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两种向日葵检疫性真菌病害的多重DPO-PCR检测方法 被引量:10
1
作者 张娜 乾义柯 +4 位作者 魏霜 梁巧玲 鄞杰平 刘中勇 陈卫民 《植物检疫》 北大核心 2015年第6期35-38,共4页
本研究根据向日葵白锈病菌大亚基核糖体RNA基因序列,向日葵黑茎病菌的ITS-5.8S r RNA基因序列,分别设计特异性DPO(dual priming oligonucleotide)引物,建立同时检测这两种检疫性病菌的多重DPO-PCR检测方法,并对其特异性和灵敏度进行评... 本研究根据向日葵白锈病菌大亚基核糖体RNA基因序列,向日葵黑茎病菌的ITS-5.8S r RNA基因序列,分别设计特异性DPO(dual priming oligonucleotide)引物,建立同时检测这两种检疫性病菌的多重DPO-PCR检测方法,并对其特异性和灵敏度进行评价。结果表明,所设计的DPO引物特异性强,仅向日葵白锈病菌和向日葵黑茎病菌可分别扩增出307 bp与388 bp的特异性条带,其他参照菌株及阴性对照均无条带;检测体系对混合模板中向日葵白锈病菌和向日葵黑茎病菌的DNA灵敏度均达0.05 ng/μL;且该检测方法对退火温度不敏感,适用范围广。该方法能够准确、快速的检测向日葵白锈病菌和向日葵黑茎病菌,适合于口岸实验室的快速检测。 展开更多
关键词 向日葵白锈病菌 向日葵黑茎病菌 多重dpo-pcr 检测
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金黄色葡萄球菌DPO-PCR快速检测方法的建立与应用 被引量:4
2
作者 李丹丹 徐义刚 +3 位作者 邱索平 王昱 高会江 高慎阳 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期419-423,共5页
为建立检测金黄色葡萄球菌(SA)的PCR方法,以SA Sa442基因为靶基因设计了一对双启动寡核苷酸引物(DPO),建立了SA的DPO-PCR快速检测方法。结果显示,在45~65℃退火温度范围内均能高效地扩增出目的基因,表明DPO引物对退火温度不敏感,该... 为建立检测金黄色葡萄球菌(SA)的PCR方法,以SA Sa442基因为靶基因设计了一对双启动寡核苷酸引物(DPO),建立了SA的DPO-PCR快速检测方法。结果显示,在45~65℃退火温度范围内均能高效地扩增出目的基因,表明DPO引物对退火温度不敏感,该方法的灵敏度为2.27×102cfu/m L,同时DPO引物特异性强,与其他菌株无非特异性扩增反应。利用该方法和行标法分别对采集的175份样品进行检测,均共计检出13份SA阳性样品,两者符合率为100%。作者建立的DPO-PCR方法设计简单、特异性强,具有良好的实用性,为快速准确检测SA提供新的检测手段。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 Sa442基因 dpo-pcr
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肠致病性大肠杆菌DPO-PCR快速检测方法的建立 被引量:4
3
作者 李丹丹 徐义刚 +3 位作者 陈文慧 邱索平 高慎阳 李一经 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期541-544,共4页
为建立肠致病性大肠杆菌(EPEC)的快速检测方法,本研究以EPEC bfp A基因为靶基因设计了一对双启动寡核苷酸引物(DPO),建立了EPEC的DPO-PCR快速检测方法。结果显示,退火温度在45℃~65℃范围内均能够高效地扩增出目的基因,表明DPO引物... 为建立肠致病性大肠杆菌(EPEC)的快速检测方法,本研究以EPEC bfp A基因为靶基因设计了一对双启动寡核苷酸引物(DPO),建立了EPEC的DPO-PCR快速检测方法。结果显示,退火温度在45℃~65℃范围内均能够高效地扩增出目的基因,表明DPO引物对退火温度不敏感。该方法对其他菌株的扩增结果均为阴性,特异性强;其灵敏度为97 cfu/m L。利用该方法和国标法分别对采集的230份临床样品进行检测,均共计检出5份EPEC阳性样品,两者符合率为100%。本研究建立的DPO-PCR方法设计简单、特异性强、灵敏度高,具有良好的实用性,为快速准确检测EPEC提供新的检测手段。 展开更多
关键词 肠致病性大肠杆菌 bfpA基因 dpo-pcr
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副溶血弧菌DPO-PCR检测方法的建立 被引量:2
4
