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钙依赖蛋白激酶(CDPKs)在植物钙信号转导中的作用 被引量:39
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作者 刘贯山 陈珈 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2003年第2期160-167,共8页
CDPKs在植物钙信号转导中起重要作用。本文介绍了植物钙信号转导及CDPKs的结构与生化性质 ,在此基础上 ,重点总结了CDPKs在植物钙信号转导中的潜在调节作用 ,包括基因表达、代谢、离子和水分的跨膜运输、细胞骨架的动态变化、气孔运动... CDPKs在植物钙信号转导中起重要作用。本文介绍了植物钙信号转导及CDPKs的结构与生化性质 ,在此基础上 ,重点总结了CDPKs在植物钙信号转导中的潜在调节作用 ,包括基因表达、代谢、离子和水分的跨膜运输、细胞骨架的动态变化、气孔运动和生长发育等 。 展开更多
关键词 钙依赖蛋白激酶 cdpks 植物钙信号转导 结构 生化性质 钙调素
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钙依赖型蛋白激酶(CDPKs)在植物中的生理功能 被引量:12
2
作者 倪天华 魏幼璋 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2002年第6期241-246,共6页
 简要介绍了钙依赖型蛋白激酶(Calcium-dependentProteinKinases,CDPKs)的结构特点及家族成员,重点对CDPKs在植物环境胁迫、防御反应、生长发育、离子通道调节和激素信号等方面的生理功能研究进展进行了综述和讨论,并展望了该领域的研...  简要介绍了钙依赖型蛋白激酶(Calcium-dependentProteinKinases,CDPKs)的结构特点及家族成员,重点对CDPKs在植物环境胁迫、防御反应、生长发育、离子通道调节和激素信号等方面的生理功能研究进展进行了综述和讨论,并展望了该领域的研究前景。 展开更多
关键词 钙依赖型蛋白激酶 生理功能 植物 cdpks 激素信号
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小麦成熟胚脱分化过程CDPKs基因的差异表达分析 被引量:1
3
作者 雷志华 崔琰 +2 位作者 赵一丹 陈军营 陈新建 《植物生理学通讯》 CSCD 北大核心 2009年第2期125-128,共4页
用Affymetrix小麦基因芯片检测小麦成熟胚脱分化过程中CDPKs基因的表达变化的结果表明,在检测到的16个CDPKs基因中,有15个基因在小麦成熟胚脱分化过程中发生了有意义变化,其中上调表达基因有12个,上调2~7.5倍,下调表达基因有2个,下调3... 用Affymetrix小麦基因芯片检测小麦成熟胚脱分化过程中CDPKs基因的表达变化的结果表明,在检测到的16个CDPKs基因中,有15个基因在小麦成熟胚脱分化过程中发生了有意义变化,其中上调表达基因有12个,上调2~7.5倍,下调表达基因有2个,下调3~6.1倍,在不同时点既有上调又有下调的1个。根据已知CDPKs生物功能和它们表达变化趋势以及这些变化趋势与脱分化过程中的吻合程度分析结果,推测CPK2A、CPK2B、CPK6和Os12g0169800基因参与了小麦成熟胚脱分化过程的启动和愈伤组织的形成。 展开更多
关键词 蛋白激酶 cdpks 基因芯片 脱分化
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钙依赖蛋白激酶(CDPKs)在植物钙信号转导中的生理功能 被引量:3
4
作者 雷志华 陈军营 陈新建 《福建林业科技》 北大核心 2007年第3期244-249,254,共7页
介绍了钙依赖蛋白激酶(CDPKs)的结构特点以及酶活性调节,从激素信号、生长发育、细胞骨架、胁迫信号、防御反应、碳氮代谢以及离子通道调节几个方面阐述了CDPKs在植物钙信号转导中的生理功能,并对该领域的研究前景作了展望。
关键词 蛋白激酶 cdpks 信号转导 植物钙
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小麦幼胚脱分化过程中CDPKs基因的差异表达分析
5
作者 雷志华 崔琰 +2 位作者 赵一丹 陈新建 陈军营 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期579-582,共4页
