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COL4A1在胃癌中的表达及其生物学功能
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作者 邱锦维 余小娟 +9 位作者 俞诗雅 陈永元 林鸿铭 赵虎 王瑜 吴伟航 杨劲 吴俊鸿 刘婷婷 陈东生 《现代肿瘤医学》 2025年第12期2049-2062,共14页
目的:探索胶原蛋白在胃癌(gastric cancer,GC)中的作用,筛选与胃癌相关的胶原蛋白关键基因(COL4A1),并鉴定该基因的关键生物学功能。方法:从基因综合表达数据库中获取GC微阵列数据,MSigDB网站获取胶原蛋白相关基因集,两者交互筛选出8个G... 目的:探索胶原蛋白在胃癌(gastric cancer,GC)中的作用,筛选与胃癌相关的胶原蛋白关键基因(COL4A1),并鉴定该基因的关键生物学功能。方法:从基因综合表达数据库中获取GC微阵列数据,MSigDB网站获取胶原蛋白相关基因集,两者交互筛选出8个GC相关胶原蛋白基因,用上述基因在TCGA-STAD数据库中进行差异表达分析、生存分析及ROC曲线并最终确定关键基因。CBioPortal分析该基因在GC中的突变、甲基化模式。STRING、GO和KEGG分别分析其共表达网络及相关富集通路。通过TISIDB数据库分析该基因表达与免疫调节因子之间的关联。使用GC细胞系BGC823和MGC803构建关键基因敲低模型,并通过CCK8、流式细胞术、迁移实验研究该基因在GC细胞中的作用。结果:研究最终确定COL4A1作为与GC相关的胶原蛋白关键基因,并可能作为GC的预后标志物。GC患者中COL4A1的突变和低甲基化水平与不良预后相关联。COL4A1及其相关基因在细胞黏附分子和胶原蛋白生物合成途径中显著富集,并且其表达水平与肿瘤免疫细胞浸润密切相关。qRT-PCR和WB实验结果表明COL4A1在GC中表达显著上调,功能研究结果表明,抑制COL4A1能降低GC细胞的增殖和迁移能力,并促进细胞凋亡及细胞周期停滞。结论:COL4A1是GC中与免疫浸润相关的预后标志物,并为治疗策略提供了新的线索。 展开更多
关键词 胃癌 col4a1 预后 甲基化 免疫浸润
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1例表现为认知功能减退的COL4A1基因突变相关脑小血管病病例报道
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作者 熊程 张小东 《川北医学院学报》 2025年第2期257-259,共3页
1病例资料患者,女,57岁,两年前出现肢体无力,平路行走时出现跌倒,之后跌倒越来越频繁;入院半年前开始出现反应变慢,性格由开朗逐渐发展为少言少语伴傻笑。入院1个月前,除了跌倒、傻笑增多外,还出现了坐立不稳,偶有饮水呛咳,病程中无头... 1病例资料患者,女,57岁,两年前出现肢体无力,平路行走时出现跌倒,之后跌倒越来越频繁;入院半年前开始出现反应变慢,性格由开朗逐渐发展为少言少语伴傻笑。入院1个月前,除了跌倒、傻笑增多外,还出现了坐立不稳,偶有饮水呛咳,病程中无头痛头晕、肢体抽搐及视力障碍。既往否认高血压史、糖尿病史;否认脑血管疾病史、遗传史、精神疾病史;否认手术史、外伤史。查体:生命体征平稳。 展开更多
关键词 脑小血管病 col4a1基因突变 认知障碍 临床全外显子测序
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COL4A1基因Q1334H多态性与中国男性骨密度显著相关性研究 被引量:5
3
作者 吴涤 洪秀梅 +2 位作者 杨天鹏 李志平 臧桐华 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期269-271,共3页
目的研究COL4A1基因多态性与中国农村男性骨密度关系。方法采用双能X线吸收仪对367名男性研究对象进行腰椎及股骨扫描,应用PCR-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测COL4A1基因Q1334H多态位点基因型,用广义线性模型分析此位点多态性... 目的研究COL4A1基因多态性与中国农村男性骨密度关系。方法采用双能X线吸收仪对367名男性研究对象进行腰椎及股骨扫描,应用PCR-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测COL4A1基因Q1334H多态位点基因型,用广义线性模型分析此位点多态性与腰椎2 ̄4及股骨骨密度关系。结果在调整环境危险因素前后,均显示COL4A1基因H1334H基因型与股骨颈骨密度降低呈显著相关(P=0.0074)、但与腰椎2 ̄4的骨密度无显著相关性(P=0.351)。结论在中国农村男性人群中COL4A1基因Q1334H多态性与股骨颈骨密度相关。 展开更多