作者 李丹丹 徐义刚 +3 位作者 王昱 邱索平 高会江 高慎阳 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期133-136,共4页
以副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus,VP)toxR基因为靶基因设计了一对双启动寡核苷酸(DPO)引物,建立了DPO-PCR快速检测VP的方法.结果显示,退火温度在49~69℃都能有效地扩增出目的基因,表明该检测方法对退火温度不敏感;该DPO引物... 以副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus,VP)toxR基因为靶基因设计了一对双启动寡核苷酸(DPO)引物,建立了DPO-PCR快速检测VP的方法.结果显示,退火温度在49~69℃都能有效地扩增出目的基因,表明该检测方法对退火温度不敏感;该DPO引物仅与VP的扩增反应呈阳性,而与其他菌株无非特异性扩增反应,表明该方法特异性强;该方法的灵敏度为121 CFU/mL.利用该检测方法对采集的550份样品进行检测,共计检出19份VP阳性样品,与行标法(SN/T 1870-2007)检测结果一致,实用性良好.该DPO-PCR方法设计简单、特异性强,具有良好的实用性. 展开更多
关键词 副溶血弧菌 toxR基因 dpo-pcr
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肠侵袭性大肠杆菌DPO-PCR检测方法的建立与应用 被引量:1
5
作者 李丹丹 徐义刚 +3 位作者 邱索平 王昱 高会江 高慎阳 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期826-830,共5页
目的为建立肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)的DPO-PCR快速检测方法。方法本研究以EIECipaH基因为靶基因设计了一对双启动寡核苷酸(DPO)引物,建立了EIEC DPO-PCR检测方法。结果退火温度范围在47℃~67℃内都能有效地扩增出目的基因,表明该检... 目的为建立肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)的DPO-PCR快速检测方法。方法本研究以EIECipaH基因为靶基因设计了一对双启动寡核苷酸(DPO)引物,建立了EIEC DPO-PCR检测方法。结果退火温度范围在47℃~67℃内都能有效地扩增出目的基因,表明该检测方法对退火温度不敏感;该DPO引物仅与EIEC的扩增反应呈阳性,而与其他菌株无非特异性扩增反应,表明该方法特异性强;该方法的灵敏度为1.17×102 cfu/mL。利用该检测方法对采集的230份样品进行检测,共计检出3份EIEC阳性样品,与国标法(GB 4789.6-2003)检测结果一致,显示了良好的实用性。结论该DPO-PCR方法设计简单、特异性强,具有良好的实用性。 展开更多
关键词 肠侵袭性大肠杆菌 IPAH基因 dpo-pcr
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牛细小病毒DPO-PCR检测方法的建立 被引量:5
6
作者 王孟孟 李振雪 +6 位作者 汤婷婷 王瑞翀 王丽 徐义刚 唐丽杰 李一经 乔薪瑗 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期269-273,共5页
为建立牛细小病毒的快速检测方法,以牛细小病毒VP2基因为靶基因,设计了1对双启动寡核苷酸(dual-priming oligonucleotide,DPO)引物,建立了牛细小病毒DPO-PCR快速检测方法。退火温度不敏感试验、特异性试验和灵敏度试验的结果显示,与常规... 为建立牛细小病毒的快速检测方法,以牛细小病毒VP2基因为靶基因,设计了1对双启动寡核苷酸(dual-priming oligonucleotide,DPO)引物,建立了牛细小病毒DPO-PCR快速检测方法。退火温度不敏感试验、特异性试验和灵敏度试验的结果显示,与常规PCR方法相比,DPO-PCR方法在41~65℃退火温度范围内均能够高效地扩增出目的基因,表明DPO引物对退火温度不敏感;该方法的最低检出量为3.94×10~3copies/uL;通过对牛细小病毒、牛轮状病毒、牛病毒性腹泻病毒、牛呼吸道合胞体病毒进行检测,只有牛细小病毒的检测结果为阳性,且无非特异性扩增。结果表明,建立的DPO-PCR方法同传统PCR方法相比,特异性强、灵敏度高,为牛细小病毒的快速检测提供了一种新方法。 展开更多
关键词 牛细小病毒 dpo-pcr 快速检测
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产肠毒性大肠杆菌DPO-PCR检测方法的建立与应用 被引量:6
