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EFEMP1通过肿瘤微环境促进胃癌的生长与转移
1
作者
马俊
邓士杰
《诊断病理学杂志》
2024年第7期609-613,618,共6页
目的基于生物信息学分析EFEMP1在胃癌组织中表达及意义。方法利用GEO数据库胃癌数据集采用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法计算374例胃癌病人肿瘤组织Immune Score,Stormal Score和ESTIMATEScore,通过生存分析,蛋白互作网络(PPI)构建寻找...
目的基于生物信息学分析EFEMP1在胃癌组织中表达及意义。方法利用GEO数据库胃癌数据集采用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法计算374例胃癌病人肿瘤组织Immune Score,Stormal Score和ESTIMATEScore,通过生存分析,蛋白互作网络(PPI)构建寻找与预后相关的核心基因,并利用TCGA胃癌数据库和免疫组化染色验证核心基因表达。结果GEO和TCGA数据库中EFEMP1在正常组织和肿瘤组织中表达无差异性,与胃癌的生存时间和临床分期相关(T和Stage)。GSEA显示EFEMP1高表达主要富集于钙信号通路、细胞黏附和细胞外基质受体相互作用通路。EFEMP1表达与ITGB1在肿瘤直径、组织学分级、TNM分期均相关(P<0.05)。结论EFEMP1参与胃癌的发生、发展,在侵袭和转移中可能和ITBG1表达存在协同作用。
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关键词
生物信息学
胃癌
EFEMP1
ITGB1
肿瘤微环境
原文传递
题名
EFEMP1通过肿瘤微环境促进胃癌的生长与转移
1
作者
马俊
邓士杰
机构
安徽医科大学附属安庆第一人民医院病理科
出处
《诊断病理学杂志》
2024年第7期609-613,618,共6页
基金
安徽医科大学校科研基金(2022xkj090)。
文摘
目的基于生物信息学分析EFEMP1在胃癌组织中表达及意义。方法利用GEO数据库胃癌数据集采用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法计算374例胃癌病人肿瘤组织Immune Score,Stormal Score和ESTIMATEScore,通过生存分析,蛋白互作网络(PPI)构建寻找与预后相关的核心基因,并利用TCGA胃癌数据库和免疫组化染色验证核心基因表达。结果GEO和TCGA数据库中EFEMP1在正常组织和肿瘤组织中表达无差异性,与胃癌的生存时间和临床分期相关(T和Stage)。GSEA显示EFEMP1高表达主要富集于钙信号通路、细胞黏附和细胞外基质受体相互作用通路。EFEMP1表达与ITGB1在肿瘤直径、组织学分级、TNM分期均相关(P<0.05)。结论EFEMP1参与胃癌的发生、发展,在侵袭和转移中可能和ITBG1表达存在协同作用。
关键词
生物信息学
胃癌
EFEMP1
ITGB1
肿瘤微环境
Keywords
Bioinformatics
Gastric cancer
efempl
ITGB1
Tumor microenvironment
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
EFEMP1通过肿瘤微环境促进胃癌的生长与转移
马俊
邓士杰
《诊断病理学杂志》
2024
0
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