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五种真蝽(Pentatoma Olivier) mtDNA-COII基因序列分析及系统发育关系初探(半翅目:蝽科) 被引量:14
1
作者 卜云 郑哲民 郭昆 《Entomotaxonomia》 CSCD 北大核心 2005年第2期90-96,共7页
测定并比较分析了真蝽属(Pentatoma)5种昆虫:褐真蝽P.semiannulata、斜纹真蝽P.illuminata、红足真蝽P.rufipes、日本真蝽P.japonica和金绿真蝽P.metallifera以及益蝽亚科2种外群种类(并蝽Pinthaeushumeralis和蠋蝽Armacustos)mtDNA-COI... 测定并比较分析了真蝽属(Pentatoma)5种昆虫:褐真蝽P.semiannulata、斜纹真蝽P.illuminata、红足真蝽P.rufipes、日本真蝽P.japonica和金绿真蝽P.metallifera以及益蝽亚科2种外群种类(并蝽Pinthaeushumeralis和蠋蝽Armacustos)mtDNA-COII基因部分序列,依据分子数据建立了该5种昆虫的系统发育关系。结果显示,5种真蝽COII基因A+T平均含量(73%)高于弹尾目、缨尾目和直翅目昆虫,低于双翅目、鳞翅目及膜翅目昆虫,而与缨翅目的蓟马和半翅目的突角长蝽Oncopeltusfasciatus非常接近。系统发育结果显示,红足真蝽与日本真蝽亲缘关系最近,形成一个姊妹群,斜纹真蝽与金绿真蝽亲缘关系较近,也形成一个姊妹群,褐真蝽为较早分化的种类。 展开更多
关键词 真蝽 MTDNA coii 基因序列分析 系统发育 半翅目 蝽科
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中哈边境阿拉山口口岸输入性猫栉首蚤指名亚种线粒体COI和COII基因序列分析 被引量:2
2
作者 罗丹 王安东 +4 位作者 尹小平 田延河 梁臻 巴特 张江国 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期789-792,共4页
目的分析阿拉山口口岸地区输入性猫栉首蚤指名亚种细胞色素C氧化酶Ⅰ(COI)和Ⅱ(COII)基因特征和系统进化关系。方法从2014年1月入境集装箱死猫体表采集蚤类样本,形态学鉴定完毕后提取DNA,PCR扩增COI和COII基因并测定序列,使用Mega 6.0通... 目的分析阿拉山口口岸地区输入性猫栉首蚤指名亚种细胞色素C氧化酶Ⅰ(COI)和Ⅱ(COII)基因特征和系统进化关系。方法从2014年1月入境集装箱死猫体表采集蚤类样本,形态学鉴定完毕后提取DNA,PCR扩增COI和COII基因并测定序列,使用Mega 6.0通过ML法构建系统发育树。结果猫栉首蚤指名亚种COI和COII基因富含A+T,碱基突变多为置换突变,无移码,缺失和插入突变;Blast显示与澳大利亚猫栉首蚤指名亚种同源性较高(99%)。结论 COI基因序列存在足够的变异能够区分亲缘关系很近的种类,为外来或新发现的蚤种的鉴别提供了分子水平的技术依据。 展开更多
关键词 猫栉首蚤指名亚种 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COI) 细胞色素C氧化酶亚基Ⅱ(coii) 聚合酶链式反应 序列分析 中哈边境
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基于COII全基因序列对蜻科部分昆虫的分子系统发育分析(蜻蜓目:差翅亚目) 被引量:1
3
作者 查岭生 张大治 郑哲民 《宁夏大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2009年第4期370-374,共5页
通过设计蜻蜓目COII全基因的非特异性引物,获得蜻科5亚科15属21种蜻蜓的21条COII基因全序列.采用Clustal X(1.8),MEGA 2.1,Phylip 3.6以及MrBayes 3.0等生物学软件对其进行分子系统学研究,结果显示,①蜻科COII的A+T含量非常低(69%),这... 通过设计蜻蜓目COII全基因的非特异性引物,获得蜻科5亚科15属21种蜻蜓的21条COII基因全序列.采用Clustal X(1.8),MEGA 2.1,Phylip 3.6以及MrBayes 3.0等生物学软件对其进行分子系统学研究,结果显示,①蜻科COII的A+T含量非常低(69%),这与蜻蜓目是一比较原始类群的观点相一致;②蜻科COII全序列均含有2个半胱氨酸,这一点有别于其他类群;③各属内的种类基本聚在一起,大黄赤蜻与红蜻近缘而远离赤蜻属,褐蜻属与赤蜻属近缘,曲缘蜻亚科与赤蜻亚科近缘;④斜痣蜻亚科的进化速度相对较慢,蜻亚科与赤蜻亚科的进化速度稍快. 展开更多
关键词 蜻科 coii 系统发育 蜻蜓目
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云南师宗和江苏盱眙中华按蚊的分子鉴定及COII基因序列分析
