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miR-1184靶向COL1A1调节PI3K/Akt通路对胃癌细胞增殖、侵袭、凋亡的影响
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作者 杨路 郑欣 +2 位作者 王鑫 张利伟 张巍 《右江医学》 2025年第9期778-784,共7页
目的探讨miR-1184在胃癌中的表达及其生物学功能,并进一步探究其是否通过调控Ⅰ型胶原α1链(COL1A1)来调节PI3K-Akt信号通路及其对胃癌细胞增殖、侵袭与凋亡的影响。方法收集2022年10月至2023年8月在齐齐哈尔医学院附属第二医院接受手... 目的探讨miR-1184在胃癌中的表达及其生物学功能,并进一步探究其是否通过调控Ⅰ型胶原α1链(COL1A1)来调节PI3K-Akt信号通路及其对胃癌细胞增殖、侵袭与凋亡的影响。方法收集2022年10月至2023年8月在齐齐哈尔医学院附属第二医院接受手术切除的原发性胃癌患者的部分癌组织(30例)和癌旁组织(30例)样本。通过RT-qPCR检测胃癌细胞中miR-1184、COL1A1、PI3K和Akt的表达水平,使用细胞转染技术加入miR-1184、COL1A1、si-PI3K,应用BrdU试剂盒检测细胞增殖,Transwell实验测定细胞迁移与侵袭率,流式细胞仪检测细胞凋亡。结果在胃癌组织中,miR-1184的表达量显著低于癌旁组织(P<0.001),COL1A1、PI3K和Akt的表达显著高于癌旁组织(P<0.001)。miR-1184与COL1A1表达呈显著负相关(r=-0.988,P<0.001),PI3K与COL1A1表达呈显著正相关(r=0.980,P<0.001),PI3K与miR-1184表达呈显著负相关(r=-0.966,P<0.001)。miR-1184过表达能显著抑制COL1A1、PI3K和Akt水平(P<0.05),减少胃癌细胞增殖、迁移和侵袭,增加细胞凋亡率(P<0.05)。加入COL1A1质粒后,PI3K和Akt表达增加(P<0.05),miR-1184的抑癌作用被逆转;加入si-PI3K后,胃癌细胞增殖、迁移与侵袭力显著下调,细胞凋亡比例显著增多(P<0.05)。结论miR-1184在胃癌中的低表达及其通过调控COL1A1来影响PI3K/Akt信号通路的作用机制,过表达miR-1184能显著抑制胃癌细胞增殖、迁移与侵袭,增加细胞凋亡率。 展开更多
关键词 miR-1184 Ⅰ型胶原α1链(col1a1) PI3K/AKT 胃癌 细胞功能
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生物信息学分析:COL1A1可能是幽门螺旋杆菌通过细胞毒素相关蛋白A参与胃腺癌进程的关键靶点
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作者 阚笑 王云 宋晓萍 《临床医学进展》 2025年第6期1356-1367,共12页
目的:幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白A是一种已知的可诱导胃癌发展的重要毒力因子。本研究旨在通过生物信息学进一步确定具体在这一过程中发挥作用的生物学靶点。材料方法:首先,从基因表达综合数据库中筛选mRNA表达谱数据集GSE29998,并借... 目的:幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白A是一种已知的可诱导胃癌发展的重要毒力因子。本研究旨在通过生物信息学进一步确定具体在这一过程中发挥作用的生物学靶点。材料方法:首先,从基因表达综合数据库中筛选mRNA表达谱数据集GSE29998,并借助已有的研究成果,使用R软件(4.0.0版)分析幽门螺旋杆菌通过细胞毒素相关蛋白A参与胃腺癌进程的潜在差异表达基因,再借助富集分析进一步阐述其意义。并最终根据蛋白质互作网络的hub基因的排名,筛选出可能的潜在靶向基因。结果:我们通过差异性分析确定了540个可能的与胃腺癌相关的潜在差异基因。再结合陈等人的研究成果所提供的基因数据库,我们进一步确认18个与潜在的幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白A相关的胃腺癌差异表达基因。蛋白质–蛋白质相互作用网络提示只有COL1A1处于枢纽位置。因此我们认定COL1A1是与幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白A相关的胃腺癌差异表达基因。结论:我们的研究鉴定了在胃腺癌中18个潜在的幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白A相关的差异表达基因。幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白A可能借助COL1A1参与胃腺癌的发生发展过程中。本研究结果首次借助细胞实验相关数据筛选出临床样本中幽门螺杆菌可能影响胃腺癌发生的潜在生物学靶点,这可能有助于我们进一步理解这一疾病。 展开更多
关键词 胃腺癌 幽门螺旋杆菌 幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白A col1a1
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LINC00460-miR143-COL1A1表达调控在结直肠癌细胞增殖、迁移和侵袭的作用机制研究 被引量:1
