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DYRK2:基于东亚和欧洲人群揭示类风湿关节炎合并骨质疏松症的治疗新靶点
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作者 吴治林 何秦 +4 位作者 王枰稀 石现 袁松 张骏 王浩 《中国组织工程研究》 北大核心 2026年第6期1569-1579,共11页
背景:研究表明,类风湿关节炎与骨质疏松症呈正相关趋势,但因果关系和相关机制仍未得到证实。随着计算机科学和生命科学的交叉融合,基于全基因组关联研究数据和转录组测序数据进行孟德尔随机化和生信分析,可以评估两疾病间的因果关系、... 背景:研究表明,类风湿关节炎与骨质疏松症呈正相关趋势,但因果关系和相关机制仍未得到证实。随着计算机科学和生命科学的交叉融合,基于全基因组关联研究数据和转录组测序数据进行孟德尔随机化和生信分析,可以评估两疾病间的因果关系、探索相关机制以及挖掘治疗靶点,这将利于类风湿关节炎合并骨质疏松症的精准治疗。目的:采用双样本孟德尔随机化分析类风湿关节炎和骨质疏松症间的因果关系,同时基于汇总数据的孟德尔随机化分析和生信分析挖掘潜在共病靶点和靶向药物,旨在为类风湿关节炎合并骨质疏松症的机制探索和精准治疗提供理论依据。方法:①从基于亚洲人群和欧洲人群的GWAS Catalog、IEU Open GWAS、FinnGen以及eQTLGen数据库下载类风湿关节炎、骨质疏松症和顺式表达数量性状位点的全基因组关联研究数据,用于双样本孟德尔随机化和基于汇总数据的孟德尔随机化分析。②从GEO数据库下载类风湿关节炎的转录组测序数据(GSE93272和GSE15573),用于生物信息学分析。③以逆方差加权法作为主要分析方法,进行类风湿关节炎和骨质疏松症之间的正向和反向双样本孟德尔随机化分析,并用MR Egger法、简单模式法、加权中位数法和加权模式法对结果加以佐证。④基于汇总数据的孟德尔随机化分析鉴定与类风湿关节炎和骨质疏松症相关的基因,并基于交叉分析挖掘出类风湿关节炎和骨质疏松症共病靶点。同时,基于生信分析和细胞实验验证共病靶点的生物学功能。⑤此外,基于DYRK2构建类风湿关节炎风险预测诺莫图,通过受试者特征曲线、矫正曲线和决策曲线验证预测性能。最后,基于Enrichr数据库挖掘靶点潜在药物并进行分子对接。结果与结论:①正向孟德尔随机化分析结果显示,除外GCST90044540和GCST90086118无统计学意义,其他所有结果均表明类风湿关节炎和骨质疏松症间存在显著因果关系,并且呈正相关。②反向孟德尔随机化分析结果提示,骨质疏松症和类风湿关节炎间未见显著因果关系。③基于汇总数据的孟德尔随机化分析共鉴定出412和344个与类风湿关节炎和骨质疏松症正相关的基因,421和347个负相关基因。基于交叉分析得到26个共病基因。其中,DYRK2是潜在治疗靶点,后续生信分析和细胞实验证实DYRK2在类风湿关节炎和骨质疏松症的进展过程中发挥重要作用。④此外,构建的诺莫图具有出色的预测性能。最后,挖掘出4个DYRK2的潜在靶向药物(Undecanoic Acid、Metyrapone、JNJ-38877605和ACA),分子对接也证明具有可靠的靶向能力。⑤总之,基于亚洲人群和欧洲人群的全基因组关联研究数据证明了类风湿关节炎和骨质疏松症在遗传学层面存在着因果关系,DYRK2是潜在治疗靶点,有4种小分子是潜在靶向药物。 展开更多
关键词 类风湿关节炎 骨质疏松症 孟德尔随机化 基于汇总数据的孟德尔随机化 共病基因 dyrk2
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DYRK2在胰腺癌中的表达及临床意义
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作者 李旭 王敏 +3 位作者 江建新 田锐 石程剑 秦仁义 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2013年第15期1442-1447,共6页
目的:探讨双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶2(dual-specificity tyrosine phosphorylation-regulated kinase2,DYRK2)在胰腺癌中的表达及其临床意义.方法:应用实时荧光定量PCR、Western blot及免疫组织化学技术检测40例胰腺癌及其癌旁正常... 目的:探讨双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶2(dual-specificity tyrosine phosphorylation-regulated kinase2,DYRK2)在胰腺癌中的表达及其临床意义.方法:应用实时荧光定量PCR、Western blot及免疫组织化学技术检测40例胰腺癌及其癌旁正常组织标本中DYRK2mRNA和蛋白的表达量,并结合免疫组织化学结果及胰腺癌患者的临床病理资料进行统计学分析.结果:实时荧光定量PCR检测显示,DYRK2m R N A在胰腺癌及其癌旁组织中均有表达,但后者的表达水平明显高于前者(P<0.01);Western blot检测显示,在88.9%的癌组织中D Y R K2蛋白的表达量低于其对应的癌旁组织;免疫组织化学染色显示,DYRK2在胰腺癌组织中的阳性比例明显低于其癌旁组织(42.5%vs87.5%,X2=17.802,P<0.01),且DYRK2的表达与胰腺癌有无淋巴结转移相关(X2=6.32,P<0.05).结论:DYRK2在胰腺癌组织中表达下调,可能与胰腺癌的发生发展和淋巴结转移等恶性生物学行为相关. 展开更多
关键词 胰腺癌 dyrk2 淋巴结转移
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牛DYRK2基因的电子克隆及生物信息学分析
