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UCHL1 promotes the proliferation of porcine granulosa cells by stabilizing CCNB1
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作者 Shengjie Shi Huan Yuan +6 位作者 Lutong Zhang Lei Gao Lili Zhao Xiangfang Zeng Shiyan Qiao Guiyan Chu Chuanjiang Cai 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2024年第5期1894-1907,共14页
Background The proliferation of porcine ovarian granulosa cells(GCs)is essential to follicular development and the ubiquitin–proteasome system is necessary for maintaining cell cycle homeostasis.Previous studies foun... Background The proliferation of porcine ovarian granulosa cells(GCs)is essential to follicular development and the ubiquitin–proteasome system is necessary for maintaining cell cycle homeostasis.Previous studies found that the deubiquitinase ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1(UCHL1)regulates female reproduction,especially in ovarian development.However,the mechanism by which UCHL1 regulates porcine GC proliferation remains unclear.Results UCHL1 overexpression promoted GC proliferation,and knockdown had the opposite effect.UCHL1 is directly bound to cyclin B1(CCNB1),prolonging the half-life of CCNB1 and inhibiting its degradation,thereby promoting GC proliferation.What's more,a flavonoid compound-isovitexin improved the enzyme activity of UCHL1 and promoted the proliferation of porcine GCs.Conclusions UCHL1 promoted the proliferation of porcine GCs by stabilizing CCNB1,and isovitexin enhanced the enzyme activity of UCHL1.These findings reveal the role of UCHL1 and the potential of isovitexin in regulating proliferation and provide insights into identifying molecular markers and nutrients that affect follicle development. 展开更多
关键词 ccnb1 Granulosa cells Isovitexin PROLIFERATION UCHL1
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CCNB1、KIF23作为骨肉瘤的核心生物标志物的探索研究
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作者 刘磊 刘夏丞 高永昌 《临床医学进展》 2024年第5期162-177,共16页
目的:骨肉瘤是一种高度侵袭性的原发性骨肿瘤,危害性不容小觑,然而目前骨肉瘤的发病机制和分子生物学特征还未确定。方法:我们利用生物信息技术,在GEO数据库中下载骨肉瘤及正常组织样本的基因表达矩阵,利用R软件包进行差异分析,获取差... 目的:骨肉瘤是一种高度侵袭性的原发性骨肿瘤,危害性不容小觑,然而目前骨肉瘤的发病机制和分子生物学特征还未确定。方法:我们利用生物信息技术,在GEO数据库中下载骨肉瘤及正常组织样本的基因表达矩阵,利用R软件包进行差异分析,获取差异基因列表,并进行GOKEGG和GSEA富集分析,构建PPI网络获取核心差异基因,并制作核心基因的表达热图。使用CIBERSORT软件包进行免疫浸润分析,获得了全基因表达矩阵的免疫细胞的比例结果和免疫细胞组分间的共表达模式图,用于研究在免疫系统治疗干预下,对于骨肉瘤的疾病进程的影响。还获取了在CTD网站中,我们找到了与核心基因的最相关的疾病。TargetScan用于筛选调节中枢DEG的miRNA。结果:共获得了1342个差异基因,富集结果显示差异表达基因主要富集在细胞激活、分泌颗粒、脂质结合、细胞周期、P53信号通路。构建了PPI网络,获得了核心基因KIF23、CCNB1,绘制了核心基因在基因表达矩阵中的表达差异情况,结果显示KIF23、CCNB1在骨肉瘤和正常组织中具有显著差异。并在CTD网站中查找到了KIF23、CCNB1和骨肉瘤、肿瘤、炎症等疾病有关。结论:CCNB1和KIF23的高表达可能导致细胞周期的异常,促进骨肉瘤细胞的异常增殖和侵袭,在骨肉瘤的发生发展过程中发挥重要的作用,CCNB1和KIF23的表达越高,则骨肉瘤的预后越差。 展开更多
关键词 骨肉瘤 生物信息学 ccnb1 KIF23