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作者 齐晓鹏 程伟 +3 位作者 田畅 陶伦 罗晓红 舒武英 《大理大学学报》 2025年第8期41-50,共10页
目的:旨在探讨LINC00460在结直肠癌中的作用机制及其对细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。方法:通过对TCGA数据库中结直肠癌患者组织样本进行lncRNA-miRNA-mRNA的竞争性内源RNA调控网络分析,并采用细胞培养、慢病毒转染、CCK-8试剂盒检... 目的:旨在探讨LINC00460在结直肠癌中的作用机制及其对细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。方法:通过对TCGA数据库中结直肠癌患者组织样本进行lncRNA-miRNA-mRNA的竞争性内源RNA调控网络分析,并采用细胞培养、慢病毒转染、CCK-8试剂盒检测、划痕试验、Transwell侵袭实验以及RT-PCR和qPCR等技术进行体外实验研究。结果:LINC00460在结直肠癌组织中呈显著高表达,且其表达与miR143呈负相关,与COL1A1 mRNA呈正相关。沉默LINC00460表达可显著降低结直肠癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力,而过表达LINC00460则可显著提高正常结肠上皮细胞的增殖、迁移和侵袭能力。结论:LINC00460可能通过靶向竞争性抑制miR143,促进COL1A1 mRNA表达,从而促进结直肠癌细胞的增殖、迁移和侵袭,有望成为结直肠癌治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 结直肠癌 LINC00460 miR143 col1a1 mRNA
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MiR-133a-3p调控COL1A1影响口腔鳞状细胞癌细胞增殖、侵袭及转移的机制研究
4
作者 努尔江·艾合买提 汪萍慧 +2 位作者 阿迪力·麦木提敏 阿力布江·依明江 肖朋 《河北医药》 2025年第11期1771-1776,共6页
目的探讨微小RNA(miR)-133a-3p在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的作用和机制。方法收集30对OSCC和癌旁组织样品,OSCC细胞系构建对照组(NC组)、miR-133a-3p过表达组(miR-133a-3p组)、抑制COL1A1组(si-COL1A1组)、过表达COL1A1组(COL1A1组)及共... 目的探讨微小RNA(miR)-133a-3p在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的作用和机制。方法收集30对OSCC和癌旁组织样品,OSCC细胞系构建对照组(NC组)、miR-133a-3p过表达组(miR-133a-3p组)、抑制COL1A1组(si-COL1A1组)、过表达COL1A1组(COL1A1组)及共转染组(miR-133a-3p+COL1A1组)。实时定量PCR检测miR-133a-3p在OSCC组织和细胞中的表达水平。采用CCK-8、克隆形成、transwell和流式细胞术检测miR-133a-3p对细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响。构建裸鼠成瘤模型验证miR-133a-3p对肿瘤组织生长的影响。苏木素伊红染色和免疫组化染色验证肿瘤组织增殖情况。双萤光素酶测定和蛋白质印迹法检测miR-133a-3p对COL1A1表达的调控作用。结果与癌旁组织及永生化口腔上皮细胞系(HIOEC)比较,OSCC组织和细胞中miR-133a-3p的表达水平下降(P<0.05);与NC组比较,miR-133a-3p组的肿瘤细胞的活力、迁移和细胞侵袭数量降低,同时细胞凋亡水平升高且差异均有统计学意义(P<0.05);si-COL1A1组的细胞活力、迁移和侵袭能力降低而细胞凋亡率升高且差异均有统计学意义(P<0.05);双萤光素酶报告证实miR-133a-3p靶向COL1A1表达(P<0.05);体内实验证明miR-133a-3p能够通过COL1A1抑制肿瘤生长,差异有统计学意义(P<0.05)。结论miR-133a-3p通过靶向COL1A1影响OSCC细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡,可能是OSCC患者潜在的预后生物标志物。 展开更多
关键词 col1a1 miR-133a-3p 口腔鳞状细胞癌 细胞增殖 细胞侵袭
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Beyond COL1A1::PDGFB:Rare fusions and their clinical implications in dermatofibrosarcoma protuberans
5
作者 Sumanta Das Sunita Ahlawat 《World Journal of Clinical Cases》 2025年第33期119-125,共7页
