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家蚕黄茧候选基因Cameo1和Cameo2在不同茧色品种的表达差异与功能分析 被引量:1
1
作者 束梅影 陈亚东 +3 位作者 牛艳山 甘丽萍 司马杨虎 徐世清 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期897-904,共8页
外层黄茧C基因是家蚕对体内类胡萝卜素选择性吸收的关键基因之一。以13个黄红茧系品种(包括1个限性黄茧品种)、7个绿茧系品种、1个白色茧品种为材料,采用RT-PCR方法,检测和分析C基因的2个候选基因Cameo1和Cameo2在4龄和5龄幼虫不同组织... 外层黄茧C基因是家蚕对体内类胡萝卜素选择性吸收的关键基因之一。以13个黄红茧系品种(包括1个限性黄茧品种)、7个绿茧系品种、1个白色茧品种为材料,采用RT-PCR方法,检测和分析C基因的2个候选基因Cameo1和Cameo2在4龄和5龄幼虫不同组织的表达差异。结果表明,丝腺对黄茧色素类胡萝卜素的吸收不依赖于Cameo1基因的表达,Cameo1基因表达没有茧色和性别特异性,其蛋白产物可能没有直接参与黄茧色素吸收,而是作为B族清道夫受体家族(SCRB)成员在家蚕免疫系统中发挥作用;虽然Cameo2基因的蛋白产物介导了中肠中的黄色茧主要色素成分叶黄素的主动运输方式,但Came-o2基因不只是在家蚕黄色茧品种中肠的特异表达基因,Cameo2基因在家蚕中肠以外的组织表达特异性与这些组织的黄茧色素积累密切关联,生殖腺可能是比中肠和丝腺更加重要的Cameo2基因表达和作用的组织。 展开更多
关键词 家蚕 外层黄茧c基因 表达特征 基因功能
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植物MAPK C族基因的研究进展 被引量:7
2
作者 朱斌 梁颖 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期27-31,共5页
促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,它包括MAPKKK、MAPKK和MAPK等3组,它们共同构成MAPK级联系统。MAPK级联系统通过参与蛋白质磷酸化作用传递和放大信号,调控下游基因的表达,最终引起植物的一系列生理反应。MAPK... 促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,它包括MAPKKK、MAPKK和MAPK等3组,它们共同构成MAPK级联系统。MAPK级联系统通过参与蛋白质磷酸化作用传递和放大信号,调控下游基因的表达,最终引起植物的一系列生理反应。MAPK的基因包括A族、B族、C族和D族4类。就C族MAPK基因的种类和功能,以及近几年来对C族MAPK基因的研究方法作综述。 展开更多
关键词 MAPK基因 c 信号转导 功能
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人类抗砷相关基因hARRG cDNA抗砷功能的研究 被引量:6
3
作者 潘泽民 杨磊 +5 位作者 吴顺华 刘开泰 顾永清 王国荃 应康 谢毅 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期140-142,共3页
目的探讨人类抗砷相关基因hARRGcDNA对砷化物的抵抗作用。方法将人类抗砷相关基因hARRGcDNA基因开放阅读框克隆于真核表达载体pcDNA4/HisC中。通过磷酸钙共沉淀方法将带hARRGcDNA基因开放阅读框的表达质粒与空pcDNA4/HisC质粒分别转染... 目的探讨人类抗砷相关基因hARRGcDNA对砷化物的抵抗作用。方法将人类抗砷相关基因hARRGcDNA基因开放阅读框克隆于真核表达载体pcDNA4/HisC中。通过磷酸钙共沉淀方法将带hARRGcDNA基因开放阅读框的表达质粒与空pcDNA4/HisC质粒分别转染到人正常肝L鄄02细胞中,细胞分别用2、4、6、8、10μmol/LNaAsO2染毒,根据染砷细胞存活数确定hARRGcDNA的抗砷性。结果生物信息学分析hARRG蛋白为膜外蛋白,转染含hARRGcDNA基因开放阅读框的pcDNA4/HisC质粒在砷环境中细胞存活数目多于未带hARRG基因开放阅读框的空质粒。结论hARRGcDNA基因具有一定的抗砷作用。 展开更多
关键词 相关基因 开放阅读框 细胞存活 转染 DNA基因 人类 表达质粒 克隆 数目 真核表达载体
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c-met及相关基因在大鼠胰腺发育功能完善中的表达 被引量:1
4
作者 程梅 刘莉洁 +5 位作者 郭静 石慧 曹丽华 侯良芹 蔺扬波 德伟 《现代生物医学进展》 CAS 2006年第10期18-20,24,共4页
