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柯萨奇B5型病毒安徽分离株的鉴定及VP1区基因特征分析 被引量:2
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作者 史永林 张永根 胡万富 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2014年第11期979-981,1028,共4页
目的了解手足口病相关病原CVB5病毒安徽分离株VP1基因遗传进化特征。方法用RD和Hep-2两种细胞对采集的手足口病临床病例咽拭子标本进行病毒分离,出现CPE后培养物上清,采用微量中和试验鉴定毒株血清型;抽提病毒RNA,用RT-PCR扩增VP1基因,... 目的了解手足口病相关病原CVB5病毒安徽分离株VP1基因遗传进化特征。方法用RD和Hep-2两种细胞对采集的手足口病临床病例咽拭子标本进行病毒分离,出现CPE后培养物上清,采用微量中和试验鉴定毒株血清型;抽提病毒RNA,用RT-PCR扩增VP1基因,对扩增产物进行基因序列测定,采用ClustalX2.0和Mega5.0生物软件对测序结果与国内外参考毒株进行基因亲缘性进化分析。结果 2株毒株微量中和试验鉴定为CVB5,基因测序显示VP1区核苷酸长度均为891bp,其核苷酸和氨基酸序列同源性均为100%;基因进化分析显示,安徽分离株与山东、河南和浙江分离毒株亲缘性较近,处于同一进化分支CladeⅠ,核苷酸同源性为92.56%-98.94%,氨基酸同源性为92.93%-100%;与国外参考株及CVB5的原型株(Faulkner/)比对,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为78.89%-83.84%和96.81%-98.59%。结论分离到的2株病毒均为肠道病毒CVB5,其VP1区基因和氨基酸序列变异较小,与国内流行参考株同源性高。 展开更多
关键词 手足口病 cvb5 VP1基因 遗传分析
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中药抗病毒鼻咽雾化吸入剂体外抗CVB_3、CVB_5作用研究 被引量:1
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作者 胡晓蕙 汪涛 +1 位作者 高岚 蒋连泓 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2001年第8期731-733,共3页
关键词 中药 抗病毒药物 鼻咽雾化吸入剂 抗CVB3 cvb5
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龙岩市柯萨奇病毒B5型基因特征分析
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作者 张彦锋 陈前进 +5 位作者 曹春远 何春荣 何云 廖亦红 吴水新 罗招福 《海峡预防医学杂志》 CAS 2018年第1期68-70,共3页
目的分析龙岩市2012年病毒性脑炎病例柯萨奇B组病毒5型(CVB5)的基因特征。方法采集患者脑脊液进行病毒分离,用中和试验确定毒株血清型,用008-013(GCRTGCAATGAYTTCTCWGT/GGIGCRTTICCYTCIGTCCA)和012-011(ATGTAYGTICCICCIGGIGG/GCICCIGAYT... 目的分析龙岩市2012年病毒性脑炎病例柯萨奇B组病毒5型(CVB5)的基因特征。方法采集患者脑脊液进行病毒分离,用中和试验确定毒株血清型,用008-013(GCRTGCAATGAYTTCTCWGT/GGIGCRTTICCYTCIGTCCA)和012-011(ATGTAYGTICCICCIGGIGG/GCICCIGAYTGITGICCRAA)两对引物分段扩增VP1区,进行序列分析。结果从152份患者脑脊液标本中,分离出2株CVB5,其部分VP1编码区序列长度为469/434个核苷酸,编码156/144个氨基酸。2株核苷酸同源性为92%,氨基酸同源性86%;与原型株Faulkner的核苷酸同源性73%~77%,氨基酸同源性82%~91%。与2011年3株龙岩分离株的核苷酸同源性83%~92%,氨基酸同源性78%~93%。系统进化树分析显示,2株龙岩分离株同属D组基因型。结论龙岩市2012年流行的CVB5病毒株出现了较大变异,患者可能出现神经系统并发症。应加强对CVB5株所致疾病的监测及其遗传进化的研究,为相关疾病防控提供依据。 展开更多
关键词 柯萨奇B组病毒5型(cvb5) 病毒性脑炎 VP1编码区 基因特征
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柯萨奇病毒B5的VP1区域基因特征分析及蛋白二级结构预测 被引量:3
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作者 饶清 龙淑英 +3 位作者 何文姬 蒋鸿超 孙强明 张桢 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期106-114,共9页
柯萨奇病毒B组5型(Coxsackievirus B5,CVB5)感染人体后可引起一系列疾病,包括上呼吸道感染、腹泻、手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)、病毒性脑炎、无菌性脑膜炎、胰腺炎、弛缓性麻痹、扩张性心肌炎以及糖尿病等症状。为了... 柯萨奇病毒B组5型(Coxsackievirus B5,CVB5)感染人体后可引起一系列疾病,包括上呼吸道感染、腹泻、手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)、病毒性脑炎、无菌性脑膜炎、胰腺炎、弛缓性麻痹、扩张性心肌炎以及糖尿病等症状。为了解云南省手足口病和疱疹性咽峡炎患者中CVB5的分子特征,本研究从2018-2019年昆明市儿童医院收集的HFMD和疱疹性咽峡炎(Herpangina,HA)患者粪便中分离得到9株CVB5,基于CVB5的VP1区的系统进化树以及蛋白二级结构的预测来分析分离株的基因序列特征以及与CVB5原型株Faulkner之间的差异,并对CVB5的分子流行病学特征进行分析。结果显示,2018-2019年分离株均属于E基因簇,与Faulkner株相比,所有分离株的VP1区域的氨基酸出现共同的10个氨基酸突变且增加了1个蛋白连接位点。本研究初步探索了肠道病毒CVB5进化过程中突变导致患者症状的差异以及揭示CVB5的全球流行趋势。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒B组5型(cvb5) 进化分析 基因特征