为了解研究蛋白激酶(CDPKs)在小麦幼胚脱分化过程中的作用,利用Affymetrix小麦基因芯片检测了小麦幼胚脱分化过程中CDPKs基因的表达变化。结果表明,在检测到的16个CDPKs基因中,有13个基因在小麦幼胚脱分化过程中发生了有意义的变化,... 为了解研究蛋白激酶(CDPKs)在小麦幼胚脱分化过程中的作用,利用Affymetrix小麦基因芯片检测了小麦幼胚脱分化过程中CDPKs基因的表达变化。结果表明,在检测到的16个CDPKs基因中,有13个基因在小麦幼胚脱分化过程中发生了有意义的变化,其中上调表达基因有5个,上调2-6.5倍,下调表达基因有8个,下调2-16倍。根据已知CDPKs生物功能和它们表达变化趋势以及这些变化趋势与脱分化过程中的吻合程度分析结果,推测CPK6、BJ286005、CK211705、BJ274015和BJ246895参与了小麦幼胚脱分化过程的启动和愈伤组织的形成。 展开更多
关键词 小麦 蛋白激酶(cdpks) 幼胚脱分化 基因表达
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钙依赖蛋白激酶(CDPKs)介导植物信号转导的分子基础 被引量:9
6
作者 王娇娇 韩胜芳 +3 位作者 李小娟 谷俊涛 路文静 肖凯 《草业学报》 CSCD 北大核心 2009年第3期241-250,共10页
钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是生长发育信号和逆境信号诱发的钙信号的重要信号传递体,在调控植物信号转导途径中下游基因的表达、生化代谢、离子和水分跨膜运输等生物学过程中具有重要作用。本研究对植物种属CDPK的结构特点、CDPK在植株体内... 钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是生长发育信号和逆境信号诱发的钙信号的重要信号传递体,在调控植物信号转导途径中下游基因的表达、生化代谢、离子和水分跨膜运输等生物学过程中具有重要作用。本研究对植物种属CDPK的结构特点、CDPK在植株体内的分布特征、CDPK生理生化特性及生化反应调控特性、CDPK在信号转导中的作用,以及CDPK在植株体内的生物学功能进行了概述。旨在为今后牧草作物CDPK的鉴定及其介导的信号转导机制的研究提供参考依据。 展开更多
关键词 钙依赖蛋白激酶(cdpks) 结构 钙信号 信号转导 生物学功能
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植物CDPKs响应逆境胁迫信号传导作用研究进展
7
作者 韦淑亚 《化工设计通讯》 CAS 2017年第1期142-142,147,共2页
钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是由多基因族编码,在植物响应逆境胁迫信号转导通路中处于关键位置。从CDPKs结构特征、CDPKs在非生物胁迫信号转导中的作用、CDPKs在生物胁迫信号转导中的作用和CDPKs介导的信号传导途径中的交互作用这几个方面综... 钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是由多基因族编码,在植物响应逆境胁迫信号转导通路中处于关键位置。从CDPKs结构特征、CDPKs在非生物胁迫信号转导中的作用、CDPKs在生物胁迫信号转导中的作用和CDPKs介导的信号传导途径中的交互作用这几个方面综合阐述了植物CDPKs响应逆境胁迫信号传导作用研究进展,旨在探讨CDPKs的功能及调控防御机制。 展开更多
关键词 cdpks 非生物胁迫 生物胁迫 逆境 研究进展
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马铃薯CDPKs家族基因的全基因组鉴定和分析 被引量:2
8
作者 龚记熠 何小红 +1 位作者 乙引 李菲 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期4343-4350,共8页
钙离子是真核生物信号转导中重要的第二信使。在植物中,细胞内Ca2+的水平受到多种因素的影响,包括激素水平、光信号、物理损伤、非生物胁迫和病原菌侵染。在植物中,CDPKs代表具有蛋白激酶和钙调蛋白两种结构域的一类新型的Ca2+传感器。C... 钙离子是真核生物信号转导中重要的第二信使。在植物中,细胞内Ca2+的水平受到多种因素的影响,包括激素水平、光信号、物理损伤、非生物胁迫和病原菌侵染。在植物中,CDPKs代表具有蛋白激酶和钙调蛋白两种结构域的一类新型的Ca2+传感器。CDPKs可以直接与钙离子结合,它们的激酶活性不依赖于钙调素蛋白。对马铃薯CDPKs家族进行全基因组分析,发现马铃薯基因组中共有21个CDPKs基因,这些基因都有CDPKs关键的结构域。马铃薯CDPKs基因不均等地分布在各个染色体上,其中一号和十号染色体最多。而且一号和十号染色体上的基因亲缘关系非常近,可能来源于基因扩增。我们的研究有助于积累马铃薯的基因资源,推动马铃薯育种进程。 展开更多
