表达组;采用ELIVISON二步法,对乳腺癌组织进行免疫组化分析并根据基因聚类分析进行分子分型;分析EMS1基因表达与乳腺癌分子分型及各项临床病理参数的关系。结果:乳腺癌组织与癌旁组织中EMS1 mRNA平均表达水平为0.578±0.105和0.397±0.079,高表达率为60.6%(57/94)。Basal-like型乳腺癌中EMS1平均表达水平最高,与其他分子分型比较,差异有统计学意义。EMS1 mRNA高表达与患者年龄≥50岁、绝经后和腋淋巴结转移成正相关,与肿瘤大小、肿瘤分级和TNM分期状况无关。结论:EMS1基因可能是乳腺癌的一种新预后指标。 展开更多
关键词 乳腺癌 EMS1 逆转录-聚合酶链式反应 腋淋巴结转移
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Cortactin的特征、功能及与肿瘤的关系 被引量:1
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作者 梅徽(综述) 谢海龙(审校) 《湘南学院学报(医学版)》 2009年第2期74-76,共3页
细胞皮质区肌动蛋白结合蛋白(cortical actin-binding protein,Cortactin)是一种含有特殊重复序列结构域的微丝肌动蛋白结合蛋白,它直接参与了细胞皮层微丝细胞骨架的组建。它又是细胞内Src类酪氨酸蛋白激酶主要底物之一,代表了一类... 细胞皮质区肌动蛋白结合蛋白(cortical actin-binding protein,Cortactin)是一种含有特殊重复序列结构域的微丝肌动蛋白结合蛋白,它直接参与了细胞皮层微丝细胞骨架的组建。它又是细胞内Src类酪氨酸蛋白激酶主要底物之一,代表了一类高度保守的胞内皮层信号蛋白质家族。近几年来,对于Cortactin在细胞中的作用及其在细胞运动中分子机制的研究取得很大进展。 展开更多
关键词 CORTACTIN EMS1 Arp2/3复合体 肿瘤
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土壤微生态对二氯喹啉酸污染及Enterobacter ludwigii EM1修复的响应 被引量:5
16
作者 张智超 高明 +4 位作者 赵昊 王晓雅 曹子敬 吴坤 徐淑霞 《河南农业科学》 北大核心 2022年第4期68-76,共9页
为明确路德维希肠杆菌(Enterobacter ludwigii)EM1降解菌对土壤二氯喹啉酸污染的修复效果,通过向人工模拟二氯喹啉酸污染土壤中定量添加降解菌EM1,设置无污染对照(CK)、二氯喹啉酸污染处理(QNC)、二氯喹啉酸污染EM1修复处理(QNC+EM1)3... 为明确路德维希肠杆菌(Enterobacter ludwigii)EM1降解菌对土壤二氯喹啉酸污染的修复效果,通过向人工模拟二氯喹啉酸污染土壤中定量添加降解菌EM1,设置无污染对照(CK)、二氯喹啉酸污染处理(QNC)、二氯喹啉酸污染EM1修复处理(QNC+EM1)3种处理,研究降解菌EM1添加前后对土壤可培养微生物、土壤酶活性及细菌群落多样性3个方面的影响。结果表明,QNC+EM1处理在培养结束时相比CK和QNC处理,土壤细菌数量分别增加36.5%和15.6%;放线菌数量相比CK和QNC处理分别增加6.7%和29.4%;真菌数量相较于CK增加7.6%,相比QNC处理降低14.1%。QNC+EM1处理在培养结束时脲酶活性相比CK无明显变化,相比QNC处理下降6.8%;培养结束时磷酸酶和蔗糖酶活性相比CK分别提升135.8%和224.4%,相比QNC处理分别提升149.7%和199.9%,均有明显提高。培养结束时,QNC+EM1处理土壤中二氯喹啉酸质量浓度比QNC处理下降76.7%。土壤细菌群落多样性的分析表明,添加降解菌EM1后,变形菌门(Proteobacteria)丰富度增加15.1个百分点,芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)和酸杆菌门(Acidobacteria)丰度降低10.7、5.5个百分点,优势菌门疣微菌门(Verrucomicrobia)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)和浮霉菌门(Planctomycetes)消失。主成分分析结果表明,添加降解菌EM1后,细菌群落结构出现明显变化。细菌之间呈现的相关关系数量在减少。总体来看,添加降解菌EM1可有效修复土壤二氯喹啉酸污染,改善土壤菌群,提高土壤酶活性,为土壤二氯喹啉酸污染的修复提供一定参考意义。 展开更多