目的:研究原癌基因c-met及其相关基因在大鼠胰腺发育及细胞功能完善过程中的表达。方法:采用高密度寡核苷酸芯片(Affymetrix芯片)对孕12.5(E12.5)、E15.5和E18.5、新生、成年胰腺进行基因转录水平分析,并用RT-PCR验证基因在大鼠... 目的:研究原癌基因c-met及其相关基因在大鼠胰腺发育及细胞功能完善过程中的表达。方法:采用高密度寡核苷酸芯片(Affymetrix芯片)对孕12.5(E12.5)、E15.5和E18.5、新生、成年胰腺进行基因转录水平分析,并用RT-PCR验证基因在大鼠胰腺不同发育时期的表达。结果:c-met基因在E15.5、E18.5较成年特异高表达。芯片中c-met转录调控基因和信号传导通路相关基因的表达趋势与c-met高度相似。RT-PCR(所用引物设计区域与芯片相同)验证,c-met表达趋势与芯片结果相符;与芯片c-met探针所用引物不同RT-PCR,结果却在各发育阶段呈现与芯片不同的表达趋势。结论:提示c-met可能在胰腺发育细胞功能完善的关键阶段起调控作用,参与胚胎胰腺发育中晚期细胞功能完善的信号传导过程。并且c-met在胰腺发育中发挥作用有可能存在不同转录本。 展开更多
关键词 c—met 胰腺生长发育 细胞功能完善 高通量寡核苷酸芯片 RT—PcR
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胃扩张对大鼠中枢和外周神经系统c-fos和外周降钙素基因相关肽mRNA表达的影响 被引量:5
5
作者 章菲菲 张珏莹 +3 位作者 吕有灵 陈宇明 萧树东 莫剑忠 《武警医学》 CAS 2006年第9期659-662,共4页
目的探索大鼠伤害性胃扩张后内脏刺激传入的途径和部位,了解外周降钙素基因相关肽(Calcitonin gene relatedpeotide,CGRP)在内脏刺激传入过程中发挥的作用。方法成年SD雄性大鼠,随机分为实验组(12只)、手术对照组(6只)和空白... 目的探索大鼠伤害性胃扩张后内脏刺激传入的途径和部位,了解外周降钙素基因相关肽(Calcitonin gene relatedpeotide,CGRP)在内脏刺激传入过程中发挥的作用。方法成年SD雄性大鼠,随机分为实验组(12只)、手术对照组(6只)和空白对照组(6只)。实验组、手术对照组先予置入胃内气囊。48h后,实验组接受反复的气囊扩张(80mmHg),2h后处死全部实验动物,立即取材(胃壁、脊髓T8-10和脑)。利用荧光定量PCR进行C-fos mRNA和CGRP mRNA的定量分析。结果实验组杏仁核、延髓、胸髓和胃窦组织c-fos表达较其他两组明显增强(P〈0.05)。实验组胃窦、胸髓和延髓CGRP表达显著增强(P〈0.05)。胸髓和延髓CGRP与c-fos表达相关(rs分别为0.778和0.774,P〈0.05)。结论胃扩张刺激可以兴奋杏仁核等皮质下中枢,CGRP参与内脏刺激信号的传入过程。 展开更多
关键词 功能性消化不良 内脏传入神经c-fos 降钙素基因相关肽
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Bezdek型模糊属性C均值聚类算法 被引量:4
6
作者 刘敬伟 徐美芝 《北京航空航天大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1121-1126,共6页
推广了属性均值聚类算法,提出了基于模糊度m的Bezdek型模糊属性C均值聚类算法(FAMC),给出了FAMC算法的迭代算法,并讨论了模糊度m对算法收敛性的影响.在标准Iris数据集与肿瘤基因芯片表达数据的模式识别实验结果,验证了该算法优于模糊C... 推广了属性均值聚类算法,提出了基于模糊度m的Bezdek型模糊属性C均值聚类算法(FAMC),给出了FAMC算法的迭代算法,并讨论了模糊度m对算法收敛性的影响.在标准Iris数据集与肿瘤基因芯片表达数据的模式识别实验结果,验证了该算法优于模糊C均值算法和属性均值聚类算法. 展开更多
关键词 模糊c均值聚类算法 属性均值聚类 稳态函数 基因表达数据
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蛋白C P275S突变导致遗传性蛋白C缺陷症的分子机制研究
7
作者 郁婷婷 王剑 +2 位作者 戴菁 王学锋 傅启华 《血栓与止血学》 2011年第1期4-7,12,共5页
目的研究蛋白C(PC)基因P275S突变导致遗传性PC缺陷症的分子机制。方法构建PC基因野生型和P275S突变型表达质粒,并瞬时转染HEK293T细胞和COS 7细胞进行体外表达。ELISA检测转染细胞上清液和细胞裂解液的PC抗原;实时荧光RT-PCR(real time,... 目的研究蛋白C(PC)基因P275S突变导致遗传性PC缺陷症的分子机制。方法构建PC基因野生型和P275S突变型表达质粒,并瞬时转染HEK293T细胞和COS 7细胞进行体外表达。ELISA检测转染细胞上清液和细胞裂解液的PC抗原;实时荧光RT-PCR(real time,RT-PCR)检测转染细胞PC mRNA表达量的改变;细胞免疫荧光染色检测PC在内质网和高尔基体内的分布。结果转染细胞上清液和细胞裂解液中的PC P275S抗原分别为野生型PC抗原的22.6%和78.9%;实时RT-PCR结果显示,与野生型PC相比,PC P275S突变体在mRNA水平没有减少;细胞免疫荧光染色显示,野生型PC蛋白在内质网和高尔基体中均有大量分布,而PC P275S突变蛋白主要位于内质网中。结论分泌障碍和细胞内降解是PC P275S导致PC缺陷症的原因。 展开更多
