In this review, we highlight the latest development of multi-channel microfluidic chip-mass spectrometry（chip-MS） in cell analysis and metabolite detection. Following a brief introduction about history and developme...In this review, we highlight the latest development of multi-channel microfluidic chip-mass spectrometry（chip-MS） in cell analysis and metabolite detection. Following a brief introduction about history and development of multi-channel microchip and MS combination, we will elaborate the key issues of constructing chip-MS platform interface. Then exciting progresses made in this field should be reviewed with well exemplified works, including chip-MS technology for cell introduction, pretreatment of cell secretions and cell metabolite analysis. We will also describe the development of integrated total analysis systems proposed by our group. We hope this brief review will inspire interested readers and provide knowledge about chip-MS platform in the bioanalysis field, particularly in cell analysis and metabolite identifying applications.展开更多
目的找出铜绿假单胞菌PAEO1野生型与PDO300、PAEO1 lasI rhlI基因缺陷型、PAEO1 lasRrhlR基因缺陷型菌株之间的差异蛋白质,探讨这些蛋白质与铜绿假单胞菌生物膜形成的关系。方法应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI)技术和CM10...目的找出铜绿假单胞菌PAEO1野生型与PDO300、PAEO1 lasI rhlI基因缺陷型、PAEO1 lasRrhlR基因缺陷型菌株之间的差异蛋白质,探讨这些蛋白质与铜绿假单胞菌生物膜形成的关系。方法应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI)技术和CM10蛋白质芯片检测PAEO1野生型与PDO300、PAEO1 lasI rhlI基因缺陷型、PAEO1 lasRrhlR基因缺陷型菌株的菌体蛋白,采用Biomarker Wizard软件进行分析,筛选差异蛋白质。结果PDO300菌株与PAEO1野生型菌株相比有10个蛋白质高表达(P<0.01),相对分子质量分别为4074、3817、8923、8148、3332、4521、7621、11 594、7831、13 751;有6个蛋白质低表达(P<0.01),相对分子质量分别为6199、6899、12 379、6115、6763、8576;PAEO1 lasI rhlI基因缺陷型菌株与PAEO1野生型菌株相比,有1个蛋白质低表达(P<0.05),相对分子质量为6910,PAEO1 lasRrhlR基因缺陷型菌株与PAEO1野生型菌株相比,有2个蛋白质高表达(P<0.05),相对分子质量分别为8924和8790;有2个蛋白质低表达(P<0.05),相对分子质量分别为6735和6986。结论用蛋白质芯片和SELDI技术对铜绿假单胞菌进行蛋白质组学研究,方法简便、敏感性高,可发现一系列低Mr或低丰度的差异蛋白质。展开更多
[目的]应用表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱技术(surface-enhanced laser desorption/inionation time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)筛选腰椎间盘突出症(lumbar intervertebral disk protrusion,LIDP)壮族血瘀证患者...[目的]应用表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱技术(surface-enhanced laser desorption/inionation time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)筛选腰椎间盘突出症(lumbar intervertebral disk protrusion,LIDP)壮族血瘀证患者血清差异表达蛋白,建立壮族LIDP血瘀证的血清蛋白指纹图谱模型,并验证血清中的差异蛋白峰。[方法]按既定统一标准选取30例壮族LIDP血瘀证患者作为观察组,然后将同期就诊并与观察组患者年龄、性别等基线资料相近的30例汉族LIDP血瘀证患者作为对照组。均按同样方法提取60例患者外周血的血清样本,采用SELDI-TOF-MS及蛋白质芯片技术检测并绘制蛋白质质谱图并用Biomarker Wizard软件识别蛋白峰信息,再运用SPSS16.0软件及Biomarker Patterns软件对数据进行统计分析处理,建立壮族LIDP血瘀证的血清诊断模型,然后对模型进行双盲验证并通过ExPASy数据库对相关差异蛋白进行蛋白检索。[结果]在两组组间有75个明显表达差异的蛋白质峰(P<0.05),用其中三个蛋白即可对LIDP壮族血瘀证和汉族血瘀证进行正确区分,其准确性分别为LIDP壮族血瘀证100%、汉族血瘀证100%;另外选取单独的68例样本对模型进行双盲验证测试,结果准确性分别为LIDP壮族血瘀证94%、LIDP汉族血瘀证83%;对建立决策树模型的3个蛋白通过分子量检索推测,显示这3个蛋白中有1个(4 011.45)在LIDP壮族血瘀证组高表达、有2个(1 191.53、1 412.52)在LIDP汉族血瘀证组高表达。[结论]壮族LIDP血瘀证患者血清中存在异常表达的蛋白质;由3个差异蛋白组成的血清蛋白质指纹图谱模型可作为壮族LIDP血瘀证的血清标志物诊断模型。展开更多
基金supported by National Natural Science Foundation of China (Nos. 81373373, 21435002, 21621003)
文摘In this review, we highlight the latest development of multi-channel microfluidic chip-mass spectrometry（chip-MS） in cell analysis and metabolite detection. Following a brief introduction about history and development of multi-channel microchip and MS combination, we will elaborate the key issues of constructing chip-MS platform interface. Then exciting progresses made in this field should be reviewed with well exemplified works, including chip-MS technology for cell introduction, pretreatment of cell secretions and cell metabolite analysis. We will also describe the development of integrated total analysis systems proposed by our group. We hope this brief review will inspire interested readers and provide knowledge about chip-MS platform in the bioanalysis field, particularly in cell analysis and metabolite identifying applications.
