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CONSTANS-LIKE 7基因对拟南芥开花的调控分析 被引量:5
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作者 王宏归 黄晨 +5 位作者 陈鹏 姜雅 张娅 唐冬英 赵小英 刘选明 《湖南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第12期88-94,共7页
为研究CONSTANS-LIKE 7(COL7)在调控植物开花方面的功能,以定量PCR,GUS染色等方法,研究光及生物钟对COL7表达的影响,以及COL7对拟南芥开花的影响.实验结果显示:光及生物钟参与调控COL7的表达;过表达COL7在长日照条件下抑制CONSTANS(CO)... 为研究CONSTANS-LIKE 7(COL7)在调控植物开花方面的功能,以定量PCR,GUS染色等方法,研究光及生物钟对COL7表达的影响,以及COL7对拟南芥开花的影响.实验结果显示:光及生物钟参与调控COL7的表达;过表达COL7在长日照条件下抑制CONSTANS(CO)以及FLOWERING LOCUS T(FT)的表达,进而抑制拟南芥开花;col7突变体不论是在长日照下还是短日照下都没有明显的开花表型,说明COL7在调控拟南芥开化方面可能与其家族基因中的其它成员存在功能冗余. 展开更多
关键词 基因表达 拟南芥 constans-like7 开花
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花生CONSTANS-Like(COL)家族基因的克隆与表达分析 被引量:5
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作者 胡冬秀 刘浩 +3 位作者 鲁清 李海芬 方加海 梁炫强 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期778-786,共9页
开花是植物从营养生长到生殖生长的重要过程,CONSTANS-Like(COL)基因是植物光周期诱导开花途径中的关键转录因子,但是在花生中的具体功能尚不清楚。本研究通过生物信息学的方法对花生COL基因家族成员序列特征、系统进化关系、基因结构... 开花是植物从营养生长到生殖生长的重要过程,CONSTANS-Like(COL)基因是植物光周期诱导开花途径中的关键转录因子,但是在花生中的具体功能尚不清楚。本研究通过生物信息学的方法对花生COL基因家族成员序列特征、系统进化关系、基因结构、保守结构域及表达模式进行分析,最终克隆了17个AhCOL基因(AhCOL1-Ah⁃COL17)。花生17个AhCOL基因氨基酸长度范围为327aa^617aa,等电点(pI)均小于7,在蛋白质序列的氮端与碳端均含有保守的BBX和CCT结构域。此外,不同组织中的基因表达模式分析,表明多数AhCOL基因在叶片中的表达量显著高于其他组织。不同时期的表达量分析表明多数AhCOL基因的表达量从苗期到开花期呈现递增。本研究为研究花生AhCOL基因的潜在功能奠定了重要基础。 展开更多
关键词 花生 constans-like 生物信息学 基因表达
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杜仲CONSTANS-like全基因组鉴定、系统进化及表达模式分析 被引量:2
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作者 刘俊 李龙 +3 位作者 陈玉龙 刘燕 吴耀松 任闪闪 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期475-485,共11页
【目的】揭示CONSTANS-like在杜仲Eucommia ulmoides基因组中的分布、结构特征及表达模式。【方法】利用生物信息学方法,对杜仲CONSTANS-like基因家族进行鉴定及理化性质、进化关系、基因结构、启动子元件和表达模式分析。【结果】杜仲... 【目的】揭示CONSTANS-like在杜仲Eucommia ulmoides基因组中的分布、结构特征及表达模式。【方法】利用生物信息学方法,对杜仲CONSTANS-like基因家族进行鉴定及理化性质、进化关系、基因结构、启动子元件和表达模式分析。【结果】杜仲基因组中共鉴定到8个EuCOLs基因,分别命名为EuCOL1~EuCOL8,氨基酸数目为315~469,理论等电点分布范围为5.10~6.47,分子量为35.21~52.65 kDa。亚细胞定位预测均定位在细胞核中,为亲水性蛋白,分布于8条染色体。系统进化分为2个亚家族(群组Ⅰ和群组Ⅲ),分别包含2和6个EuCOLs蛋白,同一亚家族基序具有相似性。EuCOLs基因结构简单,启动子中含有多个光周期响应元件。表达模式分析显示:EuCOLs在杜仲叶片发育中表达水平相对较低,EuCOL7在杜仲胶形成中表达量最高,各家族成员表达特征存在差异。蛋白互作预测显示:EuCOL7可与多个光周期响应蛋白互作。【结论】杜仲CONSTANS-like基因家族含有典型的CCT和B-box结构域,可能参与叶片发育及杜仲胶的形成。 展开更多
关键词 杜仲 constans-like 生物信息学 表达模式分析
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核桃CONSTANS-Like基因家族全基因组鉴定及表达分析
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作者 袁星 郭彩华 +3 位作者 刘金明 亢超 全绍文 牛建新 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期167-179,共13页
基于核桃基因组鉴定核桃COL(CONSTANS-Like)家族成员,并对其进行分析,以揭示核桃COL家族的分子进化和潜在功能。以‘新新2号’(Juglans regia cv.Xinxin No.2)为材料,对COL基因家族全基因组进行鉴定及生物信息分析,并分析其在不同组织... 基于核桃基因组鉴定核桃COL(CONSTANS-Like)家族成员,并对其进行分析,以揭示核桃COL家族的分子进化和潜在功能。以‘新新2号’(Juglans regia cv.Xinxin No.2)为材料,对COL基因家族全基因组进行鉴定及生物信息分析,并分析其在不同组织及不同时间雌花芽的表达。结果表明,核桃基因组中共存在55个COL基因,不均匀地分布在16个染色体和1个Scaffold上,依次命名为JrCOL1-JrCOL55,氨基酸为117-789 aa,分子量为12.99-86.08 kD,等电点为4.00-8.94,进化树分析将其分为3个亚族,且同一分支基因的保守基序和基因结构位置相似。启动子区的顺式作用元件分析发现JrCOL基因含有大量与光信号、植物激素、胁迫等相关的顺式作用元件。‘新新2号’中JrCOL家族基因具有组织特异性表达,其中JrCO1、JrCO7a-c、JrCO8、JrCOL23、JrCO31a-c、JrCO33、JrCOL35和JrCOL50a-f在叶片中表达量最高。对‘新新2号’雌花芽不同时间JrCOL基因的RT-qPCR分析表明,JrCOL1、JrCOL35、JrCOL50a-f和JrCOL52在‘新新2号’雌花芽中,具有一致的表达趋势,其中JrCOL50a-f在‘新新2号’雌花芽分化过程中起到重要作用。在核桃基因组中鉴定出55个COL家族基因,分为3个亚家族,不均匀地分布在16个染色体和1个Scaffold上,结构进化保守,组织表达模式多样。推测JrCOL家族基因在核桃叶片发育过程中发挥重要功能。 展开更多
