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骨肉瘤与尤文肉瘤关键基因CDC5L及其生物学功能的生物信息学分析 被引量:3
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作者 冯娜 宋文霞 +2 位作者 邵立平 高宇航 赵承武 《中国骨伤》 CAS CSCD 2022年第3期276-280,共5页
目的:利用生物信息学方法筛选骨肉瘤(osteosarcoma,OS)和尤文肉瘤(Ewing's sarcoma,EWS)关键基因及通路预测。方法:检索GEO数据库OS(GSE16088)及EWS(GSE45544)数据集,利用GEO2R分析差异基因,韦恩图筛选共同参与两者发生的关键基因,... 目的:利用生物信息学方法筛选骨肉瘤(osteosarcoma,OS)和尤文肉瘤(Ewing's sarcoma,EWS)关键基因及通路预测。方法:检索GEO数据库OS(GSE16088)及EWS(GSE45544)数据集,利用GEO2R分析差异基因,韦恩图筛选共同参与两者发生的关键基因,对该基因进行GO、KEGG通路分析及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,并利用UCSC进行该基因的转录因子预测,GEPIA分析转录因子与目的基因之间相关性。结果:通过对OS及EWS数据集差异性及维恩图分析,结果显示细胞分裂周期5样蛋白(cell division cycke 5-like,CDC5L)基因为参与OS及EWS发病的关键基因。该基因主要参与有丝分裂过程,与RNA代谢、Pre-mRNA内含子的处理、mRNA及Pre-mRNA的剪接等信号通路。结论:CDC5L作为关键基因,在OS及EWS进展中发挥促癌基因的作用,可能是两种原发恶性肿瘤可靠的诊疗靶点。 展开更多
关键词 骨肉瘤 尤文肉瘤 生物信息学分析 cdc5l
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CDC5L表达对神经母细胞瘤临床及预后评估的意义 被引量:6
2
作者 蔡元霞 武志祥 +1 位作者 王奕 吴晔明 《临床小儿外科杂志》 CAS 2019年第6期472-479,共8页
目的探讨CDC5L在神经母细胞瘤(neuroblastoma,NB)中的表达及对患儿临床和预后的影响。方法免疫组化(immunohistochemistry,IHC)及蛋白免疫印迹(Western blot,WB)检测CDC5L在神经母细胞瘤患儿肿瘤组织中的表达,根据患儿性别、年龄、是否... 目的探讨CDC5L在神经母细胞瘤(neuroblastoma,NB)中的表达及对患儿临床和预后的影响。方法免疫组化(immunohistochemistry,IHC)及蛋白免疫印迹(Western blot,WB)检测CDC5L在神经母细胞瘤患儿肿瘤组织中的表达,根据患儿性别、年龄、是否有骨髓浸润、肿瘤临床分期(INSS)、危险度分级、肿瘤病理诊断、Shimada病理分类及NSE、LDH是否正常进行分组,比较各组中CDC5L的表达差异,采用Kaplan-Meier和Cox回归分析CDC5L高表达组和低表达组对神经母细胞瘤生存的影响。结果IHC显示,62例神经母细胞瘤肿瘤标本中,CDC5L高表达及低表达各31例(50%),CDC5L主要在细胞核内表达;IHC及WB均显示CDC5L在神经母细胞瘤中的表达高于节细胞神经母细胞瘤(ganglioneuroblastoma,GNB), NB和GNB均起源于原始神经嵴细胞,可于肾上腺或沿脊柱旁交感神经节分布;不同之处在于NB较GNB分化差,恶性程度更高。进一步分析CDC5L在NB患儿临床和病理特征之间的表达差异发现肿瘤骨髓浸润组较无肿瘤浸润组CDC5L高表达的比例更高,差异有统计学意义(χ^2 =5.833, P =0.016);CDC5L在肿瘤临床分期Ⅲ~Ⅳ中的高表达比例高于Ⅰ~Ⅱ和Ⅳ-S期,差异有统计学意义(χ^2 =11.328, P =0.001);CDC5L高表达的比例在MYCN扩增组高于MYCN非扩增组( P =0.038);危险度分级中,高危患儿中CDC5L表达增高的比例较中危和低危患儿高(χ^ 2 =9.378, P =0.002 );Shimada病理分类中,不良组织学类型较良好组织学类型CDC5L表达增高的比例更高(χ^ 2 =7.839, P =0.005);NSE升高组较NSE正常组CDC5L表达增高的比例更高( P =0.035);LDH≥587 U/L较LDH<587 U/L有更高比例的CDC5L表达增高,差异有统计学意义(χ^ 2 =5.547, P = 0.019 )。Kaplan-Meier生存分析提示CDC5L高表达组3年存活率(48.8% vs. 88.0%)低于CDC5L低表达组,差异有统计学意义( P =0.002)。单因素Cox回归分析发现CDC5L高表达( HR =4.734,95% CI :1.590~ 14.091 )、临床分期为Ⅲ和Ⅳ期( HR =7.444,95% CI :2.187~25.339)、高危状态( HR = 2.749 ,95% CI :1.454~5.194)、Shimada 病理UFH型( HR =4.098,95% CI :1.493~11.250)均是NB患儿预后的危险因素。但是进一步多因素Cox回归分析发现上述因素均没有统计学差异( P > 0.05)结论CDC5L的表达和已知的患儿预后危险因素、不良病理类型及肿瘤标志物升高有较好的一致性,且生存分析也提示CDC5L高表达组较低表达组差,因此CDC5L可作为潜在的提示神经母细胞瘤患儿具有不良预后、不良病理类型和肿瘤标志物升高的分子标志物。 展开更多