7
作者 徐义刚 李丹丹 +2 位作者 刘忠梅 崔丽春 李苏龙 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期75-80,共6页
双启动寡核苷酸引物(dual-priming oligonucleotide,DPO)是一种新型的引物设计方法,具有设计简易、特异性强以及退火温度范围宽的特点。以产肠毒性大肠杆菌LT基因为靶基因,设计了一对DPO引物,经过对TaqDNA聚合酶、Mg2+、dNTP反... 双启动寡核苷酸引物(dual-priming oligonucleotide,DPO)是一种新型的引物设计方法,具有设计简易、特异性强以及退火温度范围宽的特点。以产肠毒性大肠杆菌LT基因为靶基因,设计了一对DPO引物,经过对TaqDNA聚合酶、Mg2+、dNTP反应体系因子的优化,建立了产肠毒性大肠杆菌DPO-PCR检测方法,测定了该方法的灵敏度、特异性以及退火温度不敏感性。结果显示,该方法检测灵敏度为1.24×10^2CFU/ml,在45℃~65℃退火温度范围内,均可实现靶基因的高效扩增。该方法特异性强,测试菌株中4株产肠毒性大肠杆菌均为阳性结果,其余菌株为阴性结果,且无非特异性扩增发生。与常规PCR方法相比,DPO—PCR方法不需要对引物参数特别是退火温度反复优化,同时DPO引物的特殊结构又增强了检测特异性,为致病性微生物的快速准确检测提供了新方法。 展开更多
关键词 产肠毒性大肠杆菌 LT基因dpo-pcr
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霍乱弧菌DPO-PCR特异性检测方法的建立与应用 被引量:3
8
作者 徐义刚 李丹丹 +3 位作者 吴岩 刘忠梅 魏冬旭 李苏龙 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1284-1288,共5页
采用一种新型的引物设计方法——双启动寡核苷酸引物(dual-priming oligonucleotide,DPO),以霍乱弧菌mdh基因为靶序列,建立了霍乱弧菌DPO-PCR特异性检测方法,分析了DPO引物退火温度不敏感性、检测灵敏度及特异性,并对检测方法进行了初... 采用一种新型的引物设计方法——双启动寡核苷酸引物(dual-priming oligonucleotide,DPO),以霍乱弧菌mdh基因为靶序列,建立了霍乱弧菌DPO-PCR特异性检测方法,分析了DPO引物退火温度不敏感性、检测灵敏度及特异性,并对检测方法进行了初步应用。灵敏度结果显示,DPO-PCR方法对霍乱弧菌的最低检出限为1.07×102 CFU/mL。退火温度不敏感性试验中,与常规PCR引物相比,DPO引物在45~65℃退火温度均能够高效扩增出靶基因片段。特异性结果显示,DPO-PCR方法的特异性比常规PCR方法强,不产生任何非特异性扩增。利用建立的霍乱弧菌DPO-PCR检测方法对采集的550份样本进行检测,检出43份霍乱弧菌阳性样本,经行业标准法(SN/T2425-2010)复检,检测结果相同,表明所建立的DPO-PCR检测方法具有良好的实用性,为霍乱弧菌的快速准确检测提供了新途径。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 mdh基因 dpo-pcr方法
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双重DPO-PCR检测副溶血弧菌和霍乱弧菌 被引量:7
9
作者 魏霜 马新华 +4 位作者 汪天杰 龙阳 纪强 任娇 吴希阳 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2016年第22期80-83,共4页
根据副溶血弧菌collagenase基因和霍乱弧菌omp W基因,分别设计特异性DPO(dual priming oligonucleotide)引物,建立一种快速检测这两种弧菌的多重DPO-PCR方法,并对其特异性和灵敏度进行了评价。结果显示,设计的DPO引物特异性较强,副溶血... 根据副溶血弧菌collagenase基因和霍乱弧菌omp W基因,分别设计特异性DPO(dual priming oligonucleotide)引物,建立一种快速检测这两种弧菌的多重DPO-PCR方法,并对其特异性和灵敏度进行了评价。结果显示,设计的DPO引物特异性较强,副溶血弧菌和霍乱弧菌DNA可分别扩增出307 bp与463 bp的特异性条带,检测灵敏度均达0.1 ng/μL。该检测方法对退火温度不敏感。利用该方法对69株疑似弧菌菌株进行鉴定,结果与生理生化鉴定结果一致。该方法特异性强、灵敏度高,适合于对食品、水产品等中副溶血弧菌和霍乱弧菌的进行快速筛检。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 霍乱弧菌 多重DPO—PCR
