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Identification of processed Chinese medicinal materials using DNA mini-barcoding 被引量:11
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作者 SONG Ming DONG Gang-Qiang +2 位作者 ZHANG Ya-Qin LIU Xia SUN Wei 《Chinese Journal of Natural Medicines》 SCIE CAS CSCD 2017年第7期481-486,共6页
Most of Chinese medicinal herbs are subjected to traditional processing procedures, including stir-frying, charring, steaming, boiling, and calcining before they are released into dispensaries. The marketing and ident... Most of Chinese medicinal herbs are subjected to traditional processing procedures, including stir-frying, charring, steaming, boiling, and calcining before they are released into dispensaries. The marketing and identification of processed medicinal materials is a growing issue in the marketplace. However, conventional methods of identification have limitations, while DNA mini-barcoding, based on the sequencing of a short-standardized region, has received considerable attention as a new potential means to identify processed medicinal materials. In the present study, six DNA barcode loci including ITS2, psb A-trn H, rbc L, mat K, trnL(UAA) intron and its P6 loop, were employed for the authentication of 45 processed samples belonging to 15 species. We evaluated the amplification efficiency of each locus. We also examined the identification accuracy of the potential mini-barcode locus, of trnL(UAA) intron P6 loop. Our results showed that the five primary barcode loci were successfully amplified in only 8.89%——20% of the processed samples, while the amplification rates of the trnL(UAA) intron P6 loop were higher, at 75.56% successful amplification. We compared the mini-barcode sequences with Genbank using the Blast program. The analysis showed that 45.23% samples could be identified to genus level, while only one sample could be identified to the species level. We conclude that trnL(UAA) p6 loop is a candidate mini-barcode that has shown its potential and may become a universal mini-barcode as complementary barcode for authenticity testing and will play an important role in medicinal materials control. 展开更多
关键词 dna barcoding trnL(UAA)intron P6 loop IDENTIFICATION PROCESSED MEDICINAL MATERIALS mini-barcode
