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CLPTM1L与miR-494靶向关系的双荧光素酶报告实验验证 被引量:4
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作者 张仁 张圣洁 +2 位作者 张学研 李彤 臧文巧 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2015年第3期430-433,共4页
目的:确定miR-494与CLPTM1L的靶向关系。方法:采用生物信息学方法预测miR-494与CLPTM1L基因的结合位点。采用PCR技术扩增CLPTM1L基因3'UTR片段,并克隆至pmir GLO载体,构建野生型及突变型重组双荧光素酶报告质粒。将培养的293T细胞分... 目的:确定miR-494与CLPTM1L的靶向关系。方法:采用生物信息学方法预测miR-494与CLPTM1L基因的结合位点。采用PCR技术扩增CLPTM1L基因3'UTR片段,并克隆至pmir GLO载体,构建野生型及突变型重组双荧光素酶报告质粒。将培养的293T细胞分为4组,分别共转染miR-494或阴性对照和pmir GLO-CLPTM1L-W 3'UTR或pmir GLOCLPTM1L-M 3'UTR,检测4组细胞中荧光素酶活性。结果:酶切和测序证实成功构建了野生型及突变型重组双荧光素酶报告质粒pmir GLO-CLPTM1L-W 3'UTR和pmir GLO-CLPTM1L-M 3'UTR;与共转染miR-494 mimics和突变型CLPTM1L3'UTR质粒的293T细胞中荧光素酶活性(1.056 4±0.163 4)、共转染阴性对照序列和突变质粒的293T细胞中荧光素酶活性(0.961 3±0.177 9)或野生型质粒的293T细胞中荧光素酶活性(0.983 4±0.001 2)相比,共转染miR-494 mimics和野生型CLPTM1L 3'UTR质粒的293T细胞中荧光素酶活性(0.651 6±0.136 4)明显降低(F=4.476,P=0.040),其他3组间比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:CLPTM1L与miR-494存在靶向关系。 展开更多
关键词 miR-494 clptm1l 双荧光素酶报告系统
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CLPTM1L变异与云南汉族人群非小细胞肺癌的相关性 被引量:1
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作者 张云云 黄凤丹 +6 位作者 马千里 张新文 李盈甫 何秀莲 李传印 姚宇峰 刘伟鹏 《贵州医科大学学报》 CAS 2022年第5期524-529,共6页
目的探究唇腭裂跨膜1样蛋白(CLPTM1L)基因调控区单核苷酸多态性(SNP)变异位点(rs27069、rs27070、rs27071及rs27996)与云南地区汉族人群非小细胞肺癌发生风险的相关性。方法500例非小细胞肺癌患者作为病例组、613例健康对照个体作为对照... 目的探究唇腭裂跨膜1样蛋白(CLPTM1L)基因调控区单核苷酸多态性(SNP)变异位点(rs27069、rs27070、rs27071及rs27996)与云南地区汉族人群非小细胞肺癌发生风险的相关性。方法500例非小细胞肺癌患者作为病例组、613例健康对照个体作为对照组,采用TaqMan探针法对两组受试者外周血CLPTM1L基因调控区rs27069、rs27070、rs27071和rs27996位点进行基因分型,并采用χ2检验分析上述4个SNP位点的等位基因、基因型及单倍型分布频率。结果rs27071的等位基因和基因型分布频率在对照组和病例组间比较差异有统计学意义(P=0.006和P=0.004),该位点的C等位基因可能是非小细胞肺癌的保护性因素(OR=0.65,95%CI为0.50~0.89);而rs27069、rs27070和rs27996位点的等位基因和基因型分布频率在病例组和对照组间比较差异无统计学意义(P>0.0125);单倍型分析结果显示,单倍型rs27069[T]-rs27070[C]-rs27071[C]-rs27996[G]与降低非小细胞肺癌发生风险相关(P=0.006,OR=0.662,95%CI为0.493~0.890)。结论CLPTM1L调控区SNP位点rs27071与云南地区汉族人群肺癌的发病风险相关,该位点等位基因C可能是非小细胞肺癌的保护性因素。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 全基因组关联研究 clptm1l 基因表达 单核苷酸多态性 汉族人群 相关性
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CLPTM1L和PAX8基因多态性与云南汉族人群宫颈癌的相关性
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作者 黄凤丹 张云云 +6 位作者 严志凌 张新文 张芍 梁燕 李传印 姚宇峰 刘伟鹏 《贵州医科大学学报》 CAS 2024年第10期1428-1434,共7页
