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基于转录组信息的甘松CONSTANS转录因子家族分析
1
作者 刘芳 王远航 +9 位作者 陈红 黄雄杰 白怡婷 崔琪 雷语妍 李莹 李文兵 张绍山 陈晨 刘圆 《中草药》 北大核心 2025年第4期1346-1354,共9页
目的基于转录组数据筛选鉴定分析甘松Nardostachys jatamansi CONSTANS(CO)转录因子家族。方法运用生物信息学技术对甘松植物的CO转录因子家族成员展开综合分析,深入探究其蛋白的理化特性、基因序列结构、亚细胞位置、导肽和信号肽的预... 目的基于转录组数据筛选鉴定分析甘松Nardostachys jatamansi CONSTANS(CO)转录因子家族。方法运用生物信息学技术对甘松植物的CO转录因子家族成员展开综合分析,深入探究其蛋白的理化特性、基因序列结构、亚细胞位置、导肽和信号肽的预测,以及跨膜结构域的识别。此外,通过构建系统进化树,进一步揭示这些基因家族成员间的进化关系。结果在甘松的数据库中经过筛选、鉴定,最终得到10个CO转录因子,氨基酸长度为316~440 aa,相对分子质量在35561.67~48171.96,理论等电点范围为5.11~8.63,主要在细胞核中表达,均含有B-box和CCT结构域,均不含跨膜结构域和信号肽。构建系统进化树明确了各亚族的成员分布:第Ⅰ亚族包含2个成员,第Ⅱ亚族增至3个成员,而第Ⅲ亚族则有5个成员,这一发现为进一步探讨各亚族间的进化关系及特性差异提供了重要基础。结论利用了生物信息学的手段,全面鉴定并分析了甘松CO转录因子家族的理化性质、蛋白结构、系统发育关系等,对甘松CO转录因子家族功能的详尽研究,为后续的深入探索提供了宝贵的参考。此外,也为理解甘松药用成分合成的调控机制提供了基础,并为未来培育出更高品质的甘松品种提供了科学依据。 展开更多
关键词 甘松 constanS转录因子家族 光周期 系统进化树 生物信息学分析
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Wells评分、Kahn评分、St. André评分、Constans评分对下肢深静脉血栓的诊断价值研究 被引量：17
2
作者 田兴仓 李文玲 +6 位作者 朱力 孟淑萍 王一帆 张正平 穆丽莎 蒲艳军 孙凯 《中国全科医学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第23期2707-2710,共4页
目的评价Wells评分、Kahn评分、St.André评分、Constans评分对下肢深静脉血栓(DVT)的诊断价值。方法选择2006年7月—2009年3月在宁夏医科大学总医院行直接CT静脉造影(CTV)、间接CTV、下肢B超检查的疑诊DVT的住院患者278例,分别行下... 目的评价Wells评分、Kahn评分、St.André评分、Constans评分对下肢深静脉血栓(DVT)的诊断价值。方法选择2006年7月—2009年3月在宁夏医科大学总医院行直接CT静脉造影(CTV)、间接CTV、下肢B超检查的疑诊DVT的住院患者278例,分别行下肢Wells评分、Kahn评分、St.André评分、Constans评分。以各评分低度可能DVT作为阴性结果,中度可能DVT和高度可能DVT作为阳性结果;以CTV检查和/或下肢B超作为诊断DVT的金标准,分别计算各评分诊断DVT的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和ROC曲线下面积(AUC)。结果各评分诊断DVT的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、AUC,Wells评分为92.3%、48.9%、65.7%、85.7%、0.845;Kahn评分为64.3%、29.6%、49.2%、44.0%、0.526;St.André评分为90.2%、51.8%、66.5%、83.3%、0.761;Constans评分为95.8%、23.0%、56.8%、83.8%、0.755。Z检验结果显示,除St.André评分与Constans评分诊断DVT的AUC差异无统计学意义外,其他评分两两比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论通过比较Wells评分、Kahn评分、St.André评分、Constans评分对DVT的诊断价值发现,Wells评分在4种评分中诊断效能最高,比较适用于中国人群。 展开更多