关键词 ‘新新2号’ constans-like 核桃基因家族 全基因组鉴定 基因表达
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Genome-wide identification of the CONSTANS-LIKE(COL)family and mechanism of fruit senescence regulation by PpCOL8 in sand pear(Pyrus pyrifolia)
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作者 Yue Xu Shurui Song +9 位作者 Huiying Wang Xilong Cao Xinran Zhao Wenli Wang Liyue Huo Yawei Li Misganaw Wassie Bin Lu Liang Chen Haiyan Shi 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2024年第4期1222-1237,共16页
Pyrus pyrifolia Nakai‘Whangkeumbae'is a sand pear fruit with excellent nutritional quality and taste.However,the industrial development of pear fruit is significantly limited by its short shelf life.Salicylic aci... Pyrus pyrifolia Nakai‘Whangkeumbae'is a sand pear fruit with excellent nutritional quality and taste.However,the industrial development of pear fruit is significantly limited by its short shelf life.Salicylic acid(SA),a well-known phytohormone,can delay fruit senescence and improve shelf life.However,the mechanism by which SA regulates CONSTANS-LIKE genes(COLs)during fruit senescence and the role of COL genes in mediating fruit senescence in sand pear are poorly understood.In this study,22 COL genes were identified in sand pear,including four COLs(Pp COL8,Pp COL9a,Pp COL9b,and Pp COL14)identified via transcriptome analysis and 18 COLs through genome-wide analysis.These COL genes were divided into three subgroups according to the structural domains of the COL protein.Pp COL8,with two B-box motifs and one CCT domain,belonged to the first subgroup.In contrast,the other three Pp COLs,Pp COL9a,Pp COL9b,and Pp COL14,with similar conserved protein domains and gene structures,were assigned to the third subgroup.The four COLs showed different expression patterns in pear tissues and were preferentially expressed at the early stage of fruit development.Moreover,the expression of Pp COL8 was inhibited by exogenous SA treatment,while SA up-regulated the expression of Pp COL9a and Pp COL9b.Interestingly,Pp COL8 interacts with Pp MADS,a MADS-box protein preferentially expressed in fruit,and SA up-regulated its expression.While the production of ethylene and the content of malondialdehyde(MDA)were increased in Pp COL8-overexpression sand pear fruit,the antioxidant enzyme(POD and SOD)activity and the expression of Pp POD1 and Pp SOD1 in the sand pear fruits were down-regulated,which showed that Pp COL8 promoted sand pear fruit senescence.In contrast,the corresponding changes were the opposite in Pp MADS-overexpression sand pear fruits,suggesting that Pp MADS delayed sand pear fruit senescence.The co-transformation of Pp COL8 and Pp MADS also delayed sand pear fruit senescence.The results of this study revealed that Pp COL8 can play a key role in pear fruit senescence by interacting with Pp MADS through the SA signaling pathway. 展开更多
