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DCL2-dependent regulation of sRNA biogenesis and translocation in soybean
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作者 Xiangying Kong Kaiwen Lyu +7 位作者 Ruixin Xu Yan Zhang Dongdong Lu Yongqi Liu Jixian Zhai Lijuan Qiu Bosheng Li Zhe Yan 《The Crop Journal》 2025年第3期818-827,共10页
Small RNAs(sRNAs)are essential for regulating plant growth and development,and they possess the notable ability to travel long distances within organisms to regulate target gene expression.Our study examined the dcl2 ... Small RNAs(sRNAs)are essential for regulating plant growth and development,and they possess the notable ability to travel long distances within organisms to regulate target gene expression.Our study examined the dcl2 mutant,a key enzyme in s RNA biogenesis,to determine the role of the DCL2 protein in s RNA synthesis and to identify mobile s RNAs under DCL2 regulation.Through grafting experiments between dcl2 mutants and wild-type soybean plants,coupled with s RNA sequencing,we identified14,105 s RNAs significantly affected by DCL2 and discovered 375 mobile s RNAs under its regulation.Degradome analysis provided deeper insights into the regulatory effects of these mobile s RNAs on their target genes,enabling us to understand their potential influences on plant development and stress responses.Leveraging the systemic movement of s RNAs from roots to shoots,we propose a novel strategy for manipulating gene expression in aboveground tissues.Overall,our research findings not only deepen our understanding of the complex regulatory networks involving mobile s RNAs regulated by DCL2,but also provide a new strategy for gene regulation,which could have a positive impact on agricultural biotechnology. 展开更多
关键词 SOYBEAN dcl2-dependent small RNA Graft Mobile small RNAs
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枣DCL基因家族注释及其在枣疯病发生中的表达模式分析 被引量:1
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作者 张亚婕 黄玉静 +6 位作者 姚佳 曹懂懂 李君毅 王梦丽 李萌 李继东 冯建灿 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期936-945,共10页
