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DDX39在胃低级别上皮内瘤变组织的表达及临床意义
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作者 邓秋萍 黎莉 +4 位作者 庄薇 刘正勇 魏涛 黄大强 杨卫文 《现代消化及介入诊疗》 2025年第3期272-275,281,共5页
目的 探讨DDX39在胃癌、胃低级别上皮内瘤变、慢性非萎缩性胃炎等不同组织中的表达情况及其临床意义。方法 纳入2019年1月至2022年1月就诊于贵阳市第二人民医院消化内科门诊及病房经胃镜检查及活检、组织病理检查证实的慢性非萎缩性胃炎... 目的 探讨DDX39在胃癌、胃低级别上皮内瘤变、慢性非萎缩性胃炎等不同组织中的表达情况及其临床意义。方法 纳入2019年1月至2022年1月就诊于贵阳市第二人民医院消化内科门诊及病房经胃镜检查及活检、组织病理检查证实的慢性非萎缩性胃炎(200例)、胃低级别上皮内瘤变(200例)、胃癌(150例)病例,收集相关临床资料及胃黏膜组织,采用免疫组化法检测组织中DDX39表达情况。对胃低级别上皮内瘤变患者胃镜下大体改变、组织病理学变化及活检组织中DDX39表达情况进行随访。结果 DDX39在胃癌、胃低级别上皮内瘤变中表达较慢性非萎缩性胃炎组显著增加,且DDX39在胃癌组织中表达高于胃低级别上皮内瘤变组织。随访200例胃低级别上皮内瘤患者胃镜下表现、组织中DDX39表达情况,平均随访时长为24月,发现7例发生病理升级,其中6例转化为胃高级别上皮内瘤变,1例转化为胃癌,发生病理升级的病例胃黏膜组织中DDX39的表达量高于未发生病理升级者。结论 DDX39在胃低级别上皮内瘤变组织中高表达。DDX39的表达量与其病理升级相关,DDX39可作为胃低级别上皮内瘤变预测其病理升级的指标,同时有望作为评估是否需要行内镜下治疗的一个重要标志物。 展开更多
关键词 胃低级别上皮内瘤变 ddx39 胃癌
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RNA解旋酶DDX39对肾透明细胞癌增殖的影响 被引量:2
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作者 李凤 翁文浩 +1 位作者 龙吟 李智 《同济大学学报(医学版)》 CAS 2014年第5期11-15,共5页
目的通过小干扰RNA沉默检测DDX39基因对肾透明细胞癌增殖的影响及其相关机制。方法应用脂质体转染法将DDX39-siRNA转染人肾透明细胞癌786-O细胞,试验设空白对照组、阴性对照组、小干扰RNA转染组(DDX39-siRNA)。应用实时荧光定量PCR和Wes... 目的通过小干扰RNA沉默检测DDX39基因对肾透明细胞癌增殖的影响及其相关机制。方法应用脂质体转染法将DDX39-siRNA转染人肾透明细胞癌786-O细胞,试验设空白对照组、阴性对照组、小干扰RNA转染组(DDX39-siRNA)。应用实时荧光定量PCR和Western印迹法检测DDX39-siRNA的干扰效率;MTT法和平板克隆形成实验检测DDX39对786-O细胞增殖的影响;Western印迹法检测细胞增殖指标PCNA;流式细胞术检测DDX39-siRNA干扰后786-O细胞周期的变化。结果与阴性对照组相比,转染DDX39-siRNA后,786-O细胞中DDX39 mRNA及其蛋白的表达水平明显下降,差异有统计学意义(P<0.05);DDX39-siRNA干扰后786-O细胞增殖能力受到抑制,克隆形成能力明显下降;S期细胞减少,G2/M期细胞百分比明显增加(P<0.05)。结论 DDX39敲减后可显著抑制肾癌细胞786-O细胞增殖,并阻滞细胞于G2/M期。 展开更多
关键词 ddx39基因 细胞增殖 端粒 RNA解旋酶
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刚地弓形虫RNA结合蛋白DDX39生物信息学分析 被引量:1
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作者 杨振科 王靖惠 +4 位作者 齐一鸣 田晓薇 梅雪芳 张振超 王帅 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期358-365,373,共9页
