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长链非编码RNA CPEB1-AS1在胃癌中的表达及其对胃癌细胞增殖与迁移的影响
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作者 李卫兵 金国荣 +3 位作者 高子力 祁彤彤 尹海珍 毕小刚 《中华生物医学工程杂志》 CAS 2024年第2期90-96,共7页
目的研究长链非编码RNA(lncRNA)CPEB1-AS1在胃癌中的表达及长片段敲除CPEB1-AS1基因对胃癌细胞增殖和迁移的影响。方法利用生物信息学方法分析胃癌转录组芯片数据集GSE95667和GSE53137中lncRNA的表达。荧光定量PCR方法检测10对胃癌/癌... 目的研究长链非编码RNA(lncRNA)CPEB1-AS1在胃癌中的表达及长片段敲除CPEB1-AS1基因对胃癌细胞增殖和迁移的影响。方法利用生物信息学方法分析胃癌转录组芯片数据集GSE95667和GSE53137中lncRNA的表达。荧光定量PCR方法检测10对胃癌/癌旁组织标本中lncRNA CPEB1-AS1的表达。在胃癌细胞中,使用CRISPR-Cas9方法对CPEB1-AS1基因进行长片段敲除,利用实时无标记细胞分析仪检测敲除该基因对胃癌细胞增殖与迁移的影响。使用转录组测序分析CPEB1-AS1敲除引起的差异表达基因,并进行GO和KEGG功能富集分析寻找CPEB1-AS1基因参与的细胞进程和信号通路。结果lncRNA CPEB1-AS1在胃癌组织中的表达量为2.90±1.90,与癌旁组织(1.00±0.08)相比明显上调(P<0.01)。在胃癌细胞中长片段敲除CPEB1-AS1基因后,胃癌细胞的增殖指数和迁移指数明显低于对照细胞(P<0.01)。转录组测序分析发现敲除CPEB1-AS1基因导致胃癌细胞2187个基因下调,1569个基因上调。GO与KEGG通路富集分析发现差异表达基因显著富集于与细胞发育和分化相关的通路;与细胞膜成分和细胞外周相关的通路;神经类药物成瘾相关通路;以及胃癌、乳腺癌等肿瘤相关通路。结论lncRNA CPEB1-AS1通过参与肿瘤相关信号通路在胃癌细胞的增殖和迁移过程中具有重要作用,可望成为胃癌干预的新靶点。 展开更多
关键词 胃癌 长链非编码RNA cpeb1-as1
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