关键词 Ⅳ型胶原α链(col4a1) 多态性 相关性 骨矿物质密度(BMD)
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COL4A1基因多态性与230例健康男性体检人群骨密度关系研究 被引量:3
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作者 李得春 杨国安 吴涤 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1113-1115,共3页
目的研究COL4A1基因多态性与健康男性骨密度关系。方法采用病例-对照研究方法。收集来自包头医学院第一附属医院进行健康体检的230例男性流行病学资料,用双能X线吸收仪对研究对象进行骨扫描。应用PCR-RFLP方法检测COL4A1基因型。采用Log... 目的研究COL4A1基因多态性与健康男性骨密度关系。方法采用病例-对照研究方法。收集来自包头医学院第一附属医院进行健康体检的230例男性流行病学资料,用双能X线吸收仪对研究对象进行骨扫描。应用PCR-RFLP方法检测COL4A1基因型。采用Logistic回归法分析COL4A1多态性与骨密度间的关系。结果调整主要混杂因素后,COL4A1基因TT基因型与男性骨量流失及骨质疏松无显著相关性(P=0.785)。结论 COL4A1基因TT基因型与男性体检人群骨量流失和骨质疏松无显著相关性。 展开更多
关键词 Ⅳ型胶原α1链(col4a1) 基因 多态性 骨密度(BMD)
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COL4A1基因多态性与中国东北地区散发颅内动脉瘤的相关性研究 被引量:1
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作者 吴鹏飞 李连祥 +2 位作者 潘起晨 吴安华 王运杰 《山东医药》 CAS 北大核心 2010年第8期54-55,共2页
目的探讨Ⅳ型胶原蛋白基因α1(COL4A1)与中国东北地区颅内动脉瘤发生之间的关系及不同人群COL1A1等位基因频率分布特征。方法对病例组和对照组的外周血进行全基因组DNA提取,应用PCR反应扩增目的片断,并进行特异位点酶切,比较两组间各参... 目的探讨Ⅳ型胶原蛋白基因α1(COL4A1)与中国东北地区颅内动脉瘤发生之间的关系及不同人群COL1A1等位基因频率分布特征。方法对病例组和对照组的外周血进行全基因组DNA提取,应用PCR反应扩增目的片断,并进行特异位点酶切,比较两组间各参数的差异。结果两组COL4A1基因功能性SNP rs3783107位点基因型频率之间、等位基因频率之间比较,均无统计学差异(P均>0.05),但不同人群之间COL4A1等位基因频率比较具有统计学差异(P均<0.01)。结论COL4A1基因可能不是中国东北地区颅内动脉瘤患者的易感基因之一。但中国东北地区人群与荷兰人群COL4A1等位基因分布具有显著性差异。 展开更多
关键词 颅内动脉瘤 单核苷酸多态性 col4a1基因
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COL4A1基因突变与脑血管病 被引量:3
6
作者 陈宇 张伟丽 惠汝太 《中国分子心脏病学杂志》 CAS 2010年第6期382-384,共3页
Ⅳ型胶原蛋白基因α1(α1type IV collagen,COL4A1)编码Ⅳ型胶原的α1链,是构成所有组织基底膜的主要成分。COL4A1基因突变可引起脑内小动脉病变,在一定的环境压力下引发脑内小血管的阻塞或破裂,造成脑出血(intracerrbral hemorrhage,I... Ⅳ型胶原蛋白基因α1(α1type IV collagen,COL4A1)编码Ⅳ型胶原的α1链,是构成所有组织基底膜的主要成分。COL4A1基因突变可引起脑内小动脉病变,在一定的环境压力下引发脑内小血管的阻塞或破裂,造成脑出血(intracerrbral hemorrhage,ICH)。本文综述了COL4A1与α1链的结构,构成IV型胶原的方式,Ⅳ型胶原在基底膜中的作用以及目前发现的COL4A1突变引发的人类脑血管方面的疾病,并对发病机理进行了简要综述。 展开更多
关键词 col4a1 Ⅳ型胶原 基底膜 脑出血