关键词 蛋白c缺陷 基因 突变 功能
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C功能基因AG和OsMADS58在花发育中的保守性分析 被引量:3
8
作者 刘秋圆 贺浩华 +7 位作者 朱昌兰 彭小松 贺晓鹏 傅军如 陈小荣 欧阳林娟 边建民 胡丽芳 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期2693-2698,共6页
为了分析拟南芥C功能基因AG和水稻C功能基因OsMADS58在花器官发育中的功能保守性,构建了AG和OsMADS58的过表达载体并转化拟南芥进行相关分析。研究发现,过量表达的AG植株会出现花瓣转变为雄蕊,萼片转变为心皮的现象。在过量表达OsMADS5... 为了分析拟南芥C功能基因AG和水稻C功能基因OsMADS58在花器官发育中的功能保守性,构建了AG和OsMADS58的过表达载体并转化拟南芥进行相关分析。研究发现,过量表达的AG植株会出现花瓣转变为雄蕊,萼片转变为心皮的现象。在过量表达OsMADS58的植株中,仅出现第二轮的花瓣向第三轮雄蕊转化的现象。以上结果表明,AG和OsMADS58可能在第三轮器官的决定性上具有部分的保守性,但在第四轮器官的决定性和分生组织的决定性上具有一定的分化。 展开更多
关键词 c功能基因 AG OsMADS58 花器官 水稻 拟南芥
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苯乙酸钠对小鼠体内种植性肿瘤c-myc基因表达及免疫功能影响的实验研究
9
作者 赵平伟 姜艳芳 黄显利 《中国厂矿医学》 2006年第6期483-485,共3页
目的探讨苯乙酸钠(NaPA)对小鼠体内种植性肿瘤的作用及对c-myc基因和免疫力的影响,寻找新的有效的肿瘤治疗药物。方法制作小鼠体内种植性肿瘤模型,NaPA腹腔内注射10 d后运用反转录-多聚酶链式反应(RT-PCR)方法检测肿瘤细胞的c-myc基因... 目的探讨苯乙酸钠(NaPA)对小鼠体内种植性肿瘤的作用及对c-myc基因和免疫力的影响,寻找新的有效的肿瘤治疗药物。方法制作小鼠体内种植性肿瘤模型,NaPA腹腔内注射10 d后运用反转录-多聚酶链式反应(RT-PCR)方法检测肿瘤细胞的c-myc基因扩增情况,应用流式细胞仪(FCM)检测小鼠的免疫功能,同时检测NaPA对荷瘤小鼠的抑瘤作用和毒副作用。结果随着NaPA浓度的增加,对荷瘤小鼠的抑瘤作用加强,且明显抑制c-myc基因的表达,并具有提高小鼠免疫力的趋势。没有检测到对荷瘤小鼠正常组织的毒副作用。结论NaPA可抑制荷瘤小鼠c-myc基因过度表达,抑制肿瘤细胞恶性增殖,并且无毒副作用,有望成为新的肿瘤治疗药物。 展开更多
关键词 苯乙酸钠 c-MYc基因 免疫功能
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上覆水不同C/N比条件下沉积物环境反硝化及氨氧化功能基因丰度变化特征 被引量:7
10
作者 李筱宛 张亚平 +2 位作者 万宇 罗跃辉 阮晓红 《南京大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期27-35,共9页
以太湖梅梁湾沉积物环境为研究对象,通过室内培养试验,研究上覆水不同C/N比条件对沉积物中反硝化(nirS、nirK)及氨氧化功能基因(古菌AOA-amoA、细菌AOB-amoA)丰度的影响,实验设计硝氮水平为2.0和5.0mg·L-1,C/N为0.5、2、4、6、10、... 以太湖梅梁湾沉积物环境为研究对象,通过室内培养试验,研究上覆水不同C/N比条件对沉积物中反硝化(nirS、nirK)及氨氧化功能基因(古菌AOA-amoA、细菌AOB-amoA)丰度的影响,实验设计硝氮水平为2.0和5.0mg·L-1,C/N为0.5、2、4、6、10、14.结果表明,所有实验组样品在60天的培养周期中,反硝化功能基因丰度与本底值相比有所上升,但对C/N比变化响应不显著;氨氧化功能基因丰度对C/N比的变化有响应,当C/N比大于一定比值时,其丰度由初期的显著上升变化为显著下降.其中,氨氧化古菌(AOA-amoA)丰度对C/N比变化响应更显著.相关性分析表明,系统中硝酸盐氮浓度与氨氧化功能基因丰度呈显著相关(r2=0.551,P<0.05),当氨氧化功能基因丰度较高时,来源于沉积物中氨氮的硝化产物使得系统中硝酸盐氮趋于累积. 展开更多
关键词 碳氮比 反硝化功能基因 氨氧化功能基因