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环状RNAcirc-ccnb1通过抑制细胞周期蛋白核转位对食管鳞癌增殖和迁移的影响 被引量:1
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作者 杨瑜 刘耀河 +6 位作者 秦宁 谭柳 宋锐 侯歌 袁金金 张艳 刘宗文 《西部医学》 2021年第8期1101-1105,共5页
目的探讨环状RNA circ-ccnb1对细胞周期蛋白(cyclinb1、ccnb1)的作用,以及对食管鳞癌增殖和迁移的影响。方法①收集60例食管鳞癌组织及癌旁正常组织标本,按癌组织及正常组织分为两组,通过免疫组化检测两组组织中ccnb1的表达,并分析食管... 目的探讨环状RNA circ-ccnb1对细胞周期蛋白(cyclinb1、ccnb1)的作用,以及对食管鳞癌增殖和迁移的影响。方法①收集60例食管鳞癌组织及癌旁正常组织标本,按癌组织及正常组织分为两组,通过免疫组化检测两组组织中ccnb1的表达,并分析食管鳞癌中ccnb1表达与临床病理因素(淋巴结转移、病理分期)之间的相关性。②培养食管鳞癌细胞,并分为两组:正常食管上皮细胞(Het1-A)和食管鳞癌细胞109(EC109)。采用蛋白免疫印迹法(WB)检测两组中ccnb1蛋白的表达。③用携带circ-ccnb1的质粒转染EC109,检测其中ccnb1的核转位情况,将细胞分为3组:未转染组(Blank组)、转染空载体组(Vector组)及转染circ-ccnb1组(cir-ccnb1组)。转染成功后进行核桨分离,采用WB检测转移至胞核内的ccnb1蛋白量的变化,细胞增殖实验(CCK-8法)及划痕实验检测细胞增殖率、迁移率。结果食管鳞癌组织中ccnb1蛋白的表达高于正常组织,EC109细胞中ccnb1蛋白的表达高于Het1-A细胞(均P<0.05)。与Blank组相比,cir-ccnb1组细胞中ccnb1蛋白的核转位水平明显降低,细胞增值率、迁移率降低(均P<0.05)。结论cir-ccnb1可以通过抑制ccnb1在食管鳞癌细胞中的核转位进而影响食管鳞癌的发展,即抑制癌细胞增殖和迁移。 展开更多
关键词 circ-ccnb1 ccnb1 食管鳞癌 增殖 迁移
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CCNB1在卵巢癌中的表达及意义 被引量:11
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作者 李莉 熊国平 +1 位作者 颜琳 张庆华 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2016年第11期818-820,824,共4页
目的:探讨CCNB1在卵巢癌诊断和预后判断的作用。方法:通过Oncomine数据库分析并提取组织RNA,Real-time PCR法检测CCNB1在卵巢癌组织中的表达。通过在线数据库及分析工具"the Kaplan Meier plotter"(KM plotter)数据库的应用发... 目的:探讨CCNB1在卵巢癌诊断和预后判断的作用。方法:通过Oncomine数据库分析并提取组织RNA,Real-time PCR法检测CCNB1在卵巢癌组织中的表达。通过在线数据库及分析工具"the Kaplan Meier plotter"(KM plotter)数据库的应用发掘CCNB1的预后价值。结果:Oncomine数据库中共有18个研究结果涉及正常卵巢组织和卵巢癌组织中的CCNB1的表达情况,全部显示CCNB1在卵巢癌中表达增高。本研究对9对配对的卵巢癌及其癌旁组织进行Real-time PCR,得到相同结果。在KM plotter数据库中的分析显示:无论是无进展生存期(PFS)或总生存期(OS),CCNB1 mRNA水平越高,卵巢癌患者的预后越差(HR>1,P<0.05)。且CCNB1 mRNA高水平在早于2期(包括2期)卵巢癌患者中提示预后较差,在晚于3期(包括3期)患者中CCNB1 mRNA水平与预后无明显相关性。结论:CCNB1在卵巢癌组织中表达升高,可作为提示预后差的卵巢癌的分子标记物。 展开更多
关键词 卵巢癌 预后 ccnb1 KM plotter
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川陈皮素调节CDK1/CCNB1/PLK1信号通路对肝癌细胞恶性生物学行为的影响
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作者 乔显森 袁青 +1 位作者 陈颖溢 顾晓静 《河北医药》 CAS 2024年第23期3540-3545,共6页
目的 探究川陈皮素(NOB)调节细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)/细胞周期蛋白B1(CCNB1)/Polo样激酶1(PLK1)信号通路对肝癌细胞恶性生物学行为的影响。方法 用浓度为10.0~160.0μmol/L的川陈皮素处理人肝癌细胞(Huh-7),CCK-8法检测细胞活性... 目的 探究川陈皮素(NOB)调节细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)/细胞周期蛋白B1(CCNB1)/Polo样激酶1(PLK1)信号通路对肝癌细胞恶性生物学行为的影响。方法 用浓度为10.0~160.0μmol/L的川陈皮素处理人肝癌细胞(Huh-7),CCK-8法检测细胞活性,筛选最佳川陈皮素浓度;将Huh-7细胞分为对照组(Control组),NOB低(L组)、中(M组)、高(H组)浓度组、CDK1/CCNB1抑制剂组(CE组);用平板克隆法、流式细胞仪、划痕实验、Transwell实验分别检测细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭;免疫印迹法(Western blot)检测细胞增殖相关蛋白(Ki67、Cyclin D1)、凋亡相关蛋白(Bax、Caspase-3)、迁移侵袭相关蛋白(MMP-2、MMP-9)、CDK1、CCNB1、PLK1蛋白表达;用裸鼠移植瘤方法检测NOB对肝癌移植瘤生长的影响。结果 选择20μmol/L、40μmol/L、80μmol/L的NOB浓度用于后续实验。与Control组比较,L、M、H、CE组集落形成数、细胞划痕愈合率、细胞侵袭数量及Ki67、Cyclin D1、MMP-2、MMP-9、CDK1、CCNB1、PLK1表达水平降低,细胞凋亡率、Caspase-3、Bax表达水平明显上升(P<0.05)。裸鼠成瘤实验发现,NOB组移植瘤生长更为缓慢,移植瘤的质量和体积明显下降,且CDK1、CCNB1、PLK1表达下调(P<0.05)。结论 NOB抑制CDK1/CCNB1/PLK1信号通路抑制肝癌细胞的恶性生物学行为。 展开更多
