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广东省12个淡水国家级水产种质资源保护区鱼类DNA条形码数据库构建
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作者 时贤 朱书礼 +7 位作者 刘亚秋 武智 夏雨果 杨计平 帅方敏 李跃飞 李捷 陈蔚涛 《南方水产科学》 北大核心 2026年第1期47-59,共13页
为从分子层面评估广东省国家级水产种质资源保护区的鱼类多样性,本研究从12个保护区采集了550尾鱼类样本,经形态学初步鉴定分属9目16科53属共69种。通过对线粒体COI基因进行DNA条形码测序,并结合系统发育树、遗传距离与网状进化分析,构... 为从分子层面评估广东省国家级水产种质资源保护区的鱼类多样性,本研究从12个保护区采集了550尾鱼类样本,经形态学初步鉴定分属9目16科53属共69种。通过对线粒体COI基因进行DNA条形码测序,并结合系统发育树、遗传距离与网状进化分析,构建了保护区鱼类DNA条形码参考数据库。结果显示,该数据库的物种鉴定成功率达98.55%(68/69),证实了其可靠性。物种界定分析揭示了鲤(Cyprinus carpio)、红鳍原鲌(Cultrichthys erythropterus)、大鳍鳠(Hemibagrus macropterus)等7个物种形成了2~4个分子可操作单元(Molecular operational taxonomic units,MOTUs),且单元间的遗传距离较大,提示可能存在隐存种多样性,其原因或与水系隔离、华南地区复杂地质历史活动、人工放流、错误分类等因素有关;相反,海南鲌(Culter recurviceps)和翘嘴鲌(C.alburnus)、伽利略罗非鱼(Sarotherodon galilaeus)与奥利亚罗非鱼(Oceochromis aureus)之间的遗传距离小且共享1个MOTU,显示出近期分化的特征。综上,本研究构建了广东省内国家级水产种质资源保护区淡水鱼类DNA条形码数据库,并揭示了其中被形态学鉴定所低估的隐存多样性,为后续的鱼类资源保护与管理提供了重要科学依据。 展开更多
关键词 DNA条形码 COI基因 鱼类多样性 国家级水产种质资源保护区 隐存种
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基于线粒体COI基因的广西豇豆蓟马种群遗传分化分析
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作者 王欢廷 黄立飞 +3 位作者 龚芮 曹雪梅 郑霞林 杨朗 《环境昆虫学报》 北大核心 2026年第1期258-269,I0008-I0011,共16页
【目的】为了明确广西田间豇豆蓟马的发生种类,【方法】采集其14个设区市虫源,利用线粒体COI基因测序并分析蓟马种群间的多样性、遗传分化和系统发育。【结果】本次合计扩增234条序列片段,识别到广西豇豆田间共5种蓟马,为普通大蓟马Mega... 【目的】为了明确广西田间豇豆蓟马的发生种类,【方法】采集其14个设区市虫源,利用线粒体COI基因测序并分析蓟马种群间的多样性、遗传分化和系统发育。【结果】本次合计扩增234条序列片段,识别到广西豇豆田间共5种蓟马,为普通大蓟马Megalurothrips usitatus、花蓟马Frankliniella intonsa、黄胸蓟马Thrips hawaiiensis、棕榈蓟马Thrips palmi和华简管蓟马Haplothrips chinensis,其中优势种为普通大蓟马。分析序列得出,普通大蓟马共计7个单倍型;花蓟马有6个单倍型;黄胸蓟马和华简管蓟马为5个单倍型;棕榈蓟马仅2个单倍型。普通大蓟马多数地区种群间存在遗传分化和基因交流,其次是花蓟马和华简管蓟马。除个别地区外,黄胸蓟马和棕榈蓟马的总体采样区域内分化程度较小。【结论】这一研究成果为当地豇豆蓟马制定科学合理的防治策略提供依据。 展开更多
关键词 豇豆蓟马 COI基因 种群鉴定 遗传分化
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COI基因条形码技术在广东沿岸钳蛤科动物分类鉴定中的应用
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作者 罗浩 余语湘 +3 位作者 林奕慧 陈耀辉 纪小康 张敬怀 《海洋学报》 北大核心 2026年第1期83-96,共14页
