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楸树COBRA家族分析及在应拉木形成中的转录响应
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作者 姚程程 王瑞 +6 位作者 吴创业 王青青 胡继文 刘冰洋 费越 卢楠 王军辉 《林业科学研究》 北大核心 2025年第6期48-58,共11页
[目的]本研究旨在对楸树COBRA基因家族成员(CbuCOB)进行全基因组水平鉴定和系统表征,解析其在应拉木(TW)形成过程中的转录响应模式。[方法]运用生物信息学手段对CbuCOB基因进行鉴定和系统分析,利用RNA测序检测CbuCOB基因在不同组织中的... [目的]本研究旨在对楸树COBRA基因家族成员(CbuCOB)进行全基因组水平鉴定和系统表征,解析其在应拉木(TW)形成过程中的转录响应模式。[方法]运用生物信息学手段对CbuCOB基因进行鉴定和系统分析,利用RNA测序检测CbuCOB基因在不同组织中的表达特征及在楸树TW形成过程中的表达响应模式,并通过实时荧光定量(qRT-PCR)验证关键CbuCOB基因的相对表达量。[结果]楸树基因组中共鉴定到14个CbuCOB基因,这些基因在染色体分布不均。系统发育分析将CbuCOB蛋白分为2个亚家族(SFⅠ和SFⅡ)和12个亚组,同一亚组成员在结构上高度相似。启动子顺式作用元件分析显示,CbuCOB基因含有多个与生长发育、环境胁迫响应和植物激素信号传导相关的元件。组织表达分析表明CbuCOB基因在不同组织中表达具有特异性,其中CbuCOB1、CbuCOB2、CbuCOB3和CbuCOB9在木质部中表达水平较高。时序转录组分析显示CbuCOB基因在TW形成过程中表现出动态的转录响应,其中5个SFⅠ成员(CbuCOB1、CbuCOB2、CbuCOB8、CbuCOB9和CbuCOB12)和1个SFⅡ成员(CbuCOB4)被鉴定为差异表达基因。qRT-PCR验证了关键CbuCOB基因表达趋势与转录组结果相一致,这些基因可能参与调控楸树TW的形成。[结论]楸树COBRA基因家族成员的基因特性和表达模式呈现多样性,部分成员可能在楸树木材形成,尤其是TW形成过程中发挥关键调控作用。 展开更多
关键词 楸树 应拉木 cobra基因家族 基因表达 RNA测序
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Financial performance evaluation of firms in BIST 100 index with ITARA and COBRA methods
2
作者 Ali Katrancı Nilsen Kundakcı Dragan Pamucar 《Financial Innovation》 2025年第1期1081-1108,共28页
Evaluating firms’financial performance is important for survival in the competitive environment arising from technological advancements and gaining a competitive advantage.This study aims to assess the financial perf... Evaluating firms’financial performance is important for survival in the competitive environment arising from technological advancements and gaining a competitive advantage.This study aims to assess the financial performances of firms traded on the Istanbul Stock Exchange 100 Index(Borsa Istanbul(BIST)100 Index)between 2018 and 2022 using an integrated multi-criteria decision-making(MCDM)method.This is the first study to use a new combined approach proposed based on the indifference thresholdbased attribute ratio analysis(ITARA)and cost estimation,benchmarking,and risk assessment(COBRA)methods,which have not been applied to corporate performance assessment.The ITARA method is used to find the weights of the criteria,and the ranking of the firms in terms of financial performance is