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辣椒CaTPS8基因克隆与表达分析
被引量:
4
1
作者
赵淑芳
苟秉调
+5 位作者
魏敏
段盼盼
王永富
杨楠
张高原
魏兵强
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期1568-1578,共11页
海藻糖-6-磷酸合酶(Trehalose-6-phosphate synthase,TPS)在植物非生物胁迫响应中起着重要的调控作用。以辣椒品种‘强丰101’为材料,对CaTPS8基因进行克隆和表达分析。结果表明,该基因CDS的完整开放阅读框为2553 bp,编码850个氨基酸。...
海藻糖-6-磷酸合酶(Trehalose-6-phosphate synthase,TPS)在植物非生物胁迫响应中起着重要的调控作用。以辣椒品种‘强丰101’为材料,对CaTPS8基因进行克隆和表达分析。结果表明,该基因CDS的完整开放阅读框为2553 bp,编码850个氨基酸。生物信息学分析发现,CaTPS8蛋白的分子质量为96 ku,理论等电点为5.65,不稳定系数为48.09,推测为不稳定蛋白。蛋白结构预测显示CaTPS8蛋白包含Glyco_transf_20和GT20_TPS两个保守结构域,属于亲水性蛋白,没有跨膜结构和信号肽序列。二级、三级结构预测表明该蛋白的结构主要为α-螺旋和无规则卷曲。系统进化关系分析表明,CaTPS8蛋白与马铃薯和番茄的同源性最高,其相似度分别为87.78%和86.92%,与高粱的同源序列相似度最低,为64.76%。实时荧光定量PCR分析表明,CaTPS8基因在辣椒花中表达量最高。同时,CaTPS8基因的表达受到低温的诱导,在处理3 h时相对表达量最高,约为对照的25倍。此外,IAA、ABA、SA、GA 3和MeJA处理能够抑制CaTPS8基因的表达。研究结果为进一步阐明CaTPS8基因响应辣椒非生物胁迫的分子机理奠定基础。
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关键词
辣椒
catps8
基因克隆
表达分析
生物信息学
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职称材料
题名
辣椒CaTPS8基因克隆与表达分析
被引量:
4
1
作者
赵淑芳
苟秉调
魏敏
段盼盼
王永富
杨楠
张高原
魏兵强
机构
甘肃农业大学园艺学院
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期1568-1578,共11页
基金
国家自然科学基金(31760572)
甘肃省重点研发计划(21YF5NA091)
甘肃省高校创新基金(2020B-128)。
文摘
海藻糖-6-磷酸合酶(Trehalose-6-phosphate synthase,TPS)在植物非生物胁迫响应中起着重要的调控作用。以辣椒品种‘强丰101’为材料,对CaTPS8基因进行克隆和表达分析。结果表明,该基因CDS的完整开放阅读框为2553 bp,编码850个氨基酸。生物信息学分析发现,CaTPS8蛋白的分子质量为96 ku,理论等电点为5.65,不稳定系数为48.09,推测为不稳定蛋白。蛋白结构预测显示CaTPS8蛋白包含Glyco_transf_20和GT20_TPS两个保守结构域,属于亲水性蛋白,没有跨膜结构和信号肽序列。二级、三级结构预测表明该蛋白的结构主要为α-螺旋和无规则卷曲。系统进化关系分析表明,CaTPS8蛋白与马铃薯和番茄的同源性最高,其相似度分别为87.78%和86.92%,与高粱的同源序列相似度最低,为64.76%。实时荧光定量PCR分析表明,CaTPS8基因在辣椒花中表达量最高。同时,CaTPS8基因的表达受到低温的诱导,在处理3 h时相对表达量最高,约为对照的25倍。此外,IAA、ABA、SA、GA 3和MeJA处理能够抑制CaTPS8基因的表达。研究结果为进一步阐明CaTPS8基因响应辣椒非生物胁迫的分子机理奠定基础。
关键词
辣椒
catps8
基因克隆
表达分析
生物信息学
Keywords
Capsicum annuum L.
catps8
Gene cloning
Expression analysis
Bioinformatics
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
辣椒CaTPS8基因克隆与表达分析
赵淑芳
苟秉调
魏敏
段盼盼
王永富
杨楠
张高原
魏兵强
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
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