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油菜茎基溃疡病菌DPO-PCR检测方法的建立 被引量:2
10
作者 龙阳 袁俊杰 +4 位作者 候翠丽 卢乃会 杨卓瑜 马新华 魏霜 《植物检疫》 北大核心 2017年第4期42-45,共4页
根据油菜茎基溃疡病菌ITS基因序列,设计特异性DPO引物,建立检测油菜茎基溃疡病菌的DPO-PCR检测方法,并对其特异性、灵敏性进行评价。结果显示与常规PCR检测方法相比,DPO-PCR反应对退火温度不敏感,具有更强的特异性。利用该方法对10批油... 根据油菜茎基溃疡病菌ITS基因序列,设计特异性DPO引物,建立检测油菜茎基溃疡病菌的DPO-PCR检测方法,并对其特异性、灵敏性进行评价。结果显示与常规PCR检测方法相比,DPO-PCR反应对退火温度不敏感,具有更强的特异性。利用该方法对10批油菜籽样品进行检测,共检出5批阳性样品,检测结果与常规PCR一致,为油菜茎基溃疡病菌的检测提供了新方法。 展开更多
关键词 油菜茎基溃疡病菌 dpo-pcr 检测
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多重DPO-PCR检测转基因玉米MON810和MIR604体系建立
11
作者 周陆宁 张锐 +1 位作者 麦晨 魏霜 《现代农业科技》 2018年第17期1-2,共2页
针对转基因玉米MON810和MIR604品系插入位点序列,分别设计品系特异性DPO引物,建立转基因玉米MON810和MIR604品系检测的多重DPO-PCR方法。结果表明,设计的DPO引物特异性强,灵敏度达0.5 ng/μL,并且对退火温度不敏感。该检测方法特异性强... 针对转基因玉米MON810和MIR604品系插入位点序列,分别设计品系特异性DPO引物,建立转基因玉米MON810和MIR604品系检测的多重DPO-PCR方法。结果表明,设计的DPO引物特异性强,灵敏度达0.5 ng/μL,并且对退火温度不敏感。该检测方法特异性强、灵敏度高,适合于对转基因玉米MON810和MIR604品系进行快速检测。 展开更多
关键词 转基因玉米 MON810 MIR604 多重dpo-pcr
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应用DPO-PCR技术检测肠出血性大肠杆菌O157∶H7 被引量:11
12
作者 徐义刚 李丹丹 +2 位作者 崔丽春 刘忠梅 李苏龙 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第8期160-164,共5页
利用双启动寡核苷酸引物(dual-priming oligonucleotide,DPO)聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术检测肠出血性大肠杆菌O157∶H7。根据DPO引物设计原则,以肠出血性大肠杆菌O157∶H7 rfbE基因为靶基因设计一对DPO引物,经... 利用双启动寡核苷酸引物(dual-priming oligonucleotide,DPO)聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术检测肠出血性大肠杆菌O157∶H7。根据DPO引物设计原则,以肠出血性大肠杆菌O157∶H7 rfbE基因为靶基因设计一对DPO引物,经过反应体系的优化,建立了肠出血性大肠杆菌O157∶H7 DPO-PCR检测方法,其检测灵敏度约为94 CFU/mL。与常规PCR方法相比,所建立的DPO-PCR方法对退火温度不敏感,在引物设计和实验过程中不需要对引物及其退火温度反复优化,同时基于DPO引物的特殊结构又增强了其特异性。DPO-PCR方法设计简易、特异性强,为致病性微生物的快速准确检测提供了新途径。 展开更多
关键词 肠出血性大肠杆菌O157∶H7 rfbE基因 双启动寡核苷酸引物聚合酶链式反应
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应用DPO-PCR方法特异性检测志贺氏菌 被引量:10
13
作者 徐义刚 李丹丹 +3 位作者 刘忠梅 吴岩 李苏龙 魏冬旭 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第3期28-32,共5页
