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杉木ClHSP 70基因的克隆及表达模式分析
被引量：
1
1
作者
郭胜周
许祖元
+3 位作者
刘荣林
林秦民
曹光球
曹世江
《广西师范大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第4期213-223,共11页
本研究通过克隆、生物信息学和表达分析方法对杉木热激蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)基因进行研究,为深入理解杉木HSP 70基因的功能和杉木遗传改良以及其可持续栽培提供科学依据。本研究选用杉木优良无性系“洋061”一年生苗作...
本研究通过克隆、生物信息学和表达分析方法对杉木热激蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)基因进行研究,为深入理解杉木HSP 70基因的功能和杉木遗传改良以及其可持续栽培提供科学依据。本研究选用杉木优良无性系“洋061”一年生苗作为试验材料,利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)克隆得到ClHSP 70基因。运用Expasy软件等在线软件预测并分析ClHSP70蛋白的理化性质、跨膜螺旋域、信号肽、二级结构和三级结构;运用Cell-PLoc 2.0在线软件预测蛋白的亚细胞定位;运用Mega 11软件构建系统发育树;克隆ClHSP 70基因并构建到pCAMBIA35s-EGFP载体中,分析ClHSP70蛋白的亚细胞定位;并利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR)对其表达水平进行分析。克隆得到的ClHSP 70基因编码670个氨基酸,ClHSP70蛋白的分子式为C_(3297)H_(5306)N_(940)O_(1008)S_(26),具有不稳定性,不含信号肽和跨膜区域,预测定位于细胞质。系统进化分析表明,杉木ClHSP 70与欧榛Corylus avellana亲缘关系更为密切。亚细胞定位实验结果显示,ClHSP70蛋白定位于细胞核;qRT-PCR表达分析,ClHSP 70基因在叶片中的相对表达量最高。ClHSP 70基因在高温条件下6 h后相对表达量达到峰值,干旱处理12 h其表达量达到最大值,即ClHSP 70基因受高温和干旱胁迫诱导上调表达。杉木ClHSP 70基因的成功克隆与序列分析,揭示了其在杉木不同组织中的表达及对高温与干旱胁迫的响应,并为杉木抗逆性育种提供重要的理论基础。
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关键词
杉木
clhsp
70基因
基因克隆
亚细胞定位
高温与干旱胁迫
在线阅读
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职称材料
甘菊ClHSP70与ClHSP90基因的克隆及表达分析
被引量：
6
2
作者
罗昌
陈东亮
+1 位作者
程曦
黄丛林
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第7期1321-1330,共10页
该研究以甘菊(Chrysanthemum lavandulifolium)为实验材料,通过RT-PCR方法从甘菊转录组数据中分离出热激蛋白合成相关基因,命名为ClHSP70和ClHSP90。序列分析表明,ClHSP70基因ORF全长为2 559bp,编码852个氨基酸,蛋白功能区预测表明含有...
该研究以甘菊(Chrysanthemum lavandulifolium)为实验材料,通过RT-PCR方法从甘菊转录组数据中分离出热激蛋白合成相关基因,命名为ClHSP70和ClHSP90。序列分析表明,ClHSP70基因ORF全长为2 559bp,编码852个氨基酸,蛋白功能区预测表明含有典型的HSP70蛋白NBD和SBD保守结构域;ClHSP90基因ORF全长为2 094bp,编码697个氨基酸,含有HATPase结构域和HSP90保守结构域。生物信息学分析表明,甘菊ClHSP70与大豆(Glycine max)和烟草(Nicotiana tomentosiformis)HSP70蛋白有较高的一致性,ClHSP90基因编码的氨基酸序列与紫茎泽兰(Ageratina adenophora)HSP90高度相似;实时荧光定量表达分析表明,在42℃处理不同时间,甘菊叶片中ClHSP70和ClHSP90基因表达均在0.5h时显著增加,1h达到最大值,2h后缓慢下降;不同组织表达分析表明,甘菊在42℃处理1h后,ClHSP70在成熟叶中的表达量显著高于嫩叶和根等其他组织;ClHSP90在成熟茎中的表达量最高。研究说明,ClHSP70和ClHSP90基因具有热激蛋白特征,参与了甘菊热胁迫应答过程,该研究结果为以后深入研究其基因功能奠定了基础。
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关键词
甘菊
clhsp
70
clhsp
90
热胁迫
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职称材料
题名
杉木ClHSP 70基因的克隆及表达模式分析
被引量：
1
1
作者
郭胜周
许祖元
刘荣林
林秦民
曹光球
曹世江
机构
福建农林大学林学院
国家林业和草原局杉木工程技术研究中心(福建农林大学)
林木逆境生理生态及分子生物学福建省高校重点实验室(福建农林大学)
