目的分析甲基转移酶3(METTL3)抑制剂STM2457对人肝癌细胞系HepG2的影响,重点研究其对N6-甲基腺苷(m6A)表达的影响及其抗肿瘤机制。方法将HepG2细胞分为实验组(STM2457处理)和对照组(DMSO处理)。利用纳米孔(Nanopore)测序技术,结合m6Anet...目的分析甲基转移酶3(METTL3)抑制剂STM2457对人肝癌细胞系HepG2的影响,重点研究其对N6-甲基腺苷(m6A)表达的影响及其抗肿瘤机制。方法将HepG2细胞分为实验组(STM2457处理)和对照组(DMSO处理)。利用纳米孔(Nanopore)测序技术,结合m6Anet,NanoCount,xPore和GFOLD方法,分别对m6A修饰水平、转录组表达及差异基因进行分析。通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科(KEGG)对差异基因进行功能富集分析。结果STM2457降低HepG2细胞的m6A修饰位点数量(6446 vs 11549)及修饰水平(0.95±0.03 vs 0.98±0.03),差异具有统计学意义(Z=-19.915,P<0.01)。差异基因分析共筛选出109个上调基因和340个下调基因,其中与肝癌发生发展密切相关的基因PDLIM5、AZGP1和RNASET2,其m6A修饰水平降低,而基因表达水平升高。功能富集分析结果显示,差异基因主要富集在细胞黏附、凋亡、翻译调控及肝细胞癌相关通路。结论STM2457通过抑制METTL3活性,降低HepG2细胞的m6A修饰水平,上调基因PDLIM5,AZGP1和RNASET2的表达,促进HepG2细胞凋亡,为肝癌治疗提供潜在治疗靶点。展开更多
文摘目的分析甲基转移酶3(METTL3)抑制剂STM2457对人肝癌细胞系HepG2的影响,重点研究其对N6-甲基腺苷(m6A)表达的影响及其抗肿瘤机制。方法将HepG2细胞分为实验组(STM2457处理)和对照组(DMSO处理)。利用纳米孔(Nanopore)测序技术,结合m6Anet,NanoCount,xPore和GFOLD方法,分别对m6A修饰水平、转录组表达及差异基因进行分析。通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科(KEGG)对差异基因进行功能富集分析。结果STM2457降低HepG2细胞的m6A修饰位点数量(6446 vs 11549)及修饰水平(0.95±0.03 vs 0.98±0.03),差异具有统计学意义(Z=-19.915,P<0.01)。差异基因分析共筛选出109个上调基因和340个下调基因,其中与肝癌发生发展密切相关的基因PDLIM5、AZGP1和RNASET2,其m6A修饰水平降低,而基因表达水平升高。功能富集分析结果显示,差异基因主要富集在细胞黏附、凋亡、翻译调控及肝细胞癌相关通路。结论STM2457通过抑制METTL3活性,降低HepG2细胞的m6A修饰水平,上调基因PDLIM5,AZGP1和RNASET2的表达,促进HepG2细胞凋亡,为肝癌治疗提供潜在治疗靶点。