关键词 静脉血栓栓塞 下肢 诊断 WELLS评分 Kahn评分 St. Andre评分 constans评分
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甘蓝型油菜开花调控转录因子CONSTANS的表达分析 被引量：9
3
作者 郑本川 张锦芳 +6 位作者 李浩杰 柴靓 崔成 蒋俊 蒲晓斌 牛应泽 蒋梁材 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期2592-2598,共7页
【目的】研究开花调控转录因子CONSTANS(CO)同源基因在甘蓝型油菜中的表达特征。【方法】以早熟甘蓝型油菜品系D626-6和晚熟甘蓝型油菜品系D125-5为材料,依据甘蓝型油菜CONSTANS同源基因Bn1CON19设计特异性引物扩增CO基因全长编码区,并... 【目的】研究开花调控转录因子CONSTANS(CO)同源基因在甘蓝型油菜中的表达特征。【方法】以早熟甘蓝型油菜品系D626-6和晚熟甘蓝型油菜品系D125-5为材料,依据甘蓝型油菜CONSTANS同源基因Bn1CON19设计特异性引物扩增CO基因全长编码区,并根据获得的cDNA序列设计实时荧光定量特异性引物,采用SYBR GreenI染料法进行实时荧光定量PCR研究CO基因表达差异。【结果】在整个生育期内,早熟和晚熟甘蓝型油菜品系的CO基因以叶片中的表达量最高,花蕾和茎中表达量次之,且早晚表达量高于中午时分;在不同生育时期内,抽薹期表达量最大,且早熟甘蓝型油菜品系CO基因在叶片和花蕾中的表达明显高于晚熟甘蓝型油菜品系。【结论】CO同源基因在甘蓝型油菜成花过程中以及生育期的长短上发挥着一定的作用。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 转录调控因子 CO基因(constanS) 实时荧光定量PCR
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番茄CONSTANS类似基因的克隆与表达分析 被引量：9
4
作者 叶雪凌 刘志勇 +2 位作者 王孝宣 杜永臣 国艳梅 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1607-1612,共6页
以一个受生物钟调节的番茄转录衍生片段（transcription-drived fragment，TDF）为信息探针，通过在NCBI EST数据库中进行电子延伸和RT—PCR验证，获得了番茄CO类似基因的cDNA全长序列，命名为SlCO1（GenBank登录号，EU636698）。SlCO1... 以一个受生物钟调节的番茄转录衍生片段（transcription-drived fragment，TDF）为信息探针，通过在NCBI EST数据库中进行电子延伸和RT—PCR验证，获得了番茄CO类似基因的cDNA全长序列，命名为SlCO1（GenBank登录号，EU636698）。SlCO1蛋白含有386个氨基酸，氨基端存在两个B—box型锌指结构，羧基端含有一个TFC结构域。SlCO1蛋白与CO类蛋白的氨基酸一致性为34％-46％，但在B—box锌指和CCT结构域处高度保守。基因组序列包含1个535bp的内含子，位于B—box锌指和CCT结构域之间。表达谱分析表明，SlCO1在叶片中优势表达，在根和茎中表达较弱。SlCO1的克隆为了解CO类似基因在番茄开花中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄 开花时间 constanS类似基因
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CONSTANS-LIKE 7基因对拟南芥开花的调控分析 被引量：5
5
作者 王宏归 黄晨 +5 位作者 陈鹏 姜雅 张娅 唐冬英 赵小英 刘选明 《湖南大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第12期88-94,共7页