关键词 神经母细胞瘤 cdc5l 病理学 免疫学技术 预后 儿童
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CDC5L蛋白在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义 被引量:2
3
作者 贾文仙 蒋敏 +4 位作者 刘佳艺 檀燕君 韦怡 李萍 杨小丽 《广西医科大学学报》 CAS 2020年第6期1084-1088,共5页
目的:研究CDC5L蛋白在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达变化,分析其与临床病理的关系。方法:通过GEO公共数据库中的基因芯片数据分析CDC5L在口腔鳞癌和正常组织中的mRNA表达差异。采用免疫组织化学SP法检测CDC5L在口腔鳞癌组织及其癌旁黏... 目的:研究CDC5L蛋白在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达变化,分析其与临床病理的关系。方法:通过GEO公共数据库中的基因芯片数据分析CDC5L在口腔鳞癌和正常组织中的mRNA表达差异。采用免疫组织化学SP法检测CDC5L在口腔鳞癌组织及其癌旁黏膜组织中的蛋白表达情况,并分析其与患者临床病理特征之间的关系。结果:口腔鳞癌中CDC5L mRNA和蛋白表达水平显著高于癌旁口腔黏膜组织(P<0.05),并且其在OSCC中的蛋白表达量与肿瘤分期显著相关,T1~T2期的癌组织中的表达量显著高于T3~T4期(P<0.05),与其他参数(年龄、性别、民族、血型、肿瘤大小、原发灶部位、肿瘤细胞分化程度、淋巴结转移、吸烟、饮酒)均无显著相关性(P>0.05)。结论:CDC5L在OSCC中高表达,且蛋白表达量与肿瘤分期显著相关,提示CDC5L可能参与了OSCC的发生过程,与OSCC的关系值得进一步研究。 展开更多
关键词 cdc5l 口腔鳞状细胞癌 免疫组织化学 GEO
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结直肠癌组织中CDC5L、DDX21及端粒酶的表达与临床意义 被引量:2
4
作者 刘云 高登鹏 +1 位作者 徐亚飞 许慧颖 《西部医学》 2023年第3期348-353,共6页
目的探讨结直肠癌(CRC)中细胞分裂周期因子5(CDC5L)、DExD/H-box解旋酶(DDX21)及端粒酶(hTERT)的表达及临床意义。方法应用R语言分析人类癌症基因组数据库中CRC癌和癌旁组织中CDC5L、DDX21及hTERT的表达。应用免疫组化检测CRC癌和癌旁... 目的探讨结直肠癌(CRC)中细胞分裂周期因子5(CDC5L)、DExD/H-box解旋酶(DDX21)及端粒酶(hTERT)的表达及临床意义。方法应用R语言分析人类癌症基因组数据库中CRC癌和癌旁组织中CDC5L、DDX21及hTERT的表达。应用免疫组化检测CRC癌和癌旁组织中CDC5L、DDX21及hTERT的蛋白表达。Pearson线性相关分析CRC癌组织中CDC5L、DDX21及hTERT表达的相关性。统计学分析癌组织中CDC5L、DDX21及hTERT表达与临床病理特征之间的关系。Kaplan-Meier生存分析(Log-rank检验)不同CDC5L、DDX21及hTERT表达患者生存预后的差异。结果相较于癌旁组织,CRC癌组织中CDC5L、DDX21及hTERT mRNA的表达明显升高,差异具有统计学意义(P<0.001)。CRC癌组织中CDC5L、DDX21、hTERT表达阳性率明显高于癌旁组织(均P<0.05)。CDC5L与DDX21表达呈显著正相关(r_(s)=0.576,P<0.001);DDX21与hTERT表达呈显著正相关(r_(s)=0.521,P<0.001)。CDC5L与hTERT表达呈显著正相关(r_(s)=0.628,P<0.001)。不同肿瘤分期及淋巴结转移的CRC癌组织中CDC5L、DDX21及hTERT蛋白表达差异具有统计学意义(均P<0.05)。Kaplan-Meier生存曲线(Log-rank检验)分析结果,CDC5L阳性表达组、DDX21阳性表达组、hTERT阳性表达组患者3年总体生存率为分别明显低于CDC5L阴性表达组、DDX21阴性表达组、hTERT阴性表达组(均P<0.05)。结论CRC癌组织中CDC5L、DDX21及hTERT表达上调,CDC5L、DDX21及hTERT的表达与肿瘤分期及淋巴结转移有关,是新的评估CRC预后的肿瘤标志物。 展开更多
关键词 结直肠癌 细胞分裂周期因子5 DExD/H-box解旋酶 端粒酶 临床意义
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Meta分析:十九号复合物组成因子PRP19、SPF27、CDC5L和PLRG1在肝细胞癌中的表达及其与患者预后的关系 被引量:2
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作者 贾亦真 吕敏敏 +1 位作者 张霁 安晓萌 《肿瘤药学》 CAS 2020年第1期107-111,124,共6页