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作者 穆晓琨 字向东 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期154-157,共4页
以人DYRK2基因cDNA序列为探针,通过EST数据库进行同源性筛选,对牛DYRK2基因进行电子克隆。序列分析结果表明,牛DYRK2基因包含一个1 581 bp的开放阅读框架,共编码526个氨基酸;蛋白特征分析显示,牛DYRK2蛋白的分子式为C2632H4204N762O761S... 以人DYRK2基因cDNA序列为探针,通过EST数据库进行同源性筛选,对牛DYRK2基因进行电子克隆。序列分析结果表明,牛DYRK2基因包含一个1 581 bp的开放阅读框架,共编码526个氨基酸;蛋白特征分析显示,牛DYRK2蛋白的分子式为C2632H4204N762O761S26,相对分子质量为59 532.5,理论等电点pI为9.53。结果表明牛DYRK2基因与羊、人等其他动物的DYRK2具有较高的一致性。 展开更多
关键词 dyrk2基因 电子克隆 生物信息学
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丹参含药血清对肝星状细胞Hh通路中SuFu和DYRK2表达的影响 被引量:8
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作者 韩仕庆 王海兰 +1 位作者 冯藜枥 曹文富 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第22期4469-4474,共6页
观察丹参含药血清对瘦素刺激的大鼠肝星状细胞(hepatic stellate cell,HSCs)丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶抑制剂(Su Fu)和双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶2(DYRK2)表达的影响。清洁级SD大鼠(60只)给予丹参水煎剂、生理盐水、秋水仙碱,连续灌胃1... 观察丹参含药血清对瘦素刺激的大鼠肝星状细胞(hepatic stellate cell,HSCs)丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶抑制剂(Su Fu)和双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶2(DYRK2)表达的影响。清洁级SD大鼠(60只)给予丹参水煎剂、生理盐水、秋水仙碱,连续灌胃10 d制备丹参含药血清。体外培养的肝星状细胞(HSCs),除空白对照组外,其余各组均予瘦素100μg·L-1刺激24h,各组含药血清干预后置于37℃,5%CO2孵箱中培养。24 h后收集细胞,采用MTT法检测HSCs的增殖,分别采用RT-PCR和Western blot法测定Su Fu和DYRK2的表达情况。用瘦素刺激大鼠HSCs后,DYRK2 mRNA和蛋白表达均明显升高(与空白组比较P<0.01),Su Fu mRNA和蛋白表达均明显降低(与空白组比较P<0.01或P<0.05)。抑制剂组(cyclopamine)、丹参含药血清、秋水仙碱组干预后,DYRK2 mRNA和蛋白表达明显降低(与模型组比较P<0.01),Su Fu mRNA蛋白表达均明显升高(与模型组比较P<0.01)。在模型组的基础上加入Hh通路激动剂(purmorphamine)充分活化后,DYRK2 mRNA和蛋白表达均明显升高(与模型组比较P<0.01),Su Fu mRNA和蛋白表达均明显降低(与模型组比较P<0.01)。用丹参含药血清干预激动剂组后,DYRK2 mRNA和蛋白表达明显降低(与模型组比较P<0.01),Su Fu mRNA和蛋白表达均明显升高(与模型组比较P<0.01)。丹参含药血清可通过干预瘦素诱导的HSCs中Su Fu和DYRK2的表达,进而影响HSCs的活化增殖。 展开更多
关键词 丹参 HSCS 瘦素 SUFU dyrk2 肝纤维化
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Characterization of DYRK2(dual-specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 2) from Zebrafish(Dario rerio)
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作者 孙威 谭训刚 +2 位作者 张培军 张玉青 徐永立 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2010年第4期720-724,共5页
