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Selection Vector for Direct Cloning of Proof Reading Polymerase Chain Reaction Products Based on the Lethal <i>ccdB</i>Gene in <i>Escherichia coli </i>
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作者 Pascal Weibel Miriam Ender +2 位作者 Jerzy Madon Annelies S. Zinkernagel Reto A. Schuepbach 《Advances in Microbiology》 2013年第1期14-20,共7页
Introducing PCR products into plasmids vectors is key for molecular techniques. Ideally cloning vectors are easy to construct, modify and propagate, neither require advanced techniques nor special equipment or reagent... Introducing PCR products into plasmids vectors is key for molecular techniques. Ideally cloning vectors are easy to construct, modify and propagate, neither require advanced techniques nor special equipment or reagents and efficiently incorporate PCR products at close to zero empty vector background. We provide an easy to engineer self-made cloning vector, neither requiring sophisticated tools or techniques nor advanced cloning knowledge. Through recombination we obtained the pUC18ccdB vector, carrying the ccdB suicide gene within the pUC18 backbone. When SmaI cleaved (within the ccdB) vector was T4 ligated with small (0.2 kbp) and intermediate (1.3 to 2.2 kbp) blunt end PCR-products and transformed into E. coli, the amount of clones with incorporated PCR product was comparable to commercial PCR-cloning kits and at a close to zero PCR product negative background. In conclusion we present a simple, versatile and cheap approach to an efficient “home made” PCR-cloning vector that allows integration of crude blunt end PCR products at close to zero background. 展开更多
关键词 PCR-Cloning VECTOR BLUNT End ccdb Toxic gene
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一种快速高效的基于CcdB致死基因和SmaⅠ酶切位点的克隆体系构建 被引量:3
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作者 党会杰 刘秦 +4 位作者 许文茸 张传玲 王森 涂鲁迪 牛晓磊 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期2874-2879,共6页
PCR片段快速准确的构建到克隆载体是分子生物学实验的关键技术之一。快速高效低背景克隆体系的建立可以显著提高PCR产物的克隆效率及大大缩短克隆时间。本实验室开发出一种在常规条件下进行快速高效PCR连接的克隆体系。本研究将含有ccd ... PCR片段快速准确的构建到克隆载体是分子生物学实验的关键技术之一。快速高效低背景克隆体系的建立可以显著提高PCR产物的克隆效率及大大缩短克隆时间。本实验室开发出一种在常规条件下进行快速高效PCR连接的克隆体系。本研究将含有ccd B致死基因的gateway cassette片段,插入p UC18载体,成功构建p UC18-Ccd B致死载体,在此基础上结合ccd B致死基因内部的SmaⅠ酶切位点,开发出将PCR产物、SmaⅠ限制性内切酶、T4连接酶及p UC18-Ccd B致死载体一起加入离心管后共孵育10 min,即可转化大肠杆菌。对插入片段的重组质粒进行了酶切,PCR和测序验证,证实了该克隆体系高效可行,具有极高的阳性克隆率。该体系的建立具有高效低背景的特点,并且极大的减少了克隆步骤,省去了胶回收及双酶切过程,缩短了克隆时间,同时继承了p UC18载体的优点,具有很强的应用性及推广性。 展开更多
关键词 快速高效 克隆体系 ccdb基因 SmaⅠ酶切位点
原文传递
利用毒素蛋白基因ccdB构建高效低背景T-载体 被引量:3
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作者 耿晓姗 刘秦 +2 位作者 党会杰 武军政 罗丽娟 《热带生物学报》 2016年第2期232-236,共5页
高效低背景T-载体的构建可显著提高克隆PCR产物的效率。笔者介绍1种在实验室常规条件下简单快捷制备高效低背景T载体的方法。将含有限制酶Xcm I酶切位点的ccd B致死基因作为插入DNA片段连接到p MD19-T Simple Vector骨架上得到重组质粒... 高效低背景T-载体的构建可显著提高克隆PCR产物的效率。笔者介绍1种在实验室常规条件下简单快捷制备高效低背景T载体的方法。将含有限制酶Xcm I酶切位点的ccd B致死基因作为插入DNA片段连接到p MD19-T Simple Vector骨架上得到重组质粒,通过菌落PCR、酶切分析及测序验证正确的重组质粒经限制酶Xcm I酶切即得到T-载体。该T-载体含有的ccd B致死基因可以降低载体自连的背景干扰,提高了T-A克隆效率,具有较高的阳性克隆率,继承了p MD19-T Simple Vector的优点,与普通T-载体相比,还具有高效、低背景的优越性。整个操作过程简易可行,具备一定的应用前景。 展开更多
关键词 高效 低背景 ccdb基因 pMD19-T SIMPLE VECTOR T-载体
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基于Golden Gate高效构建psiCHECK双荧光素酶报告基因的方法及应用
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作者 杜雅婷 于文君 +2 位作者 李燕 付元磊 孙考祥 《山东第一医科大学(山东省医学科学院)学报》 CAS 2023年第3期180-185,共6页
目的 基于Golden Gate技术构建psiCHECK-CcdB重组双荧光素酶报告载体,并探讨其能否用于RNA干扰(RNA interference, RNAi)药物筛选。方法 通过聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增CcdB致死基因、氯霉素基因与Golden Gate组... 目的 基于Golden Gate技术构建psiCHECK-CcdB重组双荧光素酶报告载体,并探讨其能否用于RNA干扰(RNA interference, RNAi)药物筛选。方法 通过聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增CcdB致死基因、氯霉素基因与Golden Gate组装所需的BsmBI酶切位点,将其克隆至psiCHECK-2载体,构建出重组载体psiCHECK-CcdB。利用2种大肠杆菌DB3.1与DH5α对该载体的致死效率进行检测,选用1 387 bp大小的外源片段克隆至psiCHECK-CcdB载体,检测其连接效率,并验证重组载体能否发挥双荧光素酶报告系统功能,监测目的基因的表达变化。结果 菌落PCR以及测序鉴定psiCHECK-CcdB重组质粒构建成功,该质粒可有效致死无法耐受CcdB毒素的大肠杆菌DH5α菌株,在DB3.1菌株中正常生长。采用Golden Gate的方法可将外源片段简单快速克隆至psiCHECKCcdB载体中,连接效率显著提高且低背景克隆。通过测定双荧光素酶表达强度,证实了小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)靶向性结合目的基因可显著下调荧光素酶的表达,成功发挥双荧光素酶报告基因功能。结论 本研究成功构建了psiCHECK-CcdB重组双荧光素酶报告载体,应用Golden Gate组装技术,简化了实验操作流程,降低了实验成本,具备较高的阳性克隆率与多片段一次性组装的潜力,在RNAi药物筛选领域应用前景广阔。 展开更多
关键词 Golden Gate ccdb基因 双荧光素酶报告基因 分子克隆 RNAi药物筛选
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