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Impacts of Spartina alterniflora invasion on C-cycling functional genes and microbial communities in salt marsh wetlands during cold season
11
作者 Xiaoling Zhang Bin Ma +7 位作者 Qian Zhang Qingjun Wang Xiaodong Yang Junxiang Fei Shihong Zhang Fan Zhang Yuan Zhang Shixiao Xu 《Ecological Processes》 2025年第3期127-140,共14页
Background The invasiveness of Spartina alterniflora Loisel.into the estuarine coastal wetlands has impacted the stability of soil organic carbon,as well as the functional genes of soil microorganisms.However,the mech... Background The invasiveness of Spartina alterniflora Loisel.into the estuarine coastal wetlands has impacted the stability of soil organic carbon,as well as the functional genes of soil microorganisms.However,the mechanisms by which S.alterniflora invasion affects soil organic carbon,especially at the micro-level,is still unclear.Therefore,this study compared the differences in soil carbon cycling(C-cycling)functional genes between invaded and native areas during the cold season,as well as the changes in microbial communities involved in differential functional genes'expression.Results Our results showed that in salt marsh wetlands dominated by Suaeda salsa(L.)Pall.,invasion by S.alterniflora negatively impacts soil microbial biomass carbon(MBC)and reduces the diversity of C-cycling functional genes.The invasion species significantly increased the relative abundance of carbon fixation genes,while decreasing the relative abundance of carbon degradation genes.Additionally,the differential genes-expressing microbial communities exhibited notable differences across groups.At the class level,both generalist taxa(e.g.,Gammaproteobacteria,Deltaproteobacteria)and specialist taxa(e.g.,Nitrospiria,Flavobacteriia)collectively influenced the abundance of C-cycling functional genes.Correlation and hierarchical partitioning analyses revealed that the increased soil carbon fixation capacity was closely associated with increased soil organic carbon(SOC)and decreased MBC,whereas the decline in soil carbon degradation capacity was linked to higher soil electrical conductivity(EC)and a lower C:P ratio.Conclusions Our study filled a gap in research during the cold season and revealed that the invasion of S.alterniflora significantly impacts both soil C-cycling functional genes and their expressing microbial communities,thereby potentially affecting the soil organic carbon of salt marsh wetland ecosystems. 展开更多
