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Harnessing lysosomal genetics:development of a risk stratification panel and unveiling of DPP7 as a biomarker for colon adenocarcinoma
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作者 Zhengdong Luo Yanlei Wang +10 位作者 Shunjie Zeng Longchen Yu Yuxiao Zhao Hong Wang Yingjing Fan Yanli Zhang Lili Wang Yaping Li Zhongfang Niu Xin Zhang Yi Zhang 《Journal of Genetics and Genomics》 2025年第12期1549-1562,共14页
Lysosomal dysfunction has been implicated in the progression of colon adenocarcinoma(COAD),yet the prognostic significance and therapeutic potential of lysosome-related genes(LRGs)remain underexplored.In this study,we... Lysosomal dysfunction has been implicated in the progression of colon adenocarcinoma(COAD),yet the prognostic significance and therapeutic potential of lysosome-related genes(LRGs)remain underexplored.In this study,we construct a 6-LRG-based prognostic risk stratification model(DPP7,ADAM8,CD1B,LRP2,ATP6V1C2,and PLAAT3)by integrating LASSO and Cox regression analyses.Stratifying patients based on median risk scores,we demonstrate that high-risk patients exhibit significantly worse clinical outcomes across the TCGA cohort and five independent GEO datasets.Furthermore,this panel outperforms 136 previously published models in terms of predictive accuracy for 1-,3-,and 5-year survival rates.Validation multiplex immunofluorescence using an in-house tissue microarray cohort confirms that the 6-LRG signature serves as an independent prognostic factor.Additionally,high-risk patients exhibit distinct immunosuppressive tumor microenvironment and aggressive malignancy characteristics.Functional depletion of DPP7 significantly inhibits tumor cell proliferation,migration,and metastasis in both in vitro and in vivo settings.Moreover,DPP7 silencing attenuates epithelialemesenchymal transition,as evidenced by the upregulation of E-cadherin and downregulation of N-cadherin,Vimentin,and Snail.In conclusion,this study establishes an LRG-based model for COAD prognostic prediction and nominates DPP7 as a promising therapeutic target for COAD treatment. 展开更多
关键词 Colon adenocarcinoma LYSOSOME Prognostic panel dpp7 Immune microenvironment Malignant features
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基于生信分析DPP7在结肠癌中的诊断及预后价值 被引量:1
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作者 杨正波 《医药论坛杂志》 2022年第12期5-8,12,共5页