本研究利用一种高特异性PCR引物设计方法——双启动寡核苷酸引物(dual-primingoligonucleotide,DPO),以志贺氏菌属侵袭性质粒抗原(ipaH)基因为靶基因,设计DPO引物,建立了特异性检测志贺氏菌属的DPO—PCR方法。结果显不,所建立... 本研究利用一种高特异性PCR引物设计方法——双启动寡核苷酸引物(dual-primingoligonucleotide,DPO),以志贺氏菌属侵袭性质粒抗原(ipaH)基因为靶基因,设计DPO引物,建立了特异性检测志贺氏菌属的DPO—PCR方法。结果显不,所建立的DPO-PCR方法检测灵敏度为1.65×10^2CFU/mL;与常规PCR引物相比,DPO引物设计简易,简化了PCR引物设计;DPO引物退火温度范围宽,在50-70℃退火温度内均可对靶基因进行高效扩增;DPO引物结构特殊,具有比常规PCR引物更高的特异性,反应中无非特异性扩增产生。实践检测结果显示,利用该方法对133份冻/鲜肉类、果蔬类、鲜牛奶、鸡蛋和熟食样本进行检测,共检出15份志贺氏菌阳性样本,经国标法(GB/T4789.5-2012)复检,两者检测结果一致,显示出良好的实用性和可靠性,为志贺氏菌快速、准确的检测提供了新手段。 展开更多
关键词 志贺氏菌 侵袭性质粒抗原(ipaH)基因 DPO—PCR方法
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创伤弧菌DPO-PCR检测方法的建立 被引量:4
14
作者 李丹丹 徐义刚 +2 位作者 王昱 高会江 高慎阳 《食品科技》 CAS 北大核心 2015年第11期287-291,共5页
为建立检测创伤弧菌(VV)的快速检测方法,以VV vvhA基因为靶基因设计了一对双启动寡核苷酸引物(DPO),建立了DPO-PCR快速检测VV的方法。结果显示,退火温度范围在49~69℃内都能有效地扩增出目的基因,表明该检测方法对退火温度不敏感;该... 为建立检测创伤弧菌(VV)的快速检测方法,以VV vvhA基因为靶基因设计了一对双启动寡核苷酸引物(DPO),建立了DPO-PCR快速检测VV的方法。结果显示,退火温度范围在49~69℃内都能有效地扩增出目的基因,表明该检测方法对退火温度不敏感;该DPO引物仅与VV的扩增反应呈阳性,而与其他菌株无非特异性扩增反应,表明该方法特异性强;该方法的灵敏度为99 cfu/m L。利用该检测方法对采集的210份样品进行检测,共计检出4份VV阳性样品,与行标法(SN/T 1870—2007)检测结果一致,显示了良好的实用性。该DPO-PCR方法设计简单、特异性强,具有良好的实用性。 展开更多
关键词 创伤弧菌 vvhA基因 dpo-pcr
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向日葵黄萎病病原菌轮枝菌的多重DPO-PCR检测方法 被引量:5
15
作者 乾义柯 张娜 +2 位作者 魏霜 陆平 易建平 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期115-120,共6页
为建立可同时快速检测引起向日葵黄萎病害的2种检疫性病原菌大丽轮枝菌Verticillium dahliae Kleb.和黑白轮枝菌V.albo-atrum Reinke et Berthold的方法,根据2种病原菌的β-tubulin基因分别设计特异性DPO引物,建立多重DPO-PCR检测方法,... 为建立可同时快速检测引起向日葵黄萎病害的2种检疫性病原菌大丽轮枝菌Verticillium dahliae Kleb.和黑白轮枝菌V.albo-atrum Reinke et Berthold的方法,根据2种病原菌的β-tubulin基因分别设计特异性DPO引物,建立多重DPO-PCR检测方法,并对其特异性和灵敏度进行评价。结果表明,所设计的DPO引物特异性强,仅大丽轮枝菌和黑白轮枝菌可分别扩增出225 bp与151 bp的特异性条带,其它向日葵病害的7种病原菌及阴性对照均无目的条带;反应体系中引物终浓度为0.2μmol/L、退火温度为60℃时,30个扩增循环的检测灵敏度均可达0.05 ng菌丝DNA量;在45~65℃退火温度范围内均可高效扩增靶基因片段,表明该方法退火温度范围宽。所建立的检测方法能够准确、高效地检测引起向日葵黄萎病的大丽轮枝菌和黑白轮枝菌,可用于向日葵种子带菌筛查及田间病害诊断检测。 展开更多
关键词 向日葵黄萎病 黑白轮枝菌 大丽轮枝菌 多重dpo-pcr
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基于双启动引物特异性检测单核细胞增生李斯特氏菌的PCR方法 被引量:7
16
作者 徐义刚 李丹丹 +4 位作者 张柏棋 刘忠梅 魏冬旭 刘新亮 李苏龙 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期86-89,共4页
