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中国荷斯坦奶牛EEF1D基因的SNPs检测及其与产奶性状的关联分析 被引量：4
1
作者 张娟 母童 +5 位作者 蔡正云 顾亚玲 刘丽元 杨雪瑶 温万 孙东晓 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第4期961-969,共9页
试验旨在研究中国荷斯坦奶牛真核生物翻译延伸因子1 D(eukaryotic translation elongation factor 1delta,EEF1D)基因的多态性及其与产奶性状的相关性。利用Sequenom MassARRAY SNP分型技术对宁夏地区1 252头中国荷斯坦奶牛EEF1 D基因... 试验旨在研究中国荷斯坦奶牛真核生物翻译延伸因子1 D(eukaryotic translation elongation factor 1delta,EEF1D)基因的多态性及其与产奶性状的相关性。利用Sequenom MassARRAY SNP分型技术对宁夏地区1 252头中国荷斯坦奶牛EEF1 D基因的多态性进行了检测,并对其多态位点不同基因型和组合基因型与产奶性状进行了关联分析。结果显示,EEF1 D基因的5′侧翼区存在2个SNPs位点,即EEF1D-1和EEF1D-3;经检测发现,EEF1D-1存在2种基因型,EEF1D-3存在3种基因型。χ2检验表明,中国荷斯坦奶牛在EEF1D-1位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),在EEF1D-3位点未偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);EEF1D-1和EEF1D-3位点多态信息含量(PIC)分别为0.10和0.28,分别呈现低度多态和中度多态。在试验群体中,EEF1D-1位点对乳脂率和乳蛋白率性状的效应均达到极显著水平(P<0.01),对305d产奶量性状的效应达到显著水平(P<0.05);EEF1D-3位点对305d产奶量、乳脂率和乳蛋白率性状的效应均达到极显著水平(P<0.01);EEF1 D基因的优势基因型组合GG-AG和GG-GG个体乳脂率均显著高于GG-AA组合个体(P<0.05)。说明EEF1 D基因可以作为影响中国荷斯坦奶牛产奶性状的候选基因用于标记辅助选择。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 eef1d基因 产奶性状 SNP 基因型组合
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奶牛乳脂性状候选基因EEF1D突变位点功能分析 被引量：3
2
作者 蒋秋斐 蔡正云 +3 位作者 黄增文 冯小芳 张娟 顾亚玲 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第7期1155-1159,共5页
提高乳脂含量、提升奶质已成为当前奶牛业研究的重点方向之一。前期经GWAS方法研究发现,EEF1D基因5′非翻译区(5′-UTR)的G/A突变与乳脂率极显著相关,为了进一步对候选基因EEF1D的突变位点进行功能分析,首先通过人工合成获得了EEF1D基... 提高乳脂含量、提升奶质已成为当前奶牛业研究的重点方向之一。前期经GWAS方法研究发现,EEF1D基因5′非翻译区(5′-UTR)的G/A突变与乳脂率极显著相关,为了进一步对候选基因EEF1D的突变位点进行功能分析,首先通过人工合成获得了EEF1D基因突变型与野生型片段,并在细胞水平上对其开展了功能验证实验。研究发现,EEF1D基因5′-UTR的G/A突变引起Sp3转录起始位点后移33 bp,并且突变型的活性大约是野生型的3倍。研究结果表明,该突变可改变转录因子的转录起始位点,从而使EEF1D的表达上调。 展开更多
关键词 乳脂含量 eef1d基因 5′非翻译区(5′-UTR) SP3 突变型
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EEF1D基因表达对绵羊羊毛纤维直径和毛囊发育的影响 被引量：2
3
作者 张敏 杨华 +2 位作者 魏巧兰 何高明 沈敏 《家畜生态学报》 北大核心 2023年第1期27-31,共5页
