目的:探讨低深度全基因组拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)技术在流产物遗传学分析及诊断中的应用。方法:收集2016年1月—2018年12月在淮安市第一人民医院就诊的流产组织样本112例,采用二代测序技术对流产物...目的:探讨低深度全基因组拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)技术在流产物遗传学分析及诊断中的应用。方法:收集2016年1月—2018年12月在淮安市第一人民医院就诊的流产组织样本112例,采用二代测序技术对流产物样本进行全基因组测序,利用生物信息学方法分析流产样本可能存在的染色体异常。结果:(1)在112例流产样本中,染色体结果异常共56例(50.0%,56/112),出现异常信号频率高的分别是16三体(27.1%)、45,X(24.3%)、13三体(10.8%)、18三体(10.8%)。在56例染色体异常结果中,染色体数目异常37例(66.1%),染色体结构异常12例(21.4%),嵌合体7例(12.5%)。在12例染色体结构异常中,共发现24个基因组拷贝数变异(copy number variation,CNV),最小片段长度0.24 Mb,最大片段58.90 Mb。在检测出的24个CNV中,18个CNV有临床意义。其中2个包含微缺失/微重复综合征。(2)患者年龄≥35岁发生染色体异常导致的流产者占63.2%,年龄<35岁发生染色体异常导致的流产者占47.3%,≥35岁组的异常率比<35岁组高15.9%。结论:CNV-seq技术不但能够高效检测出非整倍体和嵌合体,还能高效检测出小片段的缺失和重复,大大提高了染色体异常的检出率,可为流产病因分析及夫妻双方再次生育提供更有价值的信息。展开更多
目的探讨染色体拷贝数变异测序(copy number varaitionsequencing,CNV-seq)在稽留流产绒毛组织检测染色体畸变的价值,明确流产病因。方法选取哈尔滨市红十字中心医院妇产科门诊诊断早期稽留流产 224例患者自愿接受流产病因学检测,进行...目的探讨染色体拷贝数变异测序(copy number varaitionsequencing,CNV-seq)在稽留流产绒毛组织检测染色体畸变的价值,明确流产病因。方法选取哈尔滨市红十字中心医院妇产科门诊诊断早期稽留流产 224例患者自愿接受流产病因学检测,进行检测前咨询,告知CNV-seq技术检测目的及意义,行人工流产时留取绒毛组织送检行CNV-seq。结果 224例流产组织CNV-seq检测成功率100%,检出染色体畸变114例,阳性检出率为51%,其中数目异常71例,包括特纳综合征20例、16-三体19例、22-三体7例、21-三体6例、3-三体3例、14-三体2例、4-三体2例、20-三体1例、18-三体1例、15-三体1例、8-三体1例、三倍体8例,其他染色体畸变包括嵌合体、微缺失/微重复(多态性和致病性不明确)43例。结论 CNV-seq诊断稽留流产病因染色体畸变,其特异性较高,胚胎染色体非整倍体是导致早期胚胎停止发育流产的重要原因,CNV-seq在稽留流产染色体异常和拷贝数变异具有较好的临床应用价值,明确流产的遗传学病因,为再次妊娠提供指导有重要意义。展开更多
目的探讨低深度全基因组测序CNV检测技术(copy number variation sequencing,CNV-seq)在无创产前筛查高风险且超声表现正常胎儿产前诊断中的价值。方法选择2019年1月至2022年5月于张家口市妇幼保健院产前诊断中心就诊的256例无创产前筛...目的探讨低深度全基因组测序CNV检测技术(copy number variation sequencing,CNV-seq)在无创产前筛查高风险且超声表现正常胎儿产前诊断中的价值。方法选择2019年1月至2022年5月于张家口市妇幼保健院产前诊断中心就诊的256例无创产前筛查高风险且超声表现正常的孕妇作为研究对象,所有孕妇均自愿接受羊膜穿刺。