环介导等温扩增技术(LAMP)是一种广泛应用的恒温下快捷检测技术,但其极易发生气溶胶污染导致假阳性结果,将LAMP与簇状规则间隔短回文重复序列(CRISPR)系统结合可以有效避免假阳性结果。为建立针对绵羊泰勒虫18S r RNA基因的LAMP-CRISPR/...环介导等温扩增技术(LAMP)是一种广泛应用的恒温下快捷检测技术,但其极易发生气溶胶污染导致假阳性结果,将LAMP与簇状规则间隔短回文重复序列(CRISPR)系统结合可以有效避免假阳性结果。为建立针对绵羊泰勒虫18S r RNA基因的LAMP-CRISPR/Cas12a检测方法,本研究根据绵羊泰勒虫18S rRNA基因设计LAMP的特异性引物,构建靶基因的质粒标准品作为模板,优化反应条件后建立LAMP方法。进一步将LAMP产物加入CRISPR/Cas12a检测体系作为模板,优化CRISPR/Cas12a检测体系,获得最佳反应体系。结果显示,优化后LAMP方法的最佳反应温度为65℃,最佳反应时间30 min,内外引物浓度比≥6:1时最佳,LAMP-CRISPR/Cas12a的最佳反应体系为Cas12a蛋白与CRISPR RNA(crRNA)浓度比为1:2,探针浓度为2.5μmol/L。利用建立的LAMP-CRISPR/Cas12a方法检测绵羊泰勒虫、东方泰勒虫、中华泰勒虫、马泰勒虫、驽巴贝斯虫、绵羊无形体、弓形虫的DNA,结果显示仅绵羊泰勒虫为阳性结果,其他病原均为阴性;将构建的质粒标准品10倍倍比稀释(10^(0)~10^(7)倍)后作为模板,利用该方法检测,结果显示该方法的检测限为4.04拷贝/μL;于同一时间和不同时间利用该方法检测重组质粒标准品pMD19-T-T.ovis(4.04×10^(3)拷贝/μL~4.04×10^(1)拷贝/μL),分析其重复性,结果显示该方法批内变异系数小于5%,批间变异系数小于10%,具有良好的重复性。利用建立的LAMP-CRISPR/Cas12a方法与套式PCR检测临床绵羊血液样品,结果显示二者的阳性符合率达100%(14/14)、阴性符合率96.43%(54/56),总符合率97.14%(68/70)。本实验基于绵羊泰勒虫18S rRNA基因首次建立了特异性、敏感性及重复性均良好的LAMP-CRISPR/Cas12a检测方法,为绵羊泰勒虫病的监测和防控奠定了技术基础。展开更多
旨在建立一种基于重组酶聚合酶扩增技术(recombinase polymerase amplification,RPA)和成簇规律间隔短回文重复序列/CRISPR相关蛋白12a(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 12a,CRIS...旨在建立一种基于重组酶聚合酶扩增技术(recombinase polymerase amplification,RPA)和成簇规律间隔短回文重复序列/CRISPR相关蛋白12a(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 12a,CRISPR/Cas12a)系统的MSTN基因编辑猪检测方法,以满足基因编辑动物研发、育种等过程中核酸检测以及基因型鉴定的需求。本研究构建含有猪MSTN基因突变序列和野生型序列的标准质粒并设计靶向标准质粒的crRNA,基于RPA和CRISPR/Cas12a技术建立荧光报告和胶体金试纸条检测体系,筛选特异性识别标准质粒的crRNA、优化其反应条件并评价其检测灵敏度,最后通过检测猪耳组织样品评价本方法的准确性和稳定性。研究结果表明,该方法能够特异性识别MSTN基因2 bp碱基缺失序列和MSTN基因野生型序列。荧光报告体系最低可检测到4.1×10^(1)copies·μL^(-1)的标准质粒,胶体金试纸条体系最低可检测到4.1×10^(3)copies·μL^(-1)的标准质粒。通过对猪耳组织样本的检测,证明了该检测体系的准确性和可靠性。综上所述,本研究建立的MSTN基因编辑猪RPA-CRISPR/Cas12a检测方法具有操作简便、特异性和灵敏度高的特点,为MSTN基因编辑猪检测提供了重要技术支撑,具有广阔的应用前景。展开更多