为研究CONSTANS-LIKE 7(COL7)在调控植物开花方面的功能,以定量PCR,GUS染色等方法,研究光及生物钟对COL7表达的影响,以及COL7对拟南芥开花的影响.实验结果显示:光及生物钟参与调控COL7的表达;过表达COL7在长日照条件下抑制CONSTANS(CO)... 为研究CONSTANS-LIKE 7(COL7)在调控植物开花方面的功能,以定量PCR,GUS染色等方法,研究光及生物钟对COL7表达的影响,以及COL7对拟南芥开花的影响.实验结果显示:光及生物钟参与调控COL7的表达;过表达COL7在长日照条件下抑制CONSTANS(CO)以及FLOWERING LOCUS T(FT)的表达,进而抑制拟南芥开花;col7突变体不论是在长日照下还是短日照下都没有明显的开花表型,说明COL7在调控拟南芥开化方面可能与其家族基因中的其它成员存在功能冗余. 展开更多
关键词 基因表达 拟南芥 constanS-LIKE7 开花
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砂梨CONSTANS基因的克隆及原核表达分析 被引量：2
6
作者 张军霞 李鼎立 +3 位作者 王然 刘成连 原永兵 马春晖 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期824-830,共7页
为了探索梨树植物的开花调控机制,本研究以砂梨(Pyrus pyrifolia Nakai)叶片为材料,采用同源序列克隆法,进行了开花调控相关基因CONSTANS的克隆,命名为PyCO,GenBank登录号为KF246572。序列分析表明,该基因包含一个1023 bp的开放阅读框,... 为了探索梨树植物的开花调控机制,本研究以砂梨(Pyrus pyrifolia Nakai)叶片为材料,采用同源序列克隆法,进行了开花调控相关基因CONSTANS的克隆,命名为PyCO,GenBank登录号为KF246572。序列分析表明,该基因包含一个1023 bp的开放阅读框,编码340个氨基酸,推测蛋白质分子量为37.81 kD,等电点为5.95。PyCO蛋白具有典型的植物CO家族的结构特征,含有2个高度保守的B-box及CCT结构域。进化树分析表明,该氨基酸序列与苹果的同源性接近93%,与碧桃、可可树、草莓等其他高等植物的CO类蛋白同源性也在70%以上。原核表达获得了具有较高表达水平的融合蛋白,分子量约为58.5 kD,为进一步探索梨树开花调控机理奠定了基础。 展开更多
关键词 梨 constanS基因 克隆 序列分析 原核表达
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银杏CONSTANS基因植物表达载体构建 被引量：2
7
作者 张威威 宁迎晶 +3 位作者 陈柳吉 龚付全 许锋 程水源 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期8-10,共3页
目的:构建银杏CONSTANS基因的表达载体。方法:PCR扩增CO基因得到1.2kb左右的片段,用BamHⅠ+HindⅢ酶切纯化,通过T4DNA连接酶连接到植物表达载体pCAMBIA1304上,并转化到农杆菌LBA4404,然后进行菌落PCR及酶切鉴定。结果:载体构建成功。结... 目的:构建银杏CONSTANS基因的表达载体。方法:PCR扩增CO基因得到1.2kb左右的片段,用BamHⅠ+HindⅢ酶切纯化,通过T4DNA连接酶连接到植物表达载体pCAMBIA1304上,并转化到农杆菌LBA4404,然后进行菌落PCR及酶切鉴定。结果:载体构建成功。结论:构建了GbCO正义链和反义链的植物表达载体pCAMBIA 1304-GbCOs和pCAMBIA 1304-GbCOa,可用于GbCO基因的转基因功能研究。 展开更多
关键词 银杏 constanS基因 表达载体构建 转化
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高羊茅光周期调控基因CONSTANS的克隆与分析 被引量：7
8
作者 王小利 刘晓霞 +3 位作者 杨义成 陈伟 李晚忱 吴佳海 《分子植物育种》 CAS CSCD 2010年第1期45-52,共8页
本研究以坪用型"黔草1号"高羊茅为实验材料,基于多年生黑麦草CONSTANS(CO)基因序列设计引物,利用3'RACE和5'RACE方法扩增CO基因。结果表明,从高羊茅中分离出CO基因,命名为FaCON-STANS。经序列分析,cDNA全长1557bp,编... 本研究以坪用型"黔草1号"高羊茅为实验材料,基于多年生黑麦草CONSTANS(CO)基因序列设计引物,利用3'RACE和5'RACE方法扩增CO基因。结果表明,从高羊茅中分离出CO基因,命名为FaCON-STANS。经序列分析,cDNA全长1557bp,编码376个氨基酸,具有完整的开放阅读框(ORF,166～1296bp),氨基端具有B-box型锌指结构域,碳端具有CCT(CO,CO-like,TOC1)结构域。进一步的同源性分析表明,Fa-CONSTANS蛋白与禾本科植物的CO蛋白亲缘关系较近,与其它植物的亲缘关系较远。 展开更多