关键词 肝癌 川陈皮素 细胞周期蛋白依赖性激酶1/细胞周期蛋白B1/Polo样激酶1信号通路 恶性生物学行为
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基于数据库探讨细胞周期蛋白B1(CCNB1)表达对胃癌预后的影响 被引量:3
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作者 杨生辉 黄琰菁 +7 位作者 邱纯 李向璐 李赛 孙达统 盛莉 陈邓林 邢雪花 王琳 《中国数字医学》 2020年第1期37-40,共4页
目的:细胞周期蛋白B1(CCNB1)是控制细胞周期G2/M转换阶段所必需的。在多种癌症中均检测到CCNB1的高表达。研究旨在探讨CCNB1在胃癌中的表达及预后意义。方法:通过检索Oncomine数据库分析胃癌及正常或癌旁组织的CCNB1表达水平,并通过胃... 目的:细胞周期蛋白B1(CCNB1)是控制细胞周期G2/M转换阶段所必需的。在多种癌症中均检测到CCNB1的高表达。研究旨在探讨CCNB1在胃癌中的表达及预后意义。方法:通过检索Oncomine数据库分析胃癌及正常或癌旁组织的CCNB1表达水平,并通过胃癌患者的Kaplan-MeierPlotter数据库研究其预后价值。结果:Oncomine数据库检索到445项不同研究记录,在胃癌中高表达的有2项,低表达的有0项。10项研究涉及CCNB1在胃癌组织和正常组织中的转录水平的表达,共包含478个样本,与正常胃组织相比,胃癌组织中CCNB1的表达水平更高(P=0.013)。此外,生存分析结果表明,CCNB1的表达水平与胃癌总体生存率存在明显的相关性,即高表达的患者总体生存率较好,低表达患者预后较差(P=8.6×10-7).结论:CCNB1在胃癌中的高表达与胃癌患者预后相关,为更准确预测预后和早期临床治疗提供一条新途径。 展开更多
关键词 胃癌 预后 ccnb1 Oncomine Kaplan-Meier
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CCNB1基因通过调控PI3K/Akt信号通路对口腔鳞癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响 被引量:6
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作者 王璞 韦丽宾 倪广晓 《实用肿瘤学杂志》 CAS 2020年第2期144-149,共6页
目的探讨细胞周期蛋白B1(CCNB1)基因对口腔鳞癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响及作用机制。方法实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测人正常口腔上皮细胞系HOK和人口腔鳞癌细胞系SCC-15、SCC-4、Cal-27中CCNB1基因的表达量,将CCNB1 siRNA(si-CCNB1... 目的探讨细胞周期蛋白B1(CCNB1)基因对口腔鳞癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响及作用机制。方法实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测人正常口腔上皮细胞系HOK和人口腔鳞癌细胞系SCC-15、SCC-4、Cal-27中CCNB1基因的表达量,将CCNB1 siRNA(si-CCNB1)和阴性对照(si-NC)转染至SCC-15细胞,同时设置空白对照(Control),qRT-PCR和Western blot检测各组SCC-15细胞中CCNB1的表达,MTT实验、Transwell实验和划痕实验分别检测沉默CCNB1对SCC-15细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响。Western blot检测细胞中MMP-2、MMP-9、PI3K、Akt和p-Akt蛋白的表达。结果CCNB1在口腔鳞癌细胞系中的表达显著高于正常口腔上皮细胞(P<0.05),si-NC组SCC-15细胞中CCNB1 mRNA和蛋白的表达与Control组无统计学差异(P>0.05);si-CCNB1组中CCNB1 mRNA和蛋白的表达明显低于si-NC组和Control组(P<0.05),si-NC组SCC-15细胞增殖、侵袭和迁移能力及MMP-2、MMP-9、PI3K、Akt、p-Akt蛋白表达与Control组无统计学差异(P>0.05);si-CCNB1组细胞增殖、侵袭和迁移能力及MMP-2、MMP-9、PI3K、p-Akt蛋白表达均明显低于si-NC组和Control组(P<0.05),两组间Akt蛋白表达无统计学差异(P>0.05)。结论CCNB1在口腔鳞癌细胞系中呈高表达,沉默CCNB1基因能够抑制人口腔鳞癌SCC-15细胞增殖、侵袭和迁移,其作用机制可能与抑制PI3K/Akt信号通路的激活有关。 展开更多
关键词 ccnb1基因 PI3K/AKT信号通路 口腔鳞癌细胞 增殖 侵袭 迁移
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miR-150、CCNB1及MFN2参与调控肝癌细胞Huh-7凋亡并抑制其侵袭迁移的机制研究 被引量:5
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作者 文峰 向燕 《海南医学院学报》 CAS 2019年第9期650-653,共4页