关键词 Pyrus pyrifolia constans-like gene salicylic acid fruit senescence MADS
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Quantitative trait loci identification reveals zinc finger protein CONSTANS-LIKE 4 as the key candidate gene of stigma color in watermelon(Citrullus lanatus)
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作者 Shuang Pei Zexu Wu +4 位作者 Ziqiao Ji Zheng Liu Zicheng Zhu Feishi Luan Shi Liu 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2024年第7期2292-2305,共14页
Stigma color is a critical agronomic trait in watermelon that plays an important role in pollination.However,there are few reports on the regulation of stigma color in watermelon.In this study,a genetic analysis of th... Stigma color is a critical agronomic trait in watermelon that plays an important role in pollination.However,there are few reports on the regulation of stigma color in watermelon.In this study,a genetic analysis of the F2 population derived from ZXG1553(P1,with orange stigma)and W1-17(P2,with yellow stigma)indicated that stigma color is a quantitative trait and the orange stigma is recessive compared with the yellow stigma.Bulk segregant analysis sequencing(BSA-seq)revealed a 3.75 Mb segment on chromosome 6 that is related to stigma color.Also,a major stable effective QTL Clqsc6.1(QTL stigma color)was detected in two years between cleaved amplified polymorphic sequencing(CAPS)markers Chr06_8338913 and Chr06_9344593 spanning a~1.01 Mb interval that harbors 51 annotated genes.Cla97C06G117020(annotated as zinc finger protein CONSTANS-LIKE 4)was identified as the best candidate gene for the stigma color trait through RNA-seq,quantitative real-time PCR(qRT-PCR),and gene structure alignment analysis among the natural watermelon panel.The expression level of Cla97C06G117020 in the orange stigma accession was lower than in the yellow stigma accessions with a significant difference.A nonsynonymous SNP site of the Cla97C06G117020 coding region that causes amino acid variation was related to the stigma color variation among nine watermelon accessions according to their re-sequencing data.Stigma color formation is often related to carotenoids,and we also found that the expression trend of ClCHYB(annotated asβ-carotene hydroxylase)in the carotenoid metabolic pathway was consistent with Cla97C06G117020,and it was expressed in low amounts in the orange stigma accession.These data indicated that Cla97C06G117020 and ClCHYB may interact to form the stigma color.This study provides a theoretical basis for gene fine mapping and mechanisms for the regulation of stigma color in watermelon. 展开更多
关键词 WATERMELON stigma color gene mapping zinc finger protein constans-like 4