目的探讨十九号复合物组成因子PRP19、SPF27、CDC5L和PLRG1的mRNA在肝细胞癌中的表达情况及其与患者生存率的关系。方法在NCBI的GEO数据库和TCGA数据库中分别检索肝细胞癌表达谱的数据集,采用Stata进行统计分析,Kaplan-Meier法绘制TCGA... 目的探讨十九号复合物组成因子PRP19、SPF27、CDC5L和PLRG1的mRNA在肝细胞癌中的表达情况及其与患者生存率的关系。方法在NCBI的GEO数据库和TCGA数据库中分别检索肝细胞癌表达谱的数据集,采用Stata进行统计分析,Kaplan-Meier法绘制TCGA数据库中肝细胞癌患者的生存曲线。结果共纳入1033例肿瘤组织和679例正常组织,合并效应显示,肝细胞癌患者肿瘤组织中PRP19(SMD=0.67,95%CI:0.56~0.77,P<0.0001)、SPF27(SMD=0.37,95%CI:0.26~0.47,P<0.0001)、CDC5L(SMD=0.59,95%CI:0.49~0.70,P<0.0001)、PLRG1(SMD=0.30,95%CI:0.16~0.43,P<0.0001)的表达水平均显著高于正常组织。PRP19、SPF27和PLRG1高表达患者的生存率显著低于低表达者(P<0.05)。结论十九号复合物组成因子可以作为预测肝细胞癌患者预后的潜在标志物。 展开更多
关键词 肝细胞癌 十九号复合物 PRP19 SPF27 cdc5l PLRG1 META分析
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PTBP1结合CDC5L对胃癌细胞增殖活动的影响 被引量:4
6
作者 郭应伟 刘通 《解剖学研究》 CAS 2022年第5期429-436,共8页
目的为探索胃癌细胞增殖的分子机制,研究多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)和细胞分裂周期5样(裂殖酵母)(CDC5L)基因结合促进胃癌细胞增殖凋亡的影响。方法GEPIA2数据库预测PTBP1和CDC5L在胃癌细胞中的表达;RT⁃qPCR和Western blot检测PTBP1和C... 目的为探索胃癌细胞增殖的分子机制,研究多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)和细胞分裂周期5样(裂殖酵母)(CDC5L)基因结合促进胃癌细胞增殖凋亡的影响。方法GEPIA2数据库预测PTBP1和CDC5L在胃癌细胞中的表达;RT⁃qPCR和Western blot检测PTBP1和CDC5L的表达水平;GEPIA2数据库预测CDC5L和PTBP1之间的相关性,并通过免疫蛋白沉淀实验检测验证。通过转染,干扰PTBP1和CDC5L的表达。随后,克隆实验检测细胞增殖;流式细胞术检测细胞周期;TUNEL荧光染色检测细胞凋亡;Western blot检测凋亡蛋白Bax、Bcl⁃2和caspase3的表达。结果GEPIA2数据库预测所示PTBP1和CDC5L在胃癌中表达差异有统计学意义(P<0.05),且高表达。与癌旁组织中蛋白表达相比,PTBP1和CDC5L在胃癌组织中表达提高(P<0.01);比正常细胞中蛋白表达相比,PTBP1和CDC5L在胃癌细胞中表达均上调(P<0.01);GEPIA2数据库显示PTBP1与CDC5L具有正向线性相关性;免疫沉淀实验结果表明PTBP1和CDC5L可相互结合。细胞克隆实验表明PTBP1和(或)CDC5L被抑制后,胃癌细胞增殖水平下降(P<0.05);且敲低PTBP1和/或CDC5L后胃癌细胞周期G0/G1期受阻滞(P<0.001)。细胞凋亡水平检测显示,与对照组相比,干扰PTBP1和/或CDC5L后,胃癌细胞凋亡增多(P<0.01);相关凋亡蛋白差异具有统计学变化(Bcl⁃2,P<0.05;Bac,P<0.01;cleaved⁃caspase3/caspase3,P<0.05)。结论PTBP1和CDC5L具有结合关系,敲低PTBP1和CDC5L的表达具有抑制胃癌细胞增殖,促进细胞凋亡作用。 展开更多
关键词 胃癌细胞 多聚嘧啶区结合蛋白1 细胞分裂周期5样(裂殖酵母)基因 增殖 凋亡
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IGF2BP1 promotes multiple myeloma with chromosome 1q gain via increasing CDC5L expression in an m6A-dependent manner 被引量:1
7
作者 Jiadai Xu Yawen Wang +2 位作者 Liang Ren Panpan Li Peng Liu 《Genes & Diseases》 2025年第1期298-311,共14页
Multiple myeloma(MM)patients with chromosome 1q gain(1q+)are clinically and biologically heterogeneous.The underlying molecular mechanisms are still under investigation,while the identification of targets for effectiv... Multiple myeloma(MM)patients with chromosome 1q gain(1q+)are clinically and biologically heterogeneous.The underlying molecular mechanisms are still