目的本文旨在对DPP7基因在结肠癌患者中潜在的诊断和预后意义进行探讨。方法从TCGA公共数据库中下载结肠癌的相关样本资料,过滤得出包含一般临床信息、分期、预后等相关临床信息的样本资料。首先分析非配对样本中结肠癌组织与正常组织中... 目的本文旨在对DPP7基因在结肠癌患者中潜在的诊断和预后意义进行探讨。方法从TCGA公共数据库中下载结肠癌的相关样本资料,过滤得出包含一般临床信息、分期、预后等相关临床信息的样本资料。首先分析非配对样本中结肠癌组织与正常组织中DPP7基因的表达值之间有无差异,再进行筛选得出包括癌与癌旁组织的结肠癌配对样本,分析配对样本中癌与癌旁组织中DPP7的基因表达有无差异。基于DPP7的基因表达构建出预测结肠癌组织或是正常组织的ROC曲线。比较结肠癌不同肿瘤T、N、M分期中DPP7的表达差别。根据DPP7的基因表达值高低将结肠癌样本分为DPP7高表达组与DPP7低表达组,分析DPP7的高表达与低表达对结肠癌生存预后指标OS、DSS及PFI的影响。最后对DPP7与结肠癌中24种免疫细胞相关性进行分析。结果无论是非配对样本还是配对样本,DPP7在结肠癌中的基因表达值均较正常组织的表达值显著升高,并且具有统计学差异。通过DPP7在结肠癌中的表达情况构建ROC曲线,其AUC及CI值显示DPP7对结肠癌具有很好的预测作用。DPP7在结肠癌不同肿瘤N、M分期中的表达具有显著差异,且具有统计学意义。存在低表达DPP7的患者具有较好的OS、DSS和PFI。DPP7的表达与结肠癌中多种免疫细胞具有相关性。结论DPP7有可能成为结肠癌的诊断及预后指标,DPP7与结肠癌中的免疫细胞密切相关,与免疫浸润有关。 展开更多
关键词 dpp7 结肠癌 TCGA 诊断 预后
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羊栖菜多糖对2型糖尿病大鼠肾脏保护作用及其机制 被引量:6
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作者 杨旭东 张杰 申梅淑 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2010年第3期38-41,共4页
目的研究羊栖菜多糖(Sargassumfusi forme polysaccharide,SFPS)对2型糖尿病大鼠肾脏保护作用及其机制。方法将Wistar大鼠经链脲佐菌素造2型糖尿病大鼠模型,试验组给予SFPS 1.6,0.8和0.4 g.kg-1.d-1,灌胃治疗4 w。12 w后,观察肾功能、... 目的研究羊栖菜多糖(Sargassumfusi forme polysaccharide,SFPS)对2型糖尿病大鼠肾脏保护作用及其机制。方法将Wistar大鼠经链脲佐菌素造2型糖尿病大鼠模型,试验组给予SFPS 1.6,0.8和0.4 g.kg-1.d-1,灌胃治疗4 w。12 w后,观察肾功能、尿蛋白、肾脏病理变化。并以逆转录PCR检测肾脏转化生长因子β1(transforming growth factorβ1,TGF-β1)及母亲DPP同源物7(mothers against decapentaplegichomolog 7,Smad 7)的表达。结果 SFPS能显著改善肾脏功能。模型组大鼠肾脏TGF-β1和Smad 7 mRNA表达显著升高(P<0.01),而SFPS试验组TGF-β1和Smad 7 mRNA表达显著降低(P<0.01)。结论 SFPS对糖尿病大鼠肾组织有明显保护作用,其机制可能通过抑制肾脏TGF-β1和Smad 7 mRNA的表达。 展开更多
关键词 羊栖菜多糖 2型糖尿病 转化生长因子β1 母亲DPP同源物7
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沉默miR-216a对四氯化碳诱导的肝纤维化模型大鼠的保护作用及机制研究 被引量:2
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作者 卢帅军 汪芳 +1 位作者 张步荣 王卫华 《国际消化病杂志》 CAS 2021年第2期124-128,共5页
目的探究沉默miR-216a对四氯化碳(CCl4)诱导的肝纤维化模型大鼠的作用及机制。方法从50只大鼠中随机选取10只作为正常组,其余40只采用腹腔注射含CCl4的橄榄油溶液方法构建肝纤维化模型大鼠。将造模成功的30只大鼠随机分为模型组、对照... 目的探究沉默miR-216a对四氯化碳(CCl4)诱导的肝纤维化模型大鼠的作用及机制。方法从50只大鼠中随机选取10只作为正常组,其余40只采用腹腔注射含CCl4的橄榄油溶液方法构建肝纤维化模型大鼠。将造模成功的30只大鼠随机分为模型组、对照组和沉默组,每组各10只,对照组尾静脉注射含空载质粒的腺病毒,沉默组尾静脉注射含si-miR-216a质粒的腺病毒。采用酶联免疫吸附测定(ELISA)法检测各组透明质酸(HA)、层粘连蛋白(LN)、Ⅲ型前胶原(PCⅢ)、Ⅳ型胶原(ⅣC)的表达水平。采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time qPCR)法检测miR-216a、第10号染色体缺失性磷酸酶及张力蛋白同源物基因(PTEN)mRNA和母亲DPP同源物7(Samd7)mRNA的相对表达量。采用蛋白质印迹法检测PTEN和Samd7的表达水平。结果与正常组比较,模型组HA、LN、PCⅢ、ⅣC和miR-216a表达水平均升高,而PTEN mRNA、Samd7 mRNA、PTEN和Samd7的表达水平均降低,差异均有统计学意义(P均<0.05)。与模型组和对照组比较,沉默组HA、LN、PCⅢ、ⅣC和miR-216a表达水平均降低,而PTEN mRNA、Samd7 mRNA、PTEN和Samd7表达水平均升高,差异均有统计学意义(P均<0.05)。结论沉默miR-216a可降低肝纤维化大鼠HA、LN、PCⅢ和ⅣC的表达水平,改善CCl4诱导的肝纤维化损伤,其机制可能与调控PTEN/Smad7信号通路有关。 展开更多
关键词 肝纤维化 miR-216a 第10号染色体缺失性磷酸酶及张力蛋白同源物基因 母亲DPP同源物7
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