【目的】从枣基因组中注释枣DCL(dicer-like)基因家族成员,对其在枣疯病发生过程中的表达模式进行分析,研究枣DCL基因家族在响应植原体侵染中的作用。【方法】从NCBI网站下载冬枣基因组(Genebank号JREP00000000)数据,以拟南芥DCL蛋白序... 【目的】从枣基因组中注释枣DCL(dicer-like)基因家族成员,对其在枣疯病发生过程中的表达模式进行分析,研究枣DCL基因家族在响应植原体侵染中的作用。【方法】从NCBI网站下载冬枣基因组(Genebank号JREP00000000)数据,以拟南芥DCL蛋白序列为探针,使用生物信息学方法筛选得到枣DCL家族成员,分析其染色体位置、基因及蛋白结构、系统进化和保守基序特征,对枣DCL基因家族成员在枣疯病发生过程中的转录组数据进行分析,并对各成员在枣疯病发生过程中的动态进行实时定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)定量。【结果】以4个拟南芥DCL蛋白为探针,注释了11个枣DCL成员(ZjDCLs),其蛋白分子质量范围为15 217.48~225 623.49 D,等电点为5.82~9.05。11个枣DCL基因不均匀分布在6条枣染色体上,其中1号染色体上的最多。根据和拟南芥4个DCL的进化关系可将11个枣DCL成员分为4类。基因结构分析表明,ZjDCL3和ZjDCL7外显子数量最多为25个,保守基序分析表明,枣DCL的结构较为保守。转录组数据分析表明,10个枣DCL基因在枣疯病发生过程中有表达,ZjDCL6在第Ⅳ个时期的表达量最高,qRT-PCR定量分析表明,ZjDCL6,ZjDCL8和ZjDCL10在不同时期健康树和病树之间差异变化较大。【结论】枣基因组中有11个DCL基因家族成员,结构较为保守,其中ZjDCL6,ZjDCL8和ZjDCL10在枣响应植原体侵染中起重要作用。 展开更多
关键词 枣疯病 植原体 dcl基因家族 植物防御 表达模式
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多毛番茄DCL、AGO和RDR基因家族全基因组鉴定及其对番茄褪绿病毒感染和非生物胁迫响应的分析
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作者 康忱 田哲娟 +4 位作者 高亢 郝玲玉 刘伟 李亚栋 吴志明 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期1-17,共17页
对多毛番茄全基因组的Dicer-like(DCL)、Argonaute(AGO)和RNA依赖性RNA聚合酶(RDR)基因家族进行生物信息学和表达模式分析,为深入研究DCL、AGO和RDR基因家族在多毛番茄响应非生物胁迫和病毒感染过程中的功能提供参考。以拟南芥DCL、AGO... 对多毛番茄全基因组的Dicer-like(DCL)、Argonaute(AGO)和RNA依赖性RNA聚合酶(RDR)基因家族进行生物信息学和表达模式分析,为深入研究DCL、AGO和RDR基因家族在多毛番茄响应非生物胁迫和病毒感染过程中的功能提供参考。以拟南芥DCL、AGO和RDR基因为参考序列,利用本地Perl语言和Pfam、SMART等软件检索多毛番茄LA1777基因组并确定多毛番茄DCL、AGO和RDR基因家族成员。通过ExPASy、GSDS 2.0、MEGA、Tbtools、SWISS-MODEL等工具对多毛番茄DCL、AGO和RDR家族基因进行生物信息学分析。根据非生物胁迫、番茄褪绿病毒(ToCV)处理和实时荧光定量PCR技术分析该类基因的表达模式。从多毛番茄中鉴定得到7个ShDCL、15个ShAGO和6个ShRDR基因,分别分布在第5,7,6条染色体上,其编码的蛋白与其他植物DCL、AGO和RDR结构相似,均含有该家族特有的保守结构域。系统发育分析表明,这些基因被分为4个亚组,与普通番茄之间具有较高的结构和功能相似性。ShDCL2a、ShDCL2c、ShDCL3、ShDCL4、ShAGO1b、ShAGO3、ShAGO4b、ShAGO5、ShAGO7、ShAGO10a、ShAGO10b、ShRDR1、ShRDR2、ShRDR3a、ShRDR6a和ShRDR6b在多种非生物胁迫和ToCV感染后显著上调表达,推测这些基因在非生物胁迫和病毒侵染过程中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 多毛番茄 dcl AGO RDR 非生物胁迫 番茄褪绿病毒(ToCV)
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AutoCAD可视化对话框开发工具OpenDCL使用简介 被引量:7
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作者 兰度 《城市勘测》 2009年第6期87-89,92,共4页