关键词 马铃薯 cdpks家族 全基因组鉴定
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CDPKs在植物适应非生物胁迫过程中的调节作用 被引量:9
9
作者 刘亚茹 吕丽莎 +2 位作者 程瑾 司婧娜 赵瑞 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1387-1394,共8页
CDPKs(calcium-dependent protein kinases,CDPKs)在植物适应非生物胁迫过程中发挥了重要作用,CDPK家族成员众多,在植物种间分布广泛,并且定位于不同的细胞器中。CDPKs是植物细胞钙信号转导的重要感受器,通过作用于多种多样的互作底物,... CDPKs(calcium-dependent protein kinases,CDPKs)在植物适应非生物胁迫过程中发挥了重要作用,CDPK家族成员众多,在植物种间分布广泛,并且定位于不同的细胞器中。CDPKs是植物细胞钙信号转导的重要感受器,通过作用于多种多样的互作底物,参与植物对干旱胁迫、盐胁迫和低温胁迫的适应。在分子水平上,CDPKs通过磷酸化调节不同的底物蛋白的活性,进而实现基因表达调控、离子平衡调控和活性氧平衡调控,从而发挥各自的生物学功能。本文综述了CDPKs在植物逆境信号网络中的功能,并对将来的研究方向进行论述。 展开更多
关键词 钙依赖型蛋白激酶(CDPK) 非生物胁迫 信号转导
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美洲商陆PaCDPK基因家族鉴定及重金属胁迫应答分析
10
作者 谢坤宏 张大为 +4 位作者 刘营 贺丹 邹子湘 严明理 周定港 《分子植物育种》 北大核心 2025年第1期71-79,共9页
钙依赖性蛋白激酶(CDPKs)是植物细胞内Ca2+信号识别及转导的重要媒介,在生长发育和逆境应答时起重要作用。本研究基于美洲商陆(Phytolacca americana L.)的转录组数据,通过生物信息学对美洲商陆PaCDPK基因家族进行鉴定和分析,分析了该... 钙依赖性蛋白激酶(CDPKs)是植物细胞内Ca2+信号识别及转导的重要媒介,在生长发育和逆境应答时起重要作用。本研究基于美洲商陆(Phytolacca americana L.)的转录组数据,通过生物信息学对美洲商陆PaCDPK基因家族进行鉴定和分析,分析了该家族基因成员及理化特性、系统进化关系、保守基序和保守功能结构域等,同时分析了其在重金属锰(Mn)和镉(Cd)胁迫下的表达模式。共鉴定到16个CDPK基因,依次命名为PaCDPK1~PaCDPK16,二级结构主要构成元件为α-螺旋和无规卷曲;系统发育分析将16个家族成员分为4个亚家族,且同一亚家族具有相似的保守基序;各成员均具有1个核心蛋白激酶结构域和2个EF-hand结构域;在重金属胁迫下的转录数据分析显示,不同家族成员对不同重金属的响应有不同的表达模式:PaCDPK2、PaCDPK4和PaCDPK5的表达量在两种胁迫下下调,而其他成员的表达量至少在一种胁迫下显著上调。该研究系统鉴定了Mn、Cd超累积植物美洲商陆的PaCDPK基因家族,为进一步了解美洲商陆CDPK基因提供了科学依据,也为深入解析美洲商陆的生长发育、逆境应答尤其是重金属胁迫响应时的功能提供参考。 展开更多
关键词 商陆属(Phytolacca) 全长转录组 钙依赖性蛋白激酶(cdpks) 生物信息学分析 逆境胁迫
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盐藻CDPK基因的克隆与生物信息学分析 被引量:15
11
作者 张晓琳 柴晓杰 +2 位作者 张婷 余祝君 薛飞 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期418-424,共7页
为了研究CDPK基因的结构和功能,应用RT-PCR和RACE方法从盐藻Dunaliella salina中克隆得到CDPK基因(GenBank登录号为JQ964113),并对其进行生物信息学分析。结果表明:盐藻CDPK基因的cDNA全长3 052bp。5'-UTR长70bp;开放阅读框长1650bp... 为了研究CDPK基因的结构和功能,应用RT-PCR和RACE方法从盐藻Dunaliella salina中克隆得到CDPK基因(GenBank登录号为JQ964113),并对其进行生物信息学分析。结果表明:盐藻CDPK基因的cDNA全长3 052bp。5'-UTR长70bp;开放阅读框长1650bp,编码549个氨基酸;3'-UTR长1332bp。