关键词 高羊茅 constanS(CO)基因 光周期调控基因 克隆与分析
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丝瓜CONSTANS基因家族鉴定和表达分析
9
作者 胡艳平 张婷婷 +6 位作者 廖道龙 朱白婢 云天海 黄文枫 张文 周扬 王敏 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第5期1462-1469,共8页
丝瓜是典型的短日照植物,光周期是影响其产量和品质的关键因素。CONSTANS(CO)是调控植物光周期成花转变的关键基因。本研究以海南主栽品种‘泰利大肉丝瓜’为研究对象,利用生物信息学技术对CO基因家族进行鉴定分析,并研究CO基因在不同... 丝瓜是典型的短日照植物,光周期是影响其产量和品质的关键因素。CONSTANS(CO)是调控植物光周期成花转变的关键基因。本研究以海南主栽品种‘泰利大肉丝瓜’为研究对象,利用生物信息学技术对CO基因家族进行鉴定分析,并研究CO基因在不同光周期处理下的表达模式。结果表明,丝瓜中含有6个CO基因,编码的多肽链长度为321~402个氨基酸,蛋白分子量为34.95~46.54 kD,理论等电点为4.49~7.65。进化分析表明CO基因家族分为三类,每个类别蛋白的保守基元数量相同,基因中具有相似的内含子/外显子结构。LcCO蛋白均含有保守的CCT和B-box保守结构域。丝瓜LcCO启动子区域含有大量与光响应相关元件。利用实时荧光定量PCR技术发现LcCO1和LcCO5基因的表达与光周期反应呈正相关,LcCO3基因的表达与光周期反应呈负相关。本研究初步筛选出丝瓜开花生物钟调控的潜在基因,对调控丝瓜开花节律具有重要意义。 展开更多
关键词 丝瓜 constanS基因家族 光周期 基因表达
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版纳龙竹CONSTANS同源基因的克隆与序列分析 被引量：9
10
作者 崔丽莉 杨汉奇 杨宇明 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2010年第1期1-5,共5页
以版纳龙竹基因组DNA为模板，采用前人基于水稻CO同源基因Hd1序列的保守区所设计的特异引物COS1和COA1，运用PCR方法扩增出一条1520bp的DNA片段，并克隆到pGEM—T载体。测序和序列分析结果显示：该片段含有1个590bp的内含子，编码区930b... 以版纳龙竹基因组DNA为模板，采用前人基于水稻CO同源基因Hd1序列的保守区所设计的特异引物COS1和COA1，运用PCR方法扩增出一条1520bp的DNA片段，并克隆到pGEM—T载体。测序和序列分析结果显示：该片段含有1个590bp的内含子，编码区930bp共编码310个氨基酸；该基因被命名为DxCO1，其DNA序列在GenBank中的注册号为GQ358925。在GenBank中进行同源性检索的结果显示：其核苷酸序列与其它禾本科植物CO同源基因的氨基酸序列同源性高达81％～91％；推测的DxC01蛋白质序列与其它种子植物CO同源基因蛋白质序列的系统发育分析结果显示：DxC01与小麦Hdl—like等5个基因聚成了一个强烈支持的分支；另外，在该片段推测的蛋白质序列的氨基端含有一个类似锌指蛋白的B．box（Cx2Cx8Cx7Cx2Cx4Hx8H）结构域，羧基端含有一个CCT（CO，CO—like，TOC1）结构域。序列和结构的高度同源性表明：DxCO1是版纳龙竹的1个CO-like基因，可能对其开花调控有着重要作用。 展开更多
关键词 版纳龙竹 constanS基因 克隆 序列分析
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烟草CONSTANS同源基因的克隆与分析 被引量：6
11
作者 陆莹 刘艳华 +4 位作者 任民 牟建民 张兴伟 孙玉合 王志德 《中国烟草科学》 CSCD 2013年第3期60-64,共5页