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21-清咽滴丸抗柯萨奇病毒CVB_3,CVB_5作用的研究 被引量:1
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作者 王小龙 陈霞 +3 位作者 迟玮 褚玉晶 李志媛 李晓眠 《天津药学》 2012年第1期6-8,共3页
目的:探究清咽滴丸及其六种中药成分(甘草、青黛、冰片、诃子、牛黄和薄荷)提取物对柯萨奇病毒B3、B5的抑制作用。方法:采用MTT法检测活细胞生存率,结合观察CPE,在细胞水平上检验清咽滴丸及其六种成分对CVB3、CVB5增殖的抑制作用。取其... 目的:探究清咽滴丸及其六种中药成分(甘草、青黛、冰片、诃子、牛黄和薄荷)提取物对柯萨奇病毒B3、B5的抑制作用。方法:采用MTT法检测活细胞生存率,结合观察CPE,在细胞水平上检验清咽滴丸及其六种成分对CVB3、CVB5增殖的抑制作用。取其有效成分后,进一步用血清药理学的方法,检验经机体吸收后药物是否仍然具有抗病毒的效果。结果:在细胞水平上,清咽滴丸及其六种主要成分都对细胞有明显毒性作用,但只有清咽滴丸、甘草、诃子可以抑制CVB3、CVB5在细胞内的增殖。血清药理学进一步验证清咽滴丸、甘草、诃子对CVB3、CVB5有抑制作用。结论:清咽滴丸对CVB3、CVB5有一定的抗感染能力和治疗效果,其中起主要作用的成分是甘草和诃子,且抑制作用呈一定的浓度、时间依赖性。 展开更多
关键词 清咽滴丸 甘草 诃子 CVB3 cvb5
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2014年山东省柯萨奇病毒B5型的分子流行病学研究 被引量:2
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作者 王倩 林小娟 +2 位作者 王海岩 陶泽新 徐爱强 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期518-523,共6页
为了解山东省柯萨奇病毒B5型(Coxsackievirus B5,CV-B5)的分子进化特征,本研究对山东省2014年1~12月无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM)病例标本和环境污水监测标本进行肠道病毒(Enterovirus,EV)分离,阳性分离物采用分子生物学方法鉴... 为了解山东省柯萨奇病毒B5型(Coxsackievirus B5,CV-B5)的分子进化特征,本研究对山东省2014年1~12月无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM)病例标本和环境污水监测标本进行肠道病毒(Enterovirus,EV)分离,阳性分离物采用分子生物学方法鉴定型别,并对CV-B5的VP1区序列进行系统进化树分析。结果显示,2014年AM病例中分离到69株CV-B5,占EV分离株43.95%;环境污水中分离到159株CV-B5,占非脊髓灰质炎EV分离株34.49%。上述CV-B5分离株具有季节性特征,夏秋季高峰明显。系统进化树分析表明,本研究分离株属于A、B两个基因簇,各簇之内AM和环境污水分离株之间有密切的亲缘关系,且环境污水分离株具有一定的地域聚集性。A、B基因簇的组内遗传距离分别为0.026、0.030,A基因簇与B基因簇组间遗传距离为0.085,提示CV-B5在山东地区存在2个传播链共循环,同时可能存在CV-B5跨地区传播和流行。本研究结果证明环境监测具有对EV相关疾病的预警能力。 展开更多
关键词 环境监测 无菌性脑膜炎 肠道病毒(EV) 柯萨奇病毒B5型(CV-B5) 分子流行病学
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The nonstructural protein 2C of Coxsackie B virus has RNA helicase and chaperoning activities 被引量:2
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作者 Ziyu Chen Xiaobei Xiong +7 位作者 Yiyang Li Muhan Huang Yujie Ren Di Wu Yang Qiu Mingzhou Chen Ting Shu Xi Zhou 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2022年第5期656-663,共8页
RNA-remodeling proteins,including RNA helicases and chaperones,play vital roles in the remodeling of structured RNAs.During viral replication,viruses require RNA-remodeling proteins to facilitate proper folding and/or... RNA-remodeling proteins,including RNA helicases and chaperones,play vital roles in the remodeling of structured RNAs.During viral replication,viruses require RNA-remodeling proteins to facilitate proper folding and/or re-folding the viral RNA elements.Coxsackieviruses B3(CVB3)and Coxsackieviruses B5(CVB5),belonging to the genus Enterovirus in the family Picornaviridae,have been reported to cause various infectious diseases such as hand-foot-and-mouth disease,aseptic meningitis,and viral myocarditis.However,little is known about whether CVB3 and CVB5 encode any RNA remodeling proteins.In this study,we showed that 2C proteins of CVB3 and CVB5 contained