Dermatofibrosarcoma protuberans(DFSP)is a rare cutaneous intermediate-grade soft tissue tumor characterized by COL1A1::PDGFB fusion in most cases.This fusion drives tumorigenesis and forms the basis for imatinib treat... Dermatofibrosarcoma protuberans(DFSP)is a rare cutaneous intermediate-grade soft tissue tumor characterized by COL1A1::PDGFB fusion in most cases.This fusion drives tumorigenesis and forms the basis for imatinib treatment,which acts by blocking platelet-derived growth factor receptor-beta kinase activity.Apart from this canonical fusion,there is an expanding spectrum of rare fusions,including COL6A3::PDGFD,EMILIN::PDGFD,TNC::PDGFD,etc.,through mole-cular profiling.These atypical rearrangements may be encountered in morpho-logically classic DFSP,unusual anatomic sites,or diagnostically challenging variants such as fibrosarcomatous DFSP.Their recognition is clinically relevant,as they may influence tumor biology,response to targeted therapy,and eligibility for clinical trials.This newly documented DFSP involving the lacrimal sac was initially misdiagnosed as a solitary fibrous tumor,emphasizing the diagnostic pitfalls in anatomically constrained regions and the importance of integrated diagnosis combining histology,immunohistochemistry,and molecular testing.In this editorial commentary,we briefly highlight the ever-growing genomic land-scape of DFSP,report rare fusions and their biological implications,and examine the role of expanded molecular diagnostics in refining diagnosis,guiding therapy,and informing prognosis.Incorporating comprehensive fusion analysis into routine workup may be critical for accurate classification,especially in unusual presentations where reliance on morphology alone risks misdiagnosis. 展开更多
关键词 Dermatofibrosarcoma protuberans col1a1::PDGFB EMILIN TNC Molecular diagnostics
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COL1A1基因突变致新生儿骨折一例
6
作者 张来 徐慧松 《浙江中西医结合杂志》 2025年第9期857-858,共2页
成骨不全症(osteogenesis imperfecta,OI)作为遗传性结缔组织疾病的典型代表,其核心病理特征表现为骨基质代谢异常导致的骨骼脆性显著增高。该疾病临床表现呈多样性,除反复病理性骨折外,特征性蓝巩膜、牙本质发育异常及渐进性听力损伤... 成骨不全症(osteogenesis imperfecta,OI)作为遗传性结缔组织疾病的典型代表,其核心病理特征表现为骨基质代谢异常导致的骨骼脆性显著增高。该疾病临床表现呈多样性,除反复病理性骨折外,特征性蓝巩膜、牙本质发育异常及渐进性听力损伤构成其典型三联征。OI影像学检查可见骨小梁结构稀疏、骨皮质变薄及多发陈旧性骨折线等特征性改变[1-2]。 展开更多
关键词 成骨不全症 col1a1基因 基因突变 新生儿
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国人COL1A1和COL1A2突变致成骨不全家系内表型不一 被引量:6
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作者 张浩 汪纯 +6 位作者 岳华 顾洁梅 胡伟伟 何进卫 傅文贞 魏占英 章振林 《中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志》 CSCD 北大核心 2018年第6期532-539,共8页