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COL4A1基因SNPrs3783107多态性与女性骨密度的关系 被引量:1
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作者 李得春 杨国安 吴涤 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期922-924,944,共4页
目的研究COL4A1基因多态性与包头市区女性骨密度的关系。方法采用病例-对照研究方法,收集在包头医学院第一附属医院进行健康体检的596例女性流行病学资料,用双能X线吸收仪对研究对象进行骨扫描。应用PCR-RFLP方法检测COL4A1基因型。用... 目的研究COL4A1基因多态性与包头市区女性骨密度的关系。方法采用病例-对照研究方法,收集在包头医学院第一附属医院进行健康体检的596例女性流行病学资料,用双能X线吸收仪对研究对象进行骨扫描。应用PCR-RFLP方法检测COL4A1基因型。用广义线性模型分析此位点多态性与腰椎及股骨颈骨密度关系。结果在调整环境混杂因素前后,均显示COL4A1基因SNPrs3783107突变基因型与绝经前女性股骨颈和腰椎骨密度降低呈显著相关(P=0.011、0.004),但与绝经后的骨密度无显著相关性(P=0.090、0.093)。结论 COL4A1基因SNPrs3783107多态性与包头市区绝经前女性股骨颈及腰椎骨密度显著相关。 展开更多
关键词 Ⅳ型胶原α1链(col4a1) 基因 多态性 骨密度
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Ⅳ型胶原基因COL4A1突变的研究进展 被引量:1
8
作者 安丽梅 夏欣一 黄宇烽 《中国优生与遗传杂志》 2011年第10期1-4,共4页
Ⅳ型胶原蛋白基因α1(COL4A1)编码Ⅳ型胶原的α1链,是各种组织基底膜的主要结构成分。基底膜由胶原、层粘连蛋白、蛋白多糖和巢蛋白组成,在所有胶原成分中,最重要的是Ⅳ型胶原。COL4A1基因突变能引起多种疾病,在一定的环境压力下会引发H... Ⅳ型胶原蛋白基因α1(COL4A1)编码Ⅳ型胶原的α1链,是各种组织基底膜的主要结构成分。基底膜由胶原、层粘连蛋白、蛋白多糖和巢蛋白组成,在所有胶原成分中,最重要的是Ⅳ型胶原。COL4A1基因突变能引起多种疾病,在一定的环境压力下会引发HANAC综合征、肾病、孔洞脑、白内障等疾病。本文主要从COL4A1的结构、组成及在基底膜中的作用等方面,对COL4A1基因突变引发的人类疾病及其发病机制进行综述。 展开更多
关键词 col4a1基因 Ⅳ型胶原 基底膜 人类疾病
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1例遗传性血管病、肾病、动脉瘤和肌肉痉挛综合征幼儿的临床特征及COL4A1基因型研究 被引量:6
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作者 单丽丹 彭镜 +5 位作者 肖慧 吴丽文 段浩林 庞楠 Kessi Miriam 尹飞 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期754-760,共7页
遗传性血管病、肾病、动脉瘤和肌肉痉挛(HANAC)综合征是由COL4A1基因变异导致的常染色体显性遗传病,主要表现为脑白质病变、动脉瘤、视网膜动脉迂曲、多囊肾、镜下血尿、肌肉痉挛等。该文报道1例COL4A1基因变异导致HANAC综合征的临床特... 遗传性血管病、肾病、动脉瘤和肌肉痉挛(HANAC)综合征是由COL4A1基因变异导致的常染色体显性遗传病,主要表现为脑白质病变、动脉瘤、视网膜动脉迂曲、多囊肾、镜下血尿、肌肉痉挛等。该文报道1例COL4A1基因变异导致HANAC综合征的临床特征及基因型特点。患儿男,1岁8个月,幼儿期隐匿起病,主要表现为发热抽搐、侧脑室旁及双侧半卵圆中心脑白质病变、左侧基底节旁软化灶、视网膜动脉硬化、镜下血尿、肌肉痉挛。全外显子组测序结果证实患儿COL4A1基因存在(NM_001845)c.4150+1(IVS46)G>T致病性杂合新发变异,从而确诊为HANAC综合征。针对不明原因脑白质病变、卒中、血尿、多囊肾、白内障、视网膜动脉迂曲等病变的患儿或有相关家族史的家系,建议完善COL4A1基因检测。 展开更多
关键词 遗传性血管病、肾病、动脉瘤和肌肉痉挛综合征 col4a1基因 Ⅳ型胶原 基底膜 幼儿
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COL4A1/COL4A2基因变异相关婴儿痉挛症的临床特点及预后 被引量:3