目的:探究miR-150、细胞周期蛋白B1(CCNB1)及线粒体融合蛋白2(MFN2)参与调控肝癌细胞Huh-7凋亡并抑制其侵袭迁移的机制。方法:将肝癌细胞Huh-7分为对照组(control组)、阴性对照组(NC组)和miR-150过表达组(mimic组),通过质粒转染构建miR-... 目的:探究miR-150、细胞周期蛋白B1(CCNB1)及线粒体融合蛋白2(MFN2)参与调控肝癌细胞Huh-7凋亡并抑制其侵袭迁移的机制。方法:将肝癌细胞Huh-7分为对照组(control组)、阴性对照组(NC组)和miR-150过表达组(mimic组),通过质粒转染构建miR-150过表达细胞系。CCK-8和流式细胞术应用于检测细胞活力的凋亡,细胞划痕实验和Transwell应用于检测迁移和侵袭,qPCR检测miRNA和mRNA水平,WB检测蛋白的相对表达水平。结果:miR-150可显著抑制Huh-7的细胞活力而促进凋亡(P<0.01)。培养24 h后mimic组迁移率、侵袭率均显著低于control组和NC组(P<0.01)。Mimic组的CCNB1蛋白和mRNA的表达水平显著低于control组和NC组(P<0.01),MFN2显著高于control组和NC组(P<0.01)。结论:在肝癌细胞Huh-7中,miR-150可能通过下调CCNB1或上调MFN-2的水平抑制肝癌细胞的增殖、迁移、侵袭,并促进其凋亡。 展开更多
关键词 肝癌 miR-150 细胞周期蛋白B1(ccnb1) 线粒体融合蛋白2(MFN2)
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CDK1、CCNB1和NDC80与乙型肝炎相关肝细胞癌的预后和进展相关:基于生物信息学方法 被引量:5
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作者 李玉杰 吴登强 +2 位作者 韦常宏 杨雪佳 周素芳 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1509-1518,共10页
目的探讨HBV转化为HCC相关的关键基因,并探索相关的分子机制。方法分析基因表达综合(GEO)数据库中GSE55092、GSE84044和GSE121248的mRNA微阵列数据,其中包括119个HBV相关的HCC组织和252个HBV相关的非肿瘤组织。“sva”R包用于去除批间... 目的探讨HBV转化为HCC相关的关键基因,并探索相关的分子机制。方法分析基因表达综合(GEO)数据库中GSE55092、GSE84044和GSE121248的mRNA微阵列数据,其中包括119个HBV相关的HCC组织和252个HBV相关的非肿瘤组织。“sva”R包用于去除批间差。进行整合分析,获取HBV相关肝癌和HBV组织中的差异表达基因(DEGs),通过基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析对差异表达基因进行功能注释。使用相互作用基因搜索工具(STRING)构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,挖掘最重要的模块和关键基因。cBioportal用于分析hub基因的相关性。利用Kaplan-Meier和Oncomine数据库对TCGA数据库中肝癌基因表达数据进行验证,探讨hub基因与肝癌发生、发展和预后的关系。通过逆转录定量PCR(RT-qPCR)实验验证17对临床肝细胞癌样本与邻近非肿瘤组织中hub基因的表达。结果共获得121个DEGs(P<0.01),鉴定出3个遗传标记,细胞周期素依赖性激酶1(CDK1)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)和核分裂周期蛋白80(NDC80),与细胞周期、嘧啶代谢和DNA复制有关,这3个基因高度相关(P<0.05)。UALCAN数据库证实这些基因在肝癌组织中高表达并获得相关预后信息。Kaplan-Meier表明,它们与HCC患者的低存活率相关。CDK1、CCNB1和NDC80与肝癌分级相关(P<0.05),RT-qPCR实验证实CDK1、CCNB1和NDC80的mRNA在肝细胞癌中的表达明显高于癌旁组织。结论CDK1、CCNB1和NDC80基因可作为HBV相关肝细胞癌的预后标志物,在肝癌的基础研究和临床治疗方面有一定的应用价值。 展开更多
关键词 肝细胞癌 慢性乙型肝炎病毒 关键基因 CDK1 ccnb1 NDC80
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miR-144CCNB1信号调节通路在肝癌增殖、迁移和侵袭作用及相关机制的研究 被引量:6
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作者 户平安 雷霆 赵龙栓 《肝胆外科杂志》 2017年第6期471-474,共4页
目的探讨microRNA-144细胞周期蛋白B1(miR-144CCNB1)信号调节通路在肝癌增殖、迁移和侵袭作用及其相关机制。方法以2011年1月~2016年1月我院收治的100例肝癌患者的肝癌组织和癌旁组织为研究标本,采用荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测肝癌及... 目的探讨microRNA-144细胞周期蛋白B1(miR-144CCNB1)信号调节通路在肝癌增殖、迁移和侵袭作用及其相关机制。方法以2011年1月~2016年1月我院收治的100例肝癌患者的肝癌组织和癌旁组织为研究标本,采用荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测肝癌及其癌旁组织的miR-144表达和CCNB1蛋白表达情况,采用RNA干扰技术沉默CCNB1基因,并将靶向CCNB1的siRNA转染至肝癌细胞系HepG2和QGY-7703中,检测其对肝癌细胞生长、迁移和侵袭的生物学行为的影响。结果肝癌组织中miR-144表达较癌旁组织明显下调,CCNB1蛋白在肝癌组织的表达水平较癌旁组织明显上调,miR-144高表达者预后无瘤生存期较其低表达者明显长,而CCNB1蛋白低表达者无瘤生存期明显长于其高表达者,差异有统计学意义(P<0.05);与未处理者和阴性对照模拟物相较,转染CCNB1 siR肝癌细胞CCNB1蛋白表达水平明显下降;与未处理和阴性对照模拟物相较,转染CCBN1 siR HepG2细胞凋亡百分明显升高,转染CCNB1 siR HepG2细胞增殖能力明显下降,转染CCNB1siR HepG2细胞迁移能力明显降低;与阴性对照模拟物和未处理细胞相较,转染CCNB1-siR QGY-7703细胞克隆团数(成瘤能力)明显减少。结论 miR-144CCNB1信号调节通路在肝癌增殖、迁移和侵袭中发挥重要作用,其可能机制为miR-144负向调控CCNB1表达,从而影响肝癌细胞增殖、凋亡、迁移等生物学行为,为肝癌治疗的新靶点提供理论依据。 展开更多