目的观察123个汉族成骨不全(osteogenesis imperfecta,OI)家系中存在表型不一的家系比率,并探讨导致同一突变不同表型的潜在机制。方法分析123个汉族OI家系(包括以往研究的117个家系)中存在表型不一的家系比率。用单核苷酸多态性(single... 目的观察123个汉族成骨不全(osteogenesis imperfecta,OI)家系中存在表型不一的家系比率,并探讨导致同一突变不同表型的潜在机制。方法分析123个汉族OI家系(包括以往研究的117个家系)中存在表型不一的家系比率。用单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP) SNa Pshot分型技术检测21个家系先证者及其表型不一家系成员的血液和口腔黏膜的脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)中COL1A1和COL1A2基因21个SNP位点的分型,从而检查体细胞样本的嵌合率。同时检测2个存在COL1A2基因同一突变(c. 1009G>A)家系的甲基化程度差异。结果在123个OI家系中,21个(17. 1%)家系存在表型不一,仅1例先证者的父亲显示体细胞基因镶嵌,其血液中有43. 1%突变等位基因,口腔上皮细胞有39. 6%的突变等位基因。在2个存在COL1A2基因同一突变(c. 1009G>A)的家系中,2例先证者的甲基化程度均高于其母亲。结论国人OI家系内COL1A1和COL1A2基因同一突变发生不同表型的比率为17%。在这21个表型不一的家系中只有1例(4. 8%)先证者的父亲存在体细胞镶嵌。甲基化程度可能与表型严重程度有关。在遗传咨询时,对先证者无临床表型的家属进行致病基因的突变检测是十分必要的。 展开更多
关键词 成骨不全 col1a1 COL1A2 突变 不同表型
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隆突性皮肤纤维肉瘤免疫表型和COL1A1/PDGFB融合基因的临床应用研究 被引量:5
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作者 叶新青 邝晓聪 +2 位作者 韦常宏 黄俊琪 叶洪涛 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2015年第21期1042-1046,共5页
目的:探讨隆突性皮肤纤维肉瘤(dermatofibrosarcoma protuberans,DFSP)诊断中免疫表型和荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)检测COL1A1/PDGFB融合基因的应用价值。方法:观察73例DFSP中免疫组织化学标记物vimentin、... 目的:探讨隆突性皮肤纤维肉瘤(dermatofibrosarcoma protuberans,DFSP)诊断中免疫表型和荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)检测COL1A1/PDGFB融合基因的应用价值。方法:观察73例DFSP中免疫组织化学标记物vimentin、CD34、CD99、S100、desmin、SMA和FISH检测COL1A1/PDGFB融合基因的表达。选取85例非DFSP作为免疫组织化学的对照组,10例非DFSP作为FISH检测COL1A1/PDGFB融合基因的对照组。结果:vimentin、CD34、CD99、S100、desmin、SMA在73例DFSP中阳性率分别是100%、91.78%、61.64%、0、0、6.85%,在对照组中不同程度表达,其中CD34的表达在鉴别诊断中有意义。COL1A1/PDGFB融合基因在DFSP的阳性率为86.96%(60/69),对照组均阴性。结论:在DFSP的诊断中,COL1A1/PDGFB融合基因是DFSP较为特异性、敏感性的标记,而CD34是DFSP相对理想的标记。 展开更多
关键词 隆突性皮肤纤维肉瘤 免疫组织化学 FISH col1a1/PDGFB融合基因
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静压力下兔髁突软骨细胞COL2A1、SOX9、COL1A1和ALP的表达变化 被引量:13
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作者 黄林剑 李辉 +4 位作者 谢千阳 张旻 陈永进 杨驰 蔡协艺 《中国口腔颌面外科杂志》 CAS 2014年第4期295-300,共6页
目的:研究兔髁突软骨细胞对静压力的分子生物学响应。方法:体外分离培养4周龄健康雌性新西兰大白兔髁突软骨细胞,使用形态学观察,COL2A1和SOX9免疫细胞化学染色方法对P2代髁突软骨细胞进行鉴定;100kPa静压力条件下,分别对P2代髁突软... 目的:研究兔髁突软骨细胞对静压力的分子生物学响应。方法:体外分离培养4周龄健康雌性新西兰大白兔髁突软骨细胞,使用形态学观察,COL2A1和SOX9免疫细胞化学染色方法对P2代髁突软骨细胞进行鉴定;100kPa静压力条件下,分别对P2代髁突软骨细胞进行0、1、2、3和4 h的加压处理;采用CCK-8检测压力加载后各组细胞活性的变化;通过Western免疫印迹分析髁突软骨细胞COL2A1、SOX9、COL1A1和ALP的表达变化。采用SPSS19.0软件包对数据进行统计学分析。结果:兔髁突软骨细胞呈多角形,"铺路石"样排列,细胞爬片COL2A1和SOX9免疫细胞化学染色鉴定结果为阳性。100kPa静压力加载1 h时,细胞活性显著降低(P=0.04),但在2~4 h后,细胞活性恢复并与对照组无显著差异。Western印迹结果显示,压力加载3 h和4 h时,COL2A1、SOX9、COL1A1和ALP的表达显著升高。其中,在压力加载4 h组ALP的表达量比3 h组低。结论:兔髁突软骨细胞对压力微环境的改变具有一定的适应能力,100kPa静压力加载4 h不会对髁突软骨细胞活性产生不可逆损伤。适宜的压力加载对髁突软骨细胞的成软骨和成骨能力有促进作用。髁突软骨细胞压力微环境的改变,可能影响颞下颌关节适应性改建和颞下颌关节紊乱病的病理过程。 展开更多
