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利用GEO公共数据集分析CHAF1A在肿瘤中的表达及临床意义 被引量:2
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作者 李雪玲 丁明彦 +5 位作者 孙荣泽 王琪 曲川 孟冉冉 周光明 丁千山 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期642-650,共9页
目的 :研究染色体组装因子1单位A(chromatin assembly factor 1,subunit A,CHAF1A)在人体多种肿瘤中的表达情况,探讨CHAF1A与肝细胞癌、乳腺癌和肺癌临床病理特征的关系,并评价检测CHAF1A表达对肝细胞癌、乳腺癌和肺癌预后评估的意义。... 目的 :研究染色体组装因子1单位A(chromatin assembly factor 1,subunit A,CHAF1A)在人体多种肿瘤中的表达情况,探讨CHAF1A与肝细胞癌、乳腺癌和肺癌临床病理特征的关系,并评价检测CHAF1A表达对肝细胞癌、乳腺癌和肺癌预后评估的意义。方法 :从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)网站收集与CHAF1A表达及人类肿瘤相关的基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)公共数据集,下载这些肿瘤样本表达谱资料及其对应的临床信息。采用χ2检验分析CHAF1A表达与肿瘤患者临床病理指标的相关性,Kaplan-Meier法进行总生存和无复发生存期分析。采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法分析预测受CHAF1A调控的相关基因。结果 :CHAF1A在肝细胞癌、结直肠癌、食管癌、肺癌、卵巢癌、黑素瘤、鼻咽癌和胃癌中均高表达(P<0.05)。CHAF1A表达与乳腺癌患者的p53基因缺失、p53基因突变、雌激素受体表达、孕激素受体表达以及Elston组织学分级密切相关(P<0.05),与肺癌患者的年龄、性别、T分期、淋巴结浸润和远端转移密切相关(P<0.05),而在肝细胞癌、乳腺癌和肺癌中与患者手术预后相关(P<0.05)。CHAF1A可能调控与细胞周期调控、DNA复制以及细胞骨架调节相关的基因集。结论 :CHAF1A在多种肿瘤中高表达,推测其可以作为潜在的判断肿瘤患者预后的标志物以及治疗肿瘤的靶标。 展开更多
关键词 肿瘤 数据库 蛋白质 染色体蛋白质类 非组蛋白 基因表达 chaf1A
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染色体组装因子1亚基A(CHAF1A)和增殖细胞核抗原在宫颈鳞状细胞癌组织高表达并与恶性程度正相关 被引量:6
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作者 罗煜立 王倩 +1 位作者 田谱 贾英 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1696-1701,共6页
目的探讨染色体组装因子1亚基A(CHAF1A)和增殖细胞核抗原(PCNA)在宫颈鳞状细胞癌(CSCC)组织中的表达和临床意义。方法荧光定量PCR检测CSCC组织和对应癌旁组织中CHAF1A和PCNA的mRNA的水平,免疫组织化学染色法检测正常宫颈上皮、宫颈上皮... 目的探讨染色体组装因子1亚基A(CHAF1A)和增殖细胞核抗原(PCNA)在宫颈鳞状细胞癌(CSCC)组织中的表达和临床意义。方法荧光定量PCR检测CSCC组织和对应癌旁组织中CHAF1A和PCNA的mRNA的水平,免疫组织化学染色法检测正常宫颈上皮、宫颈上皮内瘤变(CIN)以及CSCC组织中CHAF1A和PCNA蛋白的表达,分析其与临床病理参数的关系,并探讨相关性。结果 CHAF1A和PCNA在CIN及CSCC组织中表达明显高于正常宫颈组织,CHAF1A和PCNA呈正相关。CHAF1A与CSCC的分化程度、肿瘤大小、浸润深度及有人乳头瘤病毒(HPV)感染有关,PCNA与CSCC的分化程度、国际妇产科联盟(FIGO)分期、淋巴结转移、浸润深度及有HPV感染有关。结论 CHAF1A和PCNA在CSCC中高表达并且与恶性程度相关,二者呈正相关。 展开更多
关键词 染色体组装因子1亚基A(chaf1A) 增殖细胞核抗原(PCNA) 宫颈鳞状细胞癌(CSCC) 免疫组织组化学染色法
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CHAF1A在肝细胞癌组织中的表达及其临床意义
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作者 付慧英 黄灿 +2 位作者 鄢业鸿 彭小东 张志谦 《实用临床医学(江西)》 CAS 2016年第1期5-9,F0004,共6页
目的研究染色质装配因子1(Chromatin assembly factor 1,CAF-1)的最大亚基p150(CHAF1A)在原发性肝细胞癌中的表达情况,并分析其表达与原发性肝细胞癌患者的性别、年龄、病理分化、门静脉癌栓、肿瘤大小、临床分期、血清HBsAg状况、肝硬... 目的研究染色质装配因子1(Chromatin assembly factor 1,CAF-1)的最大亚基p150(CHAF1A)在原发性肝细胞癌中的表达情况,并分析其表达与原发性肝细胞癌患者的性别、年龄、病理分化、门静脉癌栓、肿瘤大小、临床分期、血清HBsAg状况、肝硬化及血清AFP水平等临床病理特征的关系。方法筛选自2010年6月至2014年10月在南昌大学第一附属医院普外科行手术切除,并且全部经过病理诊断证实为原发性肝细胞癌的患者80例,取对应患者病灶边缘2cm处的正常肝组织80例及因外伤或肝内胆管结石行手术切除的正常肝组织患者20例分别作为癌旁和正常对照。应用免疫组织化学检测CHAF1A在肝癌组织、癌旁肝组织、正常肝组织中的表达,采用χ2检验分析CHAF1A在这三组中的表达差异,并分析CHAF1A的表达与肝癌临床病理特征的关系。结果CHAF1A在正常肝组织和癌旁肝组织的高表达率显著高于肝癌组织(P<0.05)。CHAF1A在不同病理分化肝癌组织中的高表达率差异有统计学意义(P=0.027);在有无伴门静脉癌栓肝脏组织中,高表达率差异有统计学意义(P<0.05)。CHAF1A在肝癌组织中的表达与性别、年龄、临床分期、肿瘤大小、血清HBsAg、肝硬化及血清AFP水平无相关性(P>0.05)。结论 CHAF1A的表达可能影响肝癌组织分化和侵袭性。但与肝癌患者的性别、年龄、临床分期、肿瘤的大小、HBsAg状况、肝硬化及血清AFP水平无相关性。 展开更多
关键词 chaf1A 原发性肝细胞癌 免疫组化 门脉癌栓 低分化
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CHAF1B promotes the progression of lung squamous-cell carcinoma by inhibiting SETD7 expression
