期刊文献+
共找到4篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
生物信息学数据库——日本DDBJ数据库及其检索应用 被引量:2
1
作者 邢美园 苏开颜 《情报杂志》 CSSCI 北大核心 2003年第5期59-61,共3页
介绍了世界三大核酸序列数据库之一的DDBJ数据库及其检索应用 ,内容涉及数据提交、数据分析及数据检索 ,如getentry、SRS、Sfgate&WAIS、TXSearch等四种软件的登录号检索、关键词及分类检索的特点、使用与技巧等。
关键词 生物信息学数据库 日本 ddbj数据库 核酸序列数据库 信息检索 数据提交 数据分析
在线阅读 下载PDF
应用系统发育树分析DDBJ基因库中HBV基因序列的基因型
2
作者 戴二黑 杨瑞馥 +1 位作者 刘恒军 宋亚军 《生物技术通讯》 CAS 2003年第1期29-32,56,共5页
为了充分利用核酸库中的HBV序列信息,探讨DDBJ核酸库中HBV基因序列的基因分型,采用ClustalX(1.8)软件比较HBV基因序列前S区序列差异并产生系统发育树。通过对下载的1471条HBV基因序列进行系统分析,获得了228条前S/S区完整的HBV基因序列... 为了充分利用核酸库中的HBV序列信息,探讨DDBJ核酸库中HBV基因序列的基因分型,采用ClustalX(1.8)软件比较HBV基因序列前S区序列差异并产生系统发育树。通过对下载的1471条HBV基因序列进行系统分析,获得了228条前S/S区完整的HBV基因序列,其中有66条序列的基因型已被各种方法所证实。利用软件分析绘制了基于228条HBV前S区基因序列的系统发育树。66条已知基因型HBV基因序列在系统发育树上的分型与其原有基因型完全吻合。在228条HBV基因序列中,有207条序列分别属于A、B、C、D、E、F和G等7个基因型,但另外21条序列不能归属于上述7个基因型的任何一种,而且它们又分为彼此相互独立存在的两群,暂分别称之为未分型Ⅰ和未分型Ⅱ。经比较未分型Ⅰ、Ⅱ和其他7个基因型前S区核苷酸序列,发现未分型Ⅰ、Ⅱ和D型前S区都有33个核苷酸缺失,但三者基因缺失片段的位置和形式各不相同。但其它六型前S区无大片段基因缺失。结果说明采用基于前S区的系统发育树基因分型分析方法正确可靠。除了现已证实的7个基因型外,尚可能存在另外两个新的HBV基因型。 展开更多
关键词 系统发育树分析 ddbj基因库 HBV 基因序列 基因型 乙型肝炎病毒
暂未订购
生物信息数据库资源查寻及共享 被引量:1
3
作者 吴耀生 《广西医科大学学报》 CAS 2003年第S1期194-196,共3页
关键词 生物信息数据库 生命科学 ddbj NCBI 序列分析工具 BANK 蛋白质序列信息 单核苷酸多态性 分子生物学数据库 信息生物学 资源
在线阅读 下载PDF
Cloning and genetic transformation of a novel rice gene OsAPT2
4
作者 WENG Man-li WANG Wang +6 位作者 ZHOU Chun-jiang QIAO li-xian WANG Wei FENG Yan-bin DUAN De-lin DENG Qi-yun WANG Bin 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第S1期205-205,共1页
A novel rice gene OsAPT2,which encodes a putative adenine phosphoribosyl transferase(APRT),was cloned.Its full-length cDNA is 1125bp,composing an ORF encoding 212 amino acid residues and a stop cordon,a 5'UTR of 1... A novel rice gene OsAPT2,which encodes a putative adenine phosphoribosyl transferase(APRT),was cloned.Its full-length cDNA is 1125bp,composing an ORF encoding 212 amino acid residues and a stop cordon,a 5'UTR of 123 bp and a 3'UTR of 363 bp.The sequence data have been submitted to the DDBJ/EMBL/GenBank databases(accession number:AY238894).The deduced amino acid sequence of OsAPT2 is highly homologous to those of previously reported APRTs.The genomic OsAPT2 gene contains 7 exons and 6 introns.Its total length is 4758 bp.Then,an antisense expression vector of the full-length OsAPT2 cDNA was constructed and transformed into rice variety Taibei309 by Agrobacterium tumefaciens mediated transformation method.In total,650 T0 transgenic plants were obtained based on both antibiotic screening and specific PCR identification.One hundred individuals of them were selected and planted in Hainan Island.From those 11 male sterile lines with seed-setting rate lower than 3%in bagged spike were obtained.Results suggest that OsAPT2 is involved in male sterility.Nine of the 11 male sterile lines were constitutive sterile lines;two of the 11 male sterile lines were thermo-sensitive genic male sterile lines,which may be useful in hybride rice breeding. 展开更多
关键词 Cloning and genetic transformation of a novel rice gene OsAPT2 length UTR ddbj cDNA gene
在线阅读 下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部