目的采用生物信息学技术对刚地弓形虫RNA结合蛋白DDX39(TgDDX39)进行分析,评估该蛋白的免疫原性,从而为研发弓形虫病疫苗提供参考依据。方法在ToxoDB数据库中检索TgDDX39氨基酸序列后,利用ProtParam、TMHMM 2.0、SignalP 5.0、NetPhos ... 目的采用生物信息学技术对刚地弓形虫RNA结合蛋白DDX39(TgDDX39)进行分析,评估该蛋白的免疫原性,从而为研发弓形虫病疫苗提供参考依据。方法在ToxoDB数据库中检索TgDDX39氨基酸序列后,利用ProtParam、TMHMM 2.0、SignalP 5.0、NetPhos 3.1、COILS、SOPMA、Phyre2、ProtScale、ABCpred、SYFPEITHI、DNASTAR等生物信息学软件预测TgDDX39蛋白的理化性质、蛋白跨膜结构域、信号肽位点、翻译后修饰位点、卷曲螺旋、二级和三级结构、亲疏水性及抗原表位。结果Tg DDX39蛋白是一种不稳定亲水性蛋白,分子式C_(2173)H_(3458)N_(598)O_(661)S_(18),含有434个氨基酸,预测分子量为49.1 kDa,理论等电点为5.55。预测该蛋白存在信号肽的可能性极低,无跨膜区,并含有27个磷酸化位点;TgDDX39蛋白二级结构中β转角和无规则卷曲占39.63%,有1个部位有形成卷曲螺旋的倾向,且TgDDX39蛋白含有多个B、T细胞抗原表位。结论生物信息学预测显示,TgDDX39蛋白具有高免疫原性、含有多种抗原表位,具有作为弓形虫病疫苗候选蛋白分子的潜力。 展开更多
关键词 刚地弓形虫 RNA结合蛋白 ddx39蛋白 生物信息学分析 免疫原性
原文传递
广西扶绥县人群DDX39基因单核苷酸多态性与肝癌家系遗传易感性的关系
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作者 任爱华 廖燕 +3 位作者 韦柳君 赵瑞强 魏斐斐 谢裕安 《中国癌症防治杂志》 CAS 2016年第6期344-348,共5页
目的 探讨广西扶绥县原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC,以下简称“肝癌”)高发家系人群DDX39基因rs12461754位点单核苷酸多态性与肝癌遗传易感性的相关性。方法 选取广西扶绥县20个肝癌高发家系共77例和10个正常对照家系... 目的 探讨广西扶绥县原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC,以下简称“肝癌”)高发家系人群DDX39基因rs12461754位点单核苷酸多态性与肝癌遗传易感性的相关性。方法 选取广西扶绥县20个肝癌高发家系共77例和10个正常对照家系共35名为研究对象,采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(matrix assisted laser desorption ionization-time of fight-mass, MALDI-TOF-MS)检测DDX39基因rs12461754位点在两组中的基因型和等位基因频率。结果 正常对照家系组人群DDX39 基因rs12461754 位点携带A等位基因型的个体发生肝癌的风险是G等位基因型个体的0.407倍(95%CI:0.125~1.326,P=0.136);在肝癌高发家系非肝癌组人群中,携带A等位基因型的个体发生肝癌的风险是G等位基因型个体的0.981倍(95%CI:0.298~3.326,P=0.976); DDX39基因rs12461754位点GG、AG、AA基因型在肝癌高发家系肝癌组、肝癌高发家系非肝癌组及正常对照家系组三组间相互比较,差异无统计学意义(P〉0.05)。结论 DDX39基因rs12461754位点单核苷酸多态性与广西扶绥县肝癌家系遗传易感性无明显相关性。 展开更多
关键词 肝肿瘤 ddx39基因 单核苷酸多态性 遗传易感性
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DDX39在胃癌组织中的表达及其与临床病理特征和预后的关系 被引量:3
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作者 熊建新 于立丽 《国际消化病杂志》 CAS 2019年第5期366-368,共3页
目的探索DDX39在胃癌组织中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法收集2015年6月至2017年6月在海南省第二人民医院接受手术治疗的91例胃癌患者的临床资料,应用免疫组织化学方法检测患者胃癌组织及癌旁正常组织(距肿瘤组织3 cm)中... 目的探索DDX39在胃癌组织中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法收集2015年6月至2017年6月在海南省第二人民医院接受手术治疗的91例胃癌患者的临床资料,应用免疫组织化学方法检测患者胃癌组织及癌旁正常组织(距肿瘤组织3 cm)中的DDX39表达,计算得出各组织中DDX39的光密度值(IOD)中位数,以此为界线将胃癌患者分为DDX39高表达组和低表达组,并探讨DDX39的表达与患者的临床病理特征和预后的相关性。结果 DDX39在胃癌组织中的表达水平明显高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。DDX39在胃癌组织中的表达与患者的病理分级和临床分期显著相关(P<0.05),而与性别、年龄、肿瘤大小、病理类型等未见明显相关。DDX39高表达的患者的术后2年累积生存率明显低于DDX39低表达患者,差异有统计学意义(χ^2=4.296,P=0.038)。结论 DDX39在胃癌组织中呈高表达,且其水平升高提示预后不良。 展开更多