钳蛤科Isognomonidae动物广泛分布于热带和亚热带海域的潮间带,具有重要的生态和经济价值。但由于物种形态受生境影响显著,基于传统形态学的钳蛤物种分类存在较大争议。本研究通过对广东沿岸潮间带采集的钳蛤样本进行线粒体COI基因序列... 钳蛤科Isognomonidae动物广泛分布于热带和亚热带海域的潮间带,具有重要的生态和经济价值。但由于物种形态受生境影响显著,基于传统形态学的钳蛤物种分类存在较大争议。本研究通过对广东沿岸潮间带采集的钳蛤样本进行线粒体COI基因序列测定,结合GenBank数据库中的同源序列,构建系统发育树,运用DNA分子条形码技术分析该地区钳蛤科的物种组成。结果显示,基于不同模型构建的COI基因系统发育树均支持钳蛤科单系发育,125条COI序列能形成68个单倍型,并被分为16个获得支持的物种水平分类单元,但这些分类单元间的进化关系还存在争议。各分类单元组内Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离为0.000~0.009,组间遗传距离为0.029~0.595。钳蛤COI基因片段的A+T和C+G含量平均分别为55.0%和45.0%,不同物种间存在差异。广东沿岸采集的标本共鉴定出5种钳蛤,包括1个已记录种方形钳蛤Isognomon nucleus和4个隐存种。DNA分子条形码技术能有效支持并修订钳蛤系统分类,揭示新物种,对海洋物种多样性保护具有重要意义。 展开更多
关键词 南海北部 钳蛤 COI 物种鉴定 隐存种
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接种旧金山卤虫对渤海湾塘沽和埕口盐场卤虫种群形态和遗传结构的影响
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作者 董考帅 韩学凯 +3 位作者 张睿 刘雪 张波 隋丽英 《水生生物学报》 北大核心 2026年第1期141-151,共11页
为探究卤虫Artemia franciscana在人工接种渤海湾盐场并与本地孤雌生殖卤虫种群共存的30余年间,其混合种群遗传多样性、遗传结构及形态学特征是否发生变化,本研究选取1990—2021年收集的美国旧金山(San Francisco Bay,SFB)A.franciscan... 为探究卤虫Artemia franciscana在人工接种渤海湾盐场并与本地孤雌生殖卤虫种群共存的30余年间,其混合种群遗传多样性、遗传结构及形态学特征是否发生变化,本研究选取1990—2021年收集的美国旧金山(San Francisco Bay,SFB)A.franciscana、越南永州人工养殖的A.franciscana、中国渤海湾(Bohai Bay,BHB)的土著孤雌生殖卤虫种群(Parthenogenetic Artemia population)及SFB A.franciscana接种后的渤海湾盐场混合种群的卤虫卵进行孵化和培养,待其生长至成体时进行形态学测量和比较。利用COI基因序列分析不同群体接种前后的遗传多样性变化,并探讨不同群体间的遗传结构及其在新栖息地的适应性变化。结果表明,旧金山卤虫接种并定植于中国渤海湾盐田后,导致该地区卤虫种群的遗传多样性升高,A.franciscana已经取代当地孤雌卤虫群体成为渤海湾盐田的优势种,而渤海湾本地孤雌种群正面临着灭绝的风险。旧金山原始种群与接种后的渤海湾埕口种群和塘沽种群无显著遗传分化,表明这两个种群均从旧金山种群直接接种引入。形态学测量分析发现,旧金山卤虫的引入造成渤海湾卤虫混合群体卵径不断下降,雄虫体长显著增加;同样旧金山卤虫引入越南后也出现卵径下降的现象。这表明旧金山卤虫具有较强的环境适应性和形态可塑性,以满足其定殖及在共存竞争中获取更宽的生态幅。研究结果为科学认识和合理保护渤海湾盐田生态系统生物多样性、制定生态环境保护策略提供科学依据。 展开更多
关键词 COI基因 遗传多样性 群体遗传结构 形态学测量值 卤虫
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素养导向的实验创新实践——DNA条形码技术在校园昆虫鉴别中的应用
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作者 吴冬霞 杨卫红 禹萍 《实验教学与仪器》 2026年第1期111-113,共3页
对马鞍山市第二十二中学校园里采集的一些常见昆虫种类进行DNA提取、PCR扩增和测序,获得线粒体COI基因的DNA条形码序列数据,并基于基因序列数据构建系统进化树,采取形态学和DNA条形码证据相结合的方法共鉴定出7种校园昆虫。将教材实验... 对马鞍山市第二十二中学校园里采集的一些常见昆虫种类进行DNA提取、PCR扩增和测序,获得线粒体COI基因的DNA条形码序列数据,并基于基因序列数据构建系统进化树,采取形态学和DNA条形码证据相结合的方法共鉴定出7种校园昆虫。将教材实验内容具体化,在解决实际问题的同时,能形成相对完整、拓展创新的实验专题。 展开更多
关键词 DNA条形码 COI基因 昆虫鉴别 形态学 系统进化树
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Molecular phylogeography and population history of Saccostrea mordax based on mitochondrial DNA