Opendcl是AutoCAD可视化对话框界面开发的第三方工具,适用于Lisp/Vlisp开发环境,使用简单,功能强大,使您通过LISP/Vlisp就能充分利用Windows资源,制作出漂亮实用的对话框界面;本文通过简单实例介绍在VisualeLisp开发环境下,利用Opendcl... Opendcl是AutoCAD可视化对话框界面开发的第三方工具,适用于Lisp/Vlisp开发环境,使用简单,功能强大,使您通过LISP/Vlisp就能充分利用Windows资源,制作出漂亮实用的对话框界面;本文通过简单实例介绍在VisualeLisp开发环境下,利用Opendcl可视化对话框开发工具进行AutoCAD对话框开发的方法。 展开更多
关键词 AUTOCAD Lisp/vlisp dcl Opendcl Objectdcl可视化对话框
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龙眼DCL家族基因的启动子分析及时空表达 被引量:7
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作者 陈晓慧 白玉 +3 位作者 李汉生 陈旭 林玉玲 赖钟雄 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1926-1933,共8页
为了解龙眼DCL基因的功能,该试验对龙眼基因组数据提取的DlDCL1、DlDCL2、DlDCL3和DlDCL4基因序列进行启动子顺式作用元件及其受miRNA调控的分析;并以龙眼胚性愈伤组织为材料,研究了DlDCLs不同基因成员在非生物胁迫和外源激素处理下的... 为了解龙眼DCL基因的功能,该试验对龙眼基因组数据提取的DlDCL1、DlDCL2、DlDCL3和DlDCL4基因序列进行启动子顺式作用元件及其受miRNA调控的分析;并以龙眼胚性愈伤组织为材料,研究了DlDCLs不同基因成员在非生物胁迫和外源激素处理下的表达情况。结果显示:(1)龙眼DCL基因启动子中除了TATA和CAAT外,还具有大量的光反应元件、激素应答元件、胁迫响应元件、组织特异性调控元件及植物生长发育相关的顺式调控元件,提示龙眼DCL基因启动子转录活性可能受到光、激素信号及逆境胁迫因素的诱导。(2)对调控龙眼DCL基因的miRNA进行筛选,结果显示DlDCL1受miR162和miR1024调控,DlDCL4受miR390和miR396调控。(3)实时荧光定量PCR显示,在一定浓度范围内,外源激素GA3、ABA和ETH均能下调DlDCLs基因的表达,而高浓度ETH处理则显著上调DlDCLs的表达。(4)高浓度蔗糖(6%)处理时DlDCL2、DlDCL3和DlDCL4显著上调表达,而低浓度(0.1%)处理时DlDCL1显著上调表达;不同温度处理下,DlDCL1在34℃时显著上升,DlDCL3随着温度的提高相对表达量逐渐减低;而DlDCL2和DlDCL4表达量差异不明显;NaCl胁迫处理下,DlDCLs在1h处理时表达量下调,但在其他不同时间点则上调表达。研究表明,龙眼DCL基因在外源激素及非生物胁迫处理下,并非是简单的一对一响应,而是存在较为复杂的响应机制。 展开更多
关键词 龙眼 dcl基因 启动子 实时荧光定量PCR
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龙眼体胚发生过程中DCL基因的分子特性及表达分析 被引量:6
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作者 陈晓慧 白玉 +3 位作者 陈旭 李汉生 林玉玲 赖钟雄 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期2120-2129,共10页
从龙眼转录组unigene序列筛选获得龙眼DCL基因(命名为DlDCL)全长序列,并结合生物信息学及实时荧光定量等方法,对龙眼DCL基因进行研究,以明确DlDCLs在龙眼体胚、不同生长组织部位中的表达规律及其对激素和光质应答反应,为进一步研究龙眼... 从龙眼转录组unigene序列筛选获得龙眼DCL基因(命名为DlDCL)全长序列,并结合生物信息学及实时荧光定量等方法,对龙眼DCL基因进行研究,以明确DlDCLs在龙眼体胚、不同生长组织部位中的表达规律及其对激素和光质应答反应,为进一步研究龙眼体胚过程中DlDCLs基因的调控研究奠定基础。结果表明:(1)龙眼转录组数据存在DlDCL1、DlDCL2、DlDCL3和DlDCL4四个DCL家族成员,且基于Unigene的FPKM值发现不同基因在体胚发生阶段具有差异表达。(2)生物信息学分析发现,DlDCLs成员间基本理化性质较为类似,均为亲水性不稳定蛋白、不含信号肽、可进行跨膜运动,但也存在一定差异,如DlDCL2为碱性蛋白,而其他3个成员为酸性蛋白;亚细胞定位预测显示,DlDCLs均定位于细胞核中,但DlDCL2也存在定位于叶绿体中;对DCL蛋白结构域预测显示,DCL是高度保守的蛋白。(3)系统进化树分析显示,不同物种的DCL分为4个分支,同源的DCL蛋白都聚为一类,且DlDCLs与柑橘DCL亲缘关系更为接近。(4)实时荧光定量PCR分析表明,DlDCLs在龙眼非胚性愈伤组织和体胚发生过程中的表达模式差异较大,但DlDCLs在愈伤组织阶段均有较高的表达量,推测DlDCLs在体胚发生过程可能具有功能的独立和协作。DlDCL1和DlDCL2在叶片、花器官等组织部位中的相对表达量较高,暗示DlDCL1和DlDCL2可能参与到光合作用和花器官的发育;DlDCLs还受2,4-D、MeJA、SA激素和光质诱导,表明DlDCLs可能参与激素和光质调控。 展开更多