Proteins of the DYRK(dual-specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase) family are characterized by the presence of a conserved kinase domain and N-terminal DH box.DYRK2 is involved in regulating key developm... Proteins of the DYRK(dual-specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase) family are characterized by the presence of a conserved kinase domain and N-terminal DH box.DYRK2 is involved in regulating key developmental and cellular processes,such as neurogenesis,cell proliferation,cytokinesis,and cellular differentiation.Herein,we report that the ortholog of DYRK2 found in zebrafish shares about 70% identity with that of human,mouse,and chick.RT-PCR showed that DYRK2 is expressed maternally and zygotically.In-situ hybridization results show that DYRK2 is expressed in somite cells that will develop into muscles.Our results provide preliminary evidence for investigating the in-vivo function of DYRK2 in zebrafish muscle development. 展开更多
关键词 ZEBRAFISH dyrk2 in-situ hybridization muscle development
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急性ST段抬高型心肌梗死患者血清miR-187-5p、DYRK2水平变化及预后价值评估 被引量:3
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作者 杨鑫 马震 夏伟安 《微循环学杂志》 2023年第3期59-64,共6页
目的:探讨急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者血清微小RNA-187-5p(miR-187-5p)、人双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶2(DYRK2)的水平变化,并分析对患者预后评估的意义。方法:选取本院2019-05-2021-12入院治疗的102例急性STEMI患者(研究组),... 目的:探讨急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者血清微小RNA-187-5p(miR-187-5p)、人双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶2(DYRK2)的水平变化,并分析对患者预后评估的意义。方法:选取本院2019-05-2021-12入院治疗的102例急性STEMI患者(研究组),以同期在本院进行体检的40例健康者作为对照组,收集整理患者一般临床资料进行分析,采用Pearson相关性分析急性STEMI患者血清miR-187-5p、DYRK2表达的关系;随访102例患者治疗后6个月内情况,根据是否发生不良心血管事件(MACE)将其分为MACE组(45例)和非MACE组(57例),采用Logistic回归分析影响急性STEMI患者预后的因素;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析miR-187-5p、DYRK2对患者预后的预测价值。结果:研究组血清miR-187-5p水平显著低于对照组,DYRK2水平显著高于对照组(P<0.01);MACE组血清miR-187-5p表达水平显著低于非MACE组,血清DYRK2水平显著高于非MACE组(P<0.01);血清miR-187-5p与DYRK2水平呈负相关(r=-0.228,P<0.05);血清DYRK2、miR-187-5p、cTnT、LVEF、TG均为STEMI患者预后的影响因素(P<0.01);ROC曲线分析显示,miR-187-5p和DYRK2联合检测对患者预后评估的ROC曲线下面积为0.872,敏感度、特异度分别为88.89%、75.44%。结论:STEMI患者血清miR-187-5p水平降低,DYRK2水平升高,二者联合检测对患者预后评估具有一定的预测价值。 展开更多
关键词 急性ST段抬高型心肌梗死 miR-187-5p 人双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶2 预后
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microRNA-622调控DYRK2在结肠癌中表达并促进结肠癌细胞SW1116侵袭转移 被引量:2
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作者 魏晰麟 杜健峰 +6 位作者 王勇 卢佳宁 娄琳 孙洁 周忠笑 张健 曾宪东 《重庆医学》 CAS 2018年第17期2285-2289,共5页