关键词 c degradation functional genes c fixation functional genes Microbial communities Plant invasion Spartina alterniflora Salt marsh wetland
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酵母双杂交技术筛选人白细胞cDNA文库中HCV NS4B结合蛋白
12
作者 赵平 程勇前 +5 位作者 于岩岩 王琳 刘妍 徐东平 钟彦伟 李晓东 《传染病信息》 2008年第3期158-160,共3页
目的筛选丙型肝炎病毒非结构蛋白4B(HCVNS4B)在人白细胞cDNA文库中的相互作用蛋白。方法应用酵母双杂交技术筛选人白细胞文库中与HCVNS4B相互作用的蛋白,对筛选结果中目的蛋白的编码基因进行克隆,并构建其酵母表达载体,在酵母细胞中进... 目的筛选丙型肝炎病毒非结构蛋白4B(HCVNS4B)在人白细胞cDNA文库中的相互作用蛋白。方法应用酵母双杂交技术筛选人白细胞文库中与HCVNS4B相互作用的蛋白,对筛选结果中目的蛋白的编码基因进行克隆,并构建其酵母表达载体,在酵母细胞中进行回交验证。结果共筛选出人白细胞cDNA文库中与能够与HCVNS4B相互作用的蛋白5种(溶菌酶前体、推测的人翻译起始因子、人选择素P配体、人HC7371基因和TNF-alpha转换酶)以及一个未知功能基因。对新基因成功克隆,在酵母细胞中回交验证了HCVNS4B与该基因的相互作用。结论在人白细胞cDNA文库中存在一些能够与HCVNS4B相互作用的蛋白,它们均与细胞的生长和代谢状态有着密切的关系,其具体作用机制尚有待进一步研究。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒非结构蛋白4B 酵母双杂交 未知功能基因
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槟榔江水牛胃型LYZ C基因分离鉴定及功能生物信息学分析
13
作者 黄静 保志鹏 +4 位作者 范新阳 张永云 杜平 康定富 苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2018年第4期640-646,共7页
【目的】溶菌酶是一种由动物产生的抗微生物酶,构成动物体先天免疫系统的一部分,在反刍动物的皱胃中还具有消化功能。迄今,普通牛溶菌酶C基因家族的分子遗传特征已被深入解析,但有关水牛溶菌酶C的研究报道较少。【方法】采用PCR产物直... 【目的】溶菌酶是一种由动物产生的抗微生物酶,构成动物体先天免疫系统的一部分,在反刍动物的皱胃中还具有消化功能。迄今,普通牛溶菌酶C基因家族的分子遗传特征已被深入解析,但有关水牛溶菌酶C的研究报道较少。【方法】采用PCR产物直接测序技术,对槟榔江水牛胃型溶菌酶C基因编码区进行了分段扩增测序、序列组装和开放阅读框的确定,并结合已发表的其他牛科物种同源序列进行了生物信息学分析。【结果】序列分析表明:水牛胃型溶菌酶C基因编码区长444 bp,编码1个由147个氨基酸残基组成的多肽,包含1个N端信号肽和1段由129个氨基酸组成的成熟肽。水牛胃型溶菌酶C成熟肽分子量为14.41 ku,等电点为6.32,含有1个alpha-lactalbumin/lysozyme C保守结构域(19~145AA),不含有跨膜结构域,为亲水蛋白,在胞外发挥生物功能;在三维结构上与普通牛的溶菌酶模板(2z2f.1.A)有99.22%的一致性;在基于氨基酸序列构建的系统树上,水牛与普通牛、瘤牛、野牦牛和野牛聚在一起,且有较高的支持率(88%)。【结论】槟榔江水牛与其他牛科物种的胃型溶菌酶具有相似的功能。 展开更多
关键词 槟榔江水牛 溶菌酶c基因 皱胃 生物信息学分析 基因功能
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曝气条件下进水C/N对水平潜流型人工湿地脱氮效果和氮转化功能微生物丰度的影响 被引量:5
14
作者 潘福霞 来晓双 +1 位作者 王树志 王惠 《环境工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1386-1394,共9页