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作者 Zhuo Zheng Yongfang Lin +4 位作者 Hua Guo Zheng Liu Xiaoliang Jie Guizhen Wang Guangbiao Zhou 《Frontiers of Medicine》 2025年第2期318-328,共11页
The p60 subunit of the chromatin assembly factor-1 complex,that is,chromatin assembly factor-1 subunit B(CHAF1B),is a histone H3/H4 chaperone crucial for the transcriptional regulation of cell differentiation and self... The p60 subunit of the chromatin assembly factor-1 complex,that is,chromatin assembly factor-1 subunit B(CHAF1B),is a histone H3/H4 chaperone crucial for the transcriptional regulation of cell differentiation and self-renewal.CHAF1B is overexpressed in several cancers and may represent a potential target for cancer therapy.However,its expression and clinical significance in lung squamous-cell carcinoma(LUSC)remain unclear.In this study,we performed weighted gene correlation network analysis to analyze the Gene Expression Omnibus GSE68793 LUSC dataset and identified CHAF1B as one of the most important driver gene candidates.Immunohistochemical analysis of 126 LUSC tumor samples and 80 adjacent normal lung tissues showed the marked upregulation of CHAF1B in tumor tissues and the negative association of its expression level with patient survival outcomes.Silencing of CHAF1B suppressed LUSC proliferation in vitro and LUSC tumor growth in vivo.Furthermore,bulk RNA sequencing of CHAF1B knockdown cells indicated SET domain containing 7(SETD7)as a significant CHAF1B target gene.In addition,CHAF1B competitively binds to the SETD7 promoter region and represses its transcription.Altogether,these results imply that CHAF1B plays a vital role in LUSC tumorigenesis and may represent a potential molecular target for this deadly disease. 展开更多
关键词 chaf1B cell cycle lung squamous cell carcinoma SETD7 WGCNA
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加密探空资料在华南暴雨数值预报的应用试验 被引量:21
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作者 黄燕燕 万齐林 +2 位作者 陈子通 张诚忠 丁伟钰 《热带气象学报》 CSCD 北大核心 2011年第2期179-188,共10页
应用逐时同化预报系统CHAF进行加密探空资料同化试验,比较了同化加密探空资料与仅同化常规探空资料所得同化分析场和模式预报结果的差异。同化加密探空资料所得分析场水汽的均方根误差减小,水汽条件和大气环流形势与实况更接近。以加密... 应用逐时同化预报系统CHAF进行加密探空资料同化试验,比较了同化加密探空资料与仅同化常规探空资料所得同化分析场和模式预报结果的差异。同化加密探空资料所得分析场水汽的均方根误差减小,水汽条件和大气环流形势与实况更接近。以加密同化探空资料所得分析场为模式初始场进行预报,雨区的分布和降水量级都较控制试验有改善。分析模式预报改善的原因,主要是大气水汽条件与环流模拟的改善以及二者之间很好的配合。 展开更多
关键词 逐时同化预报系统chaf 加密探空资料 华南暴雨 数值预报 GRAPES模式
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碳羟磷灰石吸附水溶性F^-的影响因素研究 被引量:2
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作者 黄志良 刘羽 +2 位作者 张昱 曾洁琼 张芳 《武汉化工学院学报》 2002年第4期27-30,共4页
对碳羟磷灰石 (CHAP)固定水溶性F- 的影响因素进行了较为系统的实验研究 .结果表明 :除F- 率与F- 的初始浓度、pH值、温度 (T≤ 0℃或T≥ 4 0℃ )显负相关 ,与作用时间、CHAP用量、温度 (0℃≤T≤ 4 0℃ )显正相关 .通过正交实验确定了... 对碳羟磷灰石 (CHAP)固定水溶性F- 的影响因素进行了较为系统的实验研究 .结果表明 :除F- 率与F- 的初始浓度、pH值、温度 (T≤ 0℃或T≥ 4 0℃ )显负相关 ,与作用时间、CHAP用量、温度 (0℃≤T≤ 4 0℃ )显正相关 .通过正交实验确定了最佳吸附条件 :CHAP用量 1 .5g/L ,pH值为 7,体系温度 2 0~ 4 0℃ ,作用时间为 1 2 0min ,F- 初始浓度小于 3 0 展开更多
关键词 碳羟磷灰石 吸附 水溶性 影响因素 研究 chaf 氟离子 吸附作用
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小麦杂交二代(F_2)杂交优势利用可行性研究 被引量:2