福建农林大学生命科学学院
出处
《广西师范大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第4期213-223,共11页
基金
“十四五”国家重点研发计划项目(2021YFD2201302)。
文摘
本研究通过克隆、生物信息学和表达分析方法对杉木热激蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)基因进行研究,为深入理解杉木HSP 70基因的功能和杉木遗传改良以及其可持续栽培提供科学依据。本研究选用杉木优良无性系“洋061”一年生苗作为试验材料,利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)克隆得到ClHSP 70基因。运用Expasy软件等在线软件预测并分析ClHSP70蛋白的理化性质、跨膜螺旋域、信号肽、二级结构和三级结构;运用Cell-PLoc 2.0在线软件预测蛋白的亚细胞定位;运用Mega 11软件构建系统发育树;克隆ClHSP 70基因并构建到pCAMBIA35s-EGFP载体中,分析ClHSP70蛋白的亚细胞定位;并利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR)对其表达水平进行分析。克隆得到的ClHSP 70基因编码670个氨基酸,ClHSP70蛋白的分子式为C_(3297)H_(5306)N_(940)O_(1008)S_(26),具有不稳定性,不含信号肽和跨膜区域,预测定位于细胞质。系统进化分析表明,杉木ClHSP 70与欧榛Corylus avellana亲缘关系更为密切。亚细胞定位实验结果显示,ClHSP70蛋白定位于细胞核;qRT-PCR表达分析,ClHSP 70基因在叶片中的相对表达量最高。ClHSP 70基因在高温条件下6 h后相对表达量达到峰值,干旱处理12 h其表达量达到最大值,即ClHSP 70基因受高温和干旱胁迫诱导上调表达。杉木ClHSP 70基因的成功克隆与序列分析,揭示了其在杉木不同组织中的表达及对高温与干旱胁迫的响应,并为杉木抗逆性育种提供重要的理论基础。
关键词
杉木
clhsp
70基因
基因克隆
亚细胞定位
高温与干旱胁迫
Keywords
Chinese fir
clhsp
70 gene
gene cloning
subcellular localization
high temperature and drought stress
分类号
S722.8 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
甘菊ClHSP70与ClHSP90基因的克隆及表达分析
被引量：
6
2
作者
罗昌
陈东亮
程曦
黄丛林
机构
北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第7期1321-1330,共10页
基金
北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20140109)
文摘
该研究以甘菊(Chrysanthemum lavandulifolium)为实验材料,通过RT-PCR方法从甘菊转录组数据中分离出热激蛋白合成相关基因,命名为ClHSP70和ClHSP90。序列分析表明,ClHSP70基因ORF全长为2 559bp,编码852个氨基酸,蛋白功能区预测表明含有典型的HSP70蛋白NBD和SBD保守结构域;ClHSP90基因ORF全长为2 094bp,编码697个氨基酸,含有HATPase结构域和HSP90保守结构域。生物信息学分析表明,甘菊ClHSP70与大豆(Glycine max)和烟草(Nicotiana tomentosiformis)HSP70蛋白有较高的一致性,ClHSP90基因编码的氨基酸序列与紫茎泽兰(Ageratina adenophora)HSP90高度相似;实时荧光定量表达分析表明,在42℃处理不同时间,甘菊叶片中ClHSP70和ClHSP90基因表达均在0.5h时显著增加,1h达到最大值,2h后缓慢下降;不同组织表达分析表明,甘菊在42℃处理1h后,ClHSP70在成熟叶中的表达量显著高于嫩叶和根等其他组织;ClHSP90在成熟茎中的表达量最高。研究说明,ClHSP70和ClHSP90基因具有热激蛋白特征,参与了甘菊热胁迫应答过程,该研究结果为以后深入研究其基因功能奠定了基础。
关键词
甘菊
clhsp
70
clhsp
90
热胁迫
Keywords
Chrysanthemum lavandulifolium
heat stress
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杉木ClHSP 70基因的克隆及表达模式分析
郭胜周
许祖元
刘荣林
林秦民
曹光球
曹世江
《广西师范大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025
1
在线阅读
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职称材料
2
甘菊ClHSP70与ClHSP90基因的克隆及表达分析
罗昌
陈东亮
程曦
黄丛林
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
6
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职称材料
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