蛋白表现为弱酸性,且稳定、亲水,二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构同源建模成功。亚细胞定位于叶绿体和细胞核中,无跨膜结构域,无信号肽。蛋白序列中存在4个丝氨酸磷酸化位点、4个苏氨酸磷酸化位点和3个酪氨酸磷酸化位点,蛋白激酶结构域在53~331位氨基酸处,蛋白激酶ATP结合域在59~82位氨基酸处,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性域在173~185位氨基酸处,4个EF-hand钙结合域分别在357~385、393~421、429~457、465~493位氨基酸处。进化分析结果表明,克隆的CDPK基因与团藻、衣藻、盐藻Dunaliella tertiolecta的CDPK亲缘关系最近。为进一步研究CDPK基因的功能及探究盐藻耐盐机制的信号转导途径奠定了分子基础。 展开更多
关键词 盐藻 钙依赖蛋白激酶(cdpks) CDNA全长 生物信息学分析
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植物中的钙依赖蛋白激酶(CDPK)的结构特征和功能研究进展 被引量:12
12
作者 姜珊珊 张丹 +2 位作者 孔祥培 周严 李德全 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期12-19,共8页
Ca2+是植物中重要的第二信使,细胞中的钙信号经钙传感蛋白(CaMs、CaMLs、CBLs和CDPKs)传递到下游组分(转录因子,NADPH氧化酶基因等),引起相关基因的表达,使植物对生物或非生物胁迫作出响应。钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是在植物及原生动物中... Ca2+是植物中重要的第二信使,细胞中的钙信号经钙传感蛋白(CaMs、CaMLs、CBLs和CDPKs)传递到下游组分(转录因子,NADPH氧化酶基因等),引起相关基因的表达,使植物对生物或非生物胁迫作出响应。钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是在植物及原生动物中发现的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,在Ca2+介导的信号途径中起重要作用。CDPKs是由多基因家族编码,分属4个亚家族,各亚族成员具有相同或不同的表达模式、亚细胞定位、底物特异性、功能各异或冗余等特性。综述CDPKs的结构特征、表达模式、定位、调控、体内外底物、抑制剂,以及在响应生物及非生物胁迫中的作用等方面的研究进展,旨在探讨CDPKs的功能及其调控机制。 展开更多
关键词 钙依赖蛋白激酶(cdpks) 结构特征 调控机制 生物学功能
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苜蓿钙依赖蛋白激酶家族的生物信息学分析 被引量:2
13
作者 龚记熠 张宇斌 +3 位作者 李菲 何小红 张习敏 乙引 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期3454-3462,共9页
钙元素在植物体内具有重要的生物学作用,调控细胞壁形成、花粉管发育、生物和非生物胁迫信号传导等。钙依赖蛋白激酶(calcium dependent protein kinases,CDPKs)基因可以感知细胞内Ca2+浓度的变化并将它们转化为特异性磷酸化事件,启动... 钙元素在植物体内具有重要的生物学作用,调控细胞壁形成、花粉管发育、生物和非生物胁迫信号传导等。钙依赖蛋白激酶(calcium dependent protein kinases,CDPKs)基因可以感知细胞内Ca2+浓度的变化并将它们转化为特异性磷酸化事件,启动下游信号传导过程。我们利用生物信息学数据和分析技术,鉴定出蒺藜苜蓿和天蓝苜蓿两个苜蓿品种中的CDPKs基因家族成员,并进行基因结构、进化和表达分析,初步预测了相关基因的功能。蒺藜苜蓿基因组中存在25个CDPKs基因,这些基因分成4个进化类群。蒺藜苜蓿CDPKs基因进化关系与拟南芥对应基因较近,与水稻较远。蒺藜苜蓿1号染色体上聚集的3个CDPKs基因Medtr1g041150、Medtr1g054865、Medtr1g055255序列高度相似,可能是1个基因扩增而来。利用已有的蒺藜苜蓿基因芯片表达数据,我们分析了蒺藜苜蓿CDPKs基因在不同器官以及不同处理下的表达情况,发现了多个与蒺藜苜蓿耐盐、抗根腐病菌侵染和根瘤生长过程相关的基因。 展开更多
关键词 蒺藜苜蓿 cdpks基因家族 进化 表达模式