关键词 二氯喹啉酸 Enterobacter ludwigii EM1 土壤酶活性 细菌群落多样性 土壤修复
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定量蛋白质组学方法揭示受体蛋白激酶EMS1调控拟南芥花药发育的下游信号网络 被引量:3
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作者 陆佳楠 叶娟英 +2 位作者 许俊旭 马红 常芳 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期1287-1296,共10页
被子植物的花药是产生雄配子的器官,其正常发育对植物的有性生殖和正常繁衍至关重要。在花药发育的过程中,受体激酶EMS1(EXCESS MICROSPOROCYTES 1)及其胞外配基TPD1(TAPETUM DETERMINANT 1)通过调控花药绒毡层的发育而对雄性育性发挥... 被子植物的花药是产生雄配子的器官,其正常发育对植物的有性生殖和正常繁衍至关重要。在花药发育的过程中,受体激酶EMS1(EXCESS MICROSPOROCYTES 1)及其胞外配基TPD1(TAPETUM DETERMINANT 1)通过调控花药绒毡层的发育而对雄性育性发挥重要作用。然而目前对于TPD1–EMS1的下游信号转导网络却知之甚少。随着质谱和同位素标记技术的发展,定量蛋白质组学在植物研究中的应用越来越广泛,在深入研究生物学过程的分子表型以及揭示蛋白调控网络方面发挥着越来越重要的作用。本文利用基于iTRAQ技术的定量蛋白质组学,以野生型和ems1及tpd1突变体1~9期花苞为材料,通过蛋白质组数据及转录组数据的对比分析,深入挖掘了TPD1–EMS1调控花药发育过程中下游信号网络,找到了一大批受TPD1、EMS1共同或特异调控的已知和未知功能的蛋白,为深入研究花药发育的调控网络提供了新的认识和重要的参考。 展开更多
关键词 花药发育 绒毡层 TPD1 EMS1 定量蛋白质组学 iTRAQ
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通过CRISPR/Cas9技术构建Apoe基因敲除小鼠模型及其表型研究 被引量:1
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作者 柯璐 曹愿 +7 位作者 谷文达 刘甦苏 孙晓炜 赵皓阳 翟世杰 郭怀勇 娄玥 范昌发 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1390-1398,共9页
目的本研究通过CRISPR/Cas9技术构建Apoe基因敲除小鼠模型,以进一步探讨Apoe在血脂代谢和形成动脉粥样硬化病症中的功能。方法针对C57BL/6J小鼠Apoe基因设计2个sgRNA靶位点,并将sgRNA和Cas9 mRNA共同注入受精卵,移植至ICR受体鼠,获得F0... 目的本研究通过CRISPR/Cas9技术构建Apoe基因敲除小鼠模型,以进一步探讨Apoe在血脂代谢和形成动脉粥样硬化病症中的功能。方法针对C57BL/6J小鼠Apoe基因设计2个sgRNA靶位点,并将sgRNA和Cas9 mRNA共同注入受精卵,移植至ICR受体鼠,获得F0代小鼠,通过提取鼠尾DNA以及PCR筛选,获得阳性小鼠。通过荧光定量逆转录PCR法检测小鼠各组织中Apoe mRNA表达水平。检测小鼠血清中的血脂指标,并通过油红O染色主动脉血管,以检测动脉内膜脂质的积聚。