关键词 髁突 软骨细胞 静压力 COL2A1 SOX9 col1a1 ALP
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RNAi对人类皮肤成纤维细胞COL1A1及COL3A1表达的影响 被引量:3
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作者 王琼 彭振辉 +4 位作者 王万卷 耿松梅 牛新武 王梅 刘平 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期1-6,共6页
目的研究RNA干扰(RNAi)技术对人类皮肤成纤维细胞(HSF)COL1A1及COL3A1表达的影响。I型胶原和III型胶原是构成皮肤结缔组织的主要成份,其异常是造成真皮结缔组织以及纤维增生性疾病病理变化的主要因素。RNAi技术可有效抑制特定基因的表... 目的研究RNA干扰(RNAi)技术对人类皮肤成纤维细胞(HSF)COL1A1及COL3A1表达的影响。I型胶原和III型胶原是构成皮肤结缔组织的主要成份,其异常是造成真皮结缔组织以及纤维增生性疾病病理变化的主要因素。RNAi技术可有效抑制特定基因的表达。方法利用小干扰RNA(siRNA)表达框(SEC)快速筛选有效干扰序列,再将有效SEC的siRNA片段连接入表达载体并转染HSFs,获得稳定抑制效果。结果经过筛选的有效SEC可特异性抑制HSFs中COL1A1和COL3A1的表达(分别至野生株的5.00%和6.48%),载体介导的有效干扰序列可稳定抑制HSFs中COL1A1和COL3A1的表达,抑制效果达30d(分别至阴性对照的25.21%和22.12%)。结论SEC和载体介导的RNAi均可有效并且特异性抑制COL1A1和COL3A1在HSFs中的表达。 展开更多
关键词 RNA干扰 基因沉默 col1a1 COL3A1 胶原 siRNA表达框
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前交叉韧带损伤与胶原蛋白基因COL1A1、COL5A1及COL12A1的相关性 被引量:6
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作者 陈鸿 史荔 +6 位作者 张俊 赵道洪 史磊 陆秦楠 张启 段祺辉 舒嵩华 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2017年第12期1849-1854,共6页
背景:目前前交叉韧带损伤发生的病因尚不清楚,有学者认为内部因素和外部因素共同作用导致前交叉韧带的损伤,而作为内部危险因素之一的遗传因素逐渐受到人们的重视。有研究显示,胶原蛋白基因COL1A1,COL5A1和COL12A1与部分高加索人群前交... 背景:目前前交叉韧带损伤发生的病因尚不清楚,有学者认为内部因素和外部因素共同作用导致前交叉韧带的损伤,而作为内部危险因素之一的遗传因素逐渐受到人们的重视。有研究显示,胶原蛋白基因COL1A1,COL5A1和COL12A1与部分高加索人群前交叉韧带损伤相关。目的:探索COL1A1,COL5A1和COL12A1基因多态性与中国汉族人群前交叉韧带损伤发生的关系。方法:收集105名前交叉韧带损伤的汉族患者和110例无前交叉韧带损伤史的汉族个体作为对照,通过限制性片段长度多态性分析、测序技术对COL1A1基因内含子1区的rs1800012,COL5A1基因3’-UTR区的rs12722和rs13946,COL12A1基因外显子65和29区的rs970547和rs240736进行检测并分型。结果与结论:COL1A1和COL5A1基因的rs1800012,rs12722和rs13946基因型、基因表型及单倍型在前交叉韧带损伤病例和对照组中未见显著差异;COL12A1基因的rs970547和rs240736基因型、基因表型及单倍型在前交叉韧带损伤病例和对照组中未见显著差异。但在2组男性前交叉韧带患者中rs970547基因频率差异有显著性意义。说明在中国汉族人群,COL1A1基因Sp1结合位点rs1800012不是中国汉族人群前交叉韧带损伤发生的易感位点;COL5A1基因rs12722和rs13946与中国汉族人群前交叉韧带损伤发生的关联作用不大;COL12A1基因的rs970547和rs240736与中国男性前交叉韧带损伤有一定相关性,携带有COL12A1基因rs970547 A等位基因及AA基因型的男性个体可能增加前交叉韧带损伤的患病风险。 展开更多
关键词 组织构建 组织工程 中国汉族人群 前交叉韧带损伤 胶原蛋白基因 col1a1 COL5A1 COL12A1 单核苷酸多态性 易感性
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Van der Hoeve综合征家系临床表型特征及COL1A1基因突变分析 被引量:3