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二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶BdCDPK4基因的克隆及其编码蛋白质的生物信息学分析 被引量:2
14
作者 韦淑亚 赵旭东 +2 位作者 王会平 杨广笑 何光源 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期345-352,共8页
二穗短柄草(Brachypodium distachyon L.)因与小麦、大麦等有很高的同源性,作为新型禾本科模式生物吸引了越来越多的研究者。试验采用基因克隆技术分离了二穗短柄草Bd CDPK4基因的编码区序列,并采用生物信息学方法分析了该基因及其编码... 二穗短柄草(Brachypodium distachyon L.)因与小麦、大麦等有很高的同源性,作为新型禾本科模式生物吸引了越来越多的研究者。试验采用基因克隆技术分离了二穗短柄草Bd CDPK4基因的编码区序列,并采用生物信息学方法分析了该基因及其编码的蛋白质的序列特征、结构和功能。结果表明,分离了BdCDPK4基因1 851 bp的cDNA序列(Gen Bank登录号为XM_003559516),编码区长度为1 752 bp,编码583个氨基酸,分子量为64.78 ku,等电点为9.12,含有N端可变区、蛋白激酶区、自抑制区、EF手型结构、类似钙调素等结构域。亚细胞定位预测位于叶绿体和液泡上。进化树分析结果显示,该蛋白与小麦Ta CDPK19蛋白的同源性最近。根据各物种间CDPKs蛋白的高同源性,结合小麦TaCDPK19基因被高盐和小麦白粉病菌Blumeria graministritici(Bgt)诱导,推测Bd CDPK4基因也可能参与逆境胁迫下的信号传导途径,在抗逆等生物学过程中发挥重要功能。 展开更多
关键词 cdpks BdCDPK4 多序列比对 生物信息学分析
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Involvement of Calcium dependent Protein Kinases in ABA regulation of Stomatal Movement 被引量:9
15
作者 王喜庆 武维华 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1999年第5期556-559,共4页
Patch clamp techniques were employed to investigate if calcium dependent protein kinases (CDPKs) be involved in the signal transduction pathways of stomatal movement regulation by the phytohormone abscisic acid (ABA... Patch clamp techniques were employed to investigate if calcium dependent protein kinases (CDPKs) be involved in the signal transduction pathways of stomatal movement regulation by the phytohormone abscisic acid (ABA) in Vicia faba. Stomatal opening was completely inhibited by external application of 1 μmol/L ABA, and such ABA inhibition was significantly reversed by the addition of CDPK inhibitor trifluoperazine (TFP). The inward whole cell K + currents were inhibited by 60% in the presence of 1 μmol/L intracellular ABA, and this inhibition was completely abolished by the addition of CDPK competitive substrate histone Ⅲ S. The results suggest that CDPKs may be involved in the signal transduction cascades of ABA regulated stomatal movements. 展开更多