结果PCR及测序结果确认成功构建了Apoe基因敲除小鼠(C57BL/6-Apoe^(em1)/Nifdc,简称Apoe KO小鼠);实时荧光定量逆转录PCR实验结果显示,Apoe KO纯合小鼠(Apoe^(-/-))的肝、大脑、脾、肾和肺组织中的Apoe mRNA显著降低;血清总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇水平显著升高,且雄性小鼠的血清高密度脂蛋白胆固醇水平显著降低;主动脉血管油红O染色显示,在相同且食用正常饲料条件下,野生型(wild-tpye,WT)小鼠无脂质堆积,Apoe^(-/-)小鼠则呈现大量红色脂质斑块。结论本研究成功构建Apoe基因敲除小鼠,该纯合子小鼠在非高脂饲料下呈典型的异常血脂代谢及主动脉内膜脂质积聚特征,为Apoe KO小鼠资源提供了背景数据,为血脂代谢异常表型研究提供新模型。 展开更多
关键词 APOE C57BL/6-Apoe^(em1)/Nifdc CRISPR/Cas9 血脂代谢 主动脉
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CTTN (EMS1): an oncogene contributing to the metastasis of esophageal squamous cell carcinoma 被引量:4
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作者 Man-Li Luo Ming-Rong Wang 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2007年第4期298-300,共3页
Proto-oncogenes 被 genomic 扩大经常激活。有在肿瘤纸巾的增加的拷贝数字和作为结果的在表示上的基因的描述能便于肿瘤特定的 oncogenes 的鉴定。食道的癌症全球是普通癌症,食道的有鳞的房间癌(ESCC ) 是在中国的最流行的类型。多重... Proto-oncogenes 被 genomic 扩大经常激活。有在肿瘤纸巾的增加的拷贝数字和作为结果的在表示上的基因的描述能便于肿瘤特定的 oncogenes 的鉴定。食道的癌症全球是普通癌症,食道的有鳞的房间癌(ESCC ) 是在中国的最流行的类型。多重基因变化在 ESCC 被发现了,但是很少对主要 oncogenes 和肿瘤被知道压制或涉及 ESCC 的 tumorigenesis 的基因。 展开更多
关键词 CTTN EMS1 癌基因 作用 食管鳞状细胞癌 肿瘤转移
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喉鳞状细胞癌中EMS1蛋白的表达
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作者 李继生 李晓杰 +1 位作者 谢志斌 李建石 《诊断病理学杂志》 CSCD 2009年第1期18-20,共3页
目的探讨EMS1蛋白表达与喉鳞状细胞癌(ISCC)发生、发展及临床病理特征的关系。方法采用免疫组化SP法,对45例ISCC组织(其中40例附癌旁组织)和8例正常喉黏膜组织中EMS1蛋白表达进行检测。结果EMS1蛋白表达定位于细胞的胞质,着色呈... 目的探讨EMS1蛋白表达与喉鳞状细胞癌(ISCC)发生、发展及临床病理特征的关系。方法采用免疫组化SP法,对45例ISCC组织(其中40例附癌旁组织)和8例正常喉黏膜组织中EMS1蛋白表达进行检测。结果EMS1蛋白表达定位于细胞的胞质,着色呈黄色至棕黄色;LSCC中阳性表达率82.2%,高于癌旁组织(30%)及正常喉黏膜组织(12.5%)(P〈0.01);随着组织分级的增高(分化程度的降低),EMS1蛋白阳性表达率明显增高,其差异显著(P〈0.05);EMS1蛋白的表达与肿瘤的临床分期、淋巴结转移有关,而与性别、年龄、肿瘤大小无关。结论EMS1蛋白的表达可作为LSCC患者疾病进展监控和预后观测的指标,具有临床应用价值。 展开更多
关键词 ISCC EMS1蛋白 免疫组化
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