under investigation,while the identification of targets for effective therapy of this subgroup of MM patients is urgently needed.We aimed to investigate the clinical significance and the regulatory mechanisms of insulin-like growth factor 2 messenger RNA(mRNA)binding protein 1(IGF2BP1),a N6-methyladenosine(m6A)reader,in MM patients with 1q+.We found that MM patients with 1q+exhibit a significantly higher level of IGF2BP1 mRNA than controls,while higher IGF2BP1 expression predicted a worse prognosis in MM patients with 1q+.IGF2BP1 overexpression promoted cell proliferation and G1-to-S phase transition of the cell cycle in NCI-H929 cells.Through comprehensive in silico analyses of existing public datasets and in-house generated high-throughput sequencing datasets,along with in vitro experiments,we identified CDC5L as a target of IGFBP1,which can bind to the m6A sites of CDC5L mRNA to up-regulate its protein abundance.Higher CDC5L expression also predicted a worse prognosis of MM patients with 1q+.Moreover,both knockdown and mutation of CDC5L attenuated the pro-proliferative effect of IGF2BP1.Furthermore,IGF2BP1 inhibitor BTYNB effectively inhibited CDC5L expression in MM cells with 1q+and suppressed the proliferation of these cells in vitro and in vivo.Therefore,IGF2BP1 acts as a post-transcriptional enhancer of CDC5L in an m6A-dependent manner to promote the proliferation of MM cells with 1q+.Our work identified a novel IGF2BP1-CDC5L axis and provided new insight into developing targeted therapeutics for MM patients with 1q+. 展开更多
关键词 cdc5l Chromosome 1q gain IGF2BP1 Multiple myeloma N6-methyladenosine
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加权基因共表达网络分析筛胃癌相关分子 被引量:1
8
作者 肖又德 郑永法 戈伟 《中国医药导报》 CAS 2021年第17期8-12,24,F0003,共7页
目的运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选出与胃癌发生、预后相关的分子,为胃癌的治疗和预后判断提供参考依据。方法从TCGA数据库中下载胃癌患者基因表达谱和临床数据,检索时间为建库至2020年11月14日。采用WGCNA方法对胃癌患者进行... 目的运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选出与胃癌发生、预后相关的分子,为胃癌的治疗和预后判断提供参考依据。方法从TCGA数据库中下载胃癌患者基因表达谱和临床数据,检索时间为建库至2020年11月14日。采用WGCNA方法对胃癌患者进行基因表达分析;筛选出核心靶基因并分析其功能,利用ONCOMINE和GEO数据库进行验证。结果共纳入359例胃癌患者。BLUE模块与胃癌发生、预后相关,CDC5L为核心靶基因,CDC5L与胃癌发生、预后相关。ONCOMINE数据库验证结果显示,癌组织中CDC5L表达量高于癌旁组织(P<0.01);GEO数据库验证结果显示,低表达CDC5L患者预后更好。结论CDC5L基因与胃癌发生和患者生存相关,可为胃癌发生、转移和治疗的研究提供参考依据。 展开更多
关键词 胃癌 癌症基因组图谱数据库 cdc5l 加权基因共表达网络分析
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