日照长度影响植物的生长发育,在拟南芥中CONSTANS是植物光周期开花途径中的关键基因。利用同源序列法结合RACE技术从短日照烟草品种Kutsaga.Mammoth10中分离出了开花时间相关的CO（CONSTANS）同源基因,并命名为NtCO1（基因登录号JN02253... 日照长度影响植物的生长发育,在拟南芥中CONSTANS是植物光周期开花途径中的关键基因。利用同源序列法结合RACE技术从短日照烟草品种Kutsaga.Mammoth10中分离出了开花时间相关的CO（CONSTANS）同源基因,并命名为NtCO1（基因登录号JN022535.1）。经序列分析,NtCO1全长1493 bp,具有完整的开放阅读框（ORF,81~1292 bp）,编码403个氨基酸;具有CO蛋白典型的结构域;氨基末端有两个B-box结构,羧基末端有CCT保守结构域。氨基酸同源性比对发现,NtCO1与茄科CO同源蛋白一致性最高,同马铃薯CO序列一致性达到86.5%;与拟南芥CO蛋白和水稻Hd1氨基酸序列一致性也分别达到50%和43.7%。基因表达分析表明,NtCO1在叶片中优势表达,茎中次之,根中最弱。 展开更多
关键词 constanS(CO)基因 烟草 克隆 分析 NtCO1
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银杏CONSTANS-LIKE基因的克隆与序列分析 被引量：8
12
作者 蔡雨蒙 何崇单 +4 位作者 李萌 董金金 刘伟 王俊燚 王义强 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期121-128,共8页
为阐明银杏开花调控机制,对不同时期的银杏叶片进行了转录组测序,通过分析开花前后表达量差异较大的基因,筛选出1个与开花调控相关的CONSTANS-LIKE基因。使用RT-PCR法从银杏叶片cDNA中克隆得到该基因的完整编码序列(CDS),命名为GbCOL。G... 为阐明银杏开花调控机制,对不同时期的银杏叶片进行了转录组测序,通过分析开花前后表达量差异较大的基因,筛选出1个与开花调控相关的CONSTANS-LIKE基因。使用RT-PCR法从银杏叶片cDNA中克隆得到该基因的完整编码序列(CDS),命名为GbCOL。GbCOL基因的CDS序列全长为1 239 bp,编码产物含412个氨基酸。核苷酸和蛋白质序列多重比对结果显示,GbCOL与其他植物的CO基因的核苷酸与蛋白质序列具有一定的同源性,与裸子植物中的CO基因同源性较高。该基因的蛋白产物具有典型的CONSTANS蛋白保守结构,包含2个高度保守的B-box及CCT结构域。该基因可能在银杏开花调控过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 银杏 constanS基因 克隆 开花调控
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KClO3处理对龙眼花芽形成关键基因CONSTANS表达的影响 被引量：4
13
作者 翟世博 苏良辰 +2 位作者 方妍妮 李玲 郭栋梁 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1429-1437,共9页
龙眼是重要的热带、亚热带水果,成花不稳定是生产上亟待解决的关键问题。用KClO_3诱导龙眼成花已在生产中得到广泛应用,但其机理尚不清楚。前期研究分析了KClO_3诱导龙眼成花的差异表达基因库,筛选并获得17个CONSTANS(CO)家族基因,通过... 龙眼是重要的热带、亚热带水果,成花不稳定是生产上亟待解决的关键问题。用KClO_3诱导龙眼成花已在生产中得到广泛应用,但其机理尚不清楚。前期研究分析了KClO_3诱导龙眼成花的差异表达基因库,筛选并获得17个CONSTANS(CO)家族基因,通过对基因序列的分析以及与已知的拟南芥CO家族基因比对发现该17个基因可分成五类。分析KClO_3处理诱导龙眼花芽形成过程中CO家族基因表达变化,与对照组比,在KClO_3处理后10 d,Lon48093和Lon69124基因的表达量上调;处理后20 d时,Lon47354、Lon64693、Lon65155、Lon82398和Lon85671基因的表达量上调;Lon64611和Lon88911基因的表达量在处理后10 d和20 d都比对照组高;与对照组相比,Lon20604、Lon77442、Lon73542、Lon68235、Lon81334、Lon62117、Lon71926和Lon87048基因的表达量在KClO_3处理后的各个时期始终下调。推测在KClO_3处理龙眼植株诱导提前成花过程中的不同阶段,Lon82398、Lon48093、Lon47354、Lon64693、Lon65155、Lon85671、Lon88911、Lon64611和Lon69124基因起正调控作用;Lon20604、Lon77442和Lon73542基因起负调控作用;Lon68235、Lon81334、Lon62117、Lon71926和Lon87048基因对该过程的影响很小。 展开更多