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作者 张鹏 王秋红 +6 位作者 邹丽萍 王杨阳 张梦娜 卢倩 刘丽英 王静 沈雁文 《解放军医学院学报》 CAS 北大核心 2021年第6期601-607,共7页
背景COL4A1/COL4A2变异可引起脑穿通畸形、脑血管疾病等,但目前关于COL4A1/COL4A2变异表现为婴儿痉挛症(infantile spasms,IS)的报道较少。目的总结COL4A1/COL4A2变异相关IS患儿的临床特点及预后,进一步提高临床医生对本病的认识。方法... 背景COL4A1/COL4A2变异可引起脑穿通畸形、脑血管疾病等,但目前关于COL4A1/COL4A2变异表现为婴儿痉挛症(infantile spasms,IS)的报道较少。目的总结COL4A1/COL4A2变异相关IS患儿的临床特点及预后,进一步提高临床医生对本病的认识。方法回顾性分析2019年5月-2020年8月就诊于解放军总医院第一医学中心儿内科的6例COL4A1/COL4A2变异相关脑病患儿的临床资料及基因检测结果。结果6例患儿中,男2例,女4例,起病中位年龄为6月龄(3~9月龄),均表现为痉挛性发作及脑电图呈高峰失律,明确诊断为IS。6例均伴有不同程度的精神运动发育落后。小头畸形5例,先天性白内障1例,小眼症2例,肌酸激酶升高1例,偏瘫3例,运动障碍3例。6例头颅MRI均异常,表现为脑室扩张、脑室周围白质软化和(或)脑白质体积减小,其中3例胎儿期即出现头颅MRI异常,表现为脑室扩张。5例COL4A1变异患儿均为杂合的新生变异,其中剪切变异2例:c.3406+1 G>T,c.280-1 G>A;错义变异3例:c.4088G>A p.Gly1363Asp,c.2441G>T p.Gly814Val,c.3968G>A p.Gly1323Asp(NM_001845)。1例COL4A2变异,c.1148C>T p.Pro383Leu(NM_001846),为杂合的新生变异,变异类型为错义变异。6例均曾行IS一线治疗(促肾上腺皮质激素、氨己烯酸或口服皮质醇),其中1例经氨己烯酸治疗后发作控制1年余,余5例发作均未得到控制。末次随访时6例均存在精神运动发育落后,其中3例COL4A1变异患儿的大运动及认知情况最差。结论COL4A1/COL4A2基因主要为新生变异,可表现为IS。对于COL4A1/COL4A2基因相关的IS,头颅MRI可表现为脑室扩张、脑室周围白质软化和(或)脑白质体积减小,部分患儿在胎儿期即出现头颅MRI异常;另外,可伴有发育落后、小头畸形、偏瘫、运动障碍以及其他系统异常,预后较差。 展开更多
关键词 婴儿痉挛症 col4a1基因变异 COL4A2基因变异 脑室扩张 小头畸形
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COL4A1基因相关脑穿通畸形1例报告并文献复习 被引量:3
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作者 蒋琼 朱会 +6 位作者 王齐艳 罗泽民 龙萍萍 曾兰 石镜懿 周家吉 朱书瑶 《中国生育健康杂志》 2023年第4期370-372,387,共4页
本文报道1例COL4A1基因变异相关的脑穿通畸形患儿。该患儿为2岁9月男性,胎儿期超声示双侧脑室不等大,生后全面发育落后,反复癫疒间发作,偏瘫,社交障碍、兴趣单一,MRI示脑穿通畸形。脑电图可见多灶性棘波/尖波。儿童孤独症评定量表(CARS... 本文报道1例COL4A1基因变异相关的脑穿通畸形患儿。该患儿为2岁9月男性,胎儿期超声示双侧脑室不等大,生后全面发育落后,反复癫疒间发作,偏瘫,社交障碍、兴趣单一,MRI示脑穿通畸形。脑电图可见多灶性棘波/尖波。儿童孤独症评定量表(CARS)重度异常。家系Trio全外显子测序检测发现患儿COL4A1基因存在c.2245G>A(p.G749S)新生杂合变异。Sanger测序未发现其父母携带上述突变。该突变在人类基因数据库中已有2个家系报道,国内尚无报道。COL4A1基因变异是婴儿脑发育不良的重要因素,常有癫疒间,偏瘫,全面发育落后,需及时完成基因测序以提供有效的遗传咨询。 展开更多
关键词 col4a1 基因变异 脑穿通畸形
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COL4A1/A2基因变异与出血性脑血管病及梗死后出血转化研究进展 被引量:3