为提高潜流型人工湿地在低C/N条件下的污水处理效果,考察了在植物生长旺盛期曝气条件下不同C/N(0.9∶1、2∶1、4∶1)对污水的脱氮效率、微生物群落结构和功能微生物丰度的影响。结果表明:NO3-去除率为57.48%~83.19%且随C/N的增加而增加;... 为提高潜流型人工湿地在低C/N条件下的污水处理效果,考察了在植物生长旺盛期曝气条件下不同C/N(0.9∶1、2∶1、4∶1)对污水的脱氮效率、微生物群落结构和功能微生物丰度的影响。结果表明:NO3-去除率为57.48%~83.19%且随C/N的增加而增加;当C/N为2和4时,可提高COD和TN的去除率,COD和TN去除率均达到80%以上。当C/N为2和4处理组的nirK、nosZ、厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因丰度均显著高于当C/N为0.9时的处理组(P<0.05);nxrA基因丰度随C/N增加而降低。物种数、Shannon-Wiener指数、Simpson指数、Chao1指数均随C/N的增加而增加。在不同处理组中相对丰度较高的细菌均为变形菌门和酸杆菌门,其占总细菌序列的62.89%~69.66%。对细菌群落结构进行PCoA分析,发现不同处理组间微生物群落组成结构差异较大。由此可见,在植物生长旺盛期,调节C/N为2和4均可显著提高污水处理效果,曝气和添加碳源强化措施可通过改变基质中氮转化功能微生物丰度和微生物群落结构来提高低C/N污水处理效率。 展开更多
关键词 脱氮效率 曝气 c/N污水 功能基因丰度 微生物群落结构
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慢性化脓性中耳炎真菌感染危险因素及与Dectin-1基因多态性的关联 被引量:7
15
作者 董楠楠 曹绿红 +3 位作者 骆云珍 陈晓红 黄世斌 李小四 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期879-883,共5页
目的 分析慢性化脓性中耳炎真菌感染危险因素及与树突状细胞相关C型凝集素-1(Dectin-1)基因多态性的关联。方法 回顾性分析2017年8月-2021年8月嘉兴市第二医院收治的慢性化脓性中耳炎患者100例病例资料,根据是否感染真菌分为感染组38例... 目的 分析慢性化脓性中耳炎真菌感染危险因素及与树突状细胞相关C型凝集素-1(Dectin-1)基因多态性的关联。方法 回顾性分析2017年8月-2021年8月嘉兴市第二医院收治的慢性化脓性中耳炎患者100例病例资料,根据是否感染真菌分为感染组38例和非感染组62例。比较两组患者临床一般资料,采用Logistic多因素回归分析慢性化脓性中耳炎发生真菌感染的危险因素,采用流式细胞仪检测外周血CD_(3)^(+)、CD_(4)^(+)、CD_(8)^(+)和CD_(4)^(+)/CD_(8)^(+)比值,免疫比浊法检测患者血清免疫球蛋白(Ig)G、IgA、IgM,限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)检测Dectin-1基因型分布。结果 慢性化脓性中耳炎合并真菌感染患者年龄>60岁比例、既往存在中耳炎史比例、合并糖尿病比例、上呼吸道感染比例、变应性鼻炎比例和抗菌药物滥用比例均高于非感染组患者(P<0.05),Logistic回归分析结果显示,年龄、滥用抗菌药物和合并糖尿病是慢性化脓性中耳炎患者发生真菌感染的危险因素(P<0.05)。感染组患者免疫球蛋白(IgG、IgA、IgM)和T淋巴细胞亚群(CD_(4)^(+)、CD_(8)^(+)和CD_(4)^(+)/CD_(8)^(+)比值)低于非感染组(P<0.05)。两组患者基因型及等位基因分布比较,无统计学差异。感染组携带Dectin-1等位基因型(GG和TT)患者血清免疫球蛋白(IgA、IgM)和T淋巴细胞亚群(CD_(4)^(+)、CD_(8)^(+)和CD_(4)^(+)/CD_(8)^(+)比值)水平低于携带GT患者(P<0.05)。结论 慢性化脓性中耳炎患者携带Dectin-1等位基因患者可能免疫功能低下,可影响疾病的发展。 展开更多
关键词 慢性化脓性中耳炎 真菌感染 易感性 危险因素 树突状细胞相关c型凝集素-1 基因多态性 免疫功能
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结合基因表达式编程与空间模糊聚类的图像分割 被引量:10
16
作者 李婷婷 江朝晖 +1 位作者 饶元 张晓明 《中国图象图形学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期575-583,共9页