关键词 龙眼 constanS基因 KClO3处理 基因表达 花芽形成
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银杏CONSTANS基因的克隆与序列分析 被引量：3
14
作者 龚付全 熊超 +4 位作者 陈柳吉 宁迎晶 张威威 许锋 程水源 《湖北农业科学》 北大核心 2010年第12期2945-2948,共4页
利用1对简并引物,从银杏中克隆得到CONSTANS基因的cDNA片段,命名为GbCO。GbCO长855bp,编码285个氨基酸。核苷酸和蛋白质序列多重比较结果显示,GbCO与其他植物的CO基因的核苷酸与蛋白质序列均高度同源。GbCO编码的蛋白质与挪威云杉、海... 利用1对简并引物,从银杏中克隆得到CONSTANS基因的cDNA片段,命名为GbCO。GbCO长855bp,编码285个氨基酸。核苷酸和蛋白质序列多重比较结果显示,GbCO与其他植物的CO基因的核苷酸与蛋白质序列均高度同源。GbCO编码的蛋白质与挪威云杉、海岸松和长白松的CO氨基酸相似性分别为60%、53%和52%。CO系统进化树显示,GbCO与其他裸子植物亲缘关系较近。该研究通过克隆GbCO基因,可为利用转基因技术缩短银杏童期提供基因资源,也为进一步了解银杏开花的分子调控机理奠定基础。 展开更多
关键词 银杏 constanS 基因克隆 序列分析
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花生CONSTANS-Like(COL)家族基因的克隆与表达分析 被引量：5
15
作者 胡冬秀 刘浩 +3 位作者 鲁清 李海芬 方加海 梁炫强 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期778-786,共9页
开花是植物从营养生长到生殖生长的重要过程,CONSTANS-Like(COL)基因是植物光周期诱导开花途径中的关键转录因子,但是在花生中的具体功能尚不清楚。本研究通过生物信息学的方法对花生COL基因家族成员序列特征、系统进化关系、基因结构... 开花是植物从营养生长到生殖生长的重要过程,CONSTANS-Like(COL)基因是植物光周期诱导开花途径中的关键转录因子,但是在花生中的具体功能尚不清楚。本研究通过生物信息学的方法对花生COL基因家族成员序列特征、系统进化关系、基因结构、保守结构域及表达模式进行分析,最终克隆了17个AhCOL基因(AhCOL1-Ah⁃COL17)。花生17个AhCOL基因氨基酸长度范围为327aa^617aa,等电点(pI)均小于7,在蛋白质序列的氮端与碳端均含有保守的BBX和CCT结构域。此外,不同组织中的基因表达模式分析,表明多数AhCOL基因在叶片中的表达量显著高于其他组织。不同时期的表达量分析表明多数AhCOL基因的表达量从苗期到开花期呈现递增。本研究为研究花生AhCOL基因的潜在功能奠定了重要基础。 展开更多
关键词 花生 constanS-Like 生物信息学 基因表达
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杜仲CONSTANS-like全基因组鉴定、系统进化及表达模式分析 被引量：2
16
作者 刘俊 李龙 +3 位作者 陈玉龙 刘燕 吴耀松 任闪闪 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期475-485,共11页