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作者 索阅 李伟 王拥军 《中国卒中杂志》 2017年第6期559-565,共7页
4型胶原作为基底膜的重要组成部分,与脑出血过程中血脑屏障的破坏相关,是许多出血性脑血管病动物实验中血脑屏障破坏的观测指标之一。随着基因测序及分析技术的发展,借助全基因组关联分析等策略的临床研究发现,COL4A1/A2基因的变异不仅... 4型胶原作为基底膜的重要组成部分,与脑出血过程中血脑屏障的破坏相关,是许多出血性脑血管病动物实验中血脑屏障破坏的观测指标之一。随着基因测序及分析技术的发展,借助全基因组关联分析等策略的临床研究发现,COL4A1/A2基因的变异不仅与一些单基因遗传综合征相关,也与散发性出血性脑血管病相关。研究COL4A1/A2变异与脑出血、蛛网膜下腔出血、梗死后出血转化为代表的散发性出血性脑血管病相关性,对于出血性脑血管病的发病机制、高危人群筛查、早期干预、治疗新思路是有益的。 展开更多
关键词 出血性脑血管病 col4a1/A2基因 散发性脑血管病 脑出血 蛛网膜下腔出血
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COL4A1基因突变导致1例先天性白内障合并全身多系统疾病的研究 被引量:1
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作者 杨振菲 佘重阳 +1 位作者 云波 李乾 《中国优生与遗传杂志》 2024年第5期996-1000,共5页
目的通过对一名4岁患有先天性白内障且合并多系统疾病患儿使用全外显子组测序定位分析其基因突变位点。方法对此女童及家庭成员进行详细的眼科临床检查及全身查体。采集该患儿及亲属外周血并提取基因组DNA,应用全外显子组测序定位筛查... 目的通过对一名4岁患有先天性白内障且合并多系统疾病患儿使用全外显子组测序定位分析其基因突变位点。方法对此女童及家庭成员进行详细的眼科临床检查及全身查体。采集该患儿及亲属外周血并提取基因组DNA,应用全外显子组测序定位筛查可疑致病基因,并对全部成员进行Sanger测序验证候选致病突变位点。结果经过眼科及全身查体,此4岁患儿患有先天性后囊下型白内障合并脑白质病变,肌酸激酶增高。经过全外显子组测序及生物信息学分析,在这名女童COL4A1基因中发现了一个新的致病基因突变(c.2947-c.2964dupGCAGGACAGCCTGGGCAG),此突变导致在COL4A1基因外显子中插入6个氨基酸(Ala-Gly-Gln-Pro-Gly-Gln)。结论COL4A1基因突变(c.2947-c.2964dupGCAGGACAGCCTGGGCAG)是导致该患儿发生先天性白内障合并全身系统疾病的可能致病基因突变。本研究也进一步证实了COL4A1基因在晶状体、脑白质和肌病中的重要作用。 展开更多
关键词 先天性白内障 col4a1 脑白质病变 肌酸激酶 多系统疾病
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COL4A1在胆管癌中的表达分析
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作者 唐婷 石玉莲 +3 位作者 刘艳玲 李梅莲 戴景兴 樊庭宇 《中国临床解剖学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第4期448-452,共5页
目的探究胆管癌发生发展的分子机制。方法在GEO数据库中下载数据集GSE89749,并依次进行差异基因分析、GO/KEGG富集分析和蛋白-蛋白网络(PPI)分析以得到关键基因。TCGA数据库中分析COL4A1在肾上腺皮质癌、膀胱尿路上皮癌和乳腺浸润癌等1... 目的探究胆管癌发生发展的分子机制。方法在GEO数据库中下载数据集GSE89749,并依次进行差异基因分析、GO/KEGG富集分析和蛋白-蛋白网络(PPI)分析以得到关键基因。TCGA数据库中分析COL4A1在肾上腺皮质癌、膀胱尿路上皮癌和乳腺浸润癌等16种癌症的基因表达情况。结果差异基因和GO/KEGG富集分析显示差异基因被显著富集在含胶原蛋白的细胞外基质。PPI分析结果显示基因胶原IVα1基因(COL4A1)为关键基因。COL4A1基因在胆管癌、结直肠癌和食管癌等8种癌症中高表达。结论COL4A1在胆管癌组织中显著高表达,这为探究胆管癌发生发展的分子机制提供了新的角度和实验基础。 展开更多
关键词 胆管癌 GEO数据库 TCGA数据库 col4a1