关键词 肝癌 增殖 迁移 侵袭 miR-144 ccnb1 机制
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CCNB1基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及意义 被引量:6
11
作者 崔宇平 马洪 +1 位作者 段晓峰 孙昆俊 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期395-397,共3页
目的:研究细胞周期蛋白B1(CCNB1)mRNA在口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织中的表达及其临床意义。方法:利用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测CCNB1 mRNA在42例OSCC组织和17例口腔正常黏膜组织中的表达,并分析其相对表达量与临床特... 目的:研究细胞周期蛋白B1(CCNB1)mRNA在口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织中的表达及其临床意义。方法:利用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测CCNB1 mRNA在42例OSCC组织和17例口腔正常黏膜组织中的表达,并分析其相对表达量与临床特征的关系。结果:CCNB1 mRNA在OSCC中高表达(P<0.05),高分化组织中表达量低于中低分化者(P<0.05),临床Ⅰ、Ⅱ期组低于Ⅲ、Ⅳ期(P<0.05)。不同年龄、不同性别组间差异无统计学意义(P>0.05)。结论:CCNB1基因表达的增高可能在OSCC增殖过程中起到重要作用。 展开更多
关键词 细胞周期蛋白B1(ccnb1) 口腔鳞状细胞癌(OSCC) 实时定量荧光聚合酶链反应
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非小细胞肺癌患者外周血CCNB1IP1及c-Cbl基因突变研究
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作者 冯士生 梁建琴 +1 位作者 王金河 史晓朋 《临床肺科杂志》 2013年第6期1072-1075,共4页
目的检测NSCLC患者外周血c-Cbl和CCNB1IP1基因突变情况。方法收集20例健康人、20例肺结核和40例NSCLC患者外周血标本,采用RT-PCR和基因测序方法,检测c-Cbl和CCNB1IP1基因突变。结果所有标本中均未检测出CC-NB1IP1基因突变;而仅在NSCLC... 目的检测NSCLC患者外周血c-Cbl和CCNB1IP1基因突变情况。方法收集20例健康人、20例肺结核和40例NSCLC患者外周血标本,采用RT-PCR和基因测序方法,检测c-Cbl和CCNB1IP1基因突变。结果所有标本中均未检测出CC-NB1IP1基因突变;而仅在NSCLC患者外周血检测到4种c-Cbl基因突变,突变率为20%;突变率与患者的性别、年龄及病理学分型均无相关性(P>0.05);而不同临床分期间突变率不同,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 NSCLC患者外周血中检测到c-Cbl基因突变,且不同临床分期间突变率不同。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 ccnb1IP1 C-CBL 基因突变 外周血
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CDCA7调控CCNB1IP1表达影响食管鳞癌发生发展的作用机制 被引量:1
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作者 李泓漪 翁泳佳 +2 位作者 郭定和 王少杰 成晓龙 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期1169-1177,1190,共10页
目的 探讨CDCA7对食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)细胞系KYSE450、KYSE150和KYSE180体外增殖能力的影响,并进一步分析CDCA7促进ESCC细胞增殖的作用机制。方法 利用CDCA7-siRNA敲低KYSE150和KYSE450细胞系中的CDCA7,... 目的 探讨CDCA7对食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)细胞系KYSE450、KYSE150和KYSE180体外增殖能力的影响,并进一步分析CDCA7促进ESCC细胞增殖的作用机制。方法 利用CDCA7-siRNA敲低KYSE150和KYSE450细胞系中的CDCA7,并利用过表达载体在KYSE180细胞系中进行CDCA7的外源表达;通过qRT-PCR和Western blot法检测KYSE150、KYSE450细胞系CDCA7的敲低效率和KYSE180细胞系CDCA7的外源过表达效率;CCK8、硬克隆试验检测CDCA7对ESCC细胞体外增殖能力的影响;染色质免疫共沉淀测序(chromatin immunoprecipitation sequencing,ChIP-sequence)寻找CDCA7调控的下游靶基因,Western blot和qRT-PCR法分别检测敲低和过表达细胞系中靶基因CCNB1IP1的mRNA和蛋白表达水平;采用TCGA数据库转录组数据分析CDCA7与CCNB1IP1的mRNA表达水平的相关性;双荧光素酶报告试验验证CDCA7对CCNB1IP1的转录调控作用。结果 CDCA7在食管鳞癌组织中高表达,且CDCA7表达升高的ESCC患者预后差;敲低CDCA7显著抑制ESCC的细胞增殖,相反,过表达CDCA7显著促进ESCC的细胞增殖;CDCA7能够在转录水平上正向调控CCNB1IP1的表达,从而影响CCNB1IP1的蛋白表达水平。结论 CDCA7通过转录水平调控CCNB1IP1的表达影响CCNB1IP1蛋白表达水平,从而调控ESCC细胞增殖以及ESCC的发生发展。 展开更多