【目的】揭示CONSTANS-like在杜仲Eucommia ulmoides基因组中的分布、结构特征及表达模式。【方法】利用生物信息学方法,对杜仲CONSTANS-like基因家族进行鉴定及理化性质、进化关系、基因结构、启动子元件和表达模式分析。【结果】杜仲... 【目的】揭示CONSTANS-like在杜仲Eucommia ulmoides基因组中的分布、结构特征及表达模式。【方法】利用生物信息学方法,对杜仲CONSTANS-like基因家族进行鉴定及理化性质、进化关系、基因结构、启动子元件和表达模式分析。【结果】杜仲基因组中共鉴定到8个EuCOLs基因,分别命名为EuCOL1~EuCOL8,氨基酸数目为315~469,理论等电点分布范围为5.10~6.47,分子量为35.21~52.65 kDa。亚细胞定位预测均定位在细胞核中,为亲水性蛋白,分布于8条染色体。系统进化分为2个亚家族(群组Ⅰ和群组Ⅲ),分别包含2和6个EuCOLs蛋白,同一亚家族基序具有相似性。EuCOLs基因结构简单,启动子中含有多个光周期响应元件。表达模式分析显示:EuCOLs在杜仲叶片发育中表达水平相对较低,EuCOL7在杜仲胶形成中表达量最高,各家族成员表达特征存在差异。蛋白互作预测显示:EuCOL7可与多个光周期响应蛋白互作。【结论】杜仲CONSTANS-like基因家族含有典型的CCT和B-box结构域,可能参与叶片发育及杜仲胶的形成。 展开更多
关键词 杜仲 constanS-like 生物信息学 表达模式分析
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光周期途径成花关键基因GIGANTEA和CONSTANS的研究进展 被引量：7
17
作者 帅敏敏 黄有军 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第17期5601-5607,共7页
GIGANTEA(GI)和CONSTANS(CO)在植物光周期开花诱导途径中起促进作用。GI和CO基因受生物钟调控,表达量在一天内呈规律性变化。在长日照条件下,GI和CO基因促进拟南芥开花,但在短日照条件下,对拟南芥开花时间的影响不大。GI是影响生物节律... GIGANTEA(GI)和CONSTANS(CO)在植物光周期开花诱导途径中起促进作用。GI和CO基因受生物钟调控,表达量在一天内呈规律性变化。在长日照条件下,GI和CO基因促进拟南芥开花,但在短日照条件下,对拟南芥开花时间的影响不大。GI是影响生物节律钟输出和植物进行正常生命活动的重要基因,编码一个核蛋白,GI正调控CO基因的表达。CO是编码一个B-box锌指蛋白,是监测日照长度的重要元件,并激活FT基因表达,诱导植物开花。本综述概括了近年来GI和CO基因的结构和功能,为GI和CO基因的深入研究提供参考。 展开更多
关键词 GIGANTEA constanS 光周期 昼夜节律
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四种十字花科植物CONSTANS-like基因家族的鉴定和进化分析 被引量：3
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作者 刘丹青 金玉环 +2 位作者 郭力 李永光 黄先忠 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1241-1260,共20页
CONSTANS(CO)和CONSTANS-like(COL)基因介于生物节律钟与下游开花控制基因之间,编码的蛋白质是参与调控植物生长发育及响应逆境胁迫的光周期转录因子。本研究通过全基因组分析从拟南芥(Arabidopsis thaliana)、琴叶拟南芥(Arabidopsis l... CONSTANS(CO)和CONSTANS-like(COL)基因介于生物节律钟与下游开花控制基因之间,编码的蛋白质是参与调控植物生长发育及响应逆境胁迫的光周期转录因子。本研究通过全基因组分析从拟南芥(Arabidopsis thaliana)、琴叶拟南芥(Arabidopsis lyrata)、小鼠耳芥(Arabidopsis pumila)和亚麻荠(Camelina sativa)中分别鉴定出17、17、34和51个COL基因。系统进化分为3个亚组,每组COL蛋白质均具有典型的B-box和CCT结构域;COL基因家族的扩张以片段重复或全基因组复制事件为主,且存在串联重复。比较进化分析表明4种植物的COL同源基因受到较强的纯化选择。利用小鼠耳芥RNA-Seq数据和qRT-PCR分析表明ApCOL基因家族成员的表达响应盐胁迫,暗示COL基因参与盐胁迫抗性。节律表达分析显示Ap-COL1.1/1.2、ApCOL2.1/2.2和ApCOL5.1/5.2在短日照条件下表现出明显的昼夜节律表达模式。本研究揭示了十字花科植物COL基因的进化规律,并为深入研究该家族基因在植物胁迫和开花调控中的作用提供线索。 展开更多