关键词 龙眼 体胚发生 dcl基因 分子特性 荧光定量PCR
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用AutoLISP和dcl开发AutoCAD图幅形成及快速出图 被引量:4
7
作者 卢俊辉 朱宵黎 《机械设计与制造》 北大核心 2006年第8期81-82,共2页
利用AutoLISP和dcl进行AutoCAD二次开发,完成AutoCAD自动形成图幅,实现了绘图仪连续快速出图,加快了单位内部图纸标准化进程,方便图纸在单位内部的交流,提高了工作效率。
关键词 AUTOLISP dcl 标准化 图幅 拼接
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本科教学模式新尝试:DCL模式的实施及效果初探——基于D大学生物医学专业的教学研究 被引量:10
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作者 刘珊珊 吕林海 《教学研究》 2016年第3期47-52,共6页
科技的发展、知识的更替呼唤新的教学模式。本研究提出了本科阶段一种新的教学模式:DCL模式。DCL模式的理论基础是建构主义学习理论和学习共同体理论,其实践设计过程充分展现了上述思想。论文最后呈现了基于中国本土的DCL的实践案例及... 科技的发展、知识的更替呼唤新的教学模式。本研究提出了本科阶段一种新的教学模式:DCL模式。DCL模式的理论基础是建构主义学习理论和学习共同体理论,其实践设计过程充分展现了上述思想。论文最后呈现了基于中国本土的DCL的实践案例及实施效果的实证结论,并进一步提出了中国本科教育改进的三点建议。 展开更多
关键词 教学模式 建构主义 学习共同体 dcl模式
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DCL方法在生物医学工程专业硕士专业实践过程中的应用模式探讨 被引量:2
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作者 季忠 廖彦剑 +3 位作者 侯文生 罗洪艳 胡宁 赵晓明 《教育教学论坛》 2019年第42期171-172,共2页
针对生物医学工程专业学位研究生专业实践存在的问题,基于DCL教学方法,设计符合专业学位研究生的专业实践案例,使学生在整个专业实践过程中既能得到专业共性知识和能力的培养和锻炼,又能提高解决个性化问题的能力,更符合我国专业学位研... 针对生物医学工程专业学位研究生专业实践存在的问题,基于DCL教学方法,设计符合专业学位研究生的专业实践案例,使学生在整个专业实践过程中既能得到专业共性知识和能力的培养和锻炼,又能提高解决个性化问题的能力,更符合我国专业学位研究生的培养目标。 展开更多
关键词 dcl 案例 专业实践 生物医学工程
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法国 DCL 语言能力证书考试 被引量:1
10
作者 罗莲 白乐桑 《国际汉语学报》 2013年第2期17-26,共10页
目前,国内对法国的语言测试研究非常少。本文从测试历史以及基本情况、目标人群及用途、参加考试、等级与技能、测试特点几个方面对法国DCL语言能力证书考试进行介绍,以期对未来的语言测试设计有所借鉴。
关键词 dcl 语言能力证书考试 脚本 任务 真实性
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振动激发对O+DCl→OD+Cl反应动力学性质的影响
11
作者 许雪松 李磊 +1 位作者 荆波 杨鲲 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第7期1390-1394,共5页