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作者 陈功海 张强 +3 位作者 张宇庆 许辉 江庆生 王宗彦 《大麦与谷类科学》 2008年第4期17-18,共2页
在当前小麦杂种优势利用研究未取得重大突破的情况下,无法直接利用小麦杂交一代用于大田生产,但如果选择适合的杂交二代作种子,可有效规避小麦杂交一代直接利用的各种制约因素,我们对现有的小麦杂交二代进行选择,并进行品种比较试验,筛... 在当前小麦杂种优势利用研究未取得重大突破的情况下,无法直接利用小麦杂交一代用于大田生产,但如果选择适合的杂交二代作种子,可有效规避小麦杂交一代直接利用的各种制约因素,我们对现有的小麦杂交二代进行选择,并进行品种比较试验,筛选出了有明显产量优势可利用的杂交二代组合,试图为杂交小麦研究找一个新方向。 展开更多
关键词 小麦杂交二代(F2) 杂交优势利用 经济产量 chaf2
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Improvement of groundwater resources potential by artificial recharge technique: A case study of Charf El Akab aquifer in the Tangier region, Morocco 被引量:2
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作者 SADIKI Moulay Lhassan EL MANSOURI Bouabid +3 位作者 BENSEDDIK Badr CHAO Jamal KILI Malika EL MEZOUARY Lhoussaine 《Journal of Groundwater Science and Engineering》 2019年第3期224-236,共13页
In arid and semi-arid zones,water is the most vulnerable resource to climate change.In fact,various techniques such as artificial recharge are adopted to restore aquifers and to ensure aquifer sustainability in relati... In arid and semi-arid zones,water is the most vulnerable resource to climate change.In fact,various techniques such as artificial recharge are adopted to restore aquifers and to ensure aquifer sustainability in relation to the accelerated pace of exploitation.Morocco is a Mediterranean country highly vulnerable to climate change,many of its main aquifers are subjected to excessive drawdowns.This technique is practiced to increase potentiality of these aquifers.In the Northwestern area of Morocco,the significant development experienced by Tangier City in the industrial,tourism,and commercial sectors will lead to increased water requirements-up to 5 067 L/s(159.8 mm^3)by 2030.However,the Charf El Akab aquifer system,subject to artificial recharge,is the only groundwater resource of Tangier region;hence,a rational management context is needed to ensure aquifer sustainability,and optimized exploitation under the background of differing constraints,such as increased water requirements,and climate change impacts.This work aims to respond,for the first time,to the Charf El Akab aquifer overexploitation problem,and to evaluate the future scenarios of its exploitation in the event of failure of one of the superficial resources.This work also presents a synthesized hydrodynamic modeling based on the results of the numerical simulations carried out using Feflow software for 2004(date of cessation of injections)and 2011(date of resumption of these facilities),making it possible to evaluate the impact of the artificial recharge on the piezometric level of the aquifer on a spatiotemporal scale.Finally,the exploitation scenarios have shown that the aquifer of Charf El Akab will not adequatly provide for the region's water requirements on the future horizon,entailing an optimal management of water resources in the region and an intentionally increased recharge rate. 展开更多
关键词 Artificial RECHARGE CLIMATE change Numerical modeling chaf EL Akab FEFLOW EXPLOITATION scenarios
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