obtained using the COBRA method.The results show that the firms with the highest financial performance are ISMEN,ALGYO,PGSUS,KOZAA,and IPEKE.The companies with the lowest financial performance are AKFGY,BAGFS,MGROS,KOZAL,and GOZDE.The results of this ranking provide important information for firms to recognize their position and for investors who want to invest in firms in the BIST 100 Index.Additionally,sensitivity analyses are performed to assess the impact of changes in the criteria on the ranking of the firms and to validate the results of the proposed method.A comparative analysis is made with different MCDM methods like the technique for order preference by similarity to ideal solution(TOPSIS),and combined compromise solution(CoCoSo)methods and Spearman’s rank correlation test results are presented.This approach leads to the conclusion that the proposed approach can be a useful and effective tool for assessing the financial performance of firms. 展开更多
关键词 ITARA cobra Multi-criteria decision making BIST 100 Performance evaluation
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COBRA/T——美军通用自动测试系统的新进展 被引量:12
3
作者 赵亮亮 肖明清 +2 位作者 程进军 陈利安 朱令龙 《计算机测量与控制》 北大核心 2013年第6期1408-1411,共4页
介绍了美国海军陆战队自动测试系统COBRA/T(the Common Off-the-Shelf Benchtop Rapidly deployed Advanced/Tester)的产生背景、功能、结构及优点;COBRA/T是美国海军陆战队通用自动测试系统的最新研究成果,用于基地级及前沿级的测试维... 介绍了美国海军陆战队自动测试系统COBRA/T(the Common Off-the-Shelf Benchtop Rapidly deployed Advanced/Tester)的产生背景、功能、结构及优点;COBRA/T是美国海军陆战队通用自动测试系统的最新研究成果,用于基地级及前沿级的测试维修,研制COBRA/T系统的目的是验证在保留甚至扩展VIPER/T及TETS功能的前提下如何最大限度地减小测试系统的体积,提高系统的便携性,为海军陆战队提供下一代自动测试系统,COBRA/T系统采用基于cPCI、PXI、PXI Express、LXI的多总线结构,具有体积小、功耗低、架构灵活及费用少等优点。 展开更多
关键词 自动测试系统 cobra T VIPER T “第三梯队”测试系统 PXI总线
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番茄COBRA基因克隆、表达模式及生物信息学分析 被引量:4
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作者 曹颖 唐晓凤 刘永胜 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期304-310,共7页
COBRA作为一种重要的胞外糖基磷脂酰肌醇(GP-I)锚定蛋白,影响植物细胞壁中纤维素含量及细胞的定向伸长。目前已有多个拟南芥、玉米及水稻的COBRA基因的突变体被研究。而有关番茄COBRA基因克隆的研究尚未见报道。本研究利用RT-PCR技术克... COBRA作为一种重要的胞外糖基磷脂酰肌醇(GP-I)锚定蛋白,影响植物细胞壁中纤维素含量及细胞的定向伸长。目前已有多个拟南芥、玉米及水稻的COBRA基因的突变体被研究。而有关番茄COBRA基因克隆的研究尚未见报道。本研究利用RT-PCR技术克隆了一个假定编码番茄COBRA蛋白的SlCOBRA基因,并在GenBank注册(JN398667)。序列测定和分析表明,该序列由6个外显子组成,编码444个氨基酸残基;氨基酸序列中存在COBRA蛋白的CCVS保守基序,N端的跨膜信号肽及C-末端的疏水性尾部和GPI锚定ω-位点。系统进化分析表明番茄SlCOBRA与拟南芥AtCOB具有80%氨基酸序列同源性,聚在一个分支上。Real-time PCR分析番茄各个组织中COBRA基因的表达结果表明番茄COBRA为组成型表达,在营养器官(根、茎、叶)中的表达量高于花和果实,尤其在成熟的果实中(从转色期到红熟期)表达量明显减少。 展开更多
