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乳腺癌高表达基因CKAP2L的生物信息学分析 被引量:1
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作者 许亚娜 许倩 刘镭 《承德医学院学报》 2013年第4期341-342,共2页
乳腺癌是严重威胁妇女健康的恶性肿瘤,筛查肿瘤生物标记物对早期诊断具有重要意义。本研究通过肿瘤基因组解剖计划(CGAP)SAGE数据库,筛选新的乳腺癌高表达基因,并对其中一条功能未知的新基因CKAP2L进行了初步的生物学分析,为进一... 乳腺癌是严重威胁妇女健康的恶性肿瘤,筛查肿瘤生物标记物对早期诊断具有重要意义。本研究通过肿瘤基因组解剖计划(CGAP)SAGE数据库,筛选新的乳腺癌高表达基因,并对其中一条功能未知的新基因CKAP2L进行了初步的生物学分析,为进一步深入研究该基因的生物学功能及其参与乳腺癌发生、发展的分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 乳腺癌 生物信息学 SAGE库 ckap2l
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细胞骨架相关蛋白2L在泛癌中的表达及与预后和免疫细胞浸润相关性的研究
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作者 齐立明 张亮 +1 位作者 高海丽 刘婷 《癌症》 2024年第12期595-605,共11页
背景与目的 细胞骨架相关蛋白2L(cytoskeleton associated protein 2 like protein,CKAP2L)是一种对神经干细胞或祖细胞很重要的有丝分裂纺锤体蛋白,参与多种恶性肿瘤的生物学行为。本研究探讨CKAP2L基因在不同肿瘤中的表达情况,及与患... 背景与目的 细胞骨架相关蛋白2L(cytoskeleton associated protein 2 like protein,CKAP2L)是一种对神经干细胞或祖细胞很重要的有丝分裂纺锤体蛋白,参与多种恶性肿瘤的生物学行为。本研究探讨CKAP2L基因在不同肿瘤中的表达情况,及与患者预后和免疫细胞浸润的相关性。方法 通过TIMER、TCGA及GTEx数据库分析CKAP2L在33种肿瘤及正常组织的差异表达情况。利用Kaplan-Meier生存分析研究在不同肿瘤中CKAP2L表达水平与患者预后的相关性。利用Wilcoxon秩和检验分析不同肿瘤中CKAP2L表达与临床病理分期的相关性。采用Spearman相关性分析研究CKAP2L表达与肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)、微卫星不稳定性(microsatelliteinstability,MSI)、免疫细胞浸润及免疫检查点之间的相关性。结果 TIMER数据库显示,CKAP2L在20种肿瘤中高表达。在肾上腺皮质癌、肾乳头状透明细胞癌、脑低级别胶质瘤、肝细胞肝癌、肺腺癌、间皮瘤、胰腺癌、黑色素瘤和子宫内膜癌中,CP2L高表达的患者预后较差;而在胸腺癌中,CP2L高表达的患者预后较好。在肾上腺皮质癌、肾透明细胞癌、肾乳头状透明细胞癌、肝细胞肝癌和肺腺癌中,CP2L表达与不同病理分期相关。在肺鳞状细胞癌、结肠癌、胃腺癌和肉瘤中,CP2L表达TMB和MSI呈正相关。CP2L表达与一些肿瘤中的免疫细胞浸润和免疫检查点也密切相关。结论 CP2L可能成为预测肿瘤预后的潜在生物标志物,为临床诊疗及精准化治疗提供参考。 展开更多
关键词 ckap2l 泛癌分析 生物信息学 预后 免疫浸润
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