目的探究CLPTM1L基因的单核苷酸多态性(SNP)位点(rs27069、rs27070、rs27071及rs27996)和PAX8基因SNP位点(rs4849177、rs10175462)与云南汉族人群宫颈上皮内瘤变(CIN)和宫颈癌发生风险的相关性。方法在1014例健康对照组(Control组)样本... 目的探究CLPTM1L基因的单核苷酸多态性(SNP)位点(rs27069、rs27070、rs27071及rs27996)和PAX8基因SNP位点(rs4849177、rs10175462)与云南汉族人群宫颈上皮内瘤变(CIN)和宫颈癌发生风险的相关性。方法在1014例健康对照组(Control组)样本、516例宫颈上皮内瘤变组(CIN组)样本以及953例宫颈癌组(CC组)样本中对rs27069、rs27070、rs27071、rs27996、rs4849177及rs10175462位点进行基因分型,SHEsis软件分析6个SNP位点等位基因和基因型频率在各组中的差异,χ^(2)检验检测所构建的单倍型在各组之间的分布频率差异,Bonferroni法进行多重比较校正。结果CLPTM1L基因的4个SNP位点(rs27069、rs27070、rs27071及rs27996)和PAX8基因的2个SNP(rs4849177、rs10175462)的等位基因频率、基因型频率及单倍型频率在各组之间的分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论CLPTM1L基因SNP位点(rs27069、rs27070、rs27071及rs27996)和PAX8基因的SNP位点(rs4849177、rs10175462)与云南汉族人群CIN和宫颈癌的发生风险的不相关。 展开更多
关键词 宫颈癌 clptm1l PAX8 单核苷酸多态性 云南汉族人群
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过表达CLPTM1L降低95-D肺癌细胞对吉西他滨的敏感性 被引量:1
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作者 孙亦鹏 倪振华 +4 位作者 吴颖颖 陈清阁 毕俊杰 林玉华 王雄彪 《实用肿瘤学杂志》 CAS 2019年第6期486-490,共5页
目的研究CLPTM1L基因与肺癌细胞对吉西他滨敏感性的关系,并探讨其潜在的作用机制。方法构建针对CLPTM1L基因的过表达慢病毒,并感染肺癌95-D细胞,将细胞分为CLPTM1L过表达组和对照组;采用CCK-8法检测吉西他滨处理后过表达组和对照组细胞... 目的研究CLPTM1L基因与肺癌细胞对吉西他滨敏感性的关系,并探讨其潜在的作用机制。方法构建针对CLPTM1L基因的过表达慢病毒,并感染肺癌95-D细胞,将细胞分为CLPTM1L过表达组和对照组;采用CCK-8法检测吉西他滨处理后过表达组和对照组细胞增殖的变化;采用荧光定量PCR、Western blot和免疫化学发光法检测CLPTM1L基因和蛋白变化;采用生物荧光法检测Caspase-3/7和Caspase-9活性的变化;采用Western blot检测p-4E-BP1蛋白变化。结果CLPTM1L过表达慢病毒感染95-D细胞后,CLPTM1L过表达组的CLPTM1L基因水平(P=0.036)和蛋白表达(P<0.01)均高于对照组;与对照组相比,吉西他滨处理后CLPTM1L过表达组细胞增殖显著上升(P<0.01);Caspase活性检测显示,CLPTM1L过表达组Caspase-3/7和Caspase-9活性较对照组明显下降(P<0.01);Western blot检测显示,CLPTM1L过表达组4E-BP1的磷酸化水平与对照组比较显著增高(P<0.01)。结论CLPTM1L过表达可降低肺癌细胞对吉西他滨的敏感性,其机制可能是增加了4E-BP1的磷酸化水平。 展开更多
关键词 肺癌 clptm1l 吉西他滨 p-4E-BP1
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亚洲人群CLPTM1L rs401681基因多态性与肺癌易感性的Meta分析
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作者 赵天明 朱晶 +1 位作者 胡学华 倪吉祥 《现代肿瘤医学》 CAS 2017年第3期377-381,共5页
目的:评价亚洲人群CLPTM1L rs401681基因多态性与肺癌易感性的关系。方法:计算机检索数据库,对2016年6月前公开发表的关于rs401681基因多态性的病例对照研究进行Meta分析。结果:共14篇研究符合纳入标准,累计病例数6 924例,对照组7 920例... 目的:评价亚洲人群CLPTM1L rs401681基因多态性与肺癌易感性的关系。方法:计算机检索数据库,对2016年6月前公开发表的关于rs401681基因多态性的病例对照研究进行Meta分析。结果:共14篇研究符合纳入标准,累计病例数6 924例,对照组7 920例。Meta分析结果表明,CLPTM1L rs401681基因多态性与亚洲人肺癌易感性有关,差异有统计学意义(等位基因模型:OR=0.87,95%CI:0.83~0.92,P<0.01;显性基因模型:OR=0.85,95%CI:0.79~0.90,P<0.01;隐性基因模型:OR=0.84,95%CI:0.75~0.93,P=0.01)。敏感性分析显示结果稳定。倒漏斗图及Begg's回归分析不存在发表偏移。结论:CLPTM1L rs401681多态性与肺癌易感性有关,T基因可降低肺癌发生。 展开更多
关键词 基因多态性 肺癌 META 分析
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湖北地区汉族人群TERT-CLPTM1L基因多态性与肺癌易感性关联分析 被引量:5
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作者 刘世国 裴锐 沈智俊 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2015年第14期1079-1083,共5页