目的探讨微小RNA622(microRNA-622,miR-622)及双重特异性酪氨酸调节激酶2(DYRK2)在结肠癌组织及结肠细胞系SW1116、SW480中的表达情况并研究其对SW1116侵袭转移能力的影响。方法选取82例结肠癌及癌旁组织标本,培养结肠癌细胞系SW1116、S... 目的探讨微小RNA622(microRNA-622,miR-622)及双重特异性酪氨酸调节激酶2(DYRK2)在结肠癌组织及结肠细胞系SW1116、SW480中的表达情况并研究其对SW1116侵袭转移能力的影响。方法选取82例结肠癌及癌旁组织标本,培养结肠癌细胞系SW1116、SW480及正常结肠上皮细胞系NCM460细胞。Real time PCR检测组织及细胞中miR-622的表达,Real time PCR、免疫组织化学、Western blot检测DYRK2基因及蛋白的表达并行Pearson相关性分析。在SW1116中转染miR-622mimics上调miR-622表达,同时对照(NC)组转染阴性序列并验证,Real time PCR及Western blot进一步检测上调miR-622后SW1116中DYRK2基因及蛋白表达水平,同时用Transwell法检测SW1116细胞侵袭转移能力的变化。结果Real time PCR及Western blot结果显示,相比于癌旁组织和正常结肠上皮细胞系NCM460,结肠癌组织及结肠癌细胞SW1116中miR-622mRNA呈高表达而DYRK2mRNA及蛋白呈低表达,两者表达呈明显负相关(r=0.916,P<0.01)。转染miR-622 mimics后,Real time PCR及Western blot结果显示,相比于NC组,miR-622mimics组DYRK2mRNA及蛋白表达水平减低(P<0.01)。相应的,Transwell结果显示,相比于NC组,SW1116细胞转染miR-622mimics后侵袭转移能力明显增强(P<0.01)。结论结肠癌中miR-622呈高表达而DYRK2呈低表达,上调miR-622可负性调控DYRK2表达并促进SW1116细胞侵袭转移。 展开更多
关键词 微RNA-622 dyrk2 结肠肿瘤 肿瘤浸润 肿瘤转移
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DCAF1 (VprBP): emerging physiological roles for a unique dual-service E3 ubiquitin ligase substrate receptor 被引量:3
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作者 N.Max Schabla Koushik Mondal Patrick C.Swanson 《Journal of Molecular Cell Biology》 SCIE CAS CSCD 2019年第9期725-735,共11页
Cullin-RING ligases(CRLs)comprise a large group of modular eukaryotic E3 ubiquitin ligases.Within this family,the CRL4 ligase(consisting of the Cullin4[CUL4]scaffold protein,the Rbxl RING finger domain protein,the DNA... Cullin-RING ligases(CRLs)comprise a large group of modular eukaryotic E3 ubiquitin ligases.Within this family,the CRL4 ligase(consisting of the Cullin4[CUL4]scaffold protein,the Rbxl RING finger domain protein,the DNA damage-binding protein 1[DDB1],and one of many DDBl-associated substrate receptor proteins)has been intensively studied in recent years due to its involvement in regulating various cellular processes,its role in cancer development and progression,and its subversion by viral accessory proteins.Initially discovered as a target for hijacking by the human immunodeficiency virus accessory protein r,the normal targets and function of the CRL4 substrate receptor protein DDBl-Cul4-associated factor 1(DCAF1;also known as VprBP)had remained elusive,but newer studies have begun to shed light on these questions.Here,we review recent progress in understanding the diverse physiological roles of this DCAF1 in supporting various general and cell type-specific cellular processes in its context with the CRL4 E3 ligase,as well as another HECT-type E3 ligase with which DCAF1 also associates,called EDD/UBR5.We also discuss emerging questions and areas of future study to uncover the dynamic roles of DCAF1 in normal physiology. 展开更多
关键词 V(D)J recombination MERLIN DICER p53 EDD/dyrk2 TET HIPPO
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