目的针对模糊C-均值聚类图像分割方法存在的对初始值敏感及抗噪性能差的问题,提出一种结合基因表达式编程与空间模糊聚类的图像分割方法。方法首先,利用基因表达式编程算法对图像进行初次分割,即将聚类中心编码成染色体,通过适应度评价... 目的针对模糊C-均值聚类图像分割方法存在的对初始值敏感及抗噪性能差的问题,提出一种结合基因表达式编程与空间模糊聚类的图像分割方法。方法首先,利用基因表达式编程算法对图像进行初次分割,即将聚类中心编码成染色体,通过适应度评价引导搜索获得优化的聚类中心;然后在隶属度计算中引入空间函数,以初次分割结果作为初始值,使用空间模糊聚类对图像进行二次分割。结果对加噪的合成图像和Berkeley图像的分割实验显示,本文方法在聚类划分系数(VPC)、聚类划分熵(VPE)和峰值信噪比(PSNR)等评价指标上总体性能优于经典的模糊C-均值聚类和空间模糊C-均值聚类分割算法,其中VPC值平均高出0.062 4和0.061 1,VPE值平均降低0.117 0和0.101 1,而PSNR值平均提升了约13.312 1 d B和3.308 4 d B;在对Berkeley图像库中的6幅图片的分割实验显示,本文方法对图像分割的VPC值均在0.93以上,相比两种对比方法平均提高0.157 6和0.013 3,VPE值保持在0.1附近,均低于对比方法,PSNR值平均提高2.896 3 d B和1.934 4 d B;在多目标分割实验上,随着聚类数目增加,3种方法的分割性能均有下降,但本文方法性能曲线最为平缓,受聚类数目的影响最小。虽然本文方法所需的运行时间略有增加,但求解所需的迭代次数却极大地减少。结论本文提出的图像分割方法具有很强的抗噪性、更高的分割精度和稳定性,适用于需要更精确结果、对时间要求不高的分割场景。 展开更多
关键词 图像分割 模糊c均值 基因表达式编程 聚类 空间函数
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基于分子生态学网络探究西藏草地放牧对土壤微生物群落的影响(英文) 被引量:11
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作者 孙欣 汪诗平 +2 位作者 林巧燕 周集中 杨云锋 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1818-1831,共14页
【目的】揭示西藏地区放牧对在功能基因层面上的微生物相互作用的影响。【方法】利用最近发明的网络工具(基于随机矩阵理论的分子生态学网络)分别在对照和放牧条件下分析基因芯片中碳循环和氮循环基因。【结果】碳和氮循环基因网络在对... 【目的】揭示西藏地区放牧对在功能基因层面上的微生物相互作用的影响。【方法】利用最近发明的网络工具(基于随机矩阵理论的分子生态学网络)分别在对照和放牧条件下分析基因芯片中碳循环和氮循环基因。【结果】碳和氮循环基因网络在对照和放牧条件下都具有无标度、小世界、模块性和层次性的拓扑学特征。放牧条件下的网络关键基因(模块枢纽和连通者)与对照显著不同。放牧导致网络变得小而紧密,暗示环境压力的存在。地上植物生物量与微生物基因网络显著相关(P=0.001),证实了研究样地地上植物与地下微生物紧密相连。【结论】放牧显著改变了西藏草地在功能基因层面上的微生物相互作用关系。 展开更多
关键词 分子生态学网络 土壤微生物相互作用 功能基因 西藏放牧 碳氮循环 基因芯片
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4个与营养代谢相关基因对小鼠的血清生化指标的影响
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作者 敖红 许兰文 +1 位作者 杨萍 金玫蕾 《实验动物与比较医学》 CAS 2007年第3期186-189,共4页
目的研究4个与营养代谢相关基因(DL、Tr、Pe、P3)对BALB/c小鼠的血液生化指标的影响。方法将4个基因的反义核酸微量定量注入小鼠侧脑室。设反义核酸实验组、随机序列核酸对照组和生理盐水对照组3组;3次注射后于第4天取血清进行生化指标... 目的研究4个与营养代谢相关基因(DL、Tr、Pe、P3)对BALB/c小鼠的血液生化指标的影响。方法将4个基因的反义核酸微量定量注入小鼠侧脑室。设反义核酸实验组、随机序列核酸对照组和生理盐水对照组3组;3次注射后于第4天取血清进行生化指标测定。结果DL和Tr实验组与对照组分别在6项指标上有显著性差异,Pe实验组、P3实验组与对照组分别有4项和3项指标有显著性差异。结论3个反义核酸实验组(DL、Tr和P3)BABL/c小鼠的血中甘油三酯含量都显著高于对照组,尤其是Tr反义核酸实验组的胆固醇含量也显著高于对照组,且都超出正常值范围,进一步证明Tr基因与脂类代谢有一定的相关性。另外上述3个反义核酸实验组(DL、Tr和P3)的血中葡萄糖含量也明显高于对照组并超出正常值范围,说明这些基因还可能与糖代谢相关。 展开更多
关键词 反义核酸 BALB/c小鼠 血液生化 基因功能
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保护性耕作对东北黑土微生物碳循环功能基因的影响 被引量:10
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作者 王倩 刘红文 +6 位作者 贾淑霞 申建国 陈学文 张士秀 张延 高燕 梁爱珍 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期4760-4771,共12页