以单核细胞增生李斯特氏菌iap基因为靶基因,利用一新型PCR引物设计方法——双启动引物(Dual-primingoligonucleotide,DPO),建立了特异性检测单核细胞增生李斯特氏菌的DPO—PCR方法,测试了DPO—PCR方法退火温度不敏感性、特异性及... 以单核细胞增生李斯特氏菌iap基因为靶基因,利用一新型PCR引物设计方法——双启动引物(Dual-primingoligonucleotide,DPO),建立了特异性检测单核细胞增生李斯特氏菌的DPO—PCR方法,测试了DPO—PCR方法退火温度不敏感性、特异性及灵敏度,并在实践检测中进行了初步应用。结果显示:该方法检测单核细胞增生李斯特氏菌的灵敏度为1.51×10^2CFU/mL;退火温度不敏感性测试中,与常规PCR引物相比,DPO引物在48~68℃退火温度范围内均能够高效率地扩增靶基因;特异性测试中,DPO—PCR方法能特异地检测出目标菌,与其他菌株无非特异性扩增反应,比常规PCR方法显示出更强的特异性。实践应用证明,利用DPO—PCR方法对130份样本进行检测,共计检出9份单核细胞增生李斯特氏菌阳性样本,经国标法(GB/T4789.30—2008)复检,两者检测结果一致,显示出良好的实用性,为单核细胞增生李斯特氏菌的快速准确检测提供了新方法。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特氏菌 iap基因 dpo-pcr方法
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基于DPO引物特异性检测小肠结肠炎耶尔森氏菌的PCR方法 被引量:11
17
作者 徐义刚 李丹丹 +2 位作者 刘忠梅 吴岩 李苏龙 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期507-510,520,共5页
目的 引入一种设计简易、特异性强、退火温度范围宽的双启动寡核苷酸引物(dual-priming oligonucleotide,DPO)设计,建立基于DPO引物特异性检测小肠结肠炎耶尔森氏菌的PCR方法.方法 以小肠结肠炎耶尔森氏菌16S 23SrRNA基因为靶基因,设... 目的 引入一种设计简易、特异性强、退火温度范围宽的双启动寡核苷酸引物(dual-priming oligonucleotide,DPO)设计,建立基于DPO引物特异性检测小肠结肠炎耶尔森氏菌的PCR方法.方法 以小肠结肠炎耶尔森氏菌16S 23SrRNA基因为靶基因,设计一对DPO引物,经过PCR反应体系优化,建立小肠结肠炎耶尔森氏菌DPO-PCR检测方法.测定了检测灵敏度,以常规PCR方法作为参照,分析DP&PCR方法的特异性及退火温度.结果 建立的小肠结肠炎耶尔森氏菌DPO-PCR检测方法的灵敏度为1.43×102 CFU/mL;与常规PCR方法相比,DP&PCR方法在49~69℃退火温度范围内均能保持高效率扩增;特异性强,所测试17种病原菌中,仅小肠结肠炎耶尔森氏菌为阳性结果,且无非特异性扩增.结论 DPO-PCR方法不需要对引物参数特别是退火温度进行优化,特异性强,为致病微生物的快速准确检测提供了新方法. 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森氏菌 16S-23S RRNA dpo-pcr
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基于DPO引物的空肠弯曲菌PCR检测方法的建立与初步应用 被引量:10
18
作者 徐义刚 李丹丹 +3 位作者 刘忠梅 吴岩 魏冬旭 李苏龙 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期293-296,共4页
为建立特异、快速检测空肠弯曲菌的方法,本研究针对其gyrA基因设计了一对双启动寡核苷酸引物(DPO),建立了空肠弯曲菌DPO-PCR检测方法。试验结果显示,该方法的检测下限为1.2×10^2cfu/mL,在48℃~68℃退火温度范围内均可高... 为建立特异、快速检测空肠弯曲菌的方法,本研究针对其gyrA基因设计了一对双启动寡核苷酸引物(DPO),建立了空肠弯曲菌DPO-PCR检测方法。试验结果显示,该方法的检测下限为1.2×10^2cfu/mL,在48℃~68℃退火温度范围内均可高效扩增靶基因片段,表明该方法退火温度范围宽,同时DPO引物特异性强,PCR反应过程中不会产生非特异性扩增。利用该方法对采集的184份样品进行检测,共计检出17份空肠弯曲菌阳性样品,经国标法(GB/T 4789.9-2008)复验,两者检测结果一致,显示了良好的实用性。该DPO-PCR方法设计简单、特异性强,为致病微生物的快速准确检测提供了新方法。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 GYRA基因 dpo-pcr