关键词 食管鳞癌 细胞增殖 转录调控 CDCA7 ccnb1IP1
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CCNB1在宫颈癌中的生物学功能及其与患者预后关系生物信息学分析
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作者 纪霞 郭海荣 +3 位作者 王宁 高杰 秦淑丽 杜海燕 《包头医学院学报》 CAS 2023年第7期29-33,共5页
目的:采用数据挖掘方法探讨细胞周期蛋白B1(CCNB1)在宫颈癌中的表达、功能富集和信号通路及其与患者预后关系。方法:采用生物信息数据分析方法探讨相关肿瘤数据库中CCNB1基因在宫颈癌组织及其癌旁组织中的表达;对CCNB1基因进行生物学功... 目的:采用数据挖掘方法探讨细胞周期蛋白B1(CCNB1)在宫颈癌中的表达、功能富集和信号通路及其与患者预后关系。方法:采用生物信息数据分析方法探讨相关肿瘤数据库中CCNB1基因在宫颈癌组织及其癌旁组织中的表达;对CCNB1基因进行生物学功能和信号通路富集,在STRING数据库中(http://string-db.org/cgi/input.pl)构建CCNB1基因表达蛋白相互作用网络。在Kaplan-Meier数据库(http://kmplot.com/analysis/)中分析CCNB1高低表达与宫颈癌患者总生存(OS)和无疾病进展生存(DFS)的关系。结果:在宫颈癌患者,癌组织CCNB1表达水平明显高于癌旁组织(P<0.05);CCNB1生物学过程、细胞组分和分子功能主要富集于细胞分裂和细胞周期、细胞质及细胞周期蛋白依赖性蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性;KEGG相关信号通路主要包括细胞周期、孕酮介导的卵母细胞成熟和卵母细胞减数分裂;CCNB1及其相互作用蛋白网络,蛋白与蛋白间的相互作用关系为196,平均聚集指数为0.944,蛋白网络相关作用显著(P<0.005);CCNB1高表达宫颈癌患者总生存(HR=1.62,95%CI:1.10-2.62,P<0.05)和无疾病进展生存(HR=3.53,95%CI:1.62-7.69,P<0.05),显著低于低表达者;CCNB1表达水平与B淋巴细胞(r=-0.099,P>0.05),CD8+T细胞(r=-0.036,P>0.05)、CD4+T细胞(r=0.065,P>0.05)、巨噬细胞(r=-0.79,P>0.05)、中性粒细胞(r=0.1,P>0.05)及树突状细胞浸润无关(r=0.8,P>0.05)。结论:CCNB1在宫颈癌中高表达,并参与了宫颈癌的发生发展,其高表达与患者的预后不良有关,可能成为宫颈癌靶向治疗的新靶点。 展开更多
关键词 宫颈癌 ccnb1 数据挖掘 功能富集 信号通路
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基于生物信息学分析CCNB1在肺腺癌组织中的表达及其与预后的关系
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作者 常思思 高付彦 +4 位作者 朱亚辉 卢娟娟 闫俊涛 马纯政 李洪霖 《华西医学》 CAS 2023年第3期444-453,共10页
目的评估细胞周期蛋白B1(cyclin B1,CCNB1)基因表达与肺腺癌预后的相关性。方法使用Oncomine、STRING、人类蛋白质图谱、癌症基因组图谱等数据库以及Kaplan-Meier、Cox回归分析、受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC... 目的评估细胞周期蛋白B1(cyclin B1,CCNB1)基因表达与肺腺癌预后的相关性。方法使用Oncomine、STRING、人类蛋白质图谱、癌症基因组图谱等数据库以及Kaplan-Meier、Cox回归分析、受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线、Spearman相关分析等方法来验证CCNB1对肺腺癌患者的影响。结果CCNB1在肺腺癌组织中高表达,且与肺腺癌患者的T分期(P=0.001)、N分期(P<0.001)、病理分期(P<0.001)以及性别(P=0.008)等临床特征相关。单因素Cox回归分析结果显示CCNB1的表达、T分期、N分期、M分期、病理分期是影响肺腺癌患者总生存率的因素(P<0.05),多因素Cox回归分析显示CCNB1的表达、T分期是肺腺癌患者总生存率的独立危险因素(P<0.05)。Kaplan-Meier分析得出,CCNB1高表达与较短的总生存期[风险比(hazard ratio,HR)=1.60,95%置信区间(confidence interval,CI)(1.20,2.14),P=0.002]、疾病特异性生存期[HR=1.68,95%CI(1.16,2.44),P=0.006]、无进展间期[HR=1.42,95%CI(1.09,1.85),P=0.009]相关。ROC曲线表明CCNB1可能是肺腺癌的诊断分子[曲线下面积=0.980,95%CI(0.967,0.993)]。Spearman相关分析显示,CCNB1的表达与T辅助细胞2(r_(s)=0.805,P<0.001)及T辅助细胞(r_(s)=0.103,P=0.017)的浸润呈正相关,与自然杀伤细胞(r_(s)=-0.195,P<0.001)、巨噬细胞(r_(s)=-0.134,P=0.002)、T细胞(r_(s)=-0.092,P=0.033)的浸润呈负相关。结论与正常组织相比,CCNB1在肺腺癌中高表达,与不良预后具有相关性,可能为肺腺癌患者提供潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 肺腺癌 ccnb1基因 预后 免疫细胞浸润
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基于TCGA数据挖掘和分子对接技术探讨CCNB1高表达在肺腺癌中的意义及柴胡皂苷D的干预机制 被引量:6
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作者 黄瀚 吕晓东 庞立健 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期1714-1718,共5页