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作者 李征玥 程静 +4 位作者 卢宇 张旭 金占国 贾婧杰 袁慧军 《中华耳科学杂志》 CSCD 北大核心 2012年第1期80-84,共5页
目的对一个常染色体显性遗传的Van der Hoeve综合征家系进行详尽的临床表型分析及可能的致病基因COL1A1突变检测,探讨该家系基因型及表型的关系。方法对收集到的Van der Hoeve综合征家系进行病史及血液样本采集,并对家庭主要成员进行COL... 目的对一个常染色体显性遗传的Van der Hoeve综合征家系进行详尽的临床表型分析及可能的致病基因COL1A1突变检测,探讨该家系基因型及表型的关系。方法对收集到的Van der Hoeve综合征家系进行病史及血液样本采集,并对家庭主要成员进行COL1A1基因全部外显子DNA序列分析,利用Gene Tool软件及分子生物学网站的信息分析检测数据。结果该家系先证者及其母亲COL1A1基因第40号外显子有两个碱基的缺失(c.2910_2911delAG),导致COL1A1编码的蛋白质的翻译合成在第980位氨基酸提前终止。先证者父亲无此突变。结论该家系先证者及其母亲确定为由c.2910_2911delAG突变导致的Van der Hoeve综合征。与COL1A1基因突变数据库比对,该突变位点未曾报道过。 展开更多
关键词 col1a1基因 突变分析 VAN der Hoeve综合征 成骨不全
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miR-29a-3p调控COL1A1参与喉癌Hep-2细胞增殖及凋亡过程研究 被引量:7
13
作者 黄非 王建洪 +2 位作者 毛贺娟 冯玲 李俊毅 《临床和实验医学杂志》 2017年第19期1911-1914,共4页
目的研究miR-29a-3p是否调控COL1A1参与喉癌Hep-2细胞增殖及凋亡过程。方法前瞻性选取人喉癌Hep-2细胞,分为对照组、实验组1(miR-29a-3p过表达组)、实验组2(miR-29a-3p抑制组),对照组未进行任何处理,实验组1转染miR-29a-3p模拟剂,实验组... 目的研究miR-29a-3p是否调控COL1A1参与喉癌Hep-2细胞增殖及凋亡过程。方法前瞻性选取人喉癌Hep-2细胞,分为对照组、实验组1(miR-29a-3p过表达组)、实验组2(miR-29a-3p抑制组),对照组未进行任何处理,实验组1转染miR-29a-3p模拟剂,实验组2转染miR-29a-3p抑制剂。通过qRT-PCR法检测三组细胞miR-29a-3p及COL1A1基因表达,通过western blotting法检测三组细胞COL1A1蛋白表达。采用双荧光素酶报告基因分析法验证COL1A1是否是miR-29a-3p靶基因。采用MTT比色法检测三组细胞增殖能力,采用流式细胞术检测三组细胞凋亡情况。结果 miR-29a-3p模拟剂转染Hep-2细胞后miR-29a-3p表达升高,COL1A1表达降低;miR-29a-3p抑制剂转染Hep-2细胞后miR-29a-3p表达降低,COL1A1表达升高。双荧光素酶报告基因分析法证实COL1A1是miR-29a-3p靶基因。miR-29a-3p过表达能抑制Hep-2细胞增殖,增加细胞凋亡;miR-29a-3p抑制表达能增强Hep-2细胞增殖,抑制细胞凋亡。结论 miR-29a-3p调控COL1A1参与喉癌Hep-2细胞增殖及凋亡过程。 展开更多
关键词 喉癌 HEP-2细胞 miR-29a-3p col1a1 增殖 凋亡
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驴和马COL1A1基因比较分析 被引量:2
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作者 陈建兴 孙玉江 +3 位作者 潘庆杰 马运峰 嵇传良 刘春环 《江苏农业科学》 北大核心 2017年第10期42-44,共3页
驴具有很大的市场开发潜力和价值。通过生物信息学技术分析了驴COL1A1基因的氨基酸序列特征,以期为阿胶原材料的鉴定或阿胶用驴的选育提供科学依据。经分析发现驴COL1A1基因的氨基酸构成富含大量的甘氨酸和脯氨酸,而色氨酸含量很低。氨... 驴具有很大的市场开发潜力和价值。通过生物信息学技术分析了驴COL1A1基因的氨基酸序列特征,以期为阿胶原材料的鉴定或阿胶用驴的选育提供科学依据。经分析发现驴COL1A1基因的氨基酸构成富含大量的甘氨酸和脯氨酸,而色氨酸含量很低。氨基酸序列开头的22个残基预测为该肽链的信号肽区域,COL1A1蛋白中存在大量的卷曲螺旋。驴和马该基因(剔除gap)mRNA序列间存在12处变异,氨基酸序列间只发现1处替换。提示在做原材料鉴定时,若以该基因为分子标记,应着重检测DNA间的差异。 展开更多
关键词 col1a1基因 比较分析
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COL1A1基因干扰对人结肠癌HCT-8细胞增殖的影响 被引量:1
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作者 李鹏 马艳娇 +5 位作者 李建华 宫鹏涛 杨举 李赫 欧阳红生 张西臣 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2012年第4期418-421,共4页