关键词 胃癌 ddx39 免疫组织化学 生存分析
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DDX39及PODXL蛋白在胃癌中的表达及与病理特征的统计分析 被引量:2
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作者 何梓健 《解放军预防医学杂志》 CAS 2020年第6期64-66,共3页
目的分析胃癌组织中DDX39及PODXL蛋白的表达情况,并探讨DDX39及PODXL表达与病理特征的相关性。方法回顾性分析65例行手术治疗的胃癌患者的临床资料,以术中采集的胃癌组织为胃癌组,以术中采集的癌旁正常组织为癌旁组。对比两组DDX39及PO... 目的分析胃癌组织中DDX39及PODXL蛋白的表达情况,并探讨DDX39及PODXL表达与病理特征的相关性。方法回顾性分析65例行手术治疗的胃癌患者的临床资料,以术中采集的胃癌组织为胃癌组,以术中采集的癌旁正常组织为癌旁组。对比两组DDX39及PODXL蛋白表达阳性率,分析两组DDX39及PODXL在组织中H-SCORE评分差异;同时探讨DDX39及PODXL蛋白表达情况与临床病理特征的相关性。结果胃癌组DDX39及PODXL蛋白表达阳性率高于癌旁组(P<0.05),胃癌组DDX39及PODXL在组织中H-SCORE评分高于癌旁组(P<0.05)。同时,DDX39高表达组低分化者、TNM分期Ⅲ级及以上者高于低表达组(P<0.05),PODXL高表达组低分化者、TNM分期Ⅲ级及以上者高于低表达组(P<0.05)。而胃癌组织中DDX39及DPODXL表达与分化程度呈负相关、与TNM分期呈正相关(P<0.05)。结论胃癌组织中DDX39及PODXL蛋白表达明显升高,且其表达程度与分化程度呈负相关、与TNM分期呈正相关。 展开更多
关键词 ddx39蛋白 PODXL蛋白 胃癌 临床病理特征 相关性分析
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下调DDX39A对食管鳞癌细胞生物学行为的影响及其机制
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作者 胡玮彬 孙玄子 +1 位作者 张晓智 惠蓓娜 《山西医科大学学报》 CAS 2024年第1期1-12,共12页
目的探究DDX解旋酶39A(DEAD-box RNA helicases 39A,DDX39A)对食管鳞癌KYSE-150和TE-1细胞生物学行为的影响及作用机制。方法利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)分... 目的探究DDX解旋酶39A(DEAD-box RNA helicases 39A,DDX39A)对食管鳞癌KYSE-150和TE-1细胞生物学行为的影响及作用机制。方法利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)分析DDX39A在食管鳞癌肿瘤组织和正常组织中的表达差异。进一步在TCGA数据库中,采用Spearman相关分析(设置r>0.5,P<0.05)得到与DDX39A表达最相关基因,通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA),注释DDX39A在食管鳞癌中的生物学功能。通过慢病毒介导的短发夹RNA(shRNA)干扰技术下调DDX39A在食管鳞癌KYSE-150和TE-1细胞中的表达,并将细胞分为对照(shCtrl)组和DDX39A敲减(shDDX39A)组。利用qPCR和Western blot法检测敲减效率;利用Celigo法、克隆形成实验和MTT法检测KYSE-150和TE-1细胞的增殖能力和活力;利用流式细胞术检测KYSE-150和TE-1细胞的凋亡水平;利用Transwell实验检测KYSE-150和TE-1细胞的迁移和侵袭能力;利用裸鼠成瘤实验检测敲减DDX39A对体内肿瘤的作用。利用Western blot法筛选敲减DDX39A后KYSE-150细胞内蛋白表达水平显著变化的肿瘤相关经典通路分子。通过慢病毒转染法构建已筛选的分子CDH2(Cadherin 2)过表达的稳转细胞系,并将KYSE-150细胞分为shDDX39A+NC-OE组(转染shDDX39A慢病毒和过表达空载对照病毒)和shDDX39A+CDH2-OE组(转染shDDX39A慢病毒和过表达CDH2病毒)。利用Celigo法、MTT法和Transwell实验分别检测过表达CDH2对DDX39A敲减细胞增殖能力、活力以及转移能力的影响。结果与正常组织相比,食管鳞癌组织中DDX39A的表达显著上调(P<0.001)。DDX39A及其相关基因主要作用于遗传信息的翻译与加工和细胞凋亡等过程。与shCtrl组相比,shDDX39A组KYSE-150和TE-1细胞中DDX39A的mRNA和蛋白表达显著降低(P<0.01),KYSE-150和TE-1细胞增殖和细胞活力显著下降(P<0.001),KYSE-150和TE-1细胞的克隆形成能力显著降低(P<0.01),KYSE-150和TE-1细胞的凋亡水平显著升高(P<0.01),KYSE-150和TE-1细胞的迁移和侵袭能力显著下降(P<0.001)。裸鼠成瘤实验提示DDX39A敲减后瘤体的体积和质量均明显减少(P<0.001)。与shDDX39A+NC-OE组相比,shDDX39A+CDH2-OE组KYSE-150细胞的增殖、细胞活力以及转移能力均显著提高(P<0.001)。结论DDX39A可作为食管鳞癌诊治的新靶点,上调其表达可能通过诱导上皮间充质转化促进食管鳞癌细胞生长、迁移与侵袭。 展开更多