目的 研究湖北省汉族人群中TERT-CLPTM1L基因rs402710、rs401681、rs465498、rs4975616和rs27361005个常见多态性位点与肺癌的相关性。方法收集2012-08-01-2014-08-30湖北省武汉地区病理确诊的肺癌患者304例作为研究组,样品来源为湖北... 目的 研究湖北省汉族人群中TERT-CLPTM1L基因rs402710、rs401681、rs465498、rs4975616和rs27361005个常见多态性位点与肺癌的相关性。方法收集2012-08-01-2014-08-30湖北省武汉地区病理确诊的肺癌患者304例作为研究组,样品来源为湖北省第三人民医院肿瘤科;选取同期该地区无肿瘤或其他疾病的正常人319名作为对照组,样品来源为湖北省第三人民医院体检中心。采用Sequenom公司的MassArray○RiPLEX系统对304例肺癌患者和319例对照样品的5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点进行检测。结果 5个SNP位点中,对照组rs4975616位点不符合Hardy-Weinberg平衡,在分析中舍去。关联分析的结果表明,仅rs2736100位点与肺癌的易感性相关,P=0.034;且rs2736100位点(C/C)型与(A/A)型相比,患病风险显著提高,OR=1.96,95%CI为1.13~3.41,P=0.008。连锁不平衡分析结果表明,rs402710和rs401681之间存在较强的连锁不平衡,D′=0.971,r2=0.910;rs401681和rs465498之间也存在较强的连锁不平衡,D′=0.986,r2=0.546;而rs2736100与rs402710、rs401681和rs465498之间无明显连锁不平衡现象。结论 汉族人群TERT-CLPTM1L基因的rs2736100位点与肺癌的易感性显著相关,(C/C)型的患者罹患肺癌的风险较(A/A)型高;而rs402710、rs401681和rs465498位点与肺癌的易感性无相关性。 展开更多
关键词 肺肿瘤 TERT-clptm1l基因 多态性 关联分析 流行病学
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TERT-CLMPT1L基因区域多态性与海南鼻咽癌人群患病风险关联研究 被引量:6
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作者 周平 林冰 +6 位作者 张爽 王鹏 陈伟思 杨屏 林仙桃 程少文 刘沙 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2019年第4期205-211,共7页
目的鼻咽癌是由遗传和环境因素交互作用形成的多基因遗传疾病。本研究探讨端粒酶反转录酶和唇腭裂跨膜1样蛋白(telomerase reverse transcriptase,cleft lip and palate transmembrane-like protein 1,TERT-CLPTM1L)基因区域多态性与海... 目的鼻咽癌是由遗传和环境因素交互作用形成的多基因遗传疾病。本研究探讨端粒酶反转录酶和唇腭裂跨膜1样蛋白(telomerase reverse transcriptase,cleft lip and palate transmembrane-like protein 1,TERT-CLPTM1L)基因区域多态性与海南地区鼻咽癌患病风险关联性。方法采用病例-对照研究方法,选取2018-01-01-2018-06-30在海南医学院第一附属医院就诊的65例鼻咽癌患者作为病例组,选取同期常规体检的88名健康体检者作为对照组。通过多重单碱基延伸反应(SNaPshot SNP分型技术)检测TERT-CLPTM1L基因区域中rs33954691、rs13172201、rs6554743、rs2736100、rs2736098、rs2736106、rs2853668、rs401681和rs74739441位点基因型,各位点与鼻咽癌患病风险关系采用多因素二元Logistic回归分析。结果 9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点中,rs2736098等位基因T(OR=2.669,95%CI=1.490~4.783,P=0.001)增加鼻咽癌患病风险,而rs401681等位基因T(OR=0.475,95%CI=0.257~0.877,P=0.017)降低患病风险。比较各位点基因型频率,rs33954691位点AA基因型(OR=3.911,95%CI=1.031~14.837,P=0.045)、rs2736098位点CT(OR=4.281,95%CI=1.456~12.585,P=0.008)和TT基因型(OR=13.584,95%CI=3.053~60.441,P=0.001)及rs2736106位点TC基因型(OR=4.627,95%CI=1.128~18.980,P=0.033)增加鼻咽癌患病风险,而rs401681位点TT基因型(OR=0.124,95%CI=0.022~0.693,P=0.017)降低患病风险。显性模型(OR=4.670,95%CI=1.129~19.320,P=0.033)下rs2736106等位基因C增加鼻咽癌患病风险;加性(OR=6.064,95%CI=1.256~29.290,P=0.025)、隐性(OR=4.128,95%CI=1.323~12.877,P=0.015)和显性模型(OR=4.898,95%CI=1.719~13.975,P=0.003)下rs2736098等位基因T皆增加患病风险;加性(OR=0.016,95%CI=0.002~0.162,P<0.001)、隐性(OR=0.196,95%CI=0.039~0.983,P=0.048)和显性模型(OR=0.396,95%CI=0.161~0.972,P=0.043)下rs401681等位基因T皆降低患病风险。结论TERT-CLPTM1L基因区域rs33954691、rs2736098、rs2736106和rs401681位点多态性与鼻咽癌患病风险有关联,但尚需扩大样本验证。 展开更多
关键词 TERT-clptm1l 单核苷酸多态性 鼻咽癌 危险因素 海南
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