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基于环境DNA技术的元江鱼类生物多样性研究
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作者 朱书礼 陈蔚涛 +3 位作者 李跃飞 武智 李捷 刘亚秋 《南方水产科学》 北大核心 2026年第1期60-73,共14页
元江是云南地区最主要的河流之一,拥有丰富的鱼类资源,近年来受人类活动影响,元江鱼类资源呈衰退趋势。本研究通过利用环境DNA(Environmental DNA,eDNA)技术对元江鱼类进行调查,为元江鱼类资源管理和保护提供基础数据。2023年10月在元... 元江是云南地区最主要的河流之一,拥有丰富的鱼类资源,近年来受人类活动影响,元江鱼类资源呈衰退趋势。本研究通过利用环境DNA(Environmental DNA,eDNA)技术对元江鱼类进行调查,为元江鱼类资源管理和保护提供基础数据。2023年10月在元江设置了16个站位采集水样,共检出鱼类47种,隶属于5目15科40属,包括红(鱼丕)(Bagarius rutilus)和斑鳠(Hemibagrus guttatus)等珍稀濒危鱼类,并检出8种外来鱼类。α多样性分析显示,各站位Shannon-Wiener指数为0.92~2.41,Simpson指数为0.44~0.88,Pielou均匀度指数为0.35~0.60,Margalef指数为0.30~1.16。采用层次聚类(Cluster)和非度量多维尺度分析(NMDS)方法对鱼类群落空间分布特征进行分析,结果显示鱼类群落在空间分布上存在差异,各站位从下游至上游分为3组,表现为在地理空间上相近的站位聚在一起。通过相似性百分比分析(SIMPER)物种对各组间差异的贡献,结果表明翘嘴鲌(Culter alburnus)、宽额鳢(Channa gachua)、鲮(Cirrhinus molitorella)和棒花鱼(Abbottina rivularis)等是造成各组间差异的主要种类。采用冗余分析方法(RDA)分析了鱼类多样性与环境因子的关系,发现元江鱼类群落主要受海拔、盐度、电导率、总溶解固体、氧化还原电位和总磷等环境因子影响。研究表明,环境DNA技术可有效分析元江鱼类的种类组成和分布,是开展元江鱼类生物多样性监测和保护的重要手段。 展开更多
关键词 环境dna(edna) 鱼类多样性 群落结构 环境因子 元江
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基于共价闭合环状DNA动力学的慢性乙型肝炎治疗策略
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作者 胡接力 黄爱龙 《临床肝胆病杂志》 北大核心 2026年第1期14-20,共7页
实现慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染的普遍治愈,是乙型肝炎研究领域的最高目标。深入探索HBV感染治愈的可能途径,对于明确关键研究方向具有重要意义。共价闭合环状DNA(cccDNA)作为HBV复制循环中最难以被清除的遗传物质,既是实现治愈的主要障... 实现慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染的普遍治愈,是乙型肝炎研究领域的最高目标。深入探索HBV感染治愈的可能途径,对于明确关键研究方向具有重要意义。共价闭合环状DNA(cccDNA)作为HBV复制循环中最难以被清除的遗传物质,既是实现治愈的主要障碍,也是构建治愈策略分析框架的核心基点。本文在概述“cccDNA动力学”思维框架的基础上,进一步阐释其核心内涵,并以此为依据系统探讨论述促进cccDNA衰减的关键策略。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 共价闭合环状dna 治疗学
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基于形态学和DNA条形码的青藏高原东缘鼢鼠物种鉴定
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作者 蔡振媛 孔虹颖 +8 位作者 何振邦 宋鹏飞 郭凡 李斌 梁程博 胡天石 徐波 林中原 张同作 《兽类学报》 北大核心 2026年第1期116-128,共13页
物种分类和鉴定是生物学研究的基石,综合分子生物学和经典分类学方法进行物种鉴定可提高结果可靠性。本研究采用传统形态学和线粒体细胞色素b基因(Cyt b)序列对青藏高原东缘青海省海东市平安区采集的74个鼢鼠样本进行物种鉴定。头骨形... 物种分类和鉴定是生物学研究的基石,综合分子生物学和经典分类学方法进行物种鉴定可提高结果可靠性。本研究采用传统形态学和线粒体细胞色素b基因(Cyt b)序列对青藏高原东缘青海省海东市平安区采集的74个鼢鼠样本进行物种鉴定。头骨形态鉴定结果显示,尾巴被稀疏短白毛的鼢鼠个体(Pac)为甘肃鼢鼠(Eospalax cansus),而尾巴被密毛的个体(Pab)为高原鼢鼠(Eospalax baileyi)。74个鼢鼠样本的Cyt b序列共定义了25个单倍型,结合GenBank中8种鼢鼠的Cyt b序列进行分析,在构建的系统发育树中,已知8种鼢鼠序列各自聚为1个单系群,平安区Pab的16个单倍型与已知高原鼢鼠聚为一支,Pac的8个单倍型与已知甘肃鼢鼠聚为一支。遗传距离结果显示,Pac与已知甘肃鼢鼠遗传距离小于与其他物种的遗传距离(P<0.001),Pab与已知高原鼢鼠的遗传距离小于与其他物种的遗传距离(P<0.001)。Cyt b基因分析和形态鉴定结果一致,Cyt b是鼢鼠鉴定的一个有效的DNA条形码基因。综合形态学和DNA条形码鉴定结果,平安区分布着2种鼢鼠:甘肃鼢鼠和高原鼢鼠。在地理分布上,甘肃鼢鼠主要分布在平安区北部邻近黄土高原海拔相对较低的区域,高原鼢鼠则分布在南部邻近青藏高原海拔相对较高的区域。本研究加深了对平安区鼢鼠物种组成和分布特征的了解,并为解决鼢鼠物种形态鉴定难的问题提供了DNA条形码解决方案。 展开更多
