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水稻耐寒基因CTB4a的核苷酸多样性及区域适应性 被引量：2
1
作者 宋佳 职铭阳 +6 位作者 陈强 李玥莹 吴隆坤 农保选 李丹婷 逄洪波 郑晓明 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期60-68,共9页
为探究CTB4a基因的自然变异是否与栽培稻苗期耐低温相关,本研究以133份栽培稻(Oryza sativa L.)及35份普通野生稻(O.rufipogon Griff.)为实验材料,对CTB4a编码区的核苷酸多样性及其单倍型与地理分布的关系进行分析。结果表明CTB4a基因... 为探究CTB4a基因的自然变异是否与栽培稻苗期耐低温相关,本研究以133份栽培稻(Oryza sativa L.)及35份普通野生稻(O.rufipogon Griff.)为实验材料,对CTB4a编码区的核苷酸多样性及其单倍型与地理分布的关系进行分析。结果表明CTB4a基因编码区有14个核苷酸变异,组成33个单倍型。Network分析发现,这些单倍型的286 bp处的SNP变异(+2,035,097 bp,G>C;+96 aa,Ala→Pro)将其分成Group A和Group B两组。Group A(CTB4a^(jap))共有56份样品,其中有43份(76.79%)是种植于中高纬度地区的粳稻;Group B(CTB4a^(ind))有77份样品,有63份(83.12%)是种植于热带和亚热带国家的籼稻。Group A中样品苗期黄叶率的平均值比Group B样品低30%,且两者耐寒性具有显著差异(P=1.25e-09)。位于286 bp处的变异只在Group A中出现,在Group B中均不存在,说明随着水稻种植区域向北迁移的育种过程中,栽培稻中出现了CTB4a^(jap)并被固定下来。该研究为理解水稻对低温适应的分子遗传机制和培育耐寒品种提供了理论基础。 展开更多
关键词 栽培稻 ctb4a基因 核苷酸多样性 单倍型 适应性
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基于引物扩增受阻突变技术开发水稻耐冷基因CTB4a特异性分子标记
2
作者 梁海福 潘英华 +6 位作者 刘开强 邓国富 黄娟 卿东进 高菊 伍豪 高利军 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1719-1724,共6页
水稻(Oryza sativa)作为热带与亚热带起源的作物对低温敏感。对水稻种质进行耐冷性鉴定,能筛选出耐冷性强的种质,发展耐冷基因分子标记,能够有效鉴别种质中耐冷基因的基因型。本研究使用芽期4℃低温处理10 d对41份水稻材料进行芽期耐冷... 水稻(Oryza sativa)作为热带与亚热带起源的作物对低温敏感。对水稻种质进行耐冷性鉴定,能筛选出耐冷性强的种质,发展耐冷基因分子标记,能够有效鉴别种质中耐冷基因的基因型。本研究使用芽期4℃低温处理10 d对41份水稻材料进行芽期耐冷鉴定,对品种的芽期耐冷能力进行评价,获得了参试材料中除了‘昆明小白谷’之外的芽期耐冷性最强的品种‘南特号’。对已克隆的耐冷基因CTB4a开发分子标记,能够辅助选择水稻的耐冷育种。水稻孕穗期耐冷基因CTB4a来源于‘昆明小白谷’,能够影响水稻抵抗低温的能力。参照公布的CTB4a序列信息,从中挑选出序列中的作用位点SNP (单核苷酸多态性, single nucleotide polymorphism),结合引物扩增受阻突变技术(Penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS),用Primer 6.0设计引物,建立CTB4a基因荧光分子标记GM-CTB4a,使用荧光分子标记GM-CTB4a对41份水稻品种进行鉴定,使用酶标仪在‘昆明小白谷’中检测到利用标记扩增产物中包含‘昆明小白谷’特异SNP、T碱基引物携带的FAM荧光信号,在另外40份品种的扩增产物中检测到包含作用位点的C碱基引物携带的HEX荧光信号。本研究利用设计的分子标记,鉴定了41份水稻品种的耐冷性和基因型。比对分析耐冷性和基因型鉴定结果,说明我们开发的分子标记GM-CTB4a特异性较强,具有实际应用价值。研究结果为利用水稻孕穗期耐冷基因CTB4a培育强耐冷水稻品种奠定坚实基础。 展开更多
关键词 耐冷基因 ctb4a 分子标记
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