土壤微生物既参与土壤有机碳的分解也是土壤有机碳转化和固定的驱动者,是影响土壤碳循环和有机碳稳定性的关键因素。然而,保护性耕作(秸秆还田)如何通过调节土壤微生物碳循环功能基因组成来影响土壤CO_(2)释放的机理尚不明确。因此,依... 土壤微生物既参与土壤有机碳的分解也是土壤有机碳转化和固定的驱动者,是影响土壤碳循环和有机碳稳定性的关键因素。然而,保护性耕作(秸秆还田)如何通过调节土壤微生物碳循环功能基因组成来影响土壤CO_(2)释放的机理尚不明确。因此,依托中国科学院东北地理与农业生态研究所长春保护性耕作观测站,借助鸟枪法宏基因组测序技术,分析了玉米连作系统不同耕作方式(免耕(NT)、秋翻(MP)以及常规耕作(CT))对土壤CO_(2)释放速率、碳水化合物活性酶(CAZy)、碳循环功能基因(碳固定、甲烷代谢以及碳水化合物代谢)组成的影响。研究表明:基于生长季节土壤CO_(2)释放速率6年平均值分析发现,生长季前期免耕土壤的平均CO_(2)释放速率显著低于秋翻和常规耕作,分别比秋翻低28%(5月份)、11%(6月份)和23%(7月份);比常规耕作低31%(5月份)、19%(6月份)和7%(7月份)。基于CAZy数据库注释结果,发现耕作处理显著影响一些糖苷水解酶(如GH102、GH5_38和GH13_17)、糖基转移酶(如GT39)和多糖裂解酶(如PL17和PL5_1)的基因丰度,与常规耕作相比,秸秆还田的免耕和秋翻处理的这些差异基因的相对丰度较高。基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库注释结果,发现耕作方式显著影响土壤碳循环功能基因组成(Adonis,多元方差分析,R^(2)=0.45;P=0.006),且免耕处理土壤的碳固定、甲烷代谢以及碳水化合物代谢功能基因组成不同于常规耕作和秋翻处理,单独聚为一类。免耕土壤上调的碳固定功能基因的相对丰度(所有上调功能基因相对丰度的平均值)分别比常规耕作和秋翻高17%和11%,而下调的2个功能基因(K01007和K00170)的丰度分别低19%(CT)、21%(MP)和14%(CT)、17%(MP)。免耕土壤上调的甲烷代谢基因相对丰度分别较常规耕作和秋翻高15%和10%;下调基因的丰度分别低13%(CT)和11%(MP)。免耕土壤上调的碳水化合物代谢功能基因丰度较常规耕作和秋翻高23%和14%;下调的基因丰度分别低25%(CT)和18%(MP)。冗余分析(db-RDA)表明土壤容重及土壤水溶性有机碳(DOC)是驱动土壤碳循环功能基因组成差异的主要因子(P<0.05),且免耕土壤上调的碳固定功能基因(K00625、K01676、K09709、K00925和K14470等)、甲烷代谢基因(K03520、K00830、K10713、K15633和K00625等)和碳水化合物代谢功能基因(K00886、K00830、K01676、K00117和K00114等)与土壤DOC、容重或含水量呈显著正相关。此外,研究发现土壤CO_(2)释放速率与土壤碳循环功能基因组成显著相关(R^(2)=0.80;P<0.01),尤其是与一些碳水化合物代谢功能基因显著相关。这些结果说明免耕处理通过影响土壤理化性质改变土壤碳循环过程,且推断免耕秸秆还田和减少干扰的叠加效应通过调节碳循环功能基因组成来提高土壤固碳潜力。 展开更多
关键词 耕作方式 碳循环功能基因 土壤cO_(2)排放 宏基因组
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Attenuation of myocardial injury due to oxygen free radicals(OFR) by pretreatment with OFR or calcitonin gene-related peptide 被引量:7
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作者 陶则伟 李元建 邓汉武 《中国药理学报》 CSCD 1997年第4期312-316,共5页
目的:研究氧自由基(OFR)及降钙素基因相关肽(CGRP)预处置对OFR所致离体大鼠心脏损伤的拮抗作用.方法:Langendorf法灌流心脏,电解KH液产生OFR.结果:CGRP或OFR预处置减轻OFR所致心脏收缩... 目的:研究氧自由基(OFR)及降钙素基因相关肽(CGRP)预处置对OFR所致离体大鼠心脏损伤的拮抗作用.方法:Langendorf法灌流心脏,电解KH液产生OFR.结果:CGRP或OFR预处置减轻OFR所致心脏收缩功能下降,冠脉流量减少和肌酸激酶(CK)释放增加.蛋白激酶C(PKC)抑制剂H7可取消OFR预处置的心脏保护作用(对照组,OFR损伤组,OFR预处置组,H7加OFR预处置组及H7组的CK释放量分别是110±7,215±23,169±14,240±30,113±19U·L-1).结论:OFR或CGRP预处置对OFR所致心肌损伤具有拮抗作用,该作用与PKC激活有关. 展开更多
关键词 氧自由基 降钙素 心肌损伤
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