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Aberrant expression of COL4A1 in age-related cataract and its effect on cell proliferation,apoptosis and gene expression changes 被引量:2
15
作者 Dan Zhu Peng Li +2 位作者 Li Wang Yuan He Hui-Zi Zhang 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2023年第3期333-341,共9页
AIM:To evaluate the regulation of the aberrant expression of collagen typeⅣalpha 1 chain(COL4A1)in the development of age-related cataract(ARC).METHODS:Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction(qRT... AIM:To evaluate the regulation of the aberrant expression of collagen typeⅣalpha 1 chain(COL4A1)in the development of age-related cataract(ARC).METHODS:Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction(qRT-PCR)and Western blot analysis were employed to evaluate the expression of COL4A1 in ARC patients and healthy controls.The proliferation,apoptosis,cell cycle and epithelial-mesenchymal transition(EMT)of human lens epithelial cell(HLE-B3)were further analyzed under the condition of COL4A1 gene silence.Alteration of gene expression at mRNA level after knockdown COL4A1 were also evaluated by qRT-PCR on HLE-B3 cells.RESULTS:The aberrant expression of COL4A1 was identified a clinically associated with the ARC.Silencing of COL4A1 promoted the apoptosis and inhibited the proliferation of HLE-B3 by blocking the cell cycle.Moreover,COL4A1 gene silence didn’t affect the cytoskeleton of HLE-B3 but down-regulated the Collagen typeⅣAlpha 2 Chain(COL4A2),paired box 6(PAX6),procollagen-lysine 2-oxoglutarate 5-dioxygenases 1(PLOD1)and procollagenlysine 2-oxoglutarate 5-dioxygenases 2(PLOD2)expression levels in HLE-B3 cells.Silencing the COL4A1 gene induced EMT of the HLE-B3 cells by promoting the transforming growth factor beta(TGF-β)expression.CONCLUSION:Silencing of COL4A1 induces S-phase arrest,also inhibits the proliferation and enhance HLE-B3 apoptosis and EMT,and down-regulates the expression of COL4A2,PAX6,PLOD1 and PLOD2.Thus,the expression alteration of COL4A1 may play a critical role in the pathogenesis of ARC. 展开更多