文摘目的找出铜绿假单胞菌PAEO1野生型与PDO300、PAEO1 lasI rhlI基因缺陷型、PAEO1 lasRrhlR基因缺陷型菌株之间的差异蛋白质,探讨这些蛋白质与铜绿假单胞菌生物膜形成的关系。方法应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI)技术和CM10蛋白质芯片检测PAEO1野生型与PDO300、PAEO1 lasI rhlI基因缺陷型、PAEO1 lasRrhlR基因缺陷型菌株的菌体蛋白,采用Biomarker Wizard软件进行分析,筛选差异蛋白质。结果PDO300菌株与PAEO1野生型菌株相比有10个蛋白质高表达(P<0.01),相对分子质量分别为4074、3817、8923、8148、3332、4521、7621、11 594、7831、13 751;有6个蛋白质低表达(P<0.01),相对分子质量分别为6199、6899、12 379、6115、6763、8576;PAEO1 lasI rhlI基因缺陷型菌株与PAEO1野生型菌株相比,有1个蛋白质低表达(P<0.05),相对分子质量为6910,PAEO1 lasRrhlR基因缺陷型菌株与PAEO1野生型菌株相比,有2个蛋白质高表达(P<0.05),相对分子质量分别为8924和8790;有2个蛋白质低表达(P<0.05),相对分子质量分别为6735和6986。结论用蛋白质芯片和SELDI技术对铜绿假单胞菌进行蛋白质组学研究,方法简便、敏感性高,可发现一系列低Mr或低丰度的差异蛋白质。
文摘[目的]应用表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱技术(surface-enhanced laser desorption/inionation time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)筛选腰椎间盘突出症(lumbar intervertebral disk protrusion,LIDP)壮族血瘀证患者血清差异表达蛋白,建立壮族LIDP血瘀证的血清蛋白指纹图谱模型,并验证血清中的差异蛋白峰。[方法]按既定统一标准选取30例壮族LIDP血瘀证患者作为观察组,然后将同期就诊并与观察组患者年龄、性别等基线资料相近的30例汉族LIDP血瘀证患者作为对照组。均按同样方法提取60例患者外周血的血清样本,采用SELDI-TOF-MS及蛋白质芯片技术检测并绘制蛋白质质谱图并用Biomarker Wizard软件识别蛋白峰信息,再运用SPSS16.0软件及Biomarker Patterns软件对数据进行统计分析处理,建立壮族LIDP血瘀证的血清诊断模型,然后对模型进行双盲验证并通过ExPASy数据库对相关差异蛋白进行蛋白检索。[结果]在两组组间有75个明显表达差异的蛋白质峰(P<0.05),用其中三个蛋白即可对LIDP壮族血瘀证和汉族血瘀证进行正确区分,其准确性分别为LIDP壮族血瘀证100%、汉族血瘀证100%;另外选取单独的68例样本对模型进行双盲验证测试,结果准确性分别为LIDP壮族血瘀证94%、LIDP汉族血瘀证83%;对建立决策树模型的3个蛋白通过分子量检索推测,显示这3个蛋白中有1个(4 011.45)在LIDP壮族血瘀证组高表达、有2个(1 191.53、1 412.52)在LIDP汉族血瘀证组高表达。[结论]壮族LIDP血瘀证患者血清中存在异常表达的蛋白质;由3个差异蛋白组成的血清蛋白质指纹图谱模型可作为壮族LIDP血瘀证的血清标志物诊断模型。