4
作者 胡骑 王静林 +2 位作者 何于雯 孙强 吴晶 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2016年第11期20-22,25,共4页
为了了解云南省师宗县和江苏省盱眙县中华按蚊的分子鉴定及COII基因序列特征,2014年7月在云南省师宗县和江苏省盱眙县采集蚊虫标本,通过形态学鉴定出中华按蚊,再提取蚊虫基因组DNA,用COII基因特异引物和序列测定,然后采用生物信息学软... 为了了解云南省师宗县和江苏省盱眙县中华按蚊的分子鉴定及COII基因序列特征,2014年7月在云南省师宗县和江苏省盱眙县采集蚊虫标本,通过形态学鉴定出中华按蚊,再提取蚊虫基因组DNA,用COII基因特异引物和序列测定,然后采用生物信息学软件进行核苷酸序列同源性和遗传进化分析。结果在云南省师宗县县城周围采集蚊虫标本314只,其中按蚊234只(74.52%);在江苏省盱眙县桂五镇采集蚊虫标本212只,其中按蚊143只(67.45%)。经形态学鉴定,每个地方挑选了8只疑似中华按蚊进行序列分析,结果显示,16只蚊虫COII核苷酸序列同源性在98%-100%之间,遗传进化分析显示,16只蚊虫全部与中华按蚊位于同一进化分支内。表明了采用分子鉴定的方法可有效地进行蚊虫种类鉴定。 展开更多
关键词 中华按蚊 coii基因 分子鉴定
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基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI的贵州东方蜜蜂群体遗传分析
5
作者 周文才 李应 +7 位作者 姚丹 万炜 詹洪平 黎华君 贺兴江 冉曜琦 于瀛龙 韦小平 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1819-1828,共10页
【目的】明确贵州省东方蜜蜂群体的遗传结构和遗传多样性,掌握其遗传现状,为贵州省东方蜜蜂的遗传资源评价及保护利用提供参考依据。【方法】基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI片段对贵州省内19个采样点的1282群东方蜜蜂进行遗传分析,计... 【目的】明确贵州省东方蜜蜂群体的遗传结构和遗传多样性,掌握其遗传现状,为贵州省东方蜜蜂的遗传资源评价及保护利用提供参考依据。【方法】基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI片段对贵州省内19个采样点的1282群东方蜜蜂进行遗传分析,计算单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异数(K)和核苷酸多样性(π)等遗传多样性指数,采用中性检验(Tajima's D和Fu's Fs)评估群体扩张情况,通过计算遗传分化系数(Fst)、构建系统发育进化树和分子方差分析评估其遗传分化,并开展环境因子相关分析以明确遗传分化的作用因子。【结果】贵州东方蜜蜂在线粒体tRNA^(leu)~COII片段上的Hd介于0.5421~0.9167,π介于0.00174~0.00527,K介于0.611~1.854,其中台江、雷山、麻江、罗甸、紫云、晴隆和威宁等7个采样点发生过群体扩张;在线粒体COI片段上的Hd介于0.5710~0.9109,π介于0.00109~0.00261,K介于0.874~2.084,其中松桃、江口、印江、台江、石阡、雷山、罗甸、紫云、黔西、晴隆和威宁等11个采样点发生过群体扩张。贵州东、西部东方蜜蜂群体间存在中度遗传分化(在tRNA^(leu)~COII片段上的Fst=0.04±0.02,在COI片段上的Fst=0.07±0.04),贵州西部东方蜜蜂群体内也存在中度遗传分化(在tRNA^(leu)~COII片段上的Fst=0.04±0.02,在COI片段上的Fst=0.07±0.03)。相关分析结果显示,贵州西部东方蜜蜂组群的遗传分化程度与海拔呈弱相关,但与温度、湿度等环境因子呈显著正相关。【结论】贵州省东方蜜蜂在线粒体tRNA^(leu)~COII和COI片段上的遗传多样性处于较高水平,主要归功于蜂群数量大和饲养方式较原始;贵州东方蜜蜂整体上呈现中度遗传分化,且西部东方蜜蜂组群内部的遗传分化程度较东部东方蜜蜂组群更高,主要与温度和湿度等环境因子密切相关,是其为适应所处环境而进化产生,而非海拔因素造成。 展开更多
关键词 东方蜜蜂 tRNA^(leu)~coii片段 COI片段 遗传多样性 遗传分化 环境因子
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基于COII序列的云南东方蜜蜂遗传分化研究 被引量:3
6
作者 殷玲 吉挺 +1 位作者 李冠华 牛德芳 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1500-1504,共5页