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应用DPO引物检测马铃薯病毒的多重RT-PCR技术研究 被引量:27
19
作者 刘梅 黄新 +2 位作者 马占鸿 陈洪俊 李明福 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期431-434,共4页
DPO is one of the new specific primers for virus detection.In this study,five sets of dual priming oligonucleotide(DPO) primers for Potato virus X(PVX),Potato virus Y(PVY),Potato virus V(PVV),Tobacco ring spot virus(T... DPO is one of the new specific primers for virus detection.In this study,five sets of dual priming oligonucleotide(DPO) primers for Potato virus X(PVX),Potato virus Y(PVY),Potato virus V(PVV),Tobacco ring spot virus(TRSV) and Cucumber mosaic virus(CMV) were designed and applied to the detection of the main potato viruses with multiplex reverse transcription polymerase chain reaction(m-RT-PCR),including two quarantine viruses in China(PVV and TRSV).The results showed that DPO-m-RT-PCR exhi-bited high PCR specificity and sensitivity even under less than optimal PCR condition compared with conventional m-RT-PCR.DPO-m-RT-PCR could be applied in the healthy evaluation of seed potato and its exit-entry quarantine. 展开更多
关键词 马铃薯病毒 病毒检测技术 PCR技术 检疫性有害生物 DPO RT 多重 引物
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基于DPO引物的实时荧光PCR检测微生物肥料中的鼠李糖乳杆菌 被引量:2
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作者 魏霜 孟茹 +5 位作者 乾义柯 孙凯 刘中勇 鄞杰平 周广彪 吴希阳 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期124-131,共8页
【目的】建立一种快速、准确的鼠李糖乳杆菌检测方法。【方法】根据已报道的鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)的gyr B基因保守序列,设计用于检测鼠李糖乳杆菌的特异性DPO引物,结合SYBR Green I实时荧光PCR技术,建立鼠李糖乳杆菌... 【目的】建立一种快速、准确的鼠李糖乳杆菌检测方法。【方法】根据已报道的鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)的gyr B基因保守序列,设计用于检测鼠李糖乳杆菌的特异性DPO引物,结合SYBR Green I实时荧光PCR技术,建立鼠李糖乳杆菌的实时荧光PCR检测方法,评价其特异性和灵敏度,并将建立的检测方法用于实际样品的检测中。【结果】该方法对2株鼠李糖乳杆菌能得到阳性扩增,而其余10种乳酸菌及阴性对照没有扩增曲线,而且在退火温度为50~60℃不影响其特异性;该实时荧光PCR检测灵敏度比农业部标准中普通PCR检测高10倍;用10种微生物肥料及其它益生菌产品进行了验证,检出情况与产品标识一致。【结论】研究建立的SYBR GreenⅠ实时荧光PCR能够准确、高效的检测微生物肥料及其他益生菌产品中的鼠李糖乳杆菌。 展开更多
关键词 鼠李糖乳杆菌 实时荧光PCR DPO引物 检测
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