目的探讨COL1A1基因干扰对人结肠癌HCT-8细胞增殖的影响。方法将COL1A1基因干扰质粒pGPU6/GFP/Neo-COL1A1(RNAi COL1A1)和阴性对照质粒pGPU6/GFP/Neo-shNC(PGNsN)瞬时转染入HCT-8细胞,并设空白对照组。转染后48~72 h,采用半定量RT-PCR... 目的探讨COL1A1基因干扰对人结肠癌HCT-8细胞增殖的影响。方法将COL1A1基因干扰质粒pGPU6/GFP/Neo-COL1A1(RNAi COL1A1)和阴性对照质粒pGPU6/GFP/Neo-shNC(PGNsN)瞬时转染入HCT-8细胞,并设空白对照组。转染后48~72 h,采用半定量RT-PCR法检测COL1A1基因在细胞中的转录水平;MTT法检测细胞的增殖活力;并将各组细胞接种至BALB/c小鼠上皮组织中,每隔6 d分别测量小鼠体内肿瘤大小。结果 RNAi COL1A1组HCT-8细胞COL1A1基因的mRNA转录水平较PGNsN组和空白对照组显著降低(P<0.01)。RNAi COL1A1组与PGNsN组和空白对照组比较,细胞的增殖活力有所降低,第4~7天差异有统计学意义(P<0.05),其中在第5和第6天差异极显著(P<0.01)。RNAi COL1A1组小鼠体内肿瘤大小与PGNsN组和空白对照组比较,前18 d差异无统计学意义(P>0.05);在第24天,显著小于两个对照组(P<0.05);在第30天,差异极显著(P<0.01)。结论 COL1A1基因被干扰后,能够抑制HCT-8细胞增殖,为COL1A1成为癌症治疗的候选基因提供了实验依据。 展开更多
关键词 col1a1基因 RNA干扰 结肠癌 细胞增殖
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成骨不全症Ⅳ型家系COL1A1基因突变 被引量:1
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作者 崔英霞 夏欣一 +6 位作者 史轶超 魏丽 卢洪涌 姚兵 戈一峰 李晓军 黄宇烽 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期344-346,共3页
目的报告1个常染色体显性遗传的成骨不全症Ⅳ型家系COL1A1基因突变,探讨基因型与表型的关系。方法提取该家系所有患者及正常成员和50个健康人对照血样本的DNA。对先证者COL1A1基因的启动子、51个外显子和外显子/内含子剪接处进行PCR并... 目的报告1个常染色体显性遗传的成骨不全症Ⅳ型家系COL1A1基因突变,探讨基因型与表型的关系。方法提取该家系所有患者及正常成员和50个健康人对照血样本的DNA。对先证者COL1A1基因的启动子、51个外显子和外显子/内含子剪接处进行PCR并对产物测序。对家系的另外4个患者和有血缘关系的健康者及50名健康对照者的第25外显子测序。结果先证者和所有患者COL1A1基因测序均显示第25外显子的7872位置碱基发生杂合突变(g.7872G>A,c.1678G>A,p.G560S),但家系中健康者和无血缘关系的50名健康对照者均无此改变,与临床诊断一致。先证者该基因的其他位置未见突变。结论COL1A1基因G560S突变产生的表型是成骨不全症Ⅳ型。50岁以后有听力减退,这是先前相同突变没有描述过的表型。 展开更多
关键词 成骨不全症Ⅳ型 col1a1基因 I型牙本质发育不全 进行性听力减退
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靶向COL1A1基因的shRNA对乳腺癌MDA-MB-231细胞体外侵袭与迁移的影响 被引量:1
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作者 余海浪 马文丽 +3 位作者 周珏宇 孟伟 石嵘 郑文岭 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2013年第8期981-985,共5页
目的探讨Ⅰ型胶原α1链(COL1A1)基因沉默对人乳腺癌MDA-MB-231细胞侵袭与转移的影响。方法设计2条shRNA干扰载体及1条阴性对照载体,分别稳定转染乳腺癌MDA-MB-231细胞。用Western blot法筛选抑制效率最高的细胞进行细胞平板集落形成实... 目的探讨Ⅰ型胶原α1链(COL1A1)基因沉默对人乳腺癌MDA-MB-231细胞侵袭与转移的影响。方法设计2条shRNA干扰载体及1条阴性对照载体,分别稳定转染乳腺癌MDA-MB-231细胞。用Western blot法筛选抑制效率最高的细胞进行细胞平板集落形成实验、细胞黏附实验、细胞迁移及侵袭实验,观察COL1A1基因对MDA-MB-231细胞黏附、运动及侵袭能力的影响。结果转染pshRNA-COL1A1-2干扰载体的MDA-MB-231细胞COL1A1蛋白表达降低最明显,抑制率达66.98%±2.08%,选择该组细胞作为有效干扰组进行后续实验。pshRNA-COL1A1转染组细胞的集落形成率显著低于空白对照组和阴性质粒pshRNA-scramble转染组(P<0.05);细胞黏附实验中pshRNA-COL1A1转染组细胞的吸光度值较对照组明显降低(P<0.001);转染pshRNA-COL1A1质粒组细胞的穿膜细胞数也显著低于空白对照组和阴性质粒pshRNA-scramble转染组(P<0.001)。结论 COL1A1基因沉默可在体外抑制人乳腺癌MDA-MB-231细胞的黏附、侵袭和迁移。 展开更多
关键词 SHRNA col1a1 乳腺癌 侵袭 迁移