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作者 Zeyu TANG Cui LI +3 位作者 Guochen ZANG Zhenqiang LIU Zongmei CUI Haiyan WANG 《Journal of Oceanology and Limnology》 2026年第1期357-371,共15页
The Saccostrea mordax Gould,1850 is a typical intertidal species,whose genetic differentiation is influenced by various factors,including geological and climatic changes.To explore the genetic structure and historical... The Saccostrea mordax Gould,1850 is a typical intertidal species,whose genetic differentiation is influenced by various factors,including geological and climatic changes.To explore the genetic structure and historical population characteristics of Saccostrea mordax,we sequenced the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I(COI)gene from 58 specimens sampled from four locations in the western Pacific.Additionally,103 individuals from the Persian Gulf and western Pacific(from databases)were included for phylogenetic analysis.The Bayesian Inference tree showed that all specimens were divided into two clades,i.e.,the Persian Gulf population and the western Pacific population.Spatial molecular variance analysis indicated significant genetic differentiation between the two populations,and isolation by distance analysis revealed a positive correlation between genetic differentiation and geographic distance.Neutrality tests and Bayesian Skyline Plot suggested that both populations underwent expansions during the late Pleistocene.This study revealed the population history of Saccostrea mordax and described a new lineage,Saccostrea mordax lineage D,providing a foundation for understanding oyster biodiversity formation and genetic resource conservation. 展开更多
关键词 Saccostrea mordax cytochrome c oxidase subunit I(COI) genetic structure population expansion Saccostrea mordax lineage D
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La diffusion du cinéma québécois à l'étranger
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作者 杨佩妍 《法语学习》 2010年第4期90-94,共5页
Un Franais qui se rend au Québec pour la première fois sera parfois dérouté par une expression qui ne lui est pas familière.Il s'agit pourtant souvent des mêmes mots mais employ... Un Franais qui se rend au Québec pour la première fois sera parfois dérouté par une expression qui ne lui est pas familière.Il s'agit pourtant souvent des mêmes mots mais employés de faon différente. 展开更多