【目的】研究云南东方蜜蜂群体的遗传多样性及其遗传分化,为其种质资源保护和有效利用提供参考依据。【方法】对云南不同地理东方蜜蜂群体线粒体的COII部分序列(1-259 bp)进行测序,并分析其遗传分化情况。【结果】在6个云南东方蜜蜂... 【目的】研究云南东方蜜蜂群体的遗传多样性及其遗传分化,为其种质资源保护和有效利用提供参考依据。【方法】对云南不同地理东方蜜蜂群体线粒体的COII部分序列(1-259 bp)进行测序,并分析其遗传分化情况。【结果】在6个云南东方蜜蜂群体的线粒体COII部分序列中发现有5个变异位点,并确定存在7种单倍型,其单倍型多样度为0-0.644,核苷酸多样度为0-0.00420,群体间的遗传分化系数(Fst)为0.00966-0.69753。从基于mt DNA COII单倍型的东方蜜蜂NJ系统发生树可以看出,云南东方蜜蜂群体mt DNA COII序列的7种单倍型与我国境内其他地区及邻国日本的单倍型聚为一类,而与其他国家或地区的单倍型分开。【结论】云南东方蜜蜂群体遗传多样性丰富,不同地理群体间遗传分化明显,尤其是武定东方蜜蜂群体的整齐度较差、遗传结构较复杂。 展开更多
关键词 东方蜜蜂 coii序列 遗传多样性 遗传分化 云南
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利用线粒体COII基因序列对中国尾蛱蝶属系统分化的研究(鳞翅目:蛱蝶科) 被引量:29
7
作者 王戎疆 万宏 +2 位作者 龙玉 雷光春 李绍文 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期243-247,共5页
利用线粒体COII基因序列分析法 ,研究了我国尾蛱蝶属 5种蝴蝶的系统分化。结果表明 ,在尾蛱蝶属 5个种的 12个样品中 ,4 0 5bp长的COII片段有 11 4 %的位点为多态性位点 ,大部分的碱基改变是转换。各物种内不同个体间的差异明显小于不... 利用线粒体COII基因序列分析法 ,研究了我国尾蛱蝶属 5种蝴蝶的系统分化。结果表明 ,在尾蛱蝶属 5个种的 12个样品中 ,4 0 5bp长的COII片段有 11 4 %的位点为多态性位点 ,大部分的碱基改变是转换。各物种内不同个体间的差异明显小于不同物种间的差异 ,种内个体间的差异一般为 0 5 %~ 1 5 % ,各物种间的差异绝大多数在 4 %以上。利用最大似然性法构建的尾蛱蝶属聚类关系图显示 ,尾蛱蝶属蝴蝶分为两大分支 ,一支包括大二尾蛱蝶、二尾蛱蝶和忘忧尾蛱蝶 ,另外一个分支包括窄斑凤尾蛱蝶和黑凤尾蛱蝶聚在一起。在大二尾蛱蝶、二尾蛱蝶和忘忧尾蛱蝶这一分支中 ,大二尾蛱蝶和忘忧尾蛱蝶的亲缘关系较近 ,而二尾蛱蝶较远。这些分子系统学的结果均与形态学的结果相一致 。 展开更多
关键词 鳞翅目 蛱蝶科 尾蛱蝶 线粒体CoⅡ 系统发育分析 中国
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缘蝽科部分种类线粒体COII基因的分子系统学研究(半翅目:异翅亚目)
8
作者 方雪梅 聂晓萌 《阜阳师范学院学报(自然科学版)》 2007年第3期48-51,共4页
测定分析了缘蝽科18种昆虫COII基因部分片段,结果显示,T、C、A、G的平均含量分别为33.6%、16.4%、36.3%和13.7%.A+T平均含量达到69.9%,表现出较强的A+T含量偏向性.碱基替换中转换频率是颠换的1.1倍;转换的发生以T与C之间为主,颠换以T与... 测定分析了缘蝽科18种昆虫COII基因部分片段,结果显示,T、C、A、G的平均含量分别为33.6%、16.4%、36.3%和13.7%.A+T平均含量达到69.9%,表现出较强的A+T含量偏向性.碱基替换中转换频率是颠换的1.1倍;转换的发生以T与C之间为主,颠换以T与A之间为主.从GenBank下载长蝽总科的Oncopeltus fasciatus和猎蝽总科的Triatoma dimidiata作为外群,建立缘蝽科17属18种间的系统发育关系.结果证明狭义巨缘蝽族为一个单系群,竹缘蝽族的两个属为一单系群,鼻缘蝽属与同缘蝽属亲缘关系非常近,环胫黑缘蝽(沟缘蝽亚科)和竹缘蝽族亲缘关系比较近,叶足特缘蝽和怪缘蝽亲缘关系较近. 展开更多
关键词 线粒体DNA COⅡ基因 分予系统学 半翅目 缘蝽科
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COIIS的构想
9
《中国经济和信息化》 1998年第19期49-49,共1页
1、COIIS 是什么? 中国兵器工业信息系统是一个为兵器工业服务的、广域分布的、多层次、多传媒的综合应用信息系统,它主要由三大部分构成: 总公司机关和直属公司构成的上层管理决策及办公自动化系统,它包括以信息中心的计算机主机——... 1、COIIS 是什么? 中国兵器工业信息系统是一个为兵器工业服务的、广域分布的、多层次、多传媒的综合应用信息系统,它主要由三大部分构成: 总公司机关和直属公司构成的上层管理决策及办公自动化系统,它包括以信息中心的计算机主机——卫星通信网中心站——程控电话总机三位一体的核心设备,各厅、局、直属公司的局域网(LAN)及京内企事业单位的局域网,并通过北京城域网连为一体。 展开更多