采用准经典轨线方法讨论了反应物分子的振动激发对O+DCl→OD+Cl反应动力学性质的影响.计算结果表明,反应物分子的振动激发对(2π/σ)(dσ00/dωt),(2π/σ)(dσ20/dωt)和(2π/σ)(dσ22+/dωt)3个极化微分反应截面和产物分子转动角动... 采用准经典轨线方法讨论了反应物分子的振动激发对O+DCl→OD+Cl反应动力学性质的影响.计算结果表明,反应物分子的振动激发对(2π/σ)(dσ00/dωt),(2π/σ)(dσ20/dωt)和(2π/σ)(dσ22+/dωt)3个极化微分反应截面和产物分子转动角动量取向程度的影响比较显著.变化规律反映出反应物分子的高振动激发使产物分子倾向于在平行于散射面的平面内转动. 展开更多
关键词 O+dcl反应 振动激发 极化微分反应截面 矢量相关
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改进DCL的花卉子类细粒度分类算法
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作者 张立国 刘博 +2 位作者 金梅 孙胜春 张勇 《计量学报》 CSCD 北大核心 2021年第12期1579-1585,共7页
针对现有的单一细粒度识别模型不能识别无训练样本花卉子类这一实际情况,结合DCL与KNN提出了一种将细粒度特征映射到高维空间自动分类的方法,实现无训练样本的子类分类。同时针对同一花卉子类特征较为相似且可能存在类间样本不均衡问题... 针对现有的单一细粒度识别模型不能识别无训练样本花卉子类这一实际情况,结合DCL与KNN提出了一种将细粒度特征映射到高维空间自动分类的方法,实现无训练样本的子类分类。同时针对同一花卉子类特征较为相似且可能存在类间样本不均衡问题,改进了DCL模型的损失函数(focal loss),通过对比损失(contrastive loss)加大子类的类间距,用focal loss平衡类别损失。最后在308类样本不均衡的牡丹花上进行实验。实验结果表明:改进算法后有训练样本的子类准确率为0.932,F1值为0.925,较原始DCL算法有了较大的提升,对未训练样本的子类准确率为0.903,F1值为0.888。 展开更多
关键词 计量学 细粒度图像识别 牡丹花分类 dcl改进算法 KNN算法 对比损失 损失函数
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利用DCL和VLISP语言进行内胎定型圈设计
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作者 王江忠 辛振祥 +1 位作者 高祯瑞 高立君 《青岛科技大学学报(自然科学版)》 CAS 2003年第6期528-530,共3页
利用DCL设计对话框 ,并用VLISP语言予以驱动 ,设计了内胎定型圈。本设计形象、直观、快捷 ,既方便了用户输入和修改数据 ,克服单纯用AutoLISP语言编写代码的不直观性、源代码保密性差的缺点 ,且不必用其它高级语言与AutoCAD进行数据转... 利用DCL设计对话框 ,并用VLISP语言予以驱动 ,设计了内胎定型圈。本设计形象、直观、快捷 ,既方便了用户输入和修改数据 ,克服单纯用AutoLISP语言编写代码的不直观性、源代码保密性差的缺点 ,且不必用其它高级语言与AutoCAD进行数据转换 ,使程序与AutoCAD系统协调统一。 展开更多
关键词 内胎 定型圈设计 dcl VLISP AUTOCAD
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向日葵AGO和DCL基因家族的鉴定和表达分析
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作者 张红 员世宇 +7 位作者 王文浩 刘文俊 何丽芬 闫玉星 王彦尊 王鹏冬 郑洪元 张鑫 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期363-372,共10页
为了解向日葵(Helianthus annuus)的Argonaute(AGO)和Dicer-like(DCL)的功能,利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)的AGO和DCL基因序列在向日葵基因组数据库中进行同源比对,对向日葵AGO和DCL家族成员进行生物信息学分析。结果表明,从向日... 为了解向日葵(Helianthus annuus)的Argonaute(AGO)和Dicer-like(DCL)的功能,利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)的AGO和DCL基因序列在向日葵基因组数据库中进行同源比对,对向日葵AGO和DCL家族成员进行生物信息学分析。结果表明,从向日葵中鉴定到15个HaAGOs和5个HaDCLs家族成员;这2类基因在染色体上的分布均不均匀。系统发育分析表明,与拟南芥相似,HaAGO家族成员可分为3个分支,HaDCL可分为4个分支;所有的HaAGO都具有保守的N domain、DUF1785、PAZ和PIWI结构域,HaDCL家族成员都含有PAZ和RIBOc结构域。表达分析表明,HaDCL3a和HaDCL3b在茎和花序中高度表达;亚细胞定位表明HaAGO多定位于细胞核。这表明向日葵中可能存在典型的RNAi干扰机制,并可能参与了协调向日葵的生长发育过程。 展开更多