关键词 电影节 电影局 cois ma qu tranger
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Savourer des expressions québécoises
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作者 杨佩妍 《法语学习》 2010年第3期88-94,共7页
Un Franais qui se rend au Québec pour la première fois sera parfois dérouté par une expression qui ne lui est pas familière.Il s'agit pourtant souvent des mêmes mots mais employ... Un Franais qui se rend au Québec pour la première fois sera parfois dérouté par une expression qui ne lui est pas familière.Il s'agit pourtant souvent des mêmes mots mais employés de faon différente. 展开更多
关键词 coises 法语 Savourer des expressions qu
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榴梿重要害虫--马来异裂木虱[Allocarsidara malayensis(Crawford)]在中国的发现及其潜在适生区预测 被引量:1
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作者 邱海燕 王建赟 +5 位作者 赵菁 宋凡 何志新 韩冬银 符悦冠 李磊 《热带作物学报》 北大核心 2025年第3期725-733,共9页
本研究报道了榴梿重要害虫——马来异裂木虱[Allocarsidara malayensis(Crawford)]在海南的发现,详细描述了其形态特征,克隆了其COI基因,描述了其对榴梿的危害情况,并预测了该害虫在我国的潜在适生区。通过25个有效分布点位和19个气候... 本研究报道了榴梿重要害虫——马来异裂木虱[Allocarsidara malayensis(Crawford)]在海南的发现,详细描述了其形态特征,克隆了其COI基因,描述了其对榴梿的危害情况,并预测了该害虫在我国的潜在适生区。通过25个有效分布点位和19个气候环境因素,采用最大熵(MaxEnt)模型结合地理信息系统(ArcGIS),预测马来异裂木虱的潜在适生区,并使用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析法进行验证,同时运用刀切法分析影响马来异裂木虱分布的主要环境因素。结果表明:马来异裂木虱的潜在分布区主要在东南亚、南亚、非洲、南美州和北美洲的赤道附近的热带地区。我国海南、广西、广东、福建、台湾地区、云南、四川、贵州均存在马来异裂木虱的适生区,且海南全省及台湾部分沿海地区为高适生区。在影响马来异裂木虱潜在地理分布的环境因素中,最湿月份的降水量(Bio13)和最湿季度的降水量(Bio16)为最重要影响变量。由于马来异裂木虱的适生区与榴梿的种植区较为一致,为防止马来异裂木虱的进一步传播和扩散,保障我国榴梿产业的健康发展,应加强马来异裂木虱的监测,同时开展该害虫的生物学、生态学特性及消长规律研究,研究结果为该虫经济高效防治策略的制定提供理论依据。 展开更多
关键词 榴梿 马来异裂木虱 形态特征 COI基因 MaxEnt模型 适生区
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基于COI基因的长春鳊南北方群体遗传多样性研究 被引量:1
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作者 闫春梅 郑伟 +6 位作者 柳鹏 刘慧吉 李玲雪 郎宇奎 尹文金 杨淑峰 金香琴 《水产学杂志》 2025年第4期18-23,58,共7页
本文以线粒体COI序列为分子标记,研究长春鳊(Parabramis pekinensis)南北方群体共计118个个体的遗传多样性和群体遗传结构。结果显示:在630 bp序列中共检出变异位点9个,单倍型9种,4个群体总体单倍型多样性为0.7306,核苷酸多样性为0.0021... 本文以线粒体COI序列为分子标记,研究长春鳊(Parabramis pekinensis)南北方群体共计118个个体的遗传多样性和群体遗传结构。结果显示:在630 bp序列中共检出变异位点9个,单倍型9种,4个群体总体单倍型多样性为0.7306,核苷酸多样性为0.00217。各群体单倍型多样性为0.4115~0.7548,核苷酸多样性为0.00117~0.00390,表明4个长春鳊群体遗传多样性水平较低。AMOVA分析结果显示,群体间遗传变异占25.57%,群体内遗传变异占74.43%,固定系数为0.25566,说明遗传变异主要来源于群体内,群体间遗传变异不占优势。等位基因杂合性水平较高,基因差异分化处于中等状态,群体间有着相对频繁的基因交流。中性检验和核苷酸岐点分布图表明,群体呈中性进化,未发生过显著扩增。 展开更多
