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基于TCGA数据库分析CLDN9在胃癌中的预后价值及与免疫浸润的相关性
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作者 贾晓艳 余军林 杨宏山 《中国现代普通外科进展》 2026年第1期20-27,共8页
目的:分析连接蛋白CLDN9与胃癌预后的关系并进一步探索其与免疫浸润的相关性。方法:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取胃癌的CLDN9基因表达量及相应的临床特征。通过Mann-Whitney U及Wilcoxon符号秩和检验分析胃癌组织与正常组织间CL... 目的:分析连接蛋白CLDN9与胃癌预后的关系并进一步探索其与免疫浸润的相关性。方法:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取胃癌的CLDN9基因表达量及相应的临床特征。通过Mann-Whitney U及Wilcoxon符号秩和检验分析胃癌组织与正常组织间CLDN9基因差异表达及其与临床特征的关系,进一步单因素、多因素Cox及Kaplan-Meier方法探索CLDN9与预后的相关性,利用ROC曲线获取最佳截断值。通过STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并进一步行基因本体(GO)及京都基因百科全书和基因组(KEGG)的功能注释。通过肿瘤免疫估计资源分析CLDN9与免疫细胞浸润丰度的关系。结果:CLDN9基因在胃癌组织中表达上调,且男性CLDN9高表达,而G_(3)期胃癌组织中的CLDN9低表达(均P<0.05)。CLDN9基因高表达组总生存期(OS)明显小于低表达组(20.6个月比58.2个月,HR=1.694,95%CI:1.214~2.365,P=0.002),在各亚组中(年龄>65岁、T_(1~2)、N_(1~3)、M_(0)、Ⅲ~Ⅳ期、G_(3)、R_(0)残留肿瘤、无Barretts食管、无反流史、未抗反流治疗及无Hp感染)CLDN9高表达组OS都小于低表达组(均P<0.05)。CLDN9区分胃癌组织与正常组织的最佳截断值为0.426,其敏感度和特异度分别为78.1%和73.6%。通过GO及KEGG进行功能注释发现,CLDN9可能参与细胞紧密连接及细胞-细胞黏附信号通路。CLDN9表达与CD8^(+)T细胞(r=-0.276)、中性粒细胞(r=-0.192)及树突状细胞(r=-0.213)的浸润丰度具有负相关性(P<0.001)。结论:CLDN9基因在胃癌中高表达,且高表达的CLDN9与免疫抑制及不良预后相关,可作为潜在预后预测指标及治疗靶点。 展开更多
关键词 连接蛋白cldn9 胃肿瘤 预后 免疫浸润
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CLDN9 Levels Influence the Biological Activities of Cells in Gastric Cancer
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作者 Jin Liu Xiu Zhang +2 位作者 Xiao Hu Gaofeng Yuan Kai Chen 《BIOCELL》 2025年第4期664-679,共16页
Objective:This study examines the significance and functions of CLDN9 in gastric cancer(GC),intending to identify novel targets for diagnosis and treatment.Methods:CLDN9 expression in GC tissues and cell lines was inv... Objective:This study examines the significance and functions of CLDN9 in gastric cancer(GC),intending to identify novel targets for diagnosis and treatment.Methods:CLDN9 expression in GC tissues and cell lines was investigated in TCGA data,with analysis with Western blotting,qRT-PCR,and immunohistochemical analyses.Correlations between clinicopathological characteristics,progression-free survival(PFS),and overall survival(OS)were assessed with Cox regression.The effect of CLDN9 knockdown/overexpression on tumorigenic functions(proliferation,migration,and invasion)was assessed using CCK-8,colony formation,and Transwell assays.Tumor-bearing assays were performed to verify the impact of CLDN9 knockdown on the in vivo proliferation of GC cells.Results:Analysis of TCGA data,qRT-PCR,Western blotting,and