关键词 coii 兵工 构想 信息应用系统 信息系统 兵器工业 事业单位 总公司 信息通信网 局域
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广东省二化螟越冬地理种群发生水平、遗传多样性及系统发育分析
10
作者 袁龙宇 吴阳刚 +4 位作者 钟文东 李燕芳 戴阳朔 张振飞 肖汉祥 《昆虫学报》 北大核心 2025年第5期667-678,共12页
【目的】对广东省二化螟Chilo suppressalis越冬地理种群基数监测、遗传多样性和系统发育进行调查和分析,为制定该虫有效的联防联控策略提供理论基础和参考。【方法】2017-2022年采取五点取样法对广东省各地区稻田进行二化螟采样,根据... 【目的】对广东省二化螟Chilo suppressalis越冬地理种群基数监测、遗传多样性和系统发育进行调查和分析,为制定该虫有效的联防联控策略提供理论基础和参考。【方法】2017-2022年采取五点取样法对广东省各地区稻田进行二化螟采样,根据越冬代平均数量进行分级确定二化螟发生水平。利用PCR扩增广东省二化螟9个越冬地理种群线粒体基因COI和COII,利用MEGA 7和DNA Sequence Polymorphism 5.10.01软件分析二化螟越冬地理种群遗传多样性和遗传分化趋势,并构建系统发育树和单倍型网络图。【结果】2017-2022年广东省二化螟越冬地理种群基数很高,自2018年开始二化螟种群越冬虫量基本维持在7 500头/hm2,最严重地区可达18 408头/hm2。广东省二化螟9个越冬地理种群总计检测了132条COI和COII序列,COI片段长749 bp,有30个单倍型,54个位点存在多态性;COII片段长474 bp,有22个单倍型,29个多态位点。基于COI和COII序列的系统发育树显示,广东与江西二化螟地理种群聚合为一支;粤北南雄二化螟地理种群较其他地理种群相对独立,其他地理种群聚合为一支。珠三角地区、粤北地区、粤西地区、粤东地区和赣北地区二化螟地理种群单倍型多样性(Hd=0.800~0.909)和核苷酸多样性(Pi=0.0035~0.0102)都处于较高水平,粤西地区地理种群的遗传多样性最低。中性检验结果显示,基于COI序列,总种群Tajima’s D值为-1.043,Fu’Fs值为-5.023;基于COII序列,总种群Tajima’s D值为-1.907,Fu’Fs值为-10.468;COI+COII联合基因序列总种群Tajima’s D值为-1.313,Fu’Fs值为-31.67。基于COI和COII序列的总种群遗传分化指数Fst值分别为0.144和0.102,基因流Nm值分别为1.49和2.20;COI+COII联合基因序列的总种群遗传分化指数Fst值为0.229,基因流Nm值为0.84。【结论】广东省近年来二化螟越冬地理种群呈偏重甚至大发生趋势,且种群具有较高的单倍型多态性和遗传多样性;粤东越冬地理种群多态性较为丰富,粤西越冬地理种群多态性最低。本研究中广东省二化螟越冬种群间存在一定程度的遗传分化,有些地理种群已产生相对较大的分化,如南雄地理种群。广东省和江西省二化螟越冬地理种群具有较近的亲缘关系,除粤西地区外其他不同地理种群之间的遗传分化距离不明显,地理种群之间的遗传分化与分布之间相关性较小,种群间具有频繁的基因交流,种群未经历明显的扩张但处于稳定增长的趋势。 展开更多
关键词 二化螟 线粒体基因 COI coii COI+coii 遗传多样性 系统发育
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福建省峨嵋峰自然保护区蚊种鉴定与构成调查
11
作者 谢静文 王明 +7 位作者 杜雨彤 王刚 尹紫鸽 蔡京虹 刘庆 张恒端 赵彤言 黄恩炯 《寄生虫与医学昆虫学报》 2025年第2期112-118,共7页
目的调查福建省峨嵋峰自然保护区内蚊虫种类构成。方法对蚊幼虫采用吸管法、勺捕法,成蚊采用灯诱法进行样本采集,形态学鉴定与分子生物学方法相结合对所采集蚊虫进行鉴定与分类。结果共鉴定出蚊种13属34种,包括按蚊属(Genus Anopheles M... 目的调查福建省峨嵋峰自然保护区内蚊虫种类构成。方法对蚊幼虫采用吸管法、勺捕法,成蚊采用灯诱法进行样本采集,形态学鉴定与分子生物学方法相结合对所采集蚊虫进行鉴定与分类。结果共鉴定出蚊种13属34种,包括按蚊属(Genus Anopheles Meigen,1818)4种、路蚊属(Genus Lutzia Theobald,1903)2种、库蚊属(Genus Culex Linnaeus,1758)15种、呼蚊属(Genus Hulecoeteomyia Theobald,1904)1种、陆蚊属(Genus Luius Reinert,Harbach et Kitching,2008)1种、伊蚊属(Genus Aedes Meigen,1818)1种、唐蚊属(Genus Downsiomyia Vargas,1950)1种、科蚊属(Genus Collessius Reinert,Harbach et Kitching,2006)1种、覆蚊属(Genus Stegomyia Theobald,1901)4种、蓝带蚊属(Genus Uranotaenia Lynch 1891)1种、阿蚊属(Genus Armigeres Theobald,1901)1种、巨蚊属(Genus Toxorhynchites Theobald,1901)1种、杵蚊属(Genus Tripteroides Giles,1904)1种,分子鉴定系统复核结果表明蚊种鉴定结果正确。结论本研究初步调查了峨嵋峰自然保护区内蚊虫的种类与分布情况,为后续该保护区内蚊媒研究工作提供参考,并为当地蚊虫防治工作提供了科学依据。 展开更多