关键词 番茄 cobra基因 克隆 表达模式 生物信息学分析
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COBRA工具软件在空气污染健康风险及综合收益评估中的应用 被引量:2
5
作者 李亚伟 刘静怡 +2 位作者 孟聪申 韩京秀 徐东群 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期822-827,833,共7页
目的探讨美国健康风险综合收益评估工具(COBRA)在空气污染健康风险评估中的应用,为我国开发相关工具提供借鉴。方法从软件概况、适用范围和应用文献、数据要求和软件操作、计算原理、模型构建等方面对软件进行介绍,并提出对我国的借鉴... 目的探讨美国健康风险综合收益评估工具(COBRA)在空气污染健康风险评估中的应用,为我国开发相关工具提供借鉴。方法从软件概况、适用范围和应用文献、数据要求和软件操作、计算原理、模型构建等方面对软件进行介绍,并提出对我国的借鉴意义。结果通过在软件中输入污染物的种类和变化量,可快速得到健康和经济学收益结果。结论 COBRA工具可用于快速评价、比较污染物变化的健康影响和经济学效益,对我国开发相关工具,快速评估我国不同城市、地域或全国范围的污染防控方案的健康效益,筛选成本更低、效益更大的政策措施等方面具有重要的参考价值。 展开更多
关键词 cobra工具 空气污染 健康风险收益评估 监测分析
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改进型COBRA透镜天线的设计 被引量:3
6
作者 徐福锴 周海京 丁武 《强激光与粒子束》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第8期1256-1258,共3页
设计了X波段COBRA透镜型天线,利用电磁波在不同介质传播速度的差异,通过放置于圆锥喇叭口径处不同厚度的介质透镜改变TM01模不同扇区的相位,从而改变TM01模在普通喇叭口径处的轴对称分布,将轴对称的口径场分布转换为线对称,进而实现线... 设计了X波段COBRA透镜型天线,利用电磁波在不同介质传播速度的差异,通过放置于圆锥喇叭口径处不同厚度的介质透镜改变TM01模不同扇区的相位,从而改变TM01模在普通喇叭口径处的轴对称分布,将轴对称的口径场分布转换为线对称,进而实现线极化或圆极化的轴向辐射。通过添加匹配介质,减小介质对微波的反射和驻波特性的影响;延伸喇叭到透镜边缘,使移相过程在波导内完成,有效地控制了电磁场模式。天线增益在中心工作频率为9.3 GHz时为19 dB,口径效率25%,辐射效率大于90%,反射系数小于1.3,轴比小于2 dB,3 dB相对带宽大于30%,几乎可以覆盖整个X波段。 展开更多
关键词 TM01模 cobra透镜天线 圆极化轴向辐射
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COBRAⅢC/MIT-2程序的改进及其在高通量研究堆中的应用 被引量:3
7
作者 李金才 王平 《核科学与工程》 CSCD 北大核心 1996年第1期35-41,共7页
将堆芯子通道热工水力分析程序COBRAⅢC/MIT-2的水物性、临界热流关系式、泡核沸腾起始点判断公式等加以修正或扩充,使之能用于低温低压下研究堆或实验堆的分析。利用改进的COBRAⅢC/MIT-2,对日本板状元件高... 将堆芯子通道热工水力分析程序COBRAⅢC/MIT-2的水物性、临界热流关系式、泡核沸腾起始点判断公式等加以修正或扩充,使之能用于低温低压下研究堆或实验堆的分析。利用改进的COBRAⅢC/MIT-2,对日本板状元件高通量研究堆JRR-3M在不同基准流速下以及不同流道阻塞率下的热工水力特性进行了分析计算,所得结果与日本原子能研究院开发的热工水力分析软件COOLOD的相应预测结果符合良好。 展开更多
关键词 cobra C/MIT-2 子通道分析 高通量研究堆 临界热流
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COBRA程序系列中的一个新版本——COBRAIIIC/MIT-2 被引量:2
8
作者 臧希年 赵兆颐 《原子能科学技术》 EI CAS CSCD 北大核心 1990年第4期79-82,共4页
一、前言二十多年来,在反应堆设计和安全分析领域内,随着计算机的普及和实验研究工作的开展,各种计算机程序应运而生。分析堆芯行为的程序更是层出不穷。其中美国太平洋西北实验室发展的COBRA程序系列是较好的一个。第一个版本COBRA-Ⅰ... 一、前言二十多年来,在反应堆设计和安全分析领域内,随着计算机的普及和实验研究工作的开展,各种计算机程序应运而生。分析堆芯行为的程序更是层出不穷。其中美国太平洋西北实验室发展的COBRA程序系列是较好的一个。第一个版本COBRA-Ⅰ自1967年发表至今已二十多年,中间不断公布了改进的版本,如COBRA-Ⅱ,COBRA-Ⅲ等。1973年发表的COBRA-ⅢC采用了先进的横向动量方程,较逼真地描述了物理过程。 展开更多