关键词 constanS 盐胁迫 昼夜节律 基因表达
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短命植物小拟南芥光周期调控基因CONSTANS的克隆与表达特征分析 被引量：6
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作者 刘芳 肖衡 +4 位作者 金玉环 孙琦 黄薇 康凯程 黄先忠 《石河子大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2019年第2期190-199,共10页
目的光周期是影响植物生长发育的重要因素之一,CONSTANS(CO)是植物光周期开花途径中关键的基因。方法本研究基于短命植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)转录组数据库,获得1条与拟南芥CO基因AtCOL1基因序列高度相似的unigene,通过RT-PCR... 目的光周期是影响植物生长发育的重要因素之一,CONSTANS(CO)是植物光周期开花途径中关键的基因。方法本研究基于短命植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)转录组数据库,获得1条与拟南芥CO基因AtCOL1基因序列高度相似的unigene,通过RT-PCR方法从小拟南芥中克隆了该CO同源基因,命名为ApCOL1;进行了基因的生物信息学分析及节律表达、组织表达和响应非生物胁迫的表达特征分析。结果研究结果表明ApCOL1具有两个B-box和一个CCT结构域,氨基酸序列上与AtCOL1相似性高达86.8%。系统进化分析表明ApCOL1与AtCOL1和琴叶拟南芥(Arabidopsis lyrata)的AlCOL1亲缘关系较近,且属于第I亚组成员。qRT-PCR实验表明在长日照和短日照条件下ApCOL1具有相似的昼夜节律表达特征;ApCOL1在小拟南芥各组织中均有表达,但在果荚中表达量最高。250mmol/LNaCl胁迫和20%PEG-6000模拟干旱胁迫12h明显抑制ApCOL1基因的表达,并且随着胁迫时间的延长ApCOL1表达水平没有显著差异。在高温(40℃)胁迫下,ApCOL1基因的表达在24h内先下降后上升并达到最高,48h又下降到对照水平。低温(4℃)胁迫24h之前,ApCOL1基因的表达没有明显变化,但处理48h表达水平显著下降。结论本研究表明ApCOL1基因能够响应盐、干旱、高温和低温等非生物胁迫,暗示该基因在小拟南芥抵抗逆境胁迫中起着重要作用。 展开更多
关键词 小拟南芥 constanS基因 生物节律 非生物胁迫
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辣椒CONSTANS-like转录因子家族的生物信息学分析 被引量：3
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作者 李宁 高升华 +3 位作者 王飞 尹延旭 姚明华 焦春海 《北方园艺》 CAS 北大核心 2019年第15期1-7,共7页
CONSTANS(CO)基因介于生物节律钟与下游开花基因之间,是光周期途径中的关键基因。以‘Zunla-1’辣椒基因组数据为试验材料,利用生物信息学工具对辣椒CO-like转录因子基因家族进行研究,以期为进一步揭示CO-like转录因子基因家族在辣椒开... CONSTANS(CO)基因介于生物节律钟与下游开花基因之间,是光周期途径中的关键基因。以‘Zunla-1’辣椒基因组数据为试验材料,利用生物信息学工具对辣椒CO-like转录因子基因家族进行研究,以期为进一步揭示CO-like转录因子基因家族在辣椒开花中的作用提供参考。结果表明:‘Zunla-1’辣椒基因组中共有9个CO-like基因,CO-like的蛋白大小相似,理论等电点均小于7;多序列和进化树分析将辣椒CO-like基因家族划分为3个组;利用转录组数据对9个CO-like基因家族成员的基因表达情况进行了分析,发现上述基因在叶片均有表达。 展开更多
关键词 辣椒 CO-like基因家族 生物信息学
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