关键词 蚊虫 种类构成 COI coii 峨嵋峰自然保护区 福建
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CoⅡsingle-ion magnet and its multi-dimensional aggregations:Influence of the structural rigidity on magnetic relaxation process
12
作者 Zhao-Bo Hu Ling-Ao Gui +9 位作者 Long-He Li Tong-Tong Xiao Adam THand Pagnareach Tin Mykhaylo Ozerov Yan Peng Zhongwen Ouyang Zhenxing Wang Zi-Ling Xue You Song 《Chinese Chemical Letters》 2025年第2期518-522,共5页
Two CoⅡ-based complexes,{[Co(dps)_(2)(N_(3))_(2)]·H_(2)O}_n(1)and[Co(dps)_(2)(N_(3))_(2)]_n(2),show a 1D chain and a 3D network,respectively.The central CoⅡions in the complexes have the same coordination envir... Two CoⅡ-based complexes,{[Co(dps)_(2)(N_(3))_(2)]·H_(2)O}_n(1)and[Co(dps)_(2)(N_(3))_(2)]_n(2),show a 1D chain and a 3D network,respectively.The central CoⅡions in the complexes have the same coordination environment with the[Co(dps)_(4)(N_(3))_(2)]unit.Although the differences in crystal parameters are nearly negligible,their magnetic properties are very different.AC susceptibility data show that 1 behaves as a typical field-induced single-ion magnet(SIM)with the out-of-phase(χ_(M)”)signals,while 2 shows ac signals ofχ_(M)”without peaks even under applied dc filed within our measurement window.Far-IR magneto-spectra(FIRMS)show strong spin-phonon couplings at 0 T in 2,likely making the magnetic relaxation in 2 fast,while the couplings are negligible in 1.Small spin-phonon coupling in 1 likely leads to slower magnetic relaxation,making 1 a SIM.The difference in the properties is due to the structural rigidity of 2 in its 3D network,leading to stronger spin-phonon coupling.Combined high-field EPR(HF-EPR)and FIRMS studies give spin-Hamiltonian parameters,including D=64.0(9)cm^(-1),|E|=15.7(2)cm^(-1)for 1 and D=80.0(2)cm^(-1),|E|=19.0(1)cm^(-1)for 2. 展开更多
关键词 Spin-phonon coupling Slow magnetic relaxation Structural rigidity coii compounds Far-IR magneto-spectra