关键词 Calcium dependent protein kinases (cdpks) K + channels Abscisic acid Stomatal guard cells
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植物CDPK信号转导途径及其互作组分的功能研究进展 被引量:4
16
作者 周子馨 兰海燕 《新疆大学学报(自然科学版)(中英文)》 CAS 2021年第6期705-714,共10页
钙依赖性蛋白激酶(calcium-dependent protein kinase,CDPK或CPK)是植物中最大的钙调蛋白激酶家族,其在植物体内可迅速感受瞬时Ca2+信号的变化,识别并磷酸化特异性底物后,通过信号的级联转导,引发各种生理反应,从而调控植物的生长发育... 钙依赖性蛋白激酶(calcium-dependent protein kinase,CDPK或CPK)是植物中最大的钙调蛋白激酶家族,其在植物体内可迅速感受瞬时Ca2+信号的变化,识别并磷酸化特异性底物后,通过信号的级联转导,引发各种生理反应,从而调控植物的生长发育及对多种胁迫的响应.许多植物中均具有CDPKs,根据其氨基酸序列可分为四个家族(Ⅰ-Ⅳ).CDPKs分布广泛且具有不同的亚细胞定位,这使它们能“感知”局部Ca^(2+)浓度变化并与其靶标进行特异性相互作用,从而发挥不同的生物学功能.本文主要介绍了植物CDPK信号转导途径及CDPKs的生物学特性,在此基础上重点讨论了CDPKs的互作组分及其生物学功能. 展开更多
关键词 cdpks 磷酸化 cdpks的互作组分 信号转导途径
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普通烟草CDPK基因家族的克隆及表达分析 被引量:19
17
作者 太帅帅 刘贯山 +1 位作者 孙玉合 陈珈 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期3600-3608,共9页
【目的】从普通烟草中分离更多CDPK基因,分析该基因家族的序列特征、进化关系和表达谱,为全面揭示其功能奠定基础。【方法】采用RT-PCR、RACE和生物信息学的方法,分离普通烟草CDPK基因;采用MEGA4.0软件构建系统进化树;利用RT-PCR研究普... 【目的】从普通烟草中分离更多CDPK基因,分析该基因家族的序列特征、进化关系和表达谱,为全面揭示其功能奠定基础。【方法】采用RT-PCR、RACE和生物信息学的方法,分离普通烟草CDPK基因;采用MEGA4.0软件构建系统进化树;利用RT-PCR研究普通烟草全长基因的表达谱。【结果】分离到普通烟草CDPK基因8个,其中3个可以找到完整的开放读码框;系统进化树分析显示,烟草属11个全长CDPK基因位于4个亚家族,预测的2对普通烟草和拟南芥的直系同源基因在功能上可能非常保守;3个普通烟草全长基因虽然在所有的组织中都能检测到,但是它们的表达谱在不同的组织间存在明显差异。【结论】分离到8个未报道的普通烟草CDPK基因,结合已有的报道,目前在普通烟草中获得了15个CDPK基因,为在基因组范围内研究普通烟草CDPK基因家族的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 普通烟草 CDPK 进化树 基因表达
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梨CDPK基因家族全基因组序列鉴定分析 被引量:11
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作者 许园园 李晓刚 +2 位作者 李慧 蔺经 常有宏 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第3期659-666,共8页
CDPK是植物特有的一类丝氨酸/苏氨酸型蛋白激酶,在介导植物生育信号和逆境信号转导中具有重要作用。为揭示CDPK基因在梨生长发育与抗逆防御机制中的作用,本研究通过生物信息学手段,结合梨基因组注释信息,鉴定梨基因组中CDPK家族基... CDPK是植物特有的一类丝氨酸/苏氨酸型蛋白激酶,在介导植物生育信号和逆境信号转导中具有重要作用。为揭示CDPK基因在梨生长发育与抗逆防御机制中的作用,本研究通过生物信息学手段,结合梨基因组注释信息,鉴定梨基因组中CDPK家族基因成员,利用MEGA6.0程序进行多序列比对、分类并构建系统进化树;利用per1程序以及GSDS工具进行基因结构与保守性分析,为植物CDPK基因功能分析与利用提供依据。结果表明,本研究成功鉴定出26个CDPK家族成员,根据系统发育树分析,所有PbCDPK被分为4类;基因结构预测结果表明,大多数PbCDPK均含有6~7个内含子;且预测的PbCDPK氨基酸序列绝大多数含4个EF-hand功能域;为了深入分析梨与其他物种的同源进化关系,构建了梨与拟南芥、水稻的CDPK基因系统进化树,进化树聚类分析结果将所有的CDPK蛋白分为四类。综上所述,目前已初步获得26个梨CDPK基因,为在基因组范围内研究CDPK基因在梨生长发育与逆境响应中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 CDPK家族基因 全基因组鉴定 系统进化