关键词 长春鳊 COI 遗传多样性
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人工智能主导的在线学习环境对大学生学习成效影响研究 被引量:1
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作者 李昕 祖峰 《渤海大学学报(哲学社会科学版)》 2025年第4期66-73,共8页
基于COI框架,探究生成式人工智能主导的在线学习环境对大学生学习成效的影响,构建以教学、社会、认知临场感为中介的影响模型,采用结构方程模型对问卷数据进行模型验证和中介效应检验。研究发现:生成式AI技术本身通过降低学生的社会临... 基于COI框架,探究生成式人工智能主导的在线学习环境对大学生学习成效的影响,构建以教学、社会、认知临场感为中介的影响模型,采用结构方程模型对问卷数据进行模型验证和中介效应检验。研究发现:生成式AI技术本身通过降低学生的社会临场感和认知临场感而对学习成效产生负面影响;AI教学设计可通过增强学生的社会临场感、认知临场感和教学临场感,显著提升学习成效;学习者AI使用接受度越高,越有利于提升社会临场感、认知临场感和教学临场感,进而提升学习效果;AI使用情境主要通过社会临场感直接影响学习成效。 展开更多
关键词 生成式AI 在线学习环境 学习成效 COI框架 临场感
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应用分子标记鉴定盘绒茧蜂属Cotesia寄生蜂的研究
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作者 孙星星 王凡 +5 位作者 蒋颖洁 王凯 胡积祥 李红阳 顾慧玲 张礼生 《山东农业科学》 北大核心 2025年第11期127-133,共7页
盘绒茧蜂属Cotesia寄生蜂是重要的寄生性天敌资源,能够有效控制美国白蛾、小菜蛾、甜菜夜蛾等多种农林害虫。但该属寄生蜂种类繁多,形态相似,存在较多的复合类群和近缘种。为更好地对其进行精准鉴定,本研究对采自江苏沿海地区桃园中的... 盘绒茧蜂属Cotesia寄生蜂是重要的寄生性天敌资源,能够有效控制美国白蛾、小菜蛾、甜菜夜蛾等多种农林害虫。但该属寄生蜂种类繁多,形态相似,存在较多的复合类群和近缘种。为更好地对其进行精准鉴定,本研究对采自江苏沿海地区桃园中的寄生蜂进行分类,共鉴定出5种盘绒茧蜂属寄生蜂,分别是螟蛉盘绒茧蜂Cotesia ruficrus、菜蛾盘绒茧蜂C.vestalis、二化螟盘绒茧蜂C.chilonis、粉蝶盘绒茧蜂C.glomerata和盘绒茧蜂Cotesia sp1,同时以线粒体COI与核糖体28S rDNA基因片段作为分子标记,探讨它们对盘绒茧蜂属寄生蜂物种间鉴定的准确性。研究结果表明,COI基因鉴定的准确性较高,分子鉴定结果与形态学鉴定结果一致;而28S rDNA基因鉴定的准确性较低,与形态学鉴定结果存在差异。因此,建议在鉴定盘绒茧蜂属寄生蜂物种时选用COI基因作为分子标记。 展开更多
关键词 DNA条形码 盘绒茧蜂属寄生蜂 COI 28S rDNA 鉴定 生物防治 分子标记
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基于线粒体COI基因的江西省柑橘木虱种群遗传结构分析
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作者 黄爱军 马家钰 +1 位作者 周俊 易龙 《环境昆虫学报》 北大核心 2025年第5期1605-1612,共8页
柑橘木虱Diaphorina citri Kuwayama是柑橘新梢期的重要害虫,也是柑橘黄龙病田间传播的最主要媒介昆虫,严重威胁着柑橘产业的健康发展。掌握害虫的种群遗传结构,对于制定有效的防控策略具有重要的参考价值。本研究以柑橘木虱的线粒体CO... 柑橘木虱Diaphorina citri Kuwayama是柑橘新梢期的重要害虫,也是柑橘黄龙病田间传播的最主要媒介昆虫,严重威胁着柑橘产业的健康发展。掌握害虫的种群遗传结构,对于制定有效的防控策略具有重要的参考价值。本研究以柑橘木虱的线粒体COI基因为分子标记,开展江西省柑橘木虱的种群遗传结构和多样性研究。在16个种群316头柑橘木虱供试样本COI基因序列中,共检测到8种单倍型(Hap_1~Hap_8),其中Hap_1占总群体的92.7%,是所有种群中的优势单倍型,单倍型网络图呈现典型的星型结构,且Hap_1处于中心位置,推测Hap_1为所有供试群体的祖先单倍型。总群体单倍型多样性指数(Hd)为0.139,核苷酸多样性指数(Pi)为0.00022,表现出较低的遗传多样性。XYYS种群与多数种群间分化指数(Fst)大于0.15,呈现出相对较高的分化程度,而其他种群间分化程度低。中性检验及碱基错配分布分析结果表明,江西省柑橘木虱种群经历过快速的种群扩张。本研究结果为系统了解江西省柑橘木虱种群遗传结构提供了基础数据。 展开更多