immunohistochemistry indicated significantly elevated levels of CLDN9 in GC tissues and cell lines(p 0.01).Compared to the group with high CLDN9 expression,<PFS and OS were markedly longer in cases with low CLDN9 levels(p 0.05).Multivariate regression indicated that<CLDN9 levels were independently predictive of GC prognosis.CCK-8,Transwell,and colony formation tests showed that CLDN9 overexpression promoted GC cell proliferation,clonogenicity,and migratory/invasive capabilities,but CLDN9 knockdown markedly reduced these features.Experiments involving tumor-bearing models demonstrated that the suppression of CLDN9 inhibited the in vivo growth of GC cells.Conclusion:In conclusion,this study’s findings suggested that CLDN9 might be a valuable therapeutic target or diagnostic biomarker for GC. 展开更多
关键词 Gastric cancer cldn9 cell proliferation INVASION MIGRATION
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生物信息学方法分析CLDN9基因在子宫内膜癌中表达对生存率的影响 被引量:4
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作者 诸充 康乐 +4 位作者 瞿晓燕 杨尚 闫蔷 许浩宇 和斌 《东南大学学报(医学版)》 CAS 2023年第2期169-180,共12页
目的:通过生物信息学方法分析子宫内膜癌(UCEC)中与肿瘤微环境(TME)相关的核心基因。方法:从UCSC Xena数据库下载TCGA数据库中的UCEC基因表达和临床数据。通过R软件中的ESTIMATE包计算样本的免疫细胞与基质细胞综合评分(ESTIMATE Score)... 目的:通过生物信息学方法分析子宫内膜癌(UCEC)中与肿瘤微环境(TME)相关的核心基因。方法:从UCSC Xena数据库下载TCGA数据库中的UCEC基因表达和临床数据。通过R软件中的ESTIMATE包计算样本的免疫细胞与基质细胞综合评分(ESTIMATE Score),将样本分为ESTIMATE Score高、低两组,分析组间差异基因(DEGs),对DEGs进行富集分析。再对DEGs进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),得到核心基因模块。分析核心模块基因在肿瘤和正常组织中的表达情况,结合DEGs在UCEC及子宫内膜组织中的表达水平及差异程度选取研究的目的基因。通过String数据库构建目的基因的蛋白互作网络,分析目的基因的表达与UCEC的病理特征、生存预后、TME之间的相关性。对目的基因进行GSEA富集分析,分析与目的基因表达相关的生物学通路。结果:ESTIMATE Score高、低组间共有1068个DEGs,GO/KEGG富集分析结果显示DEGs主要富集在细胞免疫反应、细胞因子及受体结合等相关生物学通路上。对DEGs进行WGCNA聚类分析得到与UCEC的病理特征、生存预后显著相关的由77个DEGs组成的基因模块。模块基因中的CLDN9在UCEC与正常内膜组织中存在显著表达差异,且随着UCEC的病理特征的恶化,CLDN9的表达呈上升趋势,同时CLDN9的表达与患者的生存呈负相关。String数据库预测了10个可能与CLDN9存在交互作用的蛋白分子。GSEA富集分析结果显示,CLDN9的表达与CD8^(+)T细胞免疫、KRAS基因调节的信号通路、异生代谢、脂肪酸代谢等通路密切相关。在UCEC的TME中,CLDN9的表达与CD8^(+)T细胞等免疫细胞的浸润水平存在着负相关。结论:本研究分析鉴定了与UCEC病理特征、生存预后、TME相关的DEGs,并从中进一步分析鉴定出了与UCEC的病理分期、免疫浸润、患者生存率密切相关的CLDN9,为UCEC的诊断治疗提供了新思路。 展开更多
关键词 cldn9基因 子宫内膜癌 肿瘤微环境 生物信息学
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基于生物信息学方法探讨CLDN9 mRNA在胃癌中的表达及临床意义
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作者 王帝 樊桦 孙万日 《齐齐哈尔医学院学报》 2024年第12期1178-1182,共5页
