目的采用生物信息学方法探讨CD39基因在肺腺癌组织中的表达情况,并分析CD39与肺腺癌免疫微环境及免疫治疗响应的关系。方法通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库分析CD39在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达差异。采用基因集富集分析(...目的采用生物信息学方法探讨CD39基因在肺腺癌组织中的表达情况,并分析CD39与肺腺癌免疫微环境及免疫治疗响应的关系。方法通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库分析CD39在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达差异。采用基因集富集分析(GSEA)研究CD39可能富集的免疫相关通路;通过肿瘤免疫数据库(TIMER)分析肺腺癌患者中CD39基因表达情况与肿瘤微环境免疫细胞浸润的关系;同时分析CD39和其他免疫检查点基因PD-1、PD-L1、CTLA-4、IDO1的相关性,采用药物敏感性基因组学数据库(GDSC)和肿瘤免疫功能障碍和排斥(TIDE)数据库,预测CD39基因表达与化疗药物敏感性以及免疫治疗的响应。结果CD39在肺腺癌组织中的表达低于在正常组织中的表达,CD39富集了免疫相关通路如炎症反应、干扰素α反应、干扰素γ反应。TIMER数据库均显示在肺腺癌组织中,CD39的表达与B细胞、CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞以及树突状细胞呈正相关性。同时CD39与其他的免疫检查点PD-1、PD-L1、CTLA-4、IDO1均呈一定的正相关性,化疗敏感性显示在肺腺癌组织中,对于博来霉素、顺铂、多西他赛、长春花碱等化疗药物,高表达CD39组对其敏感。但对于免疫治疗,其响应率却低于CD39低表达组。结论CD39在肺腺癌组织中低表达,能激活免疫相关通路,对免疫治疗响应率高,可作为肺腺癌新型分子标志物。展开更多
目的通过分析1型艾滋病病毒(HIV-1)感染者不同疾病阶段CD39^+PD-1^+CD4^+T淋巴细胞(简称CD39^+PD-1^+CD4细胞)的特点及其与潜伏病毒库形成的关系,探讨CD39^+PD-1^+CD4细胞的临床意义。方法通过流式细胞术检测CD4细胞上CD39及PD-1的表达...目的通过分析1型艾滋病病毒(HIV-1)感染者不同疾病阶段CD39^+PD-1^+CD4^+T淋巴细胞(简称CD39^+PD-1^+CD4细胞)的特点及其与潜伏病毒库形成的关系,探讨CD39^+PD-1^+CD4细胞的临床意义。方法通过流式细胞术检测CD4细胞上CD39及PD-1的表达情况,分析CD39^+PD-1^+CD4细胞与CD4细胞计数、病毒载量及CD4细胞内病毒指标的相关性。通过实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测免疫重建成功患者(CRs)和免疫重建失败患者(INRs)的HIV库,分析CD39^+PD-1^+CD4细胞与HIV库的关系。结果入组11例健康对照(HCs)和69例HIV-1感染者,其中包括38例未抗病毒治疗(ART)者(TNs)、21例CRs、10例INRs。(1)与HCs相比,TNs组患者CD39^+PD-1^+CD4细胞亚群占比显著升高(平均值0.99%vs.2.50%);与TNs组相比,ART后,CRs组患者的CD39^+PD-1^+CD4细胞亚群占比显著降低(平均值2.50%vs.0.86%);而INRs组患者该细胞亚群占比显著高于CRs组(平均值2.74%vs.0.86%);(2)在TNs组患者中CD39^+PD-1^+CD4细胞亚群占比与CD4细胞计数呈负相关(r=-0.3596,P=0.0266),与病毒载量呈正相关(r=0.4511,P=0.0045);(3)ART两年以上患者CD39^+PD-1^+CD4细胞亚群占比与HIV脱氧核糖核酸(HIV DNA)正相关(r=0.5659,P=0.0473),与细胞相关的未剪接HIV核糖核酸(HIV us RNA)正相关(r=0.6758,P=0.0137)。结论CD39^+PD-1^+CD4细胞与ART后免疫重建失败相关,其机制可能是CD39^+PD-1^+CD4细胞促进HIV建立潜伏病毒库。展开更多
文摘目的采用生物信息学方法探讨CD39基因在肺腺癌组织中的表达情况,并分析CD39与肺腺癌免疫微环境及免疫治疗响应的关系。方法通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库分析CD39在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达差异。采用基因集富集分析(GSEA)研究CD39可能富集的免疫相关通路;通过肿瘤免疫数据库(TIMER)分析肺腺癌患者中CD39基因表达情况与肿瘤微环境免疫细胞浸润的关系;同时分析CD39和其他免疫检查点基因PD-1、PD-L1、CTLA-4、IDO1的相关性,采用药物敏感性基因组学数据库(GDSC)和肿瘤免疫功能障碍和排斥(TIDE)数据库,预测CD39基因表达与化疗药物敏感性以及免疫治疗的响应。结果CD39在肺腺癌组织中的表达低于在正常组织中的表达,CD39富集了免疫相关通路如炎症反应、干扰素α反应、干扰素γ反应。TIMER数据库均显示在肺腺癌组织中,CD39的表达与B细胞、CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞以及树突状细胞呈正相关性。同时CD39与其他的免疫检查点PD-1、PD-L1、CTLA-4、IDO1均呈一定的正相关性,化疗敏感性显示在肺腺癌组织中,对于博来霉素、顺铂、多西他赛、长春花碱等化疗药物,高表达CD39组对其敏感。但对于免疫治疗,其响应率却低于CD39低表达组。结论CD39在肺腺癌组织中低表达,能激活免疫相关通路,对免疫治疗响应率高,可作为肺腺癌新型分子标志物。
文摘目的通过分析1型艾滋病病毒(HIV-1)感染者不同疾病阶段CD39^+PD-1^+CD4^+T淋巴细胞(简称CD39^+PD-1^+CD4细胞)的特点及其与潜伏病毒库形成的关系,探讨CD39^+PD-1^+CD4细胞的临床意义。方法通过流式细胞术检测CD4细胞上CD39及PD-1的表达情况,分析CD39^+PD-1^+CD4细胞与CD4细胞计数、病毒载量及CD4细胞内病毒指标的相关性。通过实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测免疫重建成功患者(CRs)和免疫重建失败患者(INRs)的HIV库,分析CD39^+PD-1^+CD4细胞与HIV库的关系。结果入组11例健康对照(HCs)和69例HIV-1感染者,其中包括38例未抗病毒治疗(ART)者(TNs)、21例CRs、10例INRs。(1)与HCs相比,TNs组患者CD39^+PD-1^+CD4细胞亚群占比显著升高(平均值0.99%vs.2.50%);与TNs组相比,ART后,CRs组患者的CD39^+PD-1^+CD4细胞亚群占比显著降低(平均值2.50%vs.0.86%);而INRs组患者该细胞亚群占比显著高于CRs组(平均值2.74%vs.0.86%);(2)在TNs组患者中CD39^+PD-1^+CD4细胞亚群占比与CD4细胞计数呈负相关(r=-0.3596,P=0.0266),与病毒载量呈正相关(r=0.4511,P=0.0045);(3)ART两年以上患者CD39^+PD-1^+CD4细胞亚群占比与HIV脱氧核糖核酸(HIV DNA)正相关(r=0.5659,P=0.0473),与细胞相关的未剪接HIV核糖核酸(HIV us RNA)正相关(r=0.6758,P=0.0137)。结论CD39^+PD-1^+CD4细胞与ART后免疫重建失败相关,其机制可能是CD39^+PD-1^+CD4细胞促进HIV建立潜伏病毒库。