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阳春砂花期调控Ghd7基因克隆及表达分析
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作者 王朵 王崇楠 +6 位作者 李爽 朱雅婷 李倩霞 张文林 赵宏友 王延谦 张丽霞 《热带农业科技》 2025年第2期60-65,共6页
根据前期筛选到的阳春砂成花途径差异基因CONSTANS(CO)设计特异引物,通过PCR克隆获得基因全长CDS序列,利用NCBI进行同源序列比对分析确认为AvGhd7基因,其全长CDS为693 bp,编码230个氨基酸残基,含有CO基因典型的CCT结构域,属于CCT超基因... 根据前期筛选到的阳春砂成花途径差异基因CONSTANS(CO)设计特异引物,通过PCR克隆获得基因全长CDS序列,利用NCBI进行同源序列比对分析确认为AvGhd7基因,其全长CDS为693 bp,编码230个氨基酸残基,含有CO基因典型的CCT结构域,属于CCT超基因家族。系统进化分析发现AvGhd7与姜科植物聚为一类。基因表达分析表明,阳春砂AvGhd7基因在开花部位的表达量显著低于其它组织部位,在早实单株中的表达量显著低于非早实单株,为阳春砂开花性状的负调控基因。本研究可为阳春砂早实性状的分子机制研究提供参考。 展开更多
关键词 阳春砂 Ghd7基因 constans-like(COL)基因 成花基因
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红掌CONSTANS类基因AaCOL1和AaCOL2的克隆与表达分析 被引量:2
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作者 牛俊海 常娟霞 +4 位作者 杨光穗 李崇晖 张志群 黄素荣 尹俊梅 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1222-1229,共8页
在诱导植物开花的光周期途径中,CONSTANS(CO)家族蛋白起着重要的调节作用。本研究利用RACE技术克隆了红掌(Anthurium andraeanum)CO家族的两个基因,命名为Aa COL1和Aa COL2,全长c DNA分别包含了1 263 bp和1 257 bp的ORF,编码产物都具有2... 在诱导植物开花的光周期途径中,CONSTANS(CO)家族蛋白起着重要的调节作用。本研究利用RACE技术克隆了红掌(Anthurium andraeanum)CO家族的两个基因,命名为Aa COL1和Aa COL2,全长c DNA分别包含了1 263 bp和1 257 bp的ORF,编码产物都具有2个N端B-box和1个C端CCT基序的CO蛋白保守性结构,系统发育显示两个基因均属于CO家族Ⅲ类成员。转录模式分析表明:Aa COL1和Aa COL2基因的组织表达规律相似,m RNA相对水平都是在根和佛焰苞中较高;但在叶片中,Aa COL1主要受短日照调节,光期转入暗期4 h后表达量最高;而Aa COL2主要受长日照诱导,光期转入暗期即16 h时表达最高。不同的光周期响应模式,暗示Aa COL1和Aa COL2可能以各自特定的方式参与成花调控,结果为进一步解析红掌开花的光调控机制奠定基础。 展开更多
关键词 红掌 constans-like基因 开花途径 光周期
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光照处理对‘大同黄花’开花节律及光周期关键基因HcCOL14表达特性的影响 被引量:6
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作者 杜崴 李森 +5 位作者 公菲菲 刘娟 高阳 熊雄 王金耀 亢秀萍 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期46-53,共8页
开花节律对黄花菜采收时间、品质和产量具有重要意义。本研究以‘大同黄花’(Hemerocallis citrina cv.‘DatongHuanghua’)为材料,分析了不同光周期对黄花菜开花节律及花蕾碳水化合物含量的影响,同时根据前期黄花菜和萱草花器官转录组... 开花节律对黄花菜采收时间、品质和产量具有重要意义。本研究以‘大同黄花’(Hemerocallis citrina cv.‘DatongHuanghua’)为材料,分析了不同光周期对黄花菜开花节律及花蕾碳水化合物含量的影响,同时根据前期黄花菜和萱草花器官转录组测序分析结果筛选出1个与光周期开花调控相关的CONSTANS-like(COL)基因,研究了该基因在不同光周期条件下开花过程中的表达特性。结果表明:光周期对于开花节律具有显著影响,黄花菜花蕾为光响应的重要部位;不同光周期条件下,开花前碳水化合物含量均高于开花后。使用PCR法克隆得到COL14基因完整编码序列,编码473个氨基酸,该基因所编码的蛋白具有2个B-box结构域和1个CCT结构域;除昼/夜10/14 h处理外,COL14基因在其它不同光周期处理的花蕾中表达模式相近,均在光暗交替时期呈现出高表达,说明该基因的表达具有明显的时间差异性和生物钟调节特性。本研究初步阐明光周期对黄花菜开花生物钟的潜在调控机制,对调控黄花菜开花节律、延长采收期具有重要意义。 展开更多
关键词 大同黄花 光周期 开花节律 constans-like 表达分析
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大豆GmCOL8基因的克隆及表达分析 被引量:1
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作者 马锦花 张清哲 +1 位作者 陈新建 傅永福 《植物生理学通讯》 CSCD 北大核心 2010年第1期17-23,共7页
从大豆品种‘垦农18’中克隆了一个CONSTANS-like基因,命名为GmCOL8。进化树分析表明它属于CONSTANS-like亚家族1的成员。mRNA表达分析显示,GmCOL8在短日下具有明显的生物钟节律性表达特性,其表达高峰出现在凌晨。GmCOL8主要在复叶中表... 从大豆品种‘垦农18’中克隆了一个CONSTANS-like基因,命名为GmCOL8。进化树分析表明它属于CONSTANS-like亚家族1的成员。mRNA表达分析显示,GmCOL8在短日下具有明显的生物钟节律性表达特性,其表达高峰出现在凌晨。GmCOL8主要在复叶中表达,表达高峰出现在开花时期。 展开更多
关键词 大豆 constans-like 生物钟节律 生物信息学
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