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铁皮石斛DoCDPK基因的克隆与表达分析 被引量:11
19
作者 盛况 高燕会 +1 位作者 斯金平 朱玉球 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期2412-2422,共11页
利用RACE技术和RT-PCR相结合,从铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)中克隆得到长度分别为1 863和1 729 bp的钙依赖蛋白激酶(calcium-dependent protein kinase)基因DoCDPK1与DoCDPK2的cDNA全长序列,开放阅读框分别为1 539... 利用RACE技术和RT-PCR相结合,从铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)中克隆得到长度分别为1 863和1 729 bp的钙依赖蛋白激酶(calcium-dependent protein kinase)基因DoCDPK1与DoCDPK2的cDNA全长序列,开放阅读框分别为1 539和1 536 bp,编码512和511个氨基酸,编码蛋白表现为亲水性,结构稳定,二级结构主要由α–螺旋和无规卷曲构成。qRT-PCR分析结果表明DoCDPK1和DoCDPK2主要在铁皮石斛叶片中表达;4℃低温和400 mmol·L^(-1) NaCl处理后,DoCDPK1和DoCDPK2在各个时间点上(2、4、8、12和24 h)的表达量有不同程度提高,而100 mmol·L^(-1) ABA处理后DoCDPK1和DoCDPK2的表达量呈现不同变化趋势,推测DoCDPK1和DoCDPK2参与低温等非生物胁迫的响应。 展开更多
关键词 铁皮石斛 CDPK基因 基因克隆 逆境胁迫 基因表达
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黄瓜钙依赖性蛋白激酶基因CsCDPK5的克隆及响应淹水胁迫的表达分析 被引量:6
20
作者 许学文 季晶 +2 位作者 陆璐 齐晓花 陈学好 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期704-714,共11页
通过对黄瓜耐涝品系Zaoer-N和不耐涝品系Pepino淹水处理72 h后发现,Zaoer-N下胚轴平均可生成24.6条不定根,而Pepino平均仅能生成1.5条不定根,两者差异显著。从上述两个品种中克隆了钙依赖性蛋白激酶基因CsCDPK5的全长,两者序列完全一致... 通过对黄瓜耐涝品系Zaoer-N和不耐涝品系Pepino淹水处理72 h后发现,Zaoer-N下胚轴平均可生成24.6条不定根,而Pepino平均仅能生成1.5条不定根,两者差异显著。从上述两个品种中克隆了钙依赖性蛋白激酶基因CsCDPK5的全长,两者序列完全一致,全长均为1 887 bp,编码629个氨基酸,预测其编码蛋白质分子量为59.17 k D,理论等电点为5.65。亚细胞定位预测表明CsCDPK5定位于细胞质。Zaoer-N和Pepino启动子相似度为99%,有14个碱基位点的差异,两者均含有与激素信号及低氧胁迫响应相关的顺式作用元件,而诱导子激活元件AT-rich sequence和功能未知元件F-box为Zaoer-N所特有的启动元件。qRT-PCR结果表明:(1)CsCDPK5在黄瓜下胚轴中的表达量最高;(2)淹水条件下,Zaoer-N和Pepino下胚轴中CsCDPK5的相对表达量均呈现先上升后下略有降,之后又上升的趋势,且Zaoer-N中的表达量大于Pepino;(3)根和叶中CsCDPK5的相对表达量无明显规律性;(4)在使用乙烯竞争性抑制剂1-MCP预处理后,淹水条件下Zaoer-N下胚轴不定根形成被抑制,CsCDPK5的表达与非淹水对照亦无明显差异。综上所述,黄瓜CsCDPK5为淹水胁迫响应基因,可能参与黄瓜淹水后下胚轴不定根的形成过程。 展开更多
关键词 黄瓜 淹水胁迫 不定根 CDPK
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