关键词 dna条形码技术 鼢鼠 Cyt b 形态 系统发育 遗传距离
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两个镍配合物的结构、抑菌活性及与DNA的相互作用
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作者 季甲 姚腾奇 +5 位作者 邓文钱 石文婧 吕璇 田琳 辛晓艳 侯银玲 《无机化学学报》 北大核心 2026年第1期78-86,共9页
通过原位反应,设计合成了2例配合物[Ni(HL_(1))_(2)]·CH_(3)CN·CH_(3)OH(1)和[Ni(L2)2](2),其中H_(2)L_(1)=2-羟基苯甲酸(6-甲氧基-吡啶-2-基亚甲基)-肼,HL2=4-溴-2-[(6-甲氧基吡啶-2-基亚甲基)-氨基]-苯酚。单晶X射线衍射分... 通过原位反应,设计合成了2例配合物[Ni(HL_(1))_(2)]·CH_(3)CN·CH_(3)OH(1)和[Ni(L2)2](2),其中H_(2)L_(1)=2-羟基苯甲酸(6-甲氧基-吡啶-2-基亚甲基)-肼,HL2=4-溴-2-[(6-甲氧基吡啶-2-基亚甲基)-氨基]-苯酚。单晶X射线衍射分析表明:配合物1和2均具有以二价镍离子为中心的单核零维结构。打孔抑菌圈实验数据表明,与单纯的过渡金属镍离子相比,配合物1和2表现出更强的抑菌活性。采用紫外可见光谱法、循环伏安法和荧光光谱法研究了配合物1和2与小牛胸腺DNA(CTDNA)之间的相互作用,结果表明2个配合物均通过插入作用模式与CTDNA结合。 展开更多
关键词 Ni配合物 原位合成 晶体结构 生物活性 dna相互作用
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基于环境DNA的河-湖水生态调查与评估研究进展
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作者 魏源送 蔡佳琳 +5 位作者 谢阳村 张耀方 程楷文 薛万来 魏明海 张俊亚 《环境科学学报》 北大核心 2026年第1期1-22,共22页
环境DNA(eDNA)技术通过分析环境样品中的遗传物质,为水生态监测与评估带来了革命性进展,实现了非侵入性、高灵敏度及多物种同步检测.本综述系统梳理并总结了近年来eDNA技术在河湖水生态调查与评估应用全链条—从eDNA信号的产生与环境行... 环境DNA(eDNA)技术通过分析环境样品中的遗传物质,为水生态监测与评估带来了革命性进展,实现了非侵入性、高灵敏度及多物种同步检测.本综述系统梳理并总结了近年来eDNA技术在河湖水生态调查与评估应用全链条—从eDNA信号的产生与环境行为到样本采集、实验分析、数据解读及模型应用的关键研究进展,并剖析了面临的核心科学问题与技术挑战.当前,eDNA技术在生物多样性评估、濒危物种追踪、外来种入侵预警及生态修复评价等方面已展现出显著应用潜力,但其可靠性与推广仍面临eDNA信号环境动态复杂、参考数据库不完整、引物通用性与特异性难以兼顾、以及生物信息分析流程标准化不足等挑战.区别于其它综述,本文不仅全面覆盖各环节的现状与瓶颈,更从标准化建设、技术方法革新、数据资源共享、多源信息融合及智能化决策支持等维度,前瞻性地展望了该领域未来的发展方向与系统性解决方案的构建框架,以期为科研工作者深入把握eDNA技术的最新进展与未来趋势提供参考,从而助力该领域的技术优化与标准化进程. 展开更多
关键词 环境dna(edna) 水生态系统 生物多样性监测 宏条形码 参考数据库 标准化
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补肾方剂治疗男性不育症患者精子DNA损伤的系统综述和meta分析
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作者 刘涛 赵琦 +4 位作者 杨朝旭 徐琰 孙志兴 陈赟 陈建淮 《中华男科学杂志》 2026年第1期52-60,共9页