关键词 cobra程序 子通道 反应堆 热工
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支气管动脉栓塞术中Cobra联合Yashiro导管对栓塞成功率的影响 被引量:4
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作者 余龙伍 华双一 +1 位作者 严雄 吴扬 《影像诊断与介入放射学》 2020年第3期195-200,共6页
目的观察支气管动脉栓塞术中Cobra联合Yashiro导管的栓塞成功率,并随访其疗效。方法回顾性分析,采集我院2015年1月~2017年1月期间支气管动脉栓塞术中单纯使用Cobra导管的70例患者纳入单一导管组(单一组),另选取2017年2月~2019年12月期... 目的观察支气管动脉栓塞术中Cobra联合Yashiro导管的栓塞成功率,并随访其疗效。方法回顾性分析,采集我院2015年1月~2017年1月期间支气管动脉栓塞术中单纯使用Cobra导管的70例患者纳入单一导管组(单一组),另选取2017年2月~2019年12月期间将支气管动脉栓塞术中联合使用Cobra与Yashiro导管的56例患者纳入联合导管组(联合组)。所有患者均完成为期3年的有效随访,记录两组患者动脉造影影像学特征、责任血管检出情况,对比两组手术及恢复相关指标,随访3个月~3年,记录并对比两组支气管栓塞的效果及并发症发生率及术后3个月内咯血复发率。结果126例患者均接受支气管动脉栓塞术治疗。联合组共检出207支责任支气管动脉,其中Cobra导管检出133支,Yashiro导管检出74支;随访结束后,联合组栓塞总有效率较单一组高,联合组手术时间较长,但X线透视时间及住院时间较短,差异有统计学意义(P<0.05);两组并发症发生率对比,差异无统计学意义(P>0.05);随访3个月期间,观察组咯血再复发率低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论Cobra联合Yashiro导管显著提高支气管栓塞动脉检出率,针对内科保守治疗无效且外科手术指征不明显的患者,支气管动脉栓塞术中采取Cobra联合Yashiro导管可降低因支气管动脉CT血管造影漏检导致再发咯血风险,提高支气管动脉栓塞成功率,虽手术时间略长但整体获益较高。 展开更多
关键词 支气管动脉栓塞术 cobra导管 Yashiro导管 成功率 并发症
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COBRAⅢC/MIT2程序的移植及其性能介绍 被引量:1
10
作者 李金才 黄芳芝 +1 位作者 钱力克 刘汉升 《核科学与工程》 CAS 1987年第2期132-143,5,共13页
本文介绍了COBRAⅢC/MJT2程序的主要特点、功能、模型以及我们对文献[1]给出的原程序中的一些错误所做的改正。文中还给出了多个例题与其它子通道程序计算结果及实验结果的比较。改正后的COBRAⅢC/MIT2程序结果与其它一些程序计算结果... 本文介绍了COBRAⅢC/MJT2程序的主要特点、功能、模型以及我们对文献[1]给出的原程序中的一些错误所做的改正。文中还给出了多个例题与其它子通道程序计算结果及实验结果的比较。改正后的COBRAⅢC/MIT2程序结果与其它一些程序计算结果及实验结果符合的很好。 展开更多
关键词 子通道分析 计算结果 例题 过冷沸腾 表面沸腾 cobra C/MIT2 程序 空泡份额 MIT
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亚麻COBRA基因家族的鉴定与生物信息学分析 被引量:4
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作者 齐燕妮 李闻娟 +4 位作者 王利民 赵玮 党照 谢亚萍 张建平 《甘肃农业科技》 2019年第9期33-38,共6页
COBRA基因编码糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白,是次生壁加厚和纤维素含量的调节因子。亚麻纤维为韧皮纤维,纤维产量与次生壁中纤维素含量及次生壁加厚密切相关。通过BLASTP和Pfam分析,鉴定到24个亚麻COBRA家族成员,并对其进行基因结构、蛋白理... COBRA基因编码糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白,是次生壁加厚和纤维素含量的调节因子。亚麻纤维为韧皮纤维,纤维产量与次生壁中纤维素含量及次生壁加厚密切相关。通过BLASTP和Pfam分析,鉴定到24个亚麻COBRA家族成员,并对其进行基因结构、蛋白理化性质及系统进化等生物信息学分析。结果表明,有22个成员具有跨膜结构域,21个成员具有N-端信号肽,16个成员具有GPI锚定位点,所有蛋白均具有CCVS保守结构域而且都定位在细胞膜。基因结构和系统进化分析表明,亚麻COBRA基因家族分为2个亚家族:COBRA-I和COBRA-II,2个亚家族的基因结构具有明显的差异。 展开更多
