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题名辣椒CaCP26基因的cDNA克隆和分析
被引量：4
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作者
李国琴
吉姣姣
巩振辉
黄炜
李大伟
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机构
西北农林科技大学园艺学院
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出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第11期111-116,共6页
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基金
公益性行业(农业)
科研专项经费干制辣椒(20090325)
+3 种基金
国家自然科学基金(30771467)
陕西省蔬菜产业技术体系(2009cytx-02)
陕西省农业攻关项目(2011K02-09)
西北农林科技大学唐仲英育种基金资助项目(66)
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文摘
利用cDNA-AFLP方法,在辣椒雄性不育两用系的可育株花蕾与不育株花蕾获得阳性差异TDF（transcription derived fragment,转录衍生片段）,通过电子克隆的方法获得大小为865 bp的cDNA序列,并在辣椒雄性不育两用系HW58可育株花蕾中进行RT-PCR验证,测序结果与电子克隆结果的一致性高达99.61%。经Blast N比对,所克隆基因与烟草CP26基因序列的同源性高达90%,命名为CaCP26（GenBank登录号为GQ999612）。该基因871 bp,包含一个864 bp的开放阅读框,编码287个氨基酸,所编码的蛋白质为疏水蛋白,分子质量30 710.47 u,理论等电点为5.807,有跨膜域,无信号肽,二级结构以无规则卷曲为主;利用Swiss-model得到CaCP26蛋白（65~285aa）的三级结构;系统进化树结果显示,辣椒CaCP26与烟草CP26的亲缘关系最近。半定量RT-PCR分析表明,CaCP26在小孢子单核期的辣椒雄性不育两用系可育株的相对表达量是不育株花蕾相对表达量的6.58倍。
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关键词
辣椒
cacp26
基因克隆
分析
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Keywords
Pepper
cacp26
Gene clone
Analysis
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分类号
S641.3
[农业科学—蔬菜学]
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