目的通过多个生物学数据库分析CLDN9 mRNA在胃癌中的表达及临床意义。方法TCGA数据库下载胃癌的转录组学数据,分析胃癌组织及胃黏膜组织中CLDN9 mRNA表达水平差异;K-M曲线分析胃癌组织中CLDN9 mRNA表达水平与生存率的关系;筛选胃癌中与C... 目的通过多个生物学数据库分析CLDN9 mRNA在胃癌中的表达及临床意义。方法TCGA数据库下载胃癌的转录组学数据,分析胃癌组织及胃黏膜组织中CLDN9 mRNA表达水平差异;K-M曲线分析胃癌组织中CLDN9 mRNA表达水平与生存率的关系;筛选胃癌中与CLDN9的共表达基因并进行GO和KEGG富集分析,分析胃癌中CLDN9与免疫细胞浸润程度的相关性。纳入109例早期胃癌患者(早期胃癌组)、51例进展期胃癌患者(进展期胃癌组)和45名健康体检者(对照组)作为研究对象,分析三组血清中CLDN9表达水平的差异。血清中CLDN9在鉴别胃癌中的临床效能采用ROC曲线分析。结果胃癌组织中CLDN9 mRNA表达水平为0.43(0.15,1.20),正常胃黏膜组织中CLDN9 mRNA表达水平为0.07(0.05,0.13),与正常胃黏膜组织相比,胃癌组织中CLDN9 mRNA表达水平显著升高,差异具有统计学意义(P<0.001)。胃癌组织中CLDN9 mRNA高表达组与CLDN9 mRNA低表达组相比生存率显著降低(HR=1.61,P<0.001)。胃癌组织中与CLDN9具有显著正相关的基因共325个,显著负相关的基因共201个。所有共表达基因富集的条目包括泛素依赖蛋白分解代谢过程、IL-6信号通路、炎症应答、泛素连接酶复合物、内质网、胞质、蛋白结合、内吞、内质网中的蛋白质加工、补体和凝血级联等。相关性分析结果显示,胃癌中CLDN9与Th2细胞(r=-0.109,P<0.05)、Treg细胞(r=-0.111,P<0.05)、嗜酸性粒细胞(r=-0.128,P<0.05)、中性粒细胞(r=-0.131,P<0.05)、CD8+T细胞(r=-0.399,P<0.001)、DC细胞(r=-0.266,P<0.001)等多个免疫细胞具有显著负相关性。对照组、早期胃癌组、进展期胃癌组三组血清中CLDN9表达水平依次为(34.23±3.91)μg/ml、(76.03±12.26)μg/ml和(104.55±15.01)μg/ml,三组间相比具有显著差异(F=45.336,P<0.001);与对照组相比,CLDN9表达水平在早期胃癌组和进展期胃癌组中明显升高(P<0.05);与早期胃癌组相比,CLDN9表达水平在进展期胃癌组中明显升高(P<0.05)。血清CLDN9在鉴别对照组和早期胃癌组临床效能显著,AUC为0.945,CLDN9截断值为79.56μg/ml,诊断敏感度和特异度为95.34%和93.23%;血清CLDN9在鉴别早期胃癌组和进展期胃癌临床效能显著,AUC为0.853,CLDN9截断值为94.24μg/ml,诊断敏感度和特异度为87.82%和90.15%。结论CLDN9在胃癌中表达显著升高,可作为胃癌患者不良预后的一项生物学标志物。 展开更多
关键词 胃癌 cldn9 预后 标志物
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Claudin-9(CLDN9)promotes gastric cancer progression by enhancing the glycolysis pathway and facilitating PD-L1 lactylation to suppress CD8^(+) T cell anti-tumor immunity
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作者 Xingbin Hu Wenhao Ouyang +3 位作者 Haizhu Chen Zhihong Liu Zijia Lai Herui Yao 《Cancer Pathogenesis and Therapy》 2025年第3期253-266,共14页
Background:Gastric cancer(GC)is a common malignancy characterized by the absence of reliable prognostic indicators and effective therapeutic targets.Claudin-9(CLDN9)has been demonstrated to be upregulated in various c... Background:Gastric cancer(GC)is a common malignancy characterized by the absence of reliable prognostic indicators and effective therapeutic targets.Claudin-9(CLDN9)has been demonstrated to be upregulated in various cancers.However,its prognostic value,biological function,and regulatory mechanisms in GC remain unclear.Therefore,this study aimed to elucidate the role of CLDN9 in GC progression and its underlying mechanisms.Methods:We utilized consensus cluster,random survival forest,and multivariate Cox regression analyses to identify CLDN9 in GC.Subsequently,we evaluated the mRNA and protein levels of CLDN9 in GC using quantitative real-time polymerase chain reaction(PCR)(qRT-PCR),Western blotting(WB),and immunohistochemistry(IHC).Furthermore,the role of CLDN9 