关键词 亚麻 纤维 cobra基因家族 序列分析 系统进化分析
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Cobra-H64/128算法的相关密钥-差分攻击 被引量:2
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作者 罗伟 郭建胜 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第8期1569-1573,共5页
本文研究了Cobra-H64/128分组密码算法在相关密钥-差分攻击下的安全性.针对Cobra-H64算法,利用新构造的相关密钥-差分路径和CP逆变换存在的信息泄露规律给出攻击算法1,恢复出了全部128bit密钥,相应的计算复杂度为2^40.5次Cobra-H64算法... 本文研究了Cobra-H64/128分组密码算法在相关密钥-差分攻击下的安全性.针对Cobra-H64算法,利用新构造的相关密钥-差分路径和CP逆变换存在的信息泄露规律给出攻击算法1,恢复出了全部128bit密钥,相应的计算复杂度为2^40.5次Cobra-H64算法加密,数据复杂度为2^40.5个选择明文,存储复杂度为2^22bit,成功率约为1;针对Cobra-H128算法,利用新构造的相关密钥-差分路径给出攻击算法2,恢复出了全部256bit密钥,相应的计算复杂度为2^76次Cobra-H128算法加密,数据复杂度为2^76个选择明文,存储复杂度为2^16.2bit.分析结果表明,Cobra-H64/128算法在相关密钥-差分攻击条件下是不安全的. 展开更多
关键词 密码分析 cobra-H64 128算法 相关密钥-差分攻击 差分传递特性 比特传递特性
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基于Samcef Rotor和Cobra的某滚动轴承-转子系统固有频率分析 被引量:1
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作者 于晓凯 徐俊 +1 位作者 谢鹏飞 屈驰飞 《智能制造》 2017年第8期38-41,共4页
建立转子系统Samcef Rotor有限元模型,通过轴承分析软件Cobra分析得到轴承5×5刚度矩阵,将轴承刚度矩阵与转子动力学软件Samcef Rotor耦合分析,可精确得到轴承-转子系统固有频率,通过试验验证了分析方法的有效性和正确性。一、... 建立转子系统Samcef Rotor有限元模型,通过轴承分析软件Cobra分析得到轴承5×5刚度矩阵,将轴承刚度矩阵与转子动力学软件Samcef Rotor耦合分析,可精确得到轴承-转子系统固有频率,通过试验验证了分析方法的有效性和正确性。一、前言随着电力、航空航天、石油化工及机械制造业的飞速发展,各种旋转机械向高速方向发展,因此对转子-轴承系统的动力学特性提出了更高的要求。随之对轴承的设计和使用提出了越来越高的要求,因此,研究滚动轴承-转子系统的动态特性具有重要的实用价值和意义。 展开更多
关键词 轴承-转子系统 cobra 频率分析 滚动 转子-轴承系统 刚度矩阵 有限元模型 转子动力学
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Primary Study of Egg Yolk Antibody for Detection of King Cobra Venom Antigens
14
作者 王桂平 刘新艳 +3 位作者 朱柳 覃媛 黄劭 余清声 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS 2005年第3期193-197,共5页
Aim To study whether antivenom from laying hens can be used for the detection of venom antigens, Methods Chickens (white Leghorn) were immunized with detoxicated king cobra venom by formaldehyde and egg yolk immunog... Aim To study whether antivenom from laying hens can be used for the detection of venom antigens, Methods Chickens (white Leghorn) were immunized with detoxicated king cobra venom by formaldehyde and egg yolk immunoglobulin (IgY) isolated from yolk; IgY was labelled with the horseradish peroxidase (HRP). Experimental