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基于多个扩增子的DNA metabarcoding技术探究黄海微型真核浮游植物多样性
被引量:
5
1
作者
张莉
张远
+1 位作者
林佳宁
王书平
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期4052-4060,共9页
微型真核浮游植物是海洋生态系统中能量流动和物质循环的关键环节,对维持海洋生态系统的稳定发挥着关键的作用.本研究首次应用DNA metabarcoding技术探讨黄海微型真核浮游植物的物种组成及多样性,对比分析ITS、18SrDNAV4和18SrDNAV9扩...
微型真核浮游植物是海洋生态系统中能量流动和物质循环的关键环节,对维持海洋生态系统的稳定发挥着关键的作用.本研究首次应用DNA metabarcoding技术探讨黄海微型真核浮游植物的物种组成及多样性,对比分析ITS、18SrDNAV4和18SrDNAV9扩增子条件下微型真核浮游植物的群落结构及多样性水平,并探讨了其多样性与温度、盐度的响应关系.结果表明:①基于ITS扩增子获得的微型真核浮游植物中绿藻门所占比例较高,而基于18SrDNAV4和18SrDNAV9扩增子获得的甲藻门相对丰度较高.②基于18SrDNAV9扩增子获得的微型真核浮游植物的ACE、Chao1、Shannon和Simpson指数较ITS和18SrDNAV4扩增子更高,而且其门、纲、目和科的数目较高.③黄海微型真核浮游植物的Shannon指数与温度呈现出显著正相关的关系(P<0.01),而与盐度呈现出显著负相关的关系(P<0.05).本研究通过对比不同扩增子条件下黄海微型真核浮游植物的群落结构及丰度特征,丰富了黄海微型真核浮游植物的认识,可为今后该海域微型真核浮游植物的生态学研究、生物多样性监测、生物资源动态变化及持续开发生产等方面的分析提供科学依据.
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关键词
微型真核浮游植物
dnametabarcoding
ITS
18SrDNAV4
18SrDNAV9
多样性
原文传递
题名
基于多个扩增子的DNA metabarcoding技术探究黄海微型真核浮游植物多样性
被引量:
5
1
作者
张莉
张远
林佳宁
王书平
机构
中国环境科学研究院河流生态保护与修复研究室
中国科学院生态环境研究中心
中国科学院大学
出处
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期4052-4060,共9页
基金
国家自然科学基金项目(41571050)
文摘
微型真核浮游植物是海洋生态系统中能量流动和物质循环的关键环节,对维持海洋生态系统的稳定发挥着关键的作用.本研究首次应用DNA metabarcoding技术探讨黄海微型真核浮游植物的物种组成及多样性,对比分析ITS、18SrDNAV4和18SrDNAV9扩增子条件下微型真核浮游植物的群落结构及多样性水平,并探讨了其多样性与温度、盐度的响应关系.结果表明:①基于ITS扩增子获得的微型真核浮游植物中绿藻门所占比例较高,而基于18SrDNAV4和18SrDNAV9扩增子获得的甲藻门相对丰度较高.②基于18SrDNAV9扩增子获得的微型真核浮游植物的ACE、Chao1、Shannon和Simpson指数较ITS和18SrDNAV4扩增子更高,而且其门、纲、目和科的数目较高.③黄海微型真核浮游植物的Shannon指数与温度呈现出显著正相关的关系(P<0.01),而与盐度呈现出显著负相关的关系(P<0.05).本研究通过对比不同扩增子条件下黄海微型真核浮游植物的群落结构及丰度特征,丰富了黄海微型真核浮游植物的认识,可为今后该海域微型真核浮游植物的生态学研究、生物多样性监测、生物资源动态变化及持续开发生产等方面的分析提供科学依据.
关键词
微型真核浮游植物
dnametabarcoding
ITS
18SrDNAV4
18SrDNAV9
多样性
Keywords
eukaryotic nano-phytoplankton
DNA metabarcoding
ITS
18S rDNA V4
18S rDNA V9
biodiversity
分类号
X171 [环境科学与工程—环境科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于多个扩增子的DNA metabarcoding技术探究黄海微型真核浮游植物多样性
张莉
张远
林佳宁
王书平
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019
5
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