目的运用meta分析方法系统评价补肾方剂治疗男性不育症患者精子DNA损伤(SDF)的有效性和安全性。方法从中国知网、维普、万方、PubMed、Cochrane Library、Embase、Web of Science数据库中检索补肾方剂改善SDF的随机对照试验(RCT)研究,... 目的运用meta分析方法系统评价补肾方剂治疗男性不育症患者精子DNA损伤(SDF)的有效性和安全性。方法从中国知网、维普、万方、PubMed、Cochrane Library、Embase、Web of Science数据库中检索补肾方剂改善SDF的随机对照试验(RCT)研究,对文献进行方法学质量评价,运用RevMan5.3.5软件进行meta分析,并对结局指标进行GRADE质量分级。结果共纳入17项RCT研究,涉及2164例男性患者。与西医常规治疗相比,补肾方剂能够显著改善男性不育症患者DNA碎片指数(DFI)(MD=-6.50,95%CI:-7.88~-5.11,P<0.01),提高配偶妊娠率(RR=2.11,95%CI:1.12~4.00,P=0.87)、精子总活率(MD=5.56,95%CI:4.39~6.74,P<0.01)、前向运动精子百分率(MD=6.82,95%CI:5.62~8.03,P<0.01)、精子浓度(MD=6.51,95%CI:3.81~9.21,P<0.01)和正常形态精子百分率(MD=1.26,95%CI:0.45~2.06,P<0.01),且补肾方剂不会增加不良反应的发生。结论低到中等质量证据表明,与西医常规治疗相比,补肾方剂在改善男性不育症患者DFI、精液参数、配偶妊娠率等方面具有一定优势,且安全性较好。 展开更多
关键词 精子dna损伤 精子dna碎片指数 男性不育症 补肾方剂 META分析
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基于周期阻滞和氧化⁃抗氧化失衡研究槟榔碱致小鼠骨髓细胞DNA损伤的机制
8
作者 于蕾 于晶涵 +6 位作者 宋辉 郎朗 马瑗晗 龚艳朝 张小坡 张彩云 王正文 《海南医科大学学报》 北大核心 2026年第2期89-95,共7页
目的:研究槟榔碱(arecoline,ARC)体内对小鼠骨髓细胞DNA的损伤作用,并探讨其作用机制。方法:采用单细胞凝胶电泳实验分析ARC对小鼠骨髓细胞DNA损伤作用。采用流式细胞术、DCFH-DA荧光染色、罗丹明123染色等方法对小鼠骨髓细胞的细胞周期... 目的:研究槟榔碱(arecoline,ARC)体内对小鼠骨髓细胞DNA的损伤作用,并探讨其作用机制。方法:采用单细胞凝胶电泳实验分析ARC对小鼠骨髓细胞DNA损伤作用。采用流式细胞术、DCFH-DA荧光染色、罗丹明123染色等方法对小鼠骨髓细胞的细胞周期,超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性和谷胱甘肽(glutathione,GSH)、丙二醛(malondial dehyde,MDA)、活性氧(reactive oxygen species,ROS)含量,线粒体膜电位(Δψm),p53蛋白含量进行分析。结果:给予ARC1/2 LD_(50)剂量可引起小鼠骨髓细胞DNA损伤,与空白组相比拖尾现象较严重。随着ARC给药剂量的增加,G_(0)/G_(1)期的细胞比例明显增加(P<0.01),使骨髓细胞周期停滞在G_(0)/G_(1)期。ARC作用小鼠骨髓细胞后,SOD活性和GSH含量明显降低(P<0.01),MDA和ROS含量明显升高(P<0.01),并且随着ARC浓度增加,Δψm明显降低(P<0.01)。ARC给药组骨髓细胞内p53蛋白含量随给药剂量的增加而明显升高(P<0.01),呈一定的剂量依赖关系。结论:ARC能造成小鼠骨髓细胞DNA损伤,可增加p53蛋白表达诱导小鼠骨髓细胞周期阻滞在G_(0)/G_(1)期,引起Δψm降低,ROS增加,脂质过氧化增强,抗氧化功能受到严重损害,氧化和抗氧化失衡,这些是ARC引起小鼠骨髓细胞DNA损伤的机制。 展开更多
关键词 槟榔碱 骨髓细胞 dna损伤 G_(0)/G_(1)期阻滞 氧化-抗氧化失衡
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阿昔洛韦抑制EB病毒裂解引发的DNA损伤
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作者 刘剑 姚友恒 +2 位作者 邱红梅 刘益飞 李燊 《交通医学》 2026年第1期6-8,12,共4页
目的:研究阿昔洛韦抑制EB病毒裂解引发的DNA损伤作用。方法:以人类伯基特淋巴瘤细胞系Akata与Daudi细胞为研究对象,对照组采用200 nmol/L佛波酯(12-O-tetradecanoylphorbol 13-acetate,TPA)诱导Akata细胞,200 nmol/L TPA联合3 mmol/L丁... 目的:研究阿昔洛韦抑制EB病毒裂解引发的DNA损伤作用。方法:以人类伯基特淋巴瘤细胞系Akata与Daudi细胞为研究对象,对照组采用200 nmol/L佛波酯(12-O-tetradecanoylphorbol 13-acetate,TPA)诱导Akata细胞,200 nmol/L TPA联合3 mmol/L丁酸钠(sodium butyrate,NaB)诱导Daudi细胞0、6、24和48 h,实验组再同时向培养基中加入50μmol/L阿昔洛韦共孵育48 h。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法测定细胞中EB病毒裂解基因BZLF1、BMRF1和BLLF1的表达水平;采用Western Blot法测定细胞中BZLF1、γH2AX蛋白表达水平。结果:TPA和NaB诱导Akata和Daudi细胞0、6、24和48 h后,细胞中BZLF1、BMRF1和BLLF1基因表达水平较诱导前显著增加,差异均有统计学意义(P<0.05)。Western Blot结果显示,Akata细胞和Daudi细胞中EB病毒由潜伏转为裂解状态后,BZLF1与DNA损伤相关蛋白γH2AX表达显著增加,阿昔洛韦干预后γH2AX与BZLF1蛋白表达显著降低。结论:阿昔洛韦可抑制EB病毒裂解引发的DNA损伤,为阿昔洛韦治疗EB病毒相关疾病提供新思路。 展开更多