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云南边境地区果实蝇属种类DNA条形码鉴定 被引量:9
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作者 尤欢 周力兵 +1 位作者 邓裕亮 陈国华 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1343-1350,共8页
【目的】果实蝇属Bactrocera中有国际上重要的检疫性害虫,基于形态的物种鉴定有一定的局限性。另一方面,云南边境地区为东南亚地区实蝇入侵我国的重要通道。因此,对该地区实蝇分子鉴定方法的研究对于该属物种的快速准确鉴定具有重要意... 【目的】果实蝇属Bactrocera中有国际上重要的检疫性害虫,基于形态的物种鉴定有一定的局限性。另一方面,云南边境地区为东南亚地区实蝇入侵我国的重要通道。因此,对该地区实蝇分子鉴定方法的研究对于该属物种的快速准确鉴定具有重要意义。本研究旨在探讨DNA条形码技术在果实蝇属物种鉴定中的有效性。【方法】使用线粒体基因COI和COII序列的通用引物对果实蝇属20个物种60份样品进行PCR扩增、测序和序列分析;采取距离方法和建树方法评价2种序列的鉴别能力。【结果】COI和COII序列平均长度分别为682 bp和339 bp,种内和种间遗传差异较大,有较明显的遗传距离间隔(barcoding gap),鉴定成功率分别为91.2%和90.7%。另外,分子系统树表明华实蝇亚属Sinodacus不是单系群。【结论】COI和COII序列均能够将绝大多数果实蝇属物种进行准确鉴别,应用COI或COII序列进行果实蝇属物种鉴定具有一定的可行性。 展开更多
关键词 双翅目 实蝇科 果实蝇属 DNA条形码 COI基因 coii基因 物种鉴定
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陕西省异色瓢虫种群遗传结构及其多样性 被引量:6
14
作者 李菁 张小飞 +3 位作者 徐玲玲 刘津 白明皓 王振营 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期3033-3042,共10页
异色瓢虫是一种重要的天敌昆虫,广泛应用于农业生物防治中.本研究以线粒体COII基因作为分子标记,对陕西省分布的异色瓢虫不同地理种群的遗传结构及遗传多样性进行分析,并探讨不同种群间的遗传分化程度及基因交流水平.结果表明:在21个种... 异色瓢虫是一种重要的天敌昆虫,广泛应用于农业生物防治中.本研究以线粒体COII基因作为分子标记,对陕西省分布的异色瓢虫不同地理种群的遗传结构及遗传多样性进行分析,并探讨不同种群间的遗传分化程度及基因交流水平.结果表明:在21个种群529头异色瓢虫供试样本的,COII序列中,共检测到15种单倍型(Hap1~Hap15),其中Hap1和Hap2所占比例最高分别占总群体的34.4%和37.6%.总群体单倍型多样性指数为0.732,各种群内单倍型多样性范围在0.652~0.786.种群间总基因流为10.13,总群体遗传分化指数为0.024,说明种群间整体遗传分化程度较低.陕西异色瓢虫种群在进化上呈现中性模型,群体大小保持相对稳定,种群间的遗传分化主要来自种群内部.基于Nei遗传距离构建的种群系统发育树,陕南区域种群与陕北和关中区域种群分化明显.种群间遗传分化与地理距离之间存在一定的相关性,并且区域种群的遗传结构与遗传多样性也表现出一定的地理分布模式,推测秦岭的阻隔及南北气候的差异,使陕北、关中与陕南种群间的基因交流存在阻力,导致南北种群间遗传结构和遗传多样性存在差异. 展开更多
关键词 异色瓢虫 地理种群 线粒体DNA coii基因 遗传结构 遗传多样性
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贵阳地区常见尸食性蝇类mtDNA分子标记的检测 被引量:3
15
作者 夏冰 刘玉铭 +5 位作者 王启燕 张红玲 戴佳琳 刘燚 吴爱民 黄江 《中国法医学杂志》 CSCD 2015年第3期244-248,共5页
目的应用mt DNA中COI(348bp)、COII(637bp)及16Sr DNA(513bp)基因序列鉴定贵阳地区常见尸食性蝇类的种属。方法收集贵阳地区常见尸食性蝇类标本,经形态学分类鉴定后提取胸肌DNA,扩增COI(348bp)、COII(637bp)及16Sr DNA(513b... 目的应用mt DNA中COI(348bp)、COII(637bp)及16Sr DNA(513bp)基因序列鉴定贵阳地区常见尸食性蝇类的种属。方法收集贵阳地区常见尸食性蝇类标本,经形态学分类鉴定后提取胸肌DNA,扩增COI(348bp)、COII(637bp)及16Sr DNA(513bp)基因片段,测序后用DNAMAN 4.0序列分析软件进行序列拼接,NCBI中的BLAST、MEGA 5.2软件包对所得序列分析建立种内及种间进化分歧率,并构建系统发育树。结果 COI种间平均进化分歧率为12.55%,种间范围在3.0%-18.6%,种内范围在0%-0.7%;COII种间平均进化分歧率为13.73%,种间范围在5.3%-21.6%,种内范围在0%-0.6%;16Sr DNA种间平均进化分歧率为4.54%,种间范围在0.4%-7.6%,种内范围在0%-0.4%。结论 COI、COII及16Sr DNA可用于尸食性蝇类的种属鉴定,该方法可作为传统分类方法的补充手段。 展开更多