采用CNV-seq和染色体核型分析两种方法进行产前诊断,比较两种产前诊断方法结果差异,并随访分析。结果羊水染色体核型分析检出的异常核型有110例,计算异常检出率为42.97%。经CNV-seq检测,所有羊水样本均成功检测。共有116例致病性CNVs被检出,10例可能良性/良性,44例VOUS,86例未见异常,异常检出率高达45.31%。有11例CNV-seq分析结果与胎儿染色体核型分析结果不相符,2例染色体数目异常合并结构异常,经CNV-seq分析结果显示为染色体非整倍体异常;染色体结构异常9例,经CNV-seq分析实现对异常片段的精准定位。两种检测结果不一致情况共有8例,有1例嵌合型非同源罗宾逊易位病例被染色体核型分析检出,CNV-seq分析检测漏检;2例细胞培养失败病例和5例染色体核型分析结果正常者,经CNV-seq检测显示均为致病性染色体异常。结论与常规染色体核型分析相比,CNV-seq可更特异、高效地检测出无创产前筛查高风险且超声表现正常胎儿的致病性CNV,是对目前临床产前诊断技术的有效补充。展开更多
文摘目的:探讨低深度全基因组拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)技术在流产物遗传学分析及诊断中的应用。方法:收集2016年1月—2018年12月在淮安市第一人民医院就诊的流产组织样本112例,采用二代测序技术对流产物样本进行全基因组测序,利用生物信息学方法分析流产样本可能存在的染色体异常。结果:(1)在112例流产样本中,染色体结果异常共56例(50.0%,56/112),出现异常信号频率高的分别是16三体(27.1%)、45,X(24.3%)、13三体(10.8%)、18三体(10.8%)。在56例染色体异常结果中,染色体数目异常37例(66.1%),染色体结构异常12例(21.4%),嵌合体7例(12.5%)。在12例染色体结构异常中,共发现24个基因组拷贝数变异(copy number variation,CNV),最小片段长度0.24 Mb,最大片段58.90 Mb。在检测出的24个CNV中,18个CNV有临床意义。其中2个包含微缺失/微重复综合征。(2)患者年龄≥35岁发生染色体异常导致的流产者占63.2%,年龄<35岁发生染色体异常导致的流产者占47.3%,≥35岁组的异常率比<35岁组高15.9%。结论:CNV-seq技术不但能够高效检测出非整倍体和嵌合体,还能高效检测出小片段的缺失和重复,大大提高了染色体异常的检出率,可为流产病因分析及夫妻双方再次生育提供更有价值的信息。
文摘目的探讨低深度全基因组测序CNV检测技术(copy number variation sequencing,CNV-seq)在无创产前筛查高风险且超声表现正常胎儿产前诊断中的价值。方法选择2019年1月至2022年5月于张家口市妇幼保健院产前诊断中心就诊的256例无创产前筛查高风险且超声表现正常的孕妇作为研究对象,所有孕妇均自愿接受羊膜穿刺。采用CNV-seq和染色体核型分析两种方法进行产前诊断,比较两种产前诊断方法结果差异,并随访分析。结果羊水染色体核型分析检出的异常核型有110例,计算异常检出率为42.97%。经CNV-seq检测,所有羊水样本均成功检测。共有116例致病性CNVs被检出,10例可能良性/良性,44例VOUS,86例未见异常,异常检出率高达45.31%。有11例CNV-seq分析结果与胎儿染色体核型分析结果不相符,2例染色体数目异常合并结构异常,经CNV-seq分析结果显示为染色体非整倍体异常;染色体结构异常9例,经CNV-seq分析实现对异常片段的精准定位。两种检测结果不一致情况共有8例,有1例嵌合型非同源罗宾逊易位病例被染色体核型分析检出,CNV-seq分析检测漏检;2例细胞培养失败病例和5例染色体核型分析结果正常者,经CNV-seq检测显示均为致病性染色体异常。结论与常规染色体核型分析相比,CNV-seq可更特异、高效地检测出无创产前筛查高风险且超声表现正常胎儿的致病性CNV,是对目前临床产前诊断技术的有效补充。