关键词 ddx39A 增殖 凋亡 迁移 侵袭 上皮间充质转化 食管鳞癌
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DDX39蛋白表达与结直肠癌预后的关系 被引量:3
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作者 马俊 常文军 张卫 《中华胃肠外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期336-341,共6页
目的研究结直肠癌组织中DDX39蛋白表达与患者预后的关系。方法收集2010年1月至2011年12月期间在上海海军军医大学附属长海医院肛肠外科接受外科手术的824例初治结直肠癌患者的临床资料及其术后肿瘤组织石蜡标本,选取其中38例患者的癌... 目的研究结直肠癌组织中DDX39蛋白表达与患者预后的关系。方法收集2010年1月至2011年12月期间在上海海军军医大学附属长海医院肛肠外科接受外科手术的824例初治结直肠癌患者的临床资料及其术后肿瘤组织石蜡标本,选取其中38例患者的癌旁组织石蜡样本作为对照;同时纳入同期37例吻合器痔上黏膜环切钉合术后正常直肠黏膜样本和33例内镜治疗后结直肠腺瘤样本。所有标本制作成组织芯片,采用免疫组织化学方法检测DDX39蛋白表达情况,分别以平均染色强度(H-Score)和染色阳性的细胞数来对DDX39在上皮和间质中的表达进行评估;H-Score≥200定义为上皮中高表达,200倍视野间质内阳性细胞数≥50定义为间质中高表达。分析DDX39表达水平与结直肠癌临床病理参数和患者预后的关系。结果无论是在上皮还是间质中,DDX39在结直肠癌组织中的表达水平均低于与正常黏膜、癌旁组织和腺瘤组织[各组织上皮中DDX39水平:正常组织253.2 ± 64.1,癌旁组织238.8 ± 79.2,腺瘤组织259.4 ± 51.6,结直肠癌组织194.2 ± 76.5(P = 0.000,P = 0.005,P = 0.000);各组织间质中DDX39水平:正常组织110.1±64.8,癌旁组织106.0 ± 49.2,腺瘤组织108.5 ± 79.1,结直肠癌组织54.1 ± 34.7,均P = 0.000]。结直肠癌病例中,上皮DDX39高表达者541例,低表达者283例;间质DDX39高表达者424例,低表达者400例。结直肠癌上皮和间质中DDX39蛋白表达的高低分别与肿瘤部位(P = 0.006,P = 0.016)、肿瘤分化程度(P = 0.002,P = 0.064)、肿瘤TNM分期(P = 0.021,P = 0.000)、血清癌胚抗原水平(P = 0.003,P = 0.005)、血清CA199水平(P = 0.040,P = 0.005)及肿瘤复发转移(P = 0.000,P = 0.000)均有关。全组结直肠癌病例术后随访(41.6±15.7)月,上皮中DDX39低表达者5年总体生存率和5年无病生存率分别为84.1%和61.5%,均显著低于高表达者(95.4%和88.2%,均P = 0.000);间质中DDX39低表达者5年总体生存率和5年无病生存率分别为86.8%和66.8%,亦均低于高表达者(96.1%和90.6%,均P = 0.000)。Cox多因素分析显示,肿瘤分化程度(总体生存:HR = 0.252,95%CI:0.128~0.497,P = 0.000;无病生存:HR = 0.266,95%CI:0.134~0.530,P = 0.000)、上皮DDX39表达水平(总体生存:HR = 0.229,95% CI:0.138~0.382,P = 0.000;无病生存:HR = 0.266,95%CI:0.158~0.446,P = 0.000)及间质DDX39表达水平(总体生存:HR = 0.331,95% CI:0.188~0.582,P = 0.000;无病生存:HR=0.326,95% CI:0.184~0.578,P = 0.000)是结直肠癌患者总体生存或无病生存的独立影响因素。结论结直肠癌组织中DDX39蛋白低表达提示患者预后不良,DDX39有望成为结直肠癌的一种新的预后标志物。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 ddx39蛋白 预后
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