关键词 阿昔洛韦 EB病毒 裂解 dna损伤
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科学思维视角下的高中生物学情境教学研究——以“重组DNA技术的基本工具”教学为例
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作者 刘会坚 魏梅红 《福建基础教育研究》 2026年第1期134-136,140,共4页
根据建构主义学习理论有关情境教学论述,以“重组DNA技术的基本工具”教学为例,通过创设系列任务情境,激发学生认知冲突,引导学生动手构建模型,深化理解。通过探究、质疑、评价与反思,突破学习难点,优化思维路径,培养学生归纳与概括、... 根据建构主义学习理论有关情境教学论述,以“重组DNA技术的基本工具”教学为例,通过创设系列任务情境,激发学生认知冲突,引导学生动手构建模型,深化理解。通过探究、质疑、评价与反思,突破学习难点,优化思维路径,培养学生归纳与概括、模型与建模、批判性思维、创造性思维等科学思维。 展开更多
关键词 科学思维 情境教学 重组dna技术 建模 批判性思维
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自己“组装”DNA链置换计算机——人工智能和仿真软件支持下的跨学科学习案例
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作者 陈凯 《中国信息技术教育》 2026年第1期27-31,共5页
DNA链置换是实现分子逻辑门进而实现较复杂的DNA计算的一种方法,DNA计算问题天然具有跨学科特征,人工智能工具和仿真软件的支持,对学习者在实施相关跨学科学习过程中消除学科壁垒、降低认知负荷起到很大的作用。本文以构造2-4二进制解... DNA链置换是实现分子逻辑门进而实现较复杂的DNA计算的一种方法,DNA计算问题天然具有跨学科特征,人工智能工具和仿真软件的支持,对学习者在实施相关跨学科学习过程中消除学科壁垒、降低认知负荷起到很大的作用。本文以构造2-4二进制解码器为例,阐述和分析在当前已有技术支持下,生成式人工智能工具和仿真软件在DNA计算相关跨学科学习过程中可能发挥的作用、优势以及弱点。 展开更多
关键词 dna链置换 生成式人工智能 仿真软件
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人工智能在DNA设计中的研究进展
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作者 刘欢 郭发旭 +4 位作者 赵晓燕 黄龙雨 王健 周国民 张建华 《生物技术通报》 北大核心 2026年第1期51-66,共16页
DNA设计是根据特定功能需求定向构建与优化基因组功能元件,已成为合成生物学与精准育种等前沿领域的关键核心技术。传统设计方法受限于对复杂调控网络认知不足及序列搜索空间巨大等瓶颈,难以实现高效、精准的序列创新。近年来,人工智能... DNA设计是根据特定功能需求定向构建与优化基因组功能元件,已成为合成生物学与精准育种等前沿领域的关键核心技术。传统设计方法受限于对复杂调控网络认知不足及序列搜索空间巨大等瓶颈,难以实现高效、精准的序列创新。近年来,人工智能技术,特别是深度生成模型与预测模型的融合应用,正深刻重塑DNA设计的理论基础与技术范式。该范式通过学习海量组学数据中蕴含的“调控语法”,能够在超长基因组序列背景下实现高分辨率的功能预测、多模态信息整合与条件可控的序列生成。本文系统综述了人工智能在DNA设计中的前沿进展,重点阐述了深度生成与预测模型在启动子、增强子等多层级调控元件设计、序列优化及作物育种等领域的关键技术路径与应用实例。通过构建“设计—预测—优化—验证”的智能化闭环,人工智能不仅显著提升了复杂功能元件的设计效率与准确性,更催生了性能超越天然元件的“超天然”序列。展望未来,随着人工智能与合成生物学、实验自动化等领域的深度融合,DNA设计有望实现从智能化设计到高通量实验验证的完整闭环,从而加速生命科学基础研究与现代农业育种等领域的创新突破。 展开更多
关键词 人工智能 dna设计 生成模型 预测模型
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高品质花生DNA提取:CTAB法改良及多维度品质评价
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作者 田冬冬 杜龙 +3 位作者 赵星睿 王柏林 刘爱民 曲明静 《花生学报》 北大核心 2026年第1期123-132,共10页