关键词 法医昆虫学 尸食性蝇类 种属鉴定 MTDNA COI coii 16Sr DNA
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中华按蚊的分子鉴定标准 被引量:3
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作者 杨飞龙 李旭东 +1 位作者 闫振天 陈斌 《重庆师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期40-44,共5页
中华按蚊(Anopheles sinensis)是重要的传疟媒介之一,广泛分布于中国和东南亚,它的形态特征和赫坎按蚊种团(Anopheles hyrcanus Group)其他蚊种十分近似,建立中华按蚊的分子鉴定标准十分重要。本研究从实验室中华按蚊品系的一个个体测... 中华按蚊(Anopheles sinensis)是重要的传疟媒介之一,广泛分布于中国和东南亚,它的形态特征和赫坎按蚊种团(Anopheles hyrcanus Group)其他蚊种十分近似,建立中华按蚊的分子鉴定标准十分重要。本研究从实验室中华按蚊品系的一个个体测序了线粒体DNA COI和COII基因,以及核糖体DNA D2、D3和ITS2位点,测序片段长度分别为658、663、551、365、556 bp。这些序列和近缘蚊种对应序列分别用最大似然法构建系统发育树,结果表明中华按蚊的序列均聚合为同一支。将测序的中华按蚊COII序列和已知蚊种的对应序列比对发现其中的保守位点分别是第133位点C,321位点C,382位点C,435位点T,516位点A和651位点C,线粒体DNA COI和COII基因序列的碱基组成具有AT偏向性,分别占69.15%和74.96%。提交了5条序列到NCBI数据库,其中核糖体DNA D2位点序列是首次在中华按蚊中公开报道。 展开更多
关键词 中华按蚊 COI coii D2位点 D3位点 ITS2位点 分子鉴定标准
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中国南方双斑长跗萤叶甲地理种群遗传结构及Wolbachia感染 被引量:2
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作者 李菁 张小飞 +3 位作者 徐玲玲 申圆圆 李肖肖 王振营 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期730-742,共13页
【目的】双斑长跗萤叶甲Monolepta hieroglyphica为多食性害虫,可取食为害多种农作物。本研究旨在探究中国南方地区分布的双斑长跗萤叶甲地理种群的遗传多样性、遗传结构及种群间的遗传分化程度与基因流水平,探究共生菌Wolbachia在中国... 【目的】双斑长跗萤叶甲Monolepta hieroglyphica为多食性害虫,可取食为害多种农作物。本研究旨在探究中国南方地区分布的双斑长跗萤叶甲地理种群的遗传多样性、遗传结构及种群间的遗传分化程度与基因流水平,探究共生菌Wolbachia在中国南方双斑长跗萤叶甲地理种群中的多样性和感染情况。【方法】以线粒体COII基因作为分子标记,对中国南方双斑长跗萤叶甲14个地理种群403头个体的COII基因片段进行PCR扩增及测序,分析单倍型多样性(Hd)、种群间遗传分化指数(Fst)和基因流(Nm),并进行分子方差分析(AMOVA)以及Tajima’s D和Fu’s Fs中性检验,构建单倍型中介网络关系图及系统发育树。PCR扩增Wolbachia的wsp基因,对供试种群进行Wolbachia感染率检测,并利用获得的wsp基因序列进行Wolbachia株系区分和系统发育分析。【结果】在供试的双斑长跗萤叶甲403头个体中共检测到23种COII基因单倍型,在系统进化上分成两大分支。总种群Hd为0.748,各种群的Hd在0.394~0.782间。中性检验结果表明种群在进化上遵循中性模型,在较近的历史时期内没有经历明显的群体扩张事件。总种群的Fst为0.2481,Nm为0.76,AMOVA结果表明种群间的遗传分化主要来自种群内部,占方差比率的73.75%。种群间的遗传距离与地理距离间无显著相关性(R=0.2898,P=0.0640)。14个地理种群的Wolbachia感染率在92.59%~100%之间,平均感染率为97.60%;基于wsp基因序列,在检测的感染个体中共发现6种Wolbachia株系(wMhie1~wMhie6),均属于A大组,这6种株系与已知的代表性株系区别明显而在系统发生树中单独聚为一个分支。【结论】中国南方双斑长跗萤叶甲种群遗传多样性较高,多数种群间存在明显的遗传分化,种群间基因交流较低,遗传分化与地理隔离之间无显著相关性。Wolbachia在中国南方双斑长跗萤叶甲种群中具有很高的感染率及丰富的感染类群。 展开更多