condition and parameters were determined by chessboard test. The specificity, sensitivity, precision, and stability of this method were assayed in the experiment. Results This method could detect as low as 32 μg· L^-1 of the king cobra antigens. A good linear relation was found within 32 ~ 750 μg· L^-1 of king cobra venom concentrations ( r = 0. 963). There was no cross reactivity for the reagents with Agkistrodon acutus Guenther venom or Vipera russelli siamensis Smith venom;slight cross reactivity .with Bungarus multicinctus Blyth venom or Bungarus fasciatus Chmeider venom; and notable cross reactivity with cobra venom. The average intra-assay relative standard deviation (RSD) was 1% - 3%, and the inter-assay RSD was less than 8%. The reagents (including IgY and HRP-IgY) were stable; no differences (P 〉 0.05) were observed for the detection of venom antigens when the reagents were stored at 37 ℃ up to 6 d. Conclusion IgY is a good reagent for diagnosis of snakebite after eliminating the genus cross reactivity. 展开更多
关键词 king cobra venom yolk immunoglobulin HENS enzyme-linked immunosorbent assays
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用眼镜蛇3号(Cobra3)仪器测量铂电阻温度系数 被引量:1
15
作者 樊艳 郑军 《高校实验室工作研究》 2012年第1期50-51,共2页
本文介绍一种利用眼镜蛇3号(Cobra3)仪器测量铂电阻温度系数的新方法。利用眼镜蛇3号仪器的精确采样和计算机实时数据处理能力,只需记录加热过程的起始和终止温度,就可精确测量。相比较于非平衡电桥法和电位差计法,具有操作方便,计算简... 本文介绍一种利用眼镜蛇3号(Cobra3)仪器测量铂电阻温度系数的新方法。利用眼镜蛇3号仪器的精确采样和计算机实时数据处理能力,只需记录加热过程的起始和终止温度,就可精确测量。相比较于非平衡电桥法和电位差计法,具有操作方便,计算简单的优势。 展开更多
关键词 cobra3 铂电阻 温度系数
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Cobra24%EC防除春花生田阔叶杂草的研究
16
作者 宋文武 孟爱芝 +3 位作者 董炜博 陈培军 宋协松 卢俊玲 《莱阳农学院学报》 2001年第2期136-139,共4页
1998~ 1 999年研究指出 ,5月上旬花生播种之后 ,当田间阔叶杂草长到 3~ 4叶时 ,667m2 喷Cobra2 4 %EC 2 5~ 35ml的范围内 ,药后 1 0d对阔叶杂草的反枝苋、铁苋菜、马齿苋的株防除效果均为 1 0 0 % ;4 5d后 ,阔叶杂草的鲜重防效为 96... 1998~ 1 999年研究指出 ,5月上旬花生播种之后 ,当田间阔叶杂草长到 3~ 4叶时 ,667m2 喷Cobra2 4 %EC 2 5~ 35ml的范围内 ,药后 1 0d对阔叶杂草的反枝苋、铁苋菜、马齿苋的株防除效果均为 1 0 0 % ;4 5d后 ,阔叶杂草的鲜重防效为 96.7%~ 98.3% ;花生收获其增产幅度为 67.5%~ 85.5% ,除草效果及增产幅度明显。 展开更多
关键词 阔叶杂草 花生田杂草 cobra EC 除草剂 药效试验 安全性
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COBRA技术在敏捷供需链管理系统中的应用
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作者 陈光武 杨菊花 《甘肃科技》 2004年第4期25-26,共2页
从ASCMS的特点出发 ,建立了ASCMS的系统模型。本文还进一步提出了将Internet、COR BA应用到ASCMS中 ,对Legacy系统进行集成和封装。