目的:基于TCGA数据挖掘及分子对接技术探究CCNB1高表达在肺腺癌中的意义及柴胡皂苷D的干预机制。方法:在TCGA数据库中获取肺腺癌相关数据,进行CCNB1基因的差异分析、配对差异分析、生存分析及其表达多重分析,发掘CCNB1基因表达与肺腺癌... 目的:基于TCGA数据挖掘及分子对接技术探究CCNB1高表达在肺腺癌中的意义及柴胡皂苷D的干预机制。方法:在TCGA数据库中获取肺腺癌相关数据,进行CCNB1基因的差异分析、配对差异分析、生存分析及其表达多重分析,发掘CCNB1基因表达与肺腺癌患者预后的相关性,并应用单因素、多因素COX回归分析CCNB1与肺腺癌患者的年龄、性别、临床分期、T分期、N分期等相关性,并判断其是否为独立预后因子;应用GSEA富集分析获取其发挥作用的机制及通路;采用分子对接技术将CCNB1与柴胡皂苷D进行对接,预测及判断其调控机制。结果:从TCGA数据库中获取肺腺癌组织535例、癌旁非癌样本59例。与癌旁非癌样本比较,肺腺癌组织中CCNB1基因表达显著升高(P<0.01),CCNB1基因低表达的生存率较高表达患者显著增加(P<0.01);男性肺腺癌患者CCNB1基因表达显著高于女性患者(P<0.01);Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期患者CCNB1基因表达显著高于Ⅰ期(P<0.01,P<0.05);T2期显著高于T1期(P<0.01);N1期、N2期显著高于N0期(P<0.01)。临床分期、T分期、N分期、CCNB1基因表达与总的生存期密切相关(P<0.01);临床分期和CCNB1基因表达可以作为独立的临床预后因子;CCNB1基因表达与细胞周期等密切相关。柴胡皂苷D与CCNB1存在结合靶点,最低结合能为-6.9 kcal/mol。结论:CCNB1基因是肺腺癌重要的临床预后因子,柴胡皂苷D可能通过调控CCNB1发挥抗肺腺癌的作用。 展开更多
关键词 肺腺癌 细胞周期蛋白B1 TCGA数据库 分子对接 柴胡皂苷D
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CCNB1在原发性肝癌中的表达及临床意义 被引量:3
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作者 石小康 丁佑铭 +2 位作者 汪斌 余斌 徐雨 《肝胆胰外科杂志》 CAS 2019年第10期596-603,共8页
目的探究细胞周期蛋白B1(CyclinB1,CCNB1)在原发性肝癌中的表达及临床意义。方法从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载正常肝组织和肝癌组织中的CCNB1mRNA二代测序数据及相应的临床病理资料,比较CCNB1 mRNA在肝癌... 目的探究细胞周期蛋白B1(CyclinB1,CCNB1)在原发性肝癌中的表达及临床意义。方法从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载正常肝组织和肝癌组织中的CCNB1mRNA二代测序数据及相应的临床病理资料,比较CCNB1 mRNA在肝癌及正常肝组织中的表达差异,同时分析其表达水平与肝癌患者临床病理学特征及预后的关系,采用Cox回归法分析影响肝癌预后的危险因素,利用生物信息学方法进行CCNB1 共表达基因的GO和KECC富集分析。结果 CCNB1 mRNA在肝癌组织中表达量明显高于正常肝组织(P<0.001);CCNB1 mRNA高表达与肝癌患者种族(P=0.005)、甲胎蛋白(AFP)表达水平(P<0.0001)、病理分级(P<0.0001)、血管侵袭(P<0.0001)等显著相关,CCNB1mRNA高表达组肝癌患者总生存期(overall survival,OS)( P=0.0015)和无病生存期(disease-free survival,DFS)( P=0.0004)短于CCNB1 mRNA低表达组,差异有统计学意义。CCNB1 mRNA表达水平是影响肝癌患者OS(HR 1.544,95%CI 1.052~2.266,P=0.027)和DFS(HR 1.793,95%CI 1.277~2.517,P=0.001)的独立危险因素。富集分析提示CCNB1共表达基因主要富集于细胞增殖、细胞周期、有丝分裂细胞周期的G1/S转换、有丝分裂细胞周期的G2/M转换等功能及细胞周期调控、p53 信号通路等通路。结论 CCNB1在原发性肝癌组织中表达上调,其异常表达水平可能成为潜在的评估肝癌患者预后的生物标志物。 展开更多
关键词 原发性肝癌 细胞周期蛋白B1 癌症基因组图谱(TCGA)
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桃叶珊瑚苷对乳腺癌细胞恶性生物学行为的影响及机制 被引量:1
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作者 司运辉 蒋凯 +2 位作者 钱立全 陈永顺 别会杰 《中国药房》 CAS 北大核心 2024年第8期918-924,共7页
目的探讨桃叶珊瑚苷(Auc)调节周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)/周期蛋白B1(CCNB1)/Polo样激酶1(PLK1)信号通路对乳腺癌细胞恶性生物学行为的影响。方法以人乳腺癌细胞MCF-7为对象,将其分为对照组,Auc低、中、高浓度组(Auc-L、Auc-M、Auc-H组... 目的探讨桃叶珊瑚苷(Auc)调节周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)/周期蛋白B1(CCNB1)/Polo样激酶1(PLK1)信号通路对乳腺癌细胞恶性生物学行为的影响。方法以人乳腺癌细胞MCF-7为对象,将其分为对照组,Auc低、中、高浓度组(Auc-L、Auc-M、Auc-H组,20、40、80μmol/L的Auc),Auc-H+pcDNA-NC组(80μmol/L的Auc+转染pcDNA-NC质粒),Auc-H+pcDNA-CDK1组(80μmol/L的Auc+转染pcDNA-CDK1质粒),检测各组细胞的增殖、克隆形成、侵袭、迁移能力,凋亡情况及周期分布,凋亡、上皮-间充质转化(EMT)、CDK1/CCNB1/PLK1信号通路相关蛋白的表达情况。