关键词 双斑长跗萤叶甲 地理种群 coii 单倍型 遗传结构 WOLBACHIA
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用mtDNA COⅡ基因序列确定我国北部湾红树植物白骨壤虫灾虫源 被引量:8
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作者 昝启杰 任竹梅 +4 位作者 李后魂 李罡 王勇军 王莉 钟扬 《自然科学进展》 北大核心 2008年第12期1380-1385,共6页
从我国近年来遭受特大虫灾的北部湾沿海红树植物白骨壤上采集害虫标本,测定其线粒体DNA细胞色素c氧化酶亚基Ⅱ(COⅡ)基因序列,并与采自深圳湾白骨壤上的害虫标本以及相关类群的COⅡ基因序列进行同源性比较,结果表明来自北部湾与深圳湾... 从我国近年来遭受特大虫灾的北部湾沿海红树植物白骨壤上采集害虫标本,测定其线粒体DNA细胞色素c氧化酶亚基Ⅱ(COⅡ)基因序列,并与采自深圳湾白骨壤上的害虫标本以及相关类群的COⅡ基因序列进行同源性比较,结果表明来自北部湾与深圳湾白骨壤的虫源均为瘤斑螟属Ptyomaxia,而不是细斑螟属Oligochroa.分子系统发育分析为纠正以前普遍认为广州小斑螟引发我国红树林特大虫灾的观点提供了新的证据. 展开更多
关键词 红树林 白骨壤 瘤斑螟属 细斑螟属 coii基因 分子系统发育分析
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基于线粒体COⅡ基因部分序列的中国斑腿蝗科部分属种系统发育研究
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作者 马兰 《农业灾害研究》 2012年第3期11-13,共3页
基于斑腿蝗科切翅蝗亚科6属11种蝗虫的COⅡ基因585bp序列进行系统发育分析,为该类群的系统发育提供分子生物学方面的证据。通过MEGA5.0软件分析显示这些序列具有明显的高A+T偏向性和R值与距离依赖性特征。分别采用邻接法(Neighbor Joini... 基于斑腿蝗科切翅蝗亚科6属11种蝗虫的COⅡ基因585bp序列进行系统发育分析,为该类群的系统发育提供分子生物学方面的证据。通过MEGA5.0软件分析显示这些序列具有明显的高A+T偏向性和R值与距离依赖性特征。分别采用邻接法(Neighbor Joining,NJ)、最大似然法(Maximum Likelihood,ML)和最大简约法(Maximum Parsimony,MP)构建系统树,结果显示:凸额蝗属、黑纹蝗属与其它各属关系较远;斜翅蝗与南方十字蝗关系较近;越北胸斑蝗与广东斜翅蝗和大斜翅蝗关系较近;异角胸斑蝗与奇冠蝗关系较近;切翅蝗亚科各属种间的关系还需要进一步研究。 展开更多
关键词 斑腿蝗科 切翅蝗亚科 coii基因 系统发育
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检疫性有害生物枣咔实蝇的快速分子鉴定 被引量:2
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作者 陈光辉 李焱 +1 位作者 张小菊 胡红英 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2021年第1期46-54,共9页
枣咔实蝇Carpomya vesuviana Costa是枣树果实的一种重要检疫性害虫,其寄主枣树在我国种植广泛,该虫一旦传入和扩散,将对我国新疆红枣产业造成严重危害。本研究以枣咔实蝇蛹和成虫为对象,通过提取枣咔实蝇蛹和成虫样品的基因组DNA,借助... 枣咔实蝇Carpomya vesuviana Costa是枣树果实的一种重要检疫性害虫,其寄主枣树在我国种植广泛,该虫一旦传入和扩散,将对我国新疆红枣产业造成严重危害。本研究以枣咔实蝇蛹和成虫为对象,通过提取枣咔实蝇蛹和成虫样品的基因组DNA,借助生物信息学分析软件挖掘枣咔实蝇ITS2、16S rRNA、CYT-B-D、CYT-B-C、COI-5'、COI-3'、COII等分子鉴定靶点序列并设计扩增引物,以建立枣咔实蝇的快速分子鉴定技术。PCR扩增、测序和序列相似性结果显示,从枣咔实蝇蛹和成虫中获得的16条序列(含14条新序列),分析表明其中CYT-B、COI、COII可作为枣咔实蝇分子鉴定序列。该技术可应用于枣咔实蝇的识别鉴定、实时监测、早期防治等项工作。 展开更多
关键词 枣咔实蝇 DNA条形码 鉴定 ITS2 16S rRNA CYT-B-D CYT-B-C COI-5' COI-3' coii
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