关键词 柑橘木虱 柑橘黄龙病 COI基因 种群遗传结构
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基于COI条形码的厦门文昌鱼物种组成和体型分布研究
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作者 郭香 宁岳 +3 位作者 巫旗生 叶军 葛辉 游远新 《安徽农业科学》 2025年第24期78-81,87,共5页
基于DNA条形码技术,结合GenBank数据库中的COI序列,对厦门黄厝海域文昌鱼的物种组成进行了系统分析。共检测48尾文昌鱼样本,获得长度为492 bp的COI序列片段。经GenBank数据库BLAST同源性比对及系统发育树构建,结果显示,日本文昌鱼37条(... 基于DNA条形码技术,结合GenBank数据库中的COI序列,对厦门黄厝海域文昌鱼的物种组成进行了系统分析。共检测48尾文昌鱼样本,获得长度为492 bp的COI序列片段。经GenBank数据库BLAST同源性比对及系统发育树构建,结果显示,日本文昌鱼37条(占77%),白氏文昌鱼11条(占23%)。表明厦门黄厝海域文昌鱼群体为混合群体,由日本文昌鱼和白氏文昌鱼共同组成,其中日本文昌鱼为当前优势种。该发现更新了该海域以白氏文昌鱼为主的传统认识,同时提示2种文昌鱼之间可能存在生态位分化。形态分析显示,厦门文昌鱼群体以中大型个体为主,日本文昌鱼群体中大型个体占37.8%,白氏文昌鱼群体中大型个体占27.3%。AMOVA方差分析表明,2种文昌鱼的体长与体重均值均无显著差异(P>0.05)。该研究结果为厦门海域文昌鱼资源的针对性保护与管理提供了科学依据。 展开更多
关键词 厦门 文昌鱼 COI条形码 体型分布 物种组成
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江苏省一种幻石蛾记述(毛翅目:幻石蛾科)
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作者 张咏 朱怡丹 +1 位作者 王备新 王萌 《环境监控与预警》 2025年第6期137-141,共5页
本研究报道了毛翅目石蛾科幻石蛾属(Apatania)一江苏省新纪录种——北京幻石蛾(Apatania yenchingensis Ulmer,1932),对该种进行了详细的形态描述,并提供了雄性外生殖器特征图。同时,首次获得北京幻石蛾的细胞色素氧化酶I(COI)条形码序... 本研究报道了毛翅目石蛾科幻石蛾属(Apatania)一江苏省新纪录种——北京幻石蛾(Apatania yenchingensis Ulmer,1932),对该种进行了详细的形态描述,并提供了雄性外生殖器特征图。同时,首次获得北京幻石蛾的细胞色素氧化酶I(COI)条形码序列,基于该基因序列构建系统发育树,初步分析了北京幻石蛾与其幻石蛾属近缘种的系统发育关系。研究的所有凭证标本均保存于南京农业大学昆虫标本馆(NJAU)。 展开更多
关键词 毛翅目 石蛾 幻石蛾属 江苏物种新纪录 COI序列
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基于毛细管电泳技术的克劳按蚊、迷糊按蚊和棋斑按蚊三重PCR方法鉴定
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作者 陶莉 聂国嫒 +6 位作者 张荣 苏小建 杨国平 耿合员 贺骥 谭伟龙 杨庆贵 《中国热带医学》 北大核心 2025年第8期1037-1041,共5页
目的建立一种能同时、准确、快速鉴定克劳按蚊、迷糊按蚊和棋斑按蚊3种按蚊的三重PCR鉴定方法。方法采用通用的DNA提取方法获取带足按蚊、雷氏按蚊、须喙按蚊、美彩按蚊、多斑按蚊、乌头按蚊、克劳按蚊、迷糊按蚊、棋斑按蚊的基因组DNA... 目的建立一种能同时、准确、快速鉴定克劳按蚊、迷糊按蚊和棋斑按蚊3种按蚊的三重PCR鉴定方法。方法采用通用的DNA提取方法获取带足按蚊、雷氏按蚊、须喙按蚊、美彩按蚊、多斑按蚊、乌头按蚊、克劳按蚊、迷糊按蚊、棋斑按蚊的基因组DNA,并测定其浓度。以克劳按蚊、迷糊按蚊和棋斑按蚊的线粒体COI基因为靶基因,其他6种蚊种作为对照,依据引物设计原则,设计出能特异性扩增3种按蚊的引物,并委托专业机构合成。以提取的按蚊DNA为模板,先进行单重PCR验证引物的特异性。在此基础上,对三重PCR反应体系中的引物浓度、dNTP浓度、Taq酶用量等进行优化,将优化后的PCR产物按照毛细管电泳实验流程上样,观察并记录检测结果。将克劳按蚊、迷糊按蚊和棋斑按蚊的模板DNA 10倍梯度稀释,稀释浓度从10 ng/μL~10^(-6) ng/μL。然后,进行三重PCR灵敏性检测。结果克劳按蚊、迷糊按蚊、棋斑按蚊的引物浓度相同,在退火温度58℃时特异性均很好,可分别扩增出118、187、307 bp的特异性条带,其他蚊种及空白对照无条带。克劳按蚊、迷糊按蚊、棋斑按蚊检测下限浓度均为10^(-4) ng/μL。结论该方法可同时、准确、快速地鉴定克劳按蚊、迷糊按蚊、棋斑按蚊样本,并适用于残缺、非成虫期等形态特征不完全的样本的鉴定,为蚊虫监测和疾病防控提供了一种可靠的技术手段。 展开更多