关键词 age-related cataracts col4a1 human lens epithelial cell
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COL4A1是胃腺癌患者预后不良的独立预测因素 被引量:1
16
作者 鲁修明 李小祺 +1 位作者 徐皓 姚寒晖 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期123-130,共8页
目的:Ⅳ型胶原蛋白α1(COL4A1)已被报道可促进不同癌型进展,本研究探讨其在胃腺癌(STAD)中的表达、生物学作用及预后意义。方法:运用生物信息学方法,使用GEPIA、The HumanProtein Atlas、TCGA、LinkedOmics等数据库预测COL4A1在STAD中... 目的:Ⅳ型胶原蛋白α1(COL4A1)已被报道可促进不同癌型进展,本研究探讨其在胃腺癌(STAD)中的表达、生物学作用及预后意义。方法:运用生物信息学方法,使用GEPIA、The HumanProtein Atlas、TCGA、LinkedOmics等数据库预测COL4A1在STAD中的表达、生物学作用及预后意义。基于TCGA数据库构建预测STAD患者预后的Nomogram模型。通过体外实验研究COL4A1对AGS增殖、迁移及对PI3K-AKT信号通路的影响。结果:(1)COL4A1在STAD组织中高表达;在结直肠癌、淋巴瘤、头颈部癌、胃癌、肝癌等组织中显著上调。COL4A1高表达患者的预后低于低表达患者(P<0.05);(2)COL4A表达水平与B细胞水平呈负相关(P<0.05);与CD4 T细胞、CD8 T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞及树突状细胞水平呈正相关(P<0.05)。COL4A1表达水平与较多药物敏感相关,如生物靶向治疗肿瘤药物(乐伐替尼、埃罗替尼、依鲁替尼)或治疗STAD患者常见化疗药物紫杉醇及奥沙利铂;(3)多因素Cox风险比例回归模型分析结果显示,COL4A1、年龄、TNM分期(Ⅲ期及Ⅳ期)、放射治疗(否)是STAD患者病死的危险因素(P<0.05)。内部数据集验证结果显示C-index为0.727(95%CI:0.651~1.000)。一年、三年及五年决策曲线分析结果显示,该Nomogram模型的临床净收益明显高于单个指标;(4)在AGS细胞中抑制COL4A1可抑制细胞活力、集落形成能力及迁移和侵袭能力。蛋白质印迹分析显示,抑制COL4A1可显著降低p-AKT和p-PI3K表达水平(P<0.05),但不影响AKT和PI3K的总表达水平(P>0.05)。结论:COL4A1表达水平是STAD患者预后不良的独立预测因素,可作为评估预后的肿瘤标志物,而靶向COL4A1的药物开发可能为STAD的治疗开辟新的治疗策略。 展开更多
关键词 胃腺癌 col4a1 TCGA GEO NOMOGRAM 预后
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COL4A1基因突变相关儿童脑病的特征分析:附3例病例报告 被引量:4
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作者 许愿愿 段袁园 +4 位作者 童文佳 赵忠礼 沈瑞丽 李敏 金丹群 《立体定向和功能性神经外科杂志》 2020年第2期99-103,121,共6页
目的分析COL4A1基因突变相关儿童脑病的临床症状、影像及遗传学特征。方法回顾性分析安徽省儿童医院于2017年1月至2019年12月收治的3例COL4A1基因突变的患儿临床症状和影像学结果,以"COL4A1""HANAC综合征"等为检索... 目的分析COL4A1基因突变相关儿童脑病的临床症状、影像及遗传学特征。方法回顾性分析安徽省儿童医院于2017年1月至2019年12月收治的3例COL4A1基因突变的患儿临床症状和影像学结果,以"COL4A1""HANAC综合征"等为检索词,在PubMed数据库、中国期刊全文数据库、万方医学以及中国知网文献数据库进行检索,结合文献复习,对COL4A1基因突变引起的儿童脑病的临床症状、影像及遗传学特点进行总结分析。结果1例患儿(11月16天)表现为癫痫发作及生长发育落后,头颅核磁共振(MRI)提示额叶脑穿通畸形和脑室周围白质软化(PVL);1例患儿(2个月14天)仅表现为抽搐,头颅MRI见脑室旁软化灶和脑室周围钙化;1例患儿(3岁)表现为有先天性白内障和生长发育迟缓,头颅MRI考虑脱髓鞘或髓鞘形成不良。3例患儿均有肌酸激酶(CK)的升高。2例是甘氨酸的错义突变,1例发生核苷酸插入,三种均导致肽链中的氨基酸序列发生改变,引起相应的病症。结论COL4A1基因突变具有可变表型的全身性疾病,除了神经系统的表现外,可累及肾、眼、肌肉及皮肤等多系统,CK升高,存在脑室周围钙化或PVL对于该疾病的诊断有指导意义。本病需要尽早发现、及时治疗,对于该家系中无症状的其他成员需进行COL4A1基因筛查,以便进行二级预防和早期干预。 展开更多