花生叶片富含多酚、多糖及其他次生代谢物,常规方法或商品化试剂盒无法从中提取高品质DNA,严重阻碍了花生分子生物学研究。本研究以传统CTAB法为基础,根据CTAB裂解液各组分在DNA提取过程中所发挥的作用,以及细胞中DNA和多酚、多糖等物... 花生叶片富含多酚、多糖及其他次生代谢物,常规方法或商品化试剂盒无法从中提取高品质DNA,严重阻碍了花生分子生物学研究。本研究以传统CTAB法为基础,根据CTAB裂解液各组分在DNA提取过程中所发挥的作用,以及细胞中DNA和多酚、多糖等物质在空间上的相分离特性,进行改良优化。首先用PVP和高浓度EDTA组成预处理液,对花生组织进行预处理,从源头上阻断酚类氧化,去除过量多酚、多糖等杂质的同时,有效降低了花生叶片组织黏度;再用高浓度CTAB(3×)裂解液对预处理后的花生组织进行裂解,可以彻底清除蛋白及中性多糖等杂质。结果表明,相比传统CTAB法,改良CTAB法提取的花生叶片基因组DNA纯度极高,OD_(260)/OD_(280)值为1.8~1.9,OD_(260)/OD_(230)值大于2.0,并且提取结果稳定性好;DNA完整性高,能有效扩增出4 kb左右大片段DNA序列;DNA稳定性得到提升,室温(25℃)放置2个月无明显降解迹象。同时,改良CTAB法DNA提取效率大大提升,10 mg叶片即可获得3μg总DNA,即使使用衰老叶片也能高效提取到高品质DNA。上述研究表明,改良CTAB法提高了花生基因组DNA的纯度、完整性、稳定性和提取效率,适合应用于花生分子生物学研究,尤其是珍稀材料的遗传鉴定,同时为富含多酚、多糖等次生代谢产物样本DNA的提取提供了重要参考。 展开更多
关键词 花生叶片 dna提取 改良CTAB法 多酚 多糖
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基于CAPS分子标记构建蒙农S007饲用大豆DNA指纹图谱
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作者 高佳荷 唐芳 +3 位作者 王勇 索荣臻 王明玖 罗四维 《中国草地学报》 北大核心 2026年第2期19-27,共9页
为提高饲用大豆品种鉴定的准确性与检测效率,本研究以内蒙古农业大学新育成品种蒙农S007饲用大豆(简称S007)为研究对象,以其亲本野大豆和其他饲用大豆品种(品系)为对照,并选取6个国内外广泛应用的栽培大豆品种作为验证材料。基于全基因... 为提高饲用大豆品种鉴定的准确性与检测效率,本研究以内蒙古农业大学新育成品种蒙农S007饲用大豆(简称S007)为研究对象,以其亲本野大豆和其他饲用大豆品种(品系)为对照,并选取6个国内外广泛应用的栽培大豆品种作为验证材料。基于全基因组重测序数据,筛选可被限制性内切酶酶切的SNP位点,开发稳定的酶切扩增多态性序列(Cleaved amplified polymorphic sequences,CAPS)分子标记,验证其稳定性和有效性,并构建可明确区分S007的DNA指纹图谱。研究结果表明,4个CAPS分子标记的SNP位点分别为:大豆6号染色体46861483位置的T-C突变在S006和S007中可被BglⅡ酶切;9号染色体47583653位置的C-A突变在野大豆和S007中不可被BglⅡ酶切;9号染色体50331067位置的T-C突变在S003和S007中不可被BglⅡ酶切;11号染色体8555794位置的C-G突变在S007和黑豆8-4-1中可被BglⅡ酶切。由此构建的蒙农S007饲用大豆的指纹图谱分子标记模式为“+——+(—)”(“+”表示可酶切,“-”表示不可酶切,“(—)”表示杂合),具备高度的品种特异性。基于上述4个CAPS标记构建的指纹图谱,可完全区分包括S007在内的9个参试大豆品种。本研究建立的方法为饲用大豆品种鉴定提供了一种高效、精准且低成本的技术方案,可为新品种审定、推广及其他植物指纹图谱构建提供参考。 展开更多
关键词 饲用大豆 CAPS分子标记 dna指纹图谱 品种鉴定
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广东省12个淡水国家级水产种质资源保护区鱼类DNA条形码数据库构建
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作者 时贤 朱书礼 +7 位作者 刘亚秋 武智 夏雨果 杨计平 帅方敏 李跃飞 李捷 陈蔚涛 《南方水产科学》 北大核心 2026年第1期47-59,共13页
为从分子层面评估广东省国家级水产种质资源保护区的鱼类多样性,本研究从12个保护区采集了550尾鱼类样本,经形态学初步鉴定分属9目16科53属共69种。通过对线粒体COI基因进行DNA条形码测序,并结合系统发育树、遗传距离与网状进化分析,构... 为从分子层面评估广东省国家级水产种质资源保护区的鱼类多样性,本研究从12个保护区采集了550尾鱼类样本,经形态学初步鉴定分属9目16科53属共69种。通过对线粒体COI基因进行DNA条形码测序,并结合系统发育树、遗传距离与网状进化分析,构建了保护区鱼类DNA条形码参考数据库。结果显示,该数据库的物种鉴定成功率达98.55%(68/69),证实了其可靠性。物种界定分析揭示了鲤(Cyprinus carpio)、红鳍原鲌(Cultrichthys erythropterus)、大鳍鳠(Hemibagrus macropterus)等7个物种形成了2~4个分子可操作单元(Molecular operational taxonomic units,MOTUs),且单元间的遗传距离较大,提示可能存在隐存种多样性,其原因或与水系隔离、华南地区复杂地质历史活动、人工放流、错误分类等因素有关;相反,海南鲌(Culter recurviceps)和翘嘴鲌(C.alburnus)、伽利略罗非鱼(Sarotherodon galilaeus)与奥利亚罗非鱼(Oceochromis aureus)之间的遗传距离小且共享1个MOTU,显示出近期分化的特征。综上,本研究构建了广东省内国家级水产种质资源保护区淡水鱼类DNA条形码数据库,并揭示了其中被形态学鉴定所低估的隐存多样性,为后续的鱼类资源保护与管理提供了重要科学依据。 展开更多