关键词 敏捷供需链 cobra LEGACY 模型
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文心兰OnCOBRA基因克隆及表达模式分析 被引量:2
18
作者 李玲 赖钟雄 +2 位作者 陈裕坤 练从龙 林鹤延 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2014年第8期1551-1558,共8页
以文心兰试管苗为材料,采用RT-PCR结合RACE法,克隆文心兰OnCOBRA基因的cDNA全长和DNA序列。结果表明:COBRA全长为1 601 bp,开放阅读框(ORF)为1 386 bp,共编码461个氨基酸;OnCOBRA的DNA序列共2 949 bp,且含有6个外显子和5个内含子。生物... 以文心兰试管苗为材料,采用RT-PCR结合RACE法,克隆文心兰OnCOBRA基因的cDNA全长和DNA序列。结果表明:COBRA全长为1 601 bp,开放阅读框(ORF)为1 386 bp,共编码461个氨基酸;OnCOBRA的DNA序列共2 949 bp,且含有6个外显子和5个内含子。生物信息学结果表明,OnCOBRA属于不稳定的疏水蛋白,具有信号肽、跨膜结构和CCVS保守区域,亚细胞定位于细胞膜中;与无油樟、玉米、籼稻、拟南芥等具有较高的同源性。系统进化树分析结果表明,文心兰OnCOBRA蛋白与玉米(ZmCOBRA)、无油樟(AtCOBRA)、籼稻(OsCOBRA)处于统一分枝,推测OnCOBRA基因是COBRA基因家族的成员。qPCR结果表明,OnCORBA为组成型表达,在成苗期表达量最高,在文心兰类原球茎时期表达量最低。 展开更多
关键词 文心兰 cobra 克隆 生物信息学 qPCR
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玉米COBRA基因家族分析及重要成员ZmCOBL03基因编辑 被引量:1
19
作者 郝竞杰 赵方方 +7 位作者 陈子奇 尹悦佳 郭嘉 张闯 于志佳 孙佳琪 吴委林 刘相国 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期23-29,共7页
利用生物信息学的方法分析玉米COBRA家族10个成员的序列特征、与其他物种的进化关系和组织特异性表达模式。结果表明,10个COBRA家族基因都含有CCVS保守结构域,并且均定位于细胞膜上。系统进化分析结果显示,该家族可以分为2个亚族,每个... 利用生物信息学的方法分析玉米COBRA家族10个成员的序列特征、与其他物种的进化关系和组织特异性表达模式。结果表明,10个COBRA家族基因都含有CCVS保守结构域,并且均定位于细胞膜上。系统进化分析结果显示,该家族可以分为2个亚族,每个亚族内的基因具有相似的基因结构和理化性质。以ZmCOBL03为候选基因开展基因编辑,采用双靶标位点的设计思路,利用农杆菌介导的玉米遗传转化技术和CRISPR/Cas9基因编辑技术,成功获得ZmCOBL03基因靶向突变的玉米株系。表型分析证实,ZmCOBL03基因突变后严重影响了玉米的正常发育,表现为植株极端矮化且生殖生长受到抑制,证实ZmCOBL03基因在植物细胞壁纤维素合成中发挥重要作用。 展开更多
关键词 玉米 cobra ZmCOBL03 基因敲除
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谷子COBRA家族成员的全基因组鉴定及表达模式分析 被引量:1
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作者 任昂彦 陈环宇 +7 位作者 王根平 施洋 陆镇威 陈涛 李晓莎 潘宗瑾 戚永奎 杨华 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第23期7669-7677,共9页
谷子(Setaria italica L.)是富含蛋白质、纤维素的主要杂粮作物之一。为了解析谷子中参与纤维素沉积和细胞扩张的COBRA家族,利用生物信息学分析手段对谷子进行全基因组鉴定和分析。结果表明,在谷子中共鉴定出9个COBRA家族成员(其中SiCO... 谷子(Setaria italica L.)是富含蛋白质、纤维素的主要杂粮作物之一。为了解析谷子中参与纤维素沉积和细胞扩张的COBRA家族,利用生物信息学分析手段对谷子进行全基因组鉴定和分析。结果表明,在谷子中共鉴定出9个COBRA家族成员(其中SiCOBL9序列不完整),可分为两个亚家族,来自同一亚家族的成员理化特性、序列保守性和基因结构相似,COBRA家族编码基因主要分布在染色体的两端,系统发育树分析显示谷子COBRA蛋白与禾本科玉米最为相似,并且所有成员都具有COBRA蛋白所具备的CCVS保守结构和糖基化修饰位点等。组织表达模式分析结果表明,基因的表达存在组织差异性,其中SiCOBL6在所选组织中表达量均较高,在所选组织中未发现特异表达的基因。 展开更多
关键词 谷子 cobra 纤维素 基因家族 生物信息学
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