关键词 col4a1 基因 突变 癫痫 脑病
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基于数据库挖掘分析COL4A1基因在结直肠癌中的表达及意义 被引量:2
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作者 姚奇 何兰珍 《岭南现代临床外科》 2020年第2期167-171,共5页
目的利用公开的生物信息学数据库分析COL4A1基因在结直肠癌中的表达以及意义。方法应用Oncomine数据库探讨COL4A1基因在结直肠癌组织中的表达;应用GEPIA数据库分析COL4A1基因的表达水平,在结直肠癌患者中的病理分期以及生存期的相关性分... 目的利用公开的生物信息学数据库分析COL4A1基因在结直肠癌中的表达以及意义。方法应用Oncomine数据库探讨COL4A1基因在结直肠癌组织中的表达;应用GEPIA数据库分析COL4A1基因的表达水平,在结直肠癌患者中的病理分期以及生存期的相关性分析;应用MethHC甲基化数据库分析COL4A1基因启动子区的甲基化水平,分析COL4A1的表达与甲基化的关系;应用String数据库分析与COL4A1蛋白相互作用的蛋白网络及可能参与的机制。结果在结直肠癌肿瘤组织中,COL4A1基因的mRNA表达水平显著地高于正常结直肠组织,COL4A1基因的mRNA表达水平与结直肠癌患者的临床病理分级及患者总体生存持续时间水平无显著的相关性。结直肠癌中COL4A1基因DNA启动子区的甲基化表达水平较正常的结直肠黏膜组织显著升高,且COL4A1基因表达与结肠癌组织中COL4A1启动子区甲基化表达水平呈正相关。COL4A1基因可能ECM受体相互作用、局部受体粘附等信号传递通路中发挥作用。结论结直肠癌组织中COL4A1基因高表达,其在结直肠癌中的作用及机制需进一步研究阐明。 展开更多
关键词 结直肠癌 col4a1基因 甲基化 预后 生物信息学
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COL4A1在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义
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作者 熊子鋆 李丹苹 李萍 《系统医学》 2021年第21期43-48,52,共7页
目的研究COL4A1在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达情况,以及与临床病理的关系。方法该文通过TCGA、GEO公共数据库中的基因表达数据分析COL4A1基因在口腔鳞癌和正常组织中的表达差异。通过收集2017年6月—2020年5月广西医科大学附属口腔医... 目的研究COL4A1在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达情况,以及与临床病理的关系。方法该文通过TCGA、GEO公共数据库中的基因表达数据分析COL4A1基因在口腔鳞癌和正常组织中的表达差异。通过收集2017年6月—2020年5月广西医科大学附属口腔医院的38对口腔鳞癌与癌旁样本进行免疫组织化学染色检测COL4A1在口腔鳞癌及其癌旁组织中的蛋白表达情况,比较COL4A1蛋白表达与临床病理参数之间的关系。结果TCGA、GEO公共数据库的Meta分析结果提示口腔鳞癌中COL4A1mRNA表达水平显著高于癌旁组织,差异有统计学意义(SMD=1.697,95%CI:0.187~2.206,P<0.001),免疫组化实验中口腔鳞癌组织平均染色计分(5.368±2.387)分显著高于癌旁组织平均染色计分(3.342±1.632)分,差异有统计学意义(P<0.05),而COL4A1在口腔鳞癌中的蛋白表达情况在相应临床病理参数之间差异无统计学意义(P>0.05)。结论COL4A1在口腔鳞癌中高表达,可能是口腔鯑癌发生、发展的危险因素,具有一定的研究价值。 展开更多
关键词 col4a1 口腔鳞状细胞癌 免疫组织化学 TCGA数据库 GEO数据库
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