关键词 dna条形码 COI基因 鱼类多样性 国家级水产种质资源保护区 隐存种
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DNA甲基化在过敏性鼻炎发病机制中的作用
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作者 徐海艳 杨晓喆 +1 位作者 王向东 张罗 《科学通报》 北大核心 2026年第5期1113-1121,共9页
变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)是一种由免疫球蛋白E(immunoglobulin E,IgE)介导的鼻黏膜慢性炎性疾病,其全球患病率呈持续上升趋势.DNA甲基化是AR环境-基因交互作用的核心环节之一,作为连接环境暴露与遗传易感性、基因调控的关键表... 变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)是一种由免疫球蛋白E(immunoglobulin E,IgE)介导的鼻黏膜慢性炎性疾病,其全球患病率呈持续上升趋势.DNA甲基化是AR环境-基因交互作用的核心环节之一,作为连接环境暴露与遗传易感性、基因调控的关键表观遗传学方式,其在AR发病机制中的作用逐步明确.本综述从遗传背景、环境暴露及分子层面系统梳理DNA甲基化对AR的调控作用及机制,为AR疾病风险预测、精准分型及表观遗传治疗策略的后续研究奠定理论基础. 展开更多
关键词 dna甲基化 过敏性鼻炎 环境因素 炎症
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基于eDNA宏条形码的蜈支洲岛增殖放流鱼类跟踪监测初探
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作者 马成丹 章翔 +5 位作者 姜守松 邓升铭 欧徽龙 郭伟良 周永灿 李建龙 《南方水产科学》 北大核心 2026年第1期84-92,共9页
鱼类增殖放流是海洋牧场建设的核心手段之一。环境DNA(Environmental DNA,eDNA)宏条形码技术具有采样便捷、物种鉴定准确等优势,且能较好地反映鱼类物种多样性,与鱼类相对生物量之间存在良好的相关性。探索增殖放流鱼类eDNA在放流海域... 鱼类增殖放流是海洋牧场建设的核心手段之一。环境DNA(Environmental DNA,eDNA)宏条形码技术具有采样便捷、物种鉴定准确等优势,且能较好地反映鱼类物种多样性,与鱼类相对生物量之间存在良好的相关性。探索增殖放流鱼类eDNA在放流海域中的扩散规律,有助于未来利用eDNA技术开展鱼类增殖放流效果的科学评估。本研究选址三亚蜈支洲岛海洋牧场,于鱼类增殖放流前1 d(D1)及放流后1 d(D2)、4 d(D3)、7 d(D4)、16 d(D5)和45 d(D6)进行水样采集,利用eDNA宏条形码技术描述川纹笛鲷(Lutjanus sebae)、红鳍笛鲷(L.erythropterus)和点带石斑鱼(Epinephelus coioides)的扩散动态特征。结果显示,放流前水样中未检测到增殖鱼类,川纹笛鲷也仅在D3于核心区的IN2站位采集的水样中被检出,而其他2种鱼在各时间、地点均未检出。增殖放流后D2和D3获得的鱼类群落结构与D1无显著差异(p>0.05,r<0.08),而D4、D5和D6的鱼类群落结构与D1均存在显著差异(p<0.05,r>0.7)。研究表明,增殖放流鱼类在海区检出率低,增殖放流效果差,可能与鱼类未经驯化或放流鱼类的eDNA浓度受环境因素影响有关。 展开更多
关键词 环境dna宏条形码 增殖放流 鱼类群落结构 扩散规律 蜈支洲岛
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泥鳅DNA甲基转移酶基因家族结构及时空表达
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作者 向玉梅 苏君晓 +1 位作者 曾燏 周小云 《华中农业大学学报》 北大核心 2026年第1期255-265,共11页