为了探讨真核翻译延伸因子1D基因(eukaryotic translation elongation factor 1 Delta,EEF1D)对羊毛品质和毛囊周期发育的影响,采集中国美利奴羊(新疆军垦型)(细毛羊)的10个脏器组织及3个毛囊发育期的中国美利奴羊(新疆军垦型)和多胎萨... 为了探讨真核翻译延伸因子1D基因(eukaryotic translation elongation factor 1 Delta,EEF1D)对羊毛品质和毛囊周期发育的影响,采集中国美利奴羊(新疆军垦型)(细毛羊)的10个脏器组织及3个毛囊发育期的中国美利奴羊(新疆军垦型)和多胎萨福克羊(粗毛羊)的毛样品和皮肤组织,测定和比较分析2个绵羊品种在3个毛囊发育期的羊毛纤维直径,应用qRT-PCR检测EEF1D基因在10个组织以及不同毛囊发育期皮肤组织中的表达水平。研究表明,在3个毛囊发育期,中国美利奴羊的羊毛纤维直径均极显著小于多胎萨福克羊(P<0.01)。EEF1D基因在中国美利奴(新疆军垦型)皮肤组织中的表达丰度显著高于其他9个组织(P<0.05)。在毛囊生长期和退行期,EEF1D基因在细毛羊中的表达量显著高于粗毛羊(P<0.05),EEF1D基因的高表达诱导毛囊发育进入休止期。 展开更多
关键词 eef1d基因 基因表达 毛囊发育 纤维直径 绵羊
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敲减EEF1D的人卵巢癌细胞的构建及其药物敏感性研究 被引量：2
4
作者 汪慎燚 徐恰 +4 位作者 阮昕 席浩 王鹏 陈曦 秦宜德 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2018年第6期828-834,共7页
目的探讨RNA干扰真核生物翻译延长因子1δ(EEF1D)基因表达对人卵巢癌耐药细胞DDP、PGPIPN敏感性的影响。方法针对人EEF1D基因设计并筛选出下调基因表达效果最佳的siRNA,构建shRNA序列表达载体pLJM1-shRNA。通过慢病毒表达载体构建稳定转... 目的探讨RNA干扰真核生物翻译延长因子1δ(EEF1D)基因表达对人卵巢癌耐药细胞DDP、PGPIPN敏感性的影响。方法针对人EEF1D基因设计并筛选出下调基因表达效果最佳的siRNA,构建shRNA序列表达载体pLJM1-shRNA。通过慢病毒表达载体构建稳定转染pLJM1-shRNA-EEF1D的SKOV3、SKOV3/DDP细胞株。RT-PCR和Western blot检测稳定转染细胞株EEF1D基因的表达情况,MTT法测定PGPIPN、DDP、DDP/PGPIPN对稳定转染细胞株的增殖抑制率。结果成功构建重组慢病毒载体pLJM1-shRNA-EEF1D。RT-PCR和Western blot法均证实在SKOV3、SKOV3/DDP细胞中成功敲减EEF1D的表达。此外,MTT结果显示,与对照组和非特异性转染组相比,DDP/PGPIPN细胞的增殖均明显受到抑制,差异有统计学意义(P<0.05)。结论通过敲减EEF1D基因表达可以明显增强人卵巢癌SKOV3/DDP细胞对DDP/PGPIPN的敏感性。 展开更多
关键词 RNA干扰 人卵巢癌 eef1d DDP PGPIPN
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中国荷斯坦奶牛EEF1D和TRAPPC9基因多态性与SCS关联性分析 被引量：1
5
作者 任宇佳 杨雪瑶 +6 位作者 张娟 蒋秋斐 李欣 韩丽云 张莉莉 孙东晓 顾亚玲 《黑龙江畜牧兽医（下半月）》 北大核心 2016年第10期75-77,共3页
乳房炎抗性的遗传选择已成为抗病育种的新措施,对现代畜牧业预防疾病具有重要的意义,可以永久地改变群体遗传组成,长期有效地控制疾病的发生。笔者采用Sequenom SNP分型测序方法对宁夏地区764头中国荷斯坦奶牛的EEF1D和TRAPPC9基因进行... 乳房炎抗性的遗传选择已成为抗病育种的新措施,对现代畜牧业预防疾病具有重要的意义,可以永久地改变群体遗传组成,长期有效地控制疾病的发生。笔者采用Sequenom SNP分型测序方法对宁夏地区764头中国荷斯坦奶牛的EEF1D和TRAPPC9基因进行单核苷酸多态性分析,并研究不同基因型与体细胞评分(SCS)关联性。结果表明:EEF1D-3位点有GG、AA和GA 3种基因型,其基因型频率分别为0.58,0.04,0.38;TRAPPC9-2525852位点有GG、TT和GT 3种基因型,其基因型频率分别为0.18,0.30,0.52;2个位点均偏离Hardy-Weinberg平衡状态且处于中度多态;平均小于5,其中EEF1D-3位点中GA基因型SCS最低为3.95;TRAPPC9-2525852位点中TT基因型SCS最低为3.91,即该地区中国荷斯坦奶牛均为健康牛。不同基因型与SCS关联性分析表明,基因型个体的SCS差异不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 荷斯坦奶牛 体细胞评分 eef1d TRAPPC9 Sequenom SNP
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