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实时肛拭子Xpert Carba-R检测预警造血干细胞移植患者CRO血流感染的临床可行性研究 被引量：2
1
作者 谢岱蓉 千晨静 +5 位作者 李紫璇 石威 仲照东 夏凌辉 吴秋玲 洪梅 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1043-1050,共8页
目的分析造血干细胞移植(HSCT)患者耐碳青霉烯类革兰阴性菌(CRO)肠道定植菌株与血流感染(BSI)菌株的同源性,验证实时肛拭子Xpert Carba-R检测在临床应用中的价值,探讨其预警BSI的可行性。方法收集并分析2021年1月至2021年12月从HSCT患... 目的分析造血干细胞移植(HSCT)患者耐碳青霉烯类革兰阴性菌(CRO)肠道定植菌株与血流感染(BSI)菌株的同源性,验证实时肛拭子Xpert Carba-R检测在临床应用中的价值,探讨其预警BSI的可行性。方法收集并分析2021年1月至2021年12月从HSCT患者的肛拭子和血培养样本中获得的耐药菌株,使用菌种鉴定、抗菌药物耐药表型、全基因组测序(WGS)、多位点序列分型和碳青霉烯酶型鉴别等方法,验证CRO肠道定植和BSI菌株的同源性。对2021年8月至2022年8月的HSCT患者同时进行肛拭子培养和实时肛拭子Xpert Cabar-R酶型筛查,以纯化菌落碳青霉烯酶基因多重实时聚合酶链反应(PCR)扩增产物的测序结果为参照标准,验证实时肛拭子Xpert Cabar-R检测的准确性。结果本研究共纳入10例HSCT患者的24株CRO菌株,其中肠道定植菌14株,BSI菌10株。同一患者的CRO肠道定植和BSI菌株及其碳青霉烯酶基因高度一致,WGS显示同一患者的CRO肠道定植菌和BSI菌的亲缘关系比不同患者的菌株关系更密切。此外,本研究纳入184例HSCT患者的488份肛拭子标本,肛拭子培养和实时肛拭子Xpert Cabar-R的CRO检出率分别为16.4%和18.4%,实时肛拭子Xpert Carba-R检测的总体敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别为96.6%、72.8%、90.6%和88.9%。结论HSCT患者CRO肠道定植菌株与BSI菌株具有高度同源性,实时肛拭子Xpert Carba-R是检测常见碳青霉烯酶基因可靠且方便的方法,可替代肛拭子培养预警CRO-BSI的发生。 展开更多
关键词 造血干细胞移植 耐碳青霉烯类革兰阴性菌 肠道菌群 定植 血流感染 Xpert carba-r
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三种检测常见碳青霉烯酶型方法的评估研究 被引量：3
2
作者 邵丽娜 赵锋 +2 位作者 徐佳恩 朱水龙 俞云松 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期763-768,共6页
目的评估mCIM联合eCIM试验、Carba-5和Carba-R三种方法检测碳青霉烯类耐药细菌(carbapenem-resistant organisms,CRO)中常见碳青霉烯酶型的性能。方法随机挑选2019年1月至2020年12月浙江大学医学院附属邵逸夫医院临床分离的122株非重复... 目的评估mCIM联合eCIM试验、Carba-5和Carba-R三种方法检测碳青霉烯类耐药细菌(carbapenem-resistant organisms,CRO)中常见碳青霉烯酶型的性能。方法随机挑选2019年1月至2020年12月浙江大学医学院附属邵逸夫医院临床分离的122株非重复CRO菌株,应用生物梅里埃MALDI-TOF MS全自动快速质谱仪对菌株进行菌种鉴定,分别采用改良碳青霉烯类抗生素灭活试验(mCIM联合eCIM试验)、Carba-5检测条和Carba-R试剂盒对所有菌株进行碳青霉烯酶型检测;以PCR法检测结果为金标准,评价上述3种检测方法的性能。结果122株CRO菌株属于12个不同菌种,PCR法碳青霉烯酶型检测结果:共112株检测结果阳性,KPC-2型阳性70株,占57%(70/122),其中肺炎克雷伯菌46株,铜绿假单胞菌12株,其他菌株12株;OXA-232型阳性19株占15%(19/122),均为肺炎克雷伯菌;NDM型阳性20株占16%(20/122),其中NDM-1型阳性7株和NDM-5型阳性13株,以大肠埃希菌为主(12/20);IMP-4型阳性2株,分别为肺炎克雷伯菌和阿氏肠杆菌;检测出1株同时产KPC-2和IMP-4的肺炎克雷伯菌;未检测到VIM型碳青霉烯酶;有10株未检出以上5种基因型。与金标准PCR方法相比mCIM联合eCIM试验灵敏度为95.65%(22/23),特异度为100.00%(90/90),阳性预测值(PPV)为100.00%(22/22),阴性预测值(NPV)为98.90%(90/91),诊断准确度为99.11%(112/113);Carba-5和Carba-R试验的灵敏度、特异性、PPV、NPV和诊断准确度均为100%。结论碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌和铜绿假单胞菌临床微生物实验室可以使用Carba-5试验快速、准确地检测常见碳青霉烯酶型,有条件的实验室还可以选择Carba-R试验,并监测患者是否存在碳青霉烯耐药菌的定植;而Carba-5和Carba-R检测结果阴性时,建议结合药敏结果进行mCIM联合eCIM试验检测。 展开更多
关键词 碳青霉烯类耐药阴性菌 碳青霉烯酶 mCIM联合eCIM试验 Carba-5 carba-r
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