the conserved SF3 helicase A,B,and C motifs,and functioned not only as RNA helicase that unwound RNA helix bidirectionally in an NTP-dependent manner,but also as RNA chaperone that remodeled structured RNAs and facilitated RNA strand annealing independently of NTP.In addition,we determined that the NTPase activity and RNA helicase activity of 2C proteins of CVB3 and CVB5 were dependent on the presence of divalent metallic ions.Our findings demonstrate that 2C proteins of CVBs possess RNA-remodeling activity and underline the functional importance of 2C protein in the life cycle of CVBs. 展开更多
关键词 2C protein Coxsackieviruses B3(CVB3) Coxsackieviruses B5(cvb5) NTPASE RNA helicase RNA chaperon
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柯萨奇病毒B组5型山东分离株基因特征分析 被引量:2
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作者 曹梦圆 崔亚楠 +6 位作者 王敏 姚雪 韦庆娟 胡弢 邢薇佳 史卫峰 李娟 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第6期659-664,670,共7页
目的探明山东11株柯萨奇病毒B组5型(CVB5)的全基因组特征,探讨CVB5病毒遗传进化规律。方法采集2020年山东省手足口病患者的粪便样本,通过临床样本荧光定量检测、病毒分离、高通量和一代测序验证,共获得11株CVB5分离株,同时结合GenBank... 目的探明山东11株柯萨奇病毒B组5型(CVB5)的全基因组特征,探讨CVB5病毒遗传进化规律。方法采集2020年山东省手足口病患者的粪便样本,通过临床样本荧光定量检测、病毒分离、高通量和一代测序验证,共获得11株CVB5分离株,同时结合GenBank公共数据库中收录的CVB5病毒株全长基因组和结构蛋白VP1基因序列,构建最大似然系统进化树,研究CVB5基因特征和遗传进化规律。结果11株CVB5分离株全长基因组呈高度核苷酸和氨基酸相似性(>99.9%),与多数2008-2020年我国流行毒株均位于全基因组进化树的Group 4分支,且与2013年江苏省分离株417核苷酸相似性最高,为96.8%;11株CVB5分离株与Group 4参考株相比,P3区3A、3B、3C和3D基因核苷酸同源性均低于P1和P2区其他基因,且多为同义突变;11株CVB5分离株VP1基因位于我国主要流行亚型即C4基因亚型中,与2018年山东省分离株SWG14、SWG44、JN18120亲缘关系较近,核苷酸同源性为96.1%~98.2%。结论CVB5毒株在我国多地持续流行,11株山东分离株同国内多数CVB5株的全基因组及VP1基因均位于同一进化分支,说明11株分离株均为近期国内流行株,它们所在Group 4为国内优势流行分支,C4基因亚型为国内VP1基因流行亚型。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒B组5型(cvb5) 手足口病 全基因组 VP1 遗传进化
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Long noncoding RNA 1392 regulates MDA5 by interaction with ELAVL1 to inhibit coxsackievirus B5 infection 被引量:2
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作者 Jing Li Jinwei Li +4 位作者 Peiying Teng Fan Yang Jihong Zhang Bo Sun Wei Chen 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2023年第5期699-708,共10页
Long noncoding RNAs(lncRNAs)modulate many aspects of biological and pathological processes.Recent studies have shown that host lncRNAs participate in the antiviral immune response,but functional lncRNAs in coxsackievi... Long noncoding RNAs(lncRNAs)modulate many aspects of biological and pathological processes.Recent studies have shown that host lncRNAs participate in the antiviral immune response,but functional lncRNAs in coxsackievirus B5(CVB5)infection remain unknown.Here,we identified a novel cytoplasmic lncRNA,LINC1392,which was highly inducible in CVB5 infected RD cells in a time-and dose-dependent manner,and also can be induced by the viral RNA and IFN-β.Further investigation showed that LINC1392 promoted several important interferon-stimulated genes(ISGs)expression,including IFIT1,IFIT2,and IFITM3 by activating MDA5,thereby