关键词 RNA干扰 AGO家族 dcl家族 向日葵 基因表达
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Autolisp和DCL语言在开发表面粗糙度标注工具中的应用 被引量:2
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作者 浦炜 卢达 《福建电脑》 2002年第11期36-37,共2页
本文利用AutoCAD的对话框控制语言DCL结合AutoLisp语言能开发具有良好工作界面的定制工具,对表面粗糙度符号实现自动标注,解决了AutoCAD软件中不能直接标注表面粗糙度符号的不足。本文针对对话框设计程序、对话框驱动程序和符号绘制程... 本文利用AutoCAD的对话框控制语言DCL结合AutoLisp语言能开发具有良好工作界面的定制工具,对表面粗糙度符号实现自动标注,解决了AutoCAD软件中不能直接标注表面粗糙度符号的不足。本文针对对话框设计程序、对话框驱动程序和符号绘制程序的开发过程及技术关键作一分析说明。 展开更多
关键词 机械制图 AUTOLISP语言 表面粗糙度符号 dcl语言 表面粗糙度标注工具
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天生桥直流线路低电压保护27DCL分析 被引量:1
16
作者 谌毅 王电处 杨跃辉 《贵州电力技术》 2015年第1期24-26,49,共4页
介绍了直流线路低电压保护27DCL的原理,分析了其保护思想、动作行为,以及保护间相互配合的关系,得出了27DCL不合理的地方,并提出了改进措施。
关键词 27dcl 原理 动作行为
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VMS DCL命令的最简输入方法
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作者 朱玉珑 李锋 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 1993年第6期42-49,共8页
本文给出了在VAX/VMS上用键定义设施和主谓模式实现的一种最简命令输入方法,它能极大地提高计算机系统的利用率和程序员的工作效率。文中给出了全部程序列表和一个应用实例。
关键词 dcl命令 输入方法 键盘
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应用AutoLISP和DCL对AutoCAD的二次开发 被引量:2
18
作者 苗现华 吴传山 《电脑知识与技术(过刊)》 2007年第24期57-58,共2页
通过实例说明,应用AutoLISP和DCL,能够编写出人机交互强,功能强大的程序,对AutoCAD进行十分有效的二次开发,从而提高绘图效率,并使AutoCAD真正地起到辅助设计作用。
关键词 AUTOLISP dcl AUTOCAD 二次开发
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基于DCL和AutoLISP语言开发的垫圈标准件库
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作者 唐静 于云程 《常州信息职业技术学院学报》 2007年第1期47-49,共3页
以标准件垫圈为例,介绍了如何在AutoCAD软件中利用DCL和AutoLISP语言开发一个能快速绘制不同类型、不同尺寸的垫圈的应用程序。以此类推,可以在AutoCAD软件中开发出大量快速绘制标准件的应用程序,从而提高绘图效率。
关键词 dcl AUTOLISP 标准件 垫圈
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基于DCL的表格数据处理
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作者 姜锐 《农机化研究》 北大核心 2004年第6期237-240,共4页
利用AutoCad软件包提供的PDB(可编程对话框)工具,结合AutoLisp的对话框控制语言DCL,将原来把数据表格固化在程序内部的方式,改为用外部数据文件形式来保存数据表格,再通过AutoLisp将外部数据文件与DCL连接,实现用户可视化参数选择界面。
关键词 表格数据处理 dcl AUTOLISP 外部数据文件 对话框控制语言 可编程对话框 CAD软件包 数据表格 参数选择 PDB 可视化 程序
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