关键词 克劳按蚊 迷糊按蚊 棋斑按蚊 毛细管电泳 COI基因 三重PCR
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基于线粒体COI基因序列的中国蚬属遗传多样性和结构分析 被引量:2
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作者 胡锦硕 邓亚菲 +4 位作者 周春花 王维开 刘雄军 欧阳珊 吴小平 《水生态学杂志》 北大核心 2025年第4期256-265,共10页
分析中国蚬属不同地理种群的遗传多样性,为蚬属资源保护和可持续开发利用提供参考,也为蚬属分类及地理分布研究提供理论依据。利用线粒体COI基因为分子标记,对2019年采自我国4大流域的13个蚬属地理种群(共计362个样本)进行遗传多样性和... 分析中国蚬属不同地理种群的遗传多样性,为蚬属资源保护和可持续开发利用提供参考,也为蚬属分类及地理分布研究提供理论依据。利用线粒体COI基因为分子标记,对2019年采自我国4大流域的13个蚬属地理种群(共计362个样本)进行遗传多样性和遗传结构研究,构建单倍型系统发育树,并进行种群历史动态分析。结果显示:线粒体COI片段长度为550bp,碱基AT含量明显大于GC含量,碱基组成具有偏好性;362个蚬属样本共检测到40个单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.812和0.02908,军山湖(JS)具有低Hd和低π,13个种群中9个种群具有高的遗传多样性水平;系统发育树和网络图均支持中国蚬属分为淡水支和河口支,淡水支包括谱系Ⅰ和谱系Ⅱ,河口支为谱系Ⅲ;长江流域和珠江流域的种群全归于淡水支,淮河流域的种群在2支中均有分布,而东南沿海诸河流域的种群多分布在河口支,蚬属的3个谱系在不同流域中的分布呈现出明显的区域性;13个岘属种群间遗传分化系数FST为0.003~0.089,其中甬江(YJ)种群与其他种群之间的FST最大(0.063~0.089)。遗传分化和基因流分析表明蚬属种群基因交流普遍。种群动态分析除巢湖种群在末次间冰期经历种群扩张外,其他种群均稳定。 展开更多
关键词 蚬属 COI基因 谱系组成 遗传多样性
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广东省二化螟越冬地理种群发生水平、遗传多样性及系统发育分析 被引量:1
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作者 袁龙宇 吴阳刚 +4 位作者 钟文东 李燕芳 戴阳朔 张振飞 肖汉祥 《昆虫学报》 北大核心 2025年第5期667-678,共12页
【目的】对广东省二化螟Chilo suppressalis越冬地理种群基数监测、遗传多样性和系统发育进行调查和分析,为制定该虫有效的联防联控策略提供理论基础和参考。【方法】2017-2022年采取五点取样法对广东省各地区稻田进行二化螟采样,根据... 【目的】对广东省二化螟Chilo suppressalis越冬地理种群基数监测、遗传多样性和系统发育进行调查和分析,为制定该虫有效的联防联控策略提供理论基础和参考。【方法】2017-2022年采取五点取样法对广东省各地区稻田进行二化螟采样,根据越冬代平均数量进行分级确定二化螟发生水平。利用PCR扩增广东省二化螟9个越冬地理种群线粒体基因COI和COII,利用MEGA 7和DNA Sequence Polymorphism 5.10.01软件分析二化螟越冬地理种群遗传多样性和遗传分化趋势,并构建系统发育树和单倍型网络图。【结果】2017-2022年广东省二化螟越冬地理种群基数很高,自2018年开始二化螟种群越冬虫量基本维持在7 500头/hm2,最严重地区可达18 408头/hm2。广东省二化螟9个越冬地理种群总计检测了132条COI和COII序列,COI片段长749 bp,有30个单倍型,54个位点存在多态性;COII片段长474 bp,有22个单倍型,29个多态位点。基于COI和COII序列的系统发育树显示,广东与江西二化螟地理种群聚合为一支;粤北南雄二化螟地理种群较其他地理种群相对独立,其他地理种群聚合为一支。珠三角地区、粤北地区、粤西地区、粤东地区和赣北地区二化螟地理种群单倍型多样性(Hd=0.800~0.909)和核苷酸多样性(Pi=0.0035~0.0102)都处于较高水平,粤西地区地理种群的遗传多样性最低。