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检测COL1A1-PDGFB融合基因协助诊断萎缩型隆突性皮肤纤维肉瘤 被引量:2
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作者 丁小洁 徐文俊 王亚琴 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期100-102,共3页
报告1例萎缩型隆突性皮肤纤维肉瘤。患者女,24岁。患者2年前无明显诱因胸部皮肤出现红斑,逐渐变大,中央萎缩。皮肤科检查:胸部一3 cm×4 cm暗紫红色近圆形斑块,表面光滑,中央萎缩,触之质地韧,无凸起包块,无触痛。皮损组织病理检查:... 报告1例萎缩型隆突性皮肤纤维肉瘤。患者女,24岁。患者2年前无明显诱因胸部皮肤出现红斑,逐渐变大,中央萎缩。皮肤科检查:胸部一3 cm×4 cm暗紫红色近圆形斑块,表面光滑,中央萎缩,触之质地韧,无凸起包块,无触痛。皮损组织病理检查:表皮轻度乳头瘤样增生,真皮萎缩变薄,真皮及皮下脂肪可见短梭形细胞增生,增生细胞和表皮之间可见肿瘤细胞无浸润带;真皮浅、中层区域肿瘤细胞数目较少,排列稍稀疏,细胞呈波浪状排列,平行于表皮;真皮深部和皮下脂肪层可见密集排列的梭形细胞增生,梭形细胞密集排列呈车幅状、席纹状或束状。免疫组化示肿瘤细胞强阳性表达CD34。采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测COL1A1-PDGFB融合基因阳性。诊断:萎缩型隆突性皮肤纤维肉瘤。 展开更多
关键词 隆突性皮肤纤维肉瘤 萎缩型 col1a1-PDGFB RT-PCR
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肺腺癌中COL1A1表达及其功能的生物信息学分析
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作者 邢龙 吴双丽 +4 位作者 袁胜利 李保健 徐敬宣 王丽娟 喻光 《现代医药卫生》 2025年第11期2519-2523,共5页
目的通过生物信息学技术探讨Ⅰ型胶原蛋白α1链(COL1A1)在肺腺癌组织中的表达特征及其与患者预后之间的关联,以及其潜在的生物学功能。方法利用GEPIA数据库分析肺腺癌和正常肺组织COL1A1表达差异并通过HPA数据库进行验证。构建ROC曲线分... 目的通过生物信息学技术探讨Ⅰ型胶原蛋白α1链(COL1A1)在肺腺癌组织中的表达特征及其与患者预后之间的关联,以及其潜在的生物学功能。方法利用GEPIA数据库分析肺腺癌和正常肺组织COL1A1表达差异并通过HPA数据库进行验证。构建ROC曲线分析COL1A1在肺腺癌预后中的预测价值。绘制Kaplan-Meier曲线以进行生存分析,然后通过String数据库得出与COL1A1关系最密切的前10个蛋白(COL1A2、COL3A1、COL5A2、SPARC、LUM、PCOLCE、ADAMTS2、BMP1、ITGB1、RUNX2)。通过R软件分析相关蛋白的生物学功能。结果相比于正常肺组织,COL1A1在肺腺癌组织中显著高表达(P<0.01)。ROC曲线显示,COL1A1在肺腺癌和正常肺组织之间有较好的预测价值。与COL1A1低表达组相比,COL1A1高表达组总体生存期较差(P<0.05)。与COL1A关系密切的前10个蛋白主要在胶原纤维组织、原纤维胶原三聚体、细胞外基质结构成分、蛋白质消化和吸收等方面发挥作用。结论COL1A1的异常表达参与了肺腺癌发生、发展过程,或可成为肺腺癌的诊断、治疗靶点,但其在肺腺癌中发挥的具体功能尚需进一步体外研究。 展开更多
关键词 肺腺癌 Ⅰ型胶原蛋白α1 生物信息学 预后 数据库
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COL1A1基因多态性与高度近视易感性的系统评价 被引量:2
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作者 于洋洋 王洁 崔心明 《中国中医眼科杂志》 2014年第2期100-104,共5页
目的评价COL1A1基因多态性与高度近视(high myopia)的相关性。方法检索Pubmed、万方、维普和CNKI数据库中已发表的相关文献,利用荟萃分析的方法进行病例对照研究。文献纳入标准:研究内容为COL1A1基因多态性与高度近视的病例对照研究;文... 目的评价COL1A1基因多态性与高度近视(high myopia)的相关性。方法检索Pubmed、万方、维普和CNKI数据库中已发表的相关文献,利用荟萃分析的方法进行病例对照研究。文献纳入标准:研究内容为COL1A1基因多态性与高度近视的病例对照研究;文章中提供了基因型频率的完整数据;研究的位点符合H-W(Hardy-Weinberg)平衡。结果经全面的文献检索最终5篇文献被纳入COL1A1基因rs2075555位点的荟萃分析,3篇文献被纳入COL1A1基因rs2269336位点的荟萃分析。合并统计量之后的结果显示,COL1A1基因rs2075555位点的基因型频率和等位基因频率4种遗传模式下在病例对照间均无明显差异(P>0.05),COL1A1基因rs2269336位点在隐性遗传模式下与高度近视的发生存在明显关联(P=0.02)。结论 COL1A1基因rs2269336位点可能是高度近视发生的重要危险因素,增加高度近视的发病风险。 展开更多
关键词 col1a1 基因多态性 高度近视 荟萃分析
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