以BALB/c裸鼠为对象,通过皮下接种MCF-7细胞悬液建立移植瘤模型,并将其分为对照组和Auc组(每组12只),检测各组裸鼠肿瘤体积、质量及肿瘤组织中CDK1/CCNB1/PLK1信号通路相关蛋白的表达情况。结果与对照组细胞相比,Auc各浓度组的细胞克隆形成数、增殖率、细胞侵袭数、划痕愈合率、G1/G0期和S期细胞占比以及B细胞淋巴瘤2(Bcl-2)、神经钙黏素、纤维连接蛋白、CDK1、CCNB1、PLK1蛋白的表达水平均显著降低(P<0.05),细胞凋亡率、G2/M期细胞占比以及Bcl-2相关X蛋白、上皮钙黏素蛋白的表达水平均显著增加(P<0.05),呈浓度依赖性(P<0.05);与Auc-H+pcDNA-NC组细胞相比,Auc-H组细胞上述指标的差异均无统计学意义(P>0.05),而Auc-H+pcDNA-CDK1组细胞上述指标则显著逆转(P<0.05)。与对照组裸鼠相比,Auc组裸鼠肿瘤体积、质量以及肿瘤组织中CDK1、CCNB1、PLK1蛋白的表达水平均显著降低(P<0.05)。结论Auc能抑制乳腺癌细胞的增殖、侵袭和迁移,诱导细胞周期阻滞,抑制EMT进程,该作用可能与抑制CDK1/CCNB1/PLK1信号通路激活有关。 展开更多
关键词 桃叶珊瑚苷 乳腺癌 恶性生物学行为 CDK1/ccnb1/PLK1信号通路
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基于加权基因共表达网络分析肺癌相关生物标志物及其潜在的分子机制
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作者 胡世陈 李婉雯 何彬 《四川医学》 CAS 2024年第9期1008-1018,共11页
目的通过生物信息学分析、鉴定枢纽基因(hub gene),寻找可以作为肺癌的生物标志物或预后标志物并探讨潜在的分子机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)的数据,鉴定肺癌肿瘤样本与正常样本之间差异表达的基因;利用R软件包中的“Limma”识... 目的通过生物信息学分析、鉴定枢纽基因(hub gene),寻找可以作为肺癌的生物标志物或预后标志物并探讨潜在的分子机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)的数据,鉴定肺癌肿瘤样本与正常样本之间差异表达的基因;利用R软件包中的“Limma”识别差异表达基因(DEGs),通过GO富集分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定相关基因模块及其功能,最终确定hub基因;基于基因表达谱交互分析数据库(GEPIA)和CBioPortal数据库,探讨hub基因表达与肺癌患者总生存期之间的关系,通过检索相关文献分析其潜在的分子机制,并进行其表达量和蛋白表达的验证。结果根据TCGA共鉴定出5259个差异表达基因(2178个上调,3081个下调),利用WGCNA确定8个与肺癌患者临床特征相关基因模块(包括与癌症发病相关模块),从中筛选出5个hub基因:CCNB1、CKAP2L、HMMR、ANLN、CDCA5,通过生存分析发现其表达水平与预后相关,并确定其与肺癌病理生理学关联。另发现CCNB1与P53有相关调控机制,CCNB1的沉默可激活P53的表达。结论5个hub基因在肺癌发生发展至关重要,可为肺癌预测、诊断、治疗和预后的生物标志物提供依据,其中CCNB1在肺癌中高表达,CCNB1沉默激活肺癌中P53信号通路抑制细胞增殖,促进细胞衰老。 展开更多
关键词 肺癌 加权基因共表达网络 枢纽基因 ccnb1 P53
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辐射诱导细胞周期调控和DNA损伤反应相关基因表达变化的实验研究 被引量:3
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作者 金顺子 武宁 +4 位作者 刘丽波 张萱 倪冠英 刘宇光 刘树铮 《辐射防护》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期70-79,共10页
采用实时定量PCR技术检测小鼠胸腺和脾脏基因表达对X射线全身照射的反应,为探索可行的辐射生物标志物打下实验基础。研究中选用细胞周期调控和DNA损伤反应相关基因Cdkn1a、Ccnd1、Ccnb1、Gadd45a、Atm和Fdxr,以Gapdh为参考基因,观察0.5... 采用实时定量PCR技术检测小鼠胸腺和脾脏基因表达对X射线全身照射的反应,为探索可行的辐射生物标志物打下实验基础。研究中选用细胞周期调控和DNA损伤反应相关基因Cdkn1a、Ccnd1、Ccnb1、Gadd45a、Atm和Fdxr,以Gapdh为参考基因,观察0.5、1、2、4、6 Gy X射线全身照射后4和24小时上述基因在胸腺和脾脏的相对表达量的变化。同时计数骨髓细胞涂片嗜多染红细胞(PCE)的微核率进行对比。结果显示,上述6种基因对电离辐射全身作用都出现变化,但以Cdkn1a、Ccnd1和Ccnb1三者对全身照射的剂量效应关系较为明显,其中Cdkn1a和Ccnd1基因的表达随辐射剂量增加而升高,Ccnb1基因的表达随辐射剂量增加而下降。剂量效应曲线可拟合为线性-平方方程,其相关系数r为0.851~0.998,p<0.05~0.01。但与嗜多染红细胞微核率进行对比,Ccnd1和Ccnb1的表达只有部分结果与之具有显著的相关关系。Cdkn1a的表达量则不仅随辐射剂量增加而升高,而且与嗜多染红细胞微核率的剂量-效应曲线明显相关,在两器官和两时间点其相关系数为0.950~0.975,p<0.01。另一方面Cd-kn1a表达量变化的幅度较大,照射后4小时和24小时胸腺的最高表达量分别为11.2和11.3倍,脾脏的最高表达量分别为20.6和9.3倍。鉴于实时定量PCR技术适用于快速、高通量检测,通过进一步在人体观察验证,Cdkn1a基因表达变化有可能成为研制新的辐射生物剂量计的候选者。 展开更多
关键词 Cdkn1a CCND1 ccnb1 GADD45A Atm Fdxr 实时定量PCR 基因表达变化 骨髓嗜多染红细胞微核率 辐射生物剂量计
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