为深入解析DNA甲基化对泥鳅等硬骨鱼类基因表达调控的作用机制,基于转录组测序数据,用hiTAIL-PCR技术克隆获得泥鳅DNA甲基转移酶基因家族dnmts的启动子序列,并用qRT-PCR和原位杂交技术分析dnmts的时空表达特征。结果显示,维持甲基化酶dn... 为深入解析DNA甲基化对泥鳅等硬骨鱼类基因表达调控的作用机制,基于转录组测序数据,用hiTAIL-PCR技术克隆获得泥鳅DNA甲基转移酶基因家族dnmts的启动子序列,并用qRT-PCR和原位杂交技术分析dnmts的时空表达特征。结果显示,维持甲基化酶dnmt1与从头甲基化酶dnmt3s的亚细胞定位、N端调控结构域存在较大的差异,dnmt1的调控域包含DMAP、PBD、CXXC和BAH保守结构域,而dnmt3s包含PWWP、ADD或CH结构域,提示dnmt1和dnmt3s间存在较大的功能分化。在4个dnmts的启动子序列上,均预测到典型元件TATA-box,以及CREB、Egr-1、Pit-1等与胚胎发育、生长、繁殖等相关的转录因子结合位点。4个dnmts的表达量均与发育阶段相关、呈动态变化,在卵裂期到囊胚期的快速卵裂阶段,dnmt1高表达,而在胚胎后期的器官分化阶段,dnmt3aa和dnmt3ab高表达。在成鱼阶段,dnmt1在性腺中高表达,dnmt3aa和dnmt3ab在脑中高表达,而dnmt3b在性腺、脑和肌肉中均有较高的表达水平。Dnmts的表达呈明显的性别二态性,dnmt1和dnmt3b在卵巢中高表达,而dnmt3aa和dnmt3ab则在精巢中高表达。原位杂交结果显示,dnmt3aa在卵巢的生殖细胞和体细胞中均有表达,而dnmt3ab仅在卵巢的体细胞中表达。以上结果表明,泥鳅dnmts各成员之间存在功能分化,并在特定的发育阶段和组织中发挥重要功能。 展开更多
关键词 泥鳅 dna甲基化 dna甲基转移酶 基因结构和功能 基因表达调控
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基于多足DNA步行器和主客体技术的可再生电化学生物传感器用于心梗microRNA的高灵敏检测
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作者 代志江 单腾腾 +2 位作者 李益和 杨建梅 赵焱 《高等学校化学学报》 北大核心 2026年第3期46-55,共10页
基于多足DNA步行器和主客体技术,构建了高灵敏检测miRNA-133a-5p的可再生电化学生物传感器.在电极表面修饰还原氧化石墨烯-金纳米颗粒复合材料(rGO@AuNPs)以固定大量的β-环糊精(β-CD),构建了可再生传感界面.当miRNA-133a-5p存在时,其... 基于多足DNA步行器和主客体技术,构建了高灵敏检测miRNA-133a-5p的可再生电化学生物传感器.在电极表面修饰还原氧化石墨烯-金纳米颗粒复合材料(rGO@AuNPs)以固定大量的β-环糊精(β-CD),构建了可再生传感界面.当miRNA-133a-5p存在时,其触发3个发夹DNA探针自组装形成三足DNA步行器,同时置换出miRNA-133a-5p,使其循环参与反应,最终产生大量步行器.步行器高效剪切信号探针,释放出大量二茂铁(Fc)标记的单链DNA片段.这些片段通过主客体作用被电极表面的β-CD捕获,产生电流信号,从而实现对miRNA-133a-5p的高灵敏检测.由于目标物循环参与反应和三足DNA步行器的高效剪切效率,使传感器的检出限达19.7 fmol/L.同时,利用电化学可控调节Fc与β-CD间的主客体作用,可使传感器实现6次再生循环利用.本研究为心梗诊断提供了新平台,也为电化学生物传感器的再生利用提供了有效策略. 展开更多
关键词 电化学生物传感器 急性心肌梗死 dna步行器 miRNA-133a-5p 可再生
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基于eDNA技术的长江上游珍稀特有鱼类国家级自然保护区鱼类群落组成及多样性空间分布特征研究
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作者 王丽 李瑞娇 +5 位作者 杨瑾 杨威 张先炳 陈启亮 段聪 胡江 《水生态学杂志》 北大核心 2026年第1期151-161,共11页
探明禁捕初期长江上游保护区内鱼类群落组成和多样性空间分布特征,于2021年8月在保护区宜宾-江津河段设置24个采样点,使用eDNA技术对该河段进行了鱼类群落组成及鱼类多样性分布特征分析。结果显示,基于e DNA技术检测到64种鱼,隶属于6目1... 探明禁捕初期长江上游保护区内鱼类群落组成和多样性空间分布特征,于2021年8月在保护区宜宾-江津河段设置24个采样点,使用eDNA技术对该河段进行了鱼类群落组成及鱼类多样性分布特征分析。结果显示,基于e DNA技术检测到64种鱼,隶属于6目18科52属,包括国家Ⅱ级重点保护水生动物胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus)和其他10种长江上游特有鱼类,与传统捕捞方法相比珍稀特有鱼类检出率更高。在空间分布上,α多样性表现趋势相同,均表现为核心区河段多样性最高,实验区多样性最低;β多样性表明,长江上游保护区内鱼类组成存在差异,在核心区河段检测出较高的鱼类丰度。长江上游珍稀特有鱼类短身金沙鳅(Jinshaia abbreviata)、长薄鳅(Leptobotia elongata)、岩原鲤(Procypris rabaudi)、胭脂鱼、和圆筒吻鮈(Rhinogobio cylindricus)只在核心区监测到,说明其适宜生境分布狭窄。研究证明了eDNA技术作为一种不断探索的新方法,可以快速高效地监测保护区内鱼类组成及多样性特征,特别是针对传统调查方法难以捕获的珍稀特有鱼类仍具有较高的检测率。 展开更多
关键词 环境dna 鱼类群落组成 鱼类多样性 长江上游珍稀特有鱼类国家级自然保护区
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