中性检验结果显示,基于COI序列,总种群Tajima’s D值为-1.043,Fu’Fs值为-5.023;基于COII序列,总种群Tajima’s D值为-1.907,Fu’Fs值为-10.468;COI+COII联合基因序列总种群Tajima’s D值为-1.313,Fu’Fs值为-31.67。基于COI和COII序列的总种群遗传分化指数Fst值分别为0.144和0.102,基因流Nm值分别为1.49和2.20;COI+COII联合基因序列的总种群遗传分化指数Fst值为0.229,基因流Nm值为0.84。【结论】广东省近年来二化螟越冬地理种群呈偏重甚至大发生趋势,且种群具有较高的单倍型多态性和遗传多样性;粤东越冬地理种群多态性较为丰富,粤西越冬地理种群多态性最低。本研究中广东省二化螟越冬种群间存在一定程度的遗传分化,有些地理种群已产生相对较大的分化,如南雄地理种群。广东省和江西省二化螟越冬地理种群具有较近的亲缘关系,除粤西地区外其他不同地理种群之间的遗传分化距离不明显,地理种群之间的遗传分化与分布之间相关性较小,种群间具有频繁的基因交流,种群未经历明显的扩张但处于稳定增长的趋势。 展开更多
关键词 二化螟 线粒体基因 COI COII COI+COII 遗传多样性 系统发育
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大型河流小时空尺度eDNA监测宜多天采样还是宜多点采样? 被引量:1
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作者 杨海乐 许兰馨 +1 位作者 吴金明 杜浩 《湖泊科学》 北大核心 2025年第4期1175-1188,共14页
样品重复数设计是环境DNA(eDNA)监测技术标准化中最靠前的一个关键环节,对特定站位或断面进行eDNA监测,采样中应该设置多少个样品重复先前已有研究探讨,而这种小时空尺度的样品重复应该是在空间上设置系列样点,还是在时间上设置连续采... 样品重复数设计是环境DNA(eDNA)监测技术标准化中最靠前的一个关键环节,对特定站位或断面进行eDNA监测,采样中应该设置多少个样品重复先前已有研究探讨,而这种小时空尺度的样品重复应该是在空间上设置系列样点,还是在时间上设置连续采样尚未有研究仔细探讨,但这对于eDNA监测实践十分重要。为解决大型河流eDNA监测中重复采样策略的优化问题,本研究在长江武汉段设计了以样品重复方式为单一变量的对照实验,通过比较不同重复方案下eDNA监测检出的物种组成差异,提出适用于小时空尺度eDNA监测的采样建议。结果显示,细菌和后生动物的eDNA监测空间序列样品比时间序列样品所检出的累计物种数多,所检出物种组成的空间异质性比时间异质性大,而真菌、真核藻类、原生动物3个细分类群相反。因此,建议在大型河流小时空尺度的eDNA监测中,监测细菌和后生动物时,样品重复的设计优先关注空间重复采样;监测真菌、真核藻类、原生动物时,样品重复的设计优先关注时间重复采样,考虑到可能存在的河流特异性、断面特异性、时间特异性,本结论可能需要进行异时异地验证。特别强调,采取空间重复采样应注意采样时间的选择,采取时间重复采样应注意采样点位的选择,针对细分类群的监测采样应注意保证样品重复数量。 展开更多
关键词 eDNA监测 小尺度时空差异 重复采样 16S rRNA基因 COI基因 长江
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基于DNA条形码的天津渤海湾鱼类资源鉴定及遗传分析 被引量:1
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作者 何晓旭 白晓慧 +1 位作者 汪笑宇 孟一耕 《河北渔业》 2025年第1期25-31,共7页
为探索DNA条形码对渤海湾部分鱼类物种鉴定的有效性并进行相关的遗传分析,对天津渤海湾10种海水鱼类共177条线粒体COI基因序列进行扩增测序和比对分析。结果表明,10种海水鱼类COI基因T、C、A和G碱基平均含量分别为30.0%、27.9%、24.1%、... 为探索DNA条形码对渤海湾部分鱼类物种鉴定的有效性并进行相关的遗传分析,对天津渤海湾10种海水鱼类共177条线粒体COI基因序列进行扩增测序和比对分析。结果表明,10种海水鱼类COI基因T、C、A和G碱基平均含量分别为30.0%、27.9%、24.1%、18.0%,具有碱基偏倚性,177个基因序列共检测到70个单倍型。遗传多样性分析显示,总体的单倍型多样性为0.4327~0.9474,核苷酸多样性为0.0008~0.0063,其中焦氏舌鳎(Cynoglossus joyneri)的变异位点、单倍型数和单倍型多样性最高。遗传距离结果显示,种间遗传距离为0.2375~0.3575,其中种间平均遗传距离是种内平均遗传距离的77倍。系统进化树具有明显的分化谱系,与形态学的鉴定结果相吻合。研究结果表明,DNA条形码技术可以对天津近岸海域常见的10种鱼类进行有效鉴定,相关遗传分析可为天津渤海湾鱼类资源保护提供数据支持。 展开更多
关键词 DNA条形码 COI基因 遗传多样性 鱼类
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