inhibiting the replication of CVB5 in vitro.Mechanistically,LINC1392 bound to ELAV like RNA binding protein 1(ELAVL1)and blocked ELAVL1 interaction with MDA5.Functional study revealed that the 245–835 nt locus of LINC1392 exerted the antiviral effect and was also an important site for ELAVL1 binding.In mice,LINC1392 could inhibit CVB5 replication and alleviated the histopathological lesions of intestinal and brain tissues induced by viral infection.Our findings collectively reveal that the novel LINC1392 acts as a positive regulator in the IFN-I signaling pathway against CVB5 infection.Elucidating the underlying mechanisms on how lncRNA regulats the host innate immunity response towards CVB5 infection will lay the foundation for antiviral drug research. 展开更多
关键词 Long noncoding RNAs(lncRNAs) Coxsackievirus B5(cvb5) Type I interferon(IFN-I)signaling pathway Melanoma differentiation-associated gene 5 (MDA5) ELAV like RNA binding protein 1(ELAVL1)
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柯萨奇病毒B组5型非结构蛋白抑制NF-κB信号通路的作用机制研究
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作者 张佳玉 滕培英 +2 位作者 吕维民 杨帆 陈伟 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1403-1410,共8页
目的 柯萨奇病毒B组5型(CVB5)是手足口病的重要病原体之一,可导致发热、皮疹或疱疹等临床症状,重症者出现神经系统疾病,甚至死亡。天然免疫应答是机体抗病毒入侵的第一道防线,其中核因子κB (NF-κB)是宿主天然免疫反应中的重要蛋白质,... 目的 柯萨奇病毒B组5型(CVB5)是手足口病的重要病原体之一,可导致发热、皮疹或疱疹等临床症状,重症者出现神经系统疾病,甚至死亡。天然免疫应答是机体抗病毒入侵的第一道防线,其中核因子κB (NF-κB)是宿主天然免疫反应中的重要蛋白质,然而关于CVB5感染后调控NF-κB介导信号通路的研究尚鲜有报道。方法 本研究通过检测启动子活性、促炎因子水平以及通路中关键蛋白表达等,阐明CVB5对NF-κB信号通路的调控作用机制。结果 CVB5感染可抑制促炎因子表达和p65的磷酸化。CVB5非结构蛋白(NSP)可抑制促炎因子表达以及重要蛋白p65和IκBα的磷酸化。经STRING11.1数据库预测表明,CVB5 3CD蛋白与宿主多聚胞嘧啶结合蛋白1 (PCBP1)具有相互作用,且PCBP1可促进IκBα和p65的磷酸化,抑制病毒复制。结论 CVB5 NSP可负调控NF-κB信号通路,且与3CD相互作用的PCBP1蛋白可通过调控NF-κB通路抑制CVB5复制。本研究探索病毒与宿主天然免疫应答的调控作用,从而为研制抗CVB5感染的药物提供作用靶点。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒B组5型(cvb5) 核因子κB(NF-κB) 非结构蛋白(NSP) 3CD 多聚胞嘧啶结合蛋白(PCBP1)
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云南省急性弛缓性麻痹病例中柯萨奇病毒B5VP1区基因特征分析 被引量:2
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作者 陈苏 张杰 +5 位作者 田炳均 汤晶晶 李凯 李琼芬 丁峥嵘 陆林 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1745-1748,共4页
目的分析云南省2015年从急性弛缓性麻痹(AFP)病例中分离到的3株柯萨奇病毒B5(CVB5)VP1区核苷酸基因特征。方法采集RD细胞和L20B细胞对AFP标本进行病毒分离,应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒VP1基因,目的基因送至基因公司进行序... 目的分析云南省2015年从急性弛缓性麻痹(AFP)病例中分离到的3株柯萨奇病毒B5(CVB5)VP1区核苷酸基因特征。方法采集RD细胞和L20B细胞对AFP标本进行病毒分离,应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒VP1基因,目的基因送至基因公司进行序列测定;应用MEGA 6软件对分离到的病毒与基因库代表株进行进化树分析。结果 213例AFP标本中分离到23株非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV),包括3株CVB5;3株CVB5与原型株VP1区之间核苷酸(nt)相似性为80.7%~81.9%,氨基酸(aa)相似性为95.1%~96.5%;系统进化树结果显示,本研究分离的CVB5与山东分离株(JN712675)的nt相似性为91.7%~92%,与安徽分离株(KF751191)的nt相似性为92%~93%。结论云南省2015年从AFP病例中分离到的3株CVB5与山东代表株(JN712675)和安徽代表株(KF751191)相似性较高。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒B5(cvb5) VP1区基因 特征 急性弛缓性麻痹(AFP)
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