【目的】在前期感染C型产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens type C,C.perfringens type C)攻毒组及对照组仔猪回肠组织高通量测序结果的基础上,为研究猪miR-96-5p在不同组织中的表达,分析其关键靶基因在仔猪感染C型产气荚膜梭菌导致...【目的】在前期感染C型产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens type C,C.perfringens type C)攻毒组及对照组仔猪回肠组织高通量测序结果的基础上,为研究猪miR-96-5p在不同组织中的表达,分析其关键靶基因在仔猪感染C型产气荚膜梭菌导致腹泻过程中的调控作用.【方法】采用RT-qPCR方法检测miR-96-5p在仔猪各组织的表达量,构建组织表达谱,并检测对照组(IC)、易感组(IS)和耐受组(IR)回肠组织中miR-96-