in GC progression was investigated using a series of functional in vivo and in vitro experiments.Finally,we elucidated the molecular mechanisms of CLDN9 using bioinformatics,molecular biology,animal models,and patient tissue specimens.Results:Two GC subtypes with survival and functional differences were identified based on glycolytic metabolic genes in the Cancer Genome Atlas(TCGA)-Stomach adenocarcinoma(STAD)dataset.A prognostic risk score was calculated using seven genes to assess the overall survival(OS)in GC.Using random survival forest and multivariate Cox analyses,we identified CLDN9 as the key gene linked to the glycolytic subtype and prognosis of GC.CLDN9 expression was significantly upregulated in patients with GC as well as in GC cells.CLDN9 knockdown inhibited tumor proliferation,invasion,and metastasis both in vivo and in vitro.Mechanistically,CLDN9 was found to regulate lactate dehydrogenase A(LDHA)expression and promote glycolytic metabolism by activating the phosphatidylinositol 3-kinase(PI3K)/protein kinase B(AKT)/hypoxia-inducible factor 1-alpha(HIF1α)signaling pathway.Additionally,lactate,a glycolytic metabolite,enhanced programmed cell death ligand 1(PD-L1)lactylation and stability,which suppressed anti-tumor immunity in CD8t T cells,thereby contributing to GC progression.Conclusions:CLDN9 expression is associated with GC development and progression.Mechanistically,CLDN9 enhances the glycolysis pathway and facilitates PD-L1 lactylation through the PI3K/AKT/HIF1αsignaling pathway,thereby suppressing anti-tumor immunity in CD8t T cells.CLDN9 has the potential to serve as a novel prognostic marker and therapeutic target for GC. 展开更多
关键词 Gastric cancer Lactylation GLYCOLYSIS Immune evasion cldn9 PD-L1
原文传递
紧密连接蛋白9在结直肠癌中的表达水平及患者总生存期的影响因素分析
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作者 肖剑 刘天云 +1 位作者 李胜 龙世友 《中国社区医师》 2025年第31期73-75,共3页
目的:分析紧密连接蛋白9(CLDN9)在结直肠癌中的表达水平及患者总生存期(OS)的影响因素。方法:将2018年7月—2019年7月于邵阳市中心医院行结直肠癌根治术的120例结直肠癌患者的肿瘤组织标本120份纳入结直肠癌组,选取其对应的癌旁组织标... 目的:分析紧密连接蛋白9(CLDN9)在结直肠癌中的表达水平及患者总生存期(OS)的影响因素。方法:将2018年7月—2019年7月于邵阳市中心医院行结直肠癌根治术的120例结直肠癌患者的肿瘤组织标本120份纳入结直肠癌组,选取其对应的癌旁组织标本50份纳入对照组,所有组织进行免疫组织化学试验,比较两组CLDN9表达水平;对患者随访5年,记录其OS。采用K-M生存曲线分析CLDN9表达对患者OS的影响,采用Cox比例风险回归模型分析结直肠癌患者OS的影响因素。结果:结直肠癌组CLDN9高表达率高于对照组(P=0.003)。CLDN9高表达患者OS较低表达患者长(P=0.002)。CLDN9高表达、临床分期Ⅲ~Ⅳ期是结直肠癌患者OS的独立危险因素(P<0.05)。结论:CLDN9在结直肠癌中呈高表达状态,结直肠癌患者的OS与CLDN9表达水平、临床分期有关,CLDN9有望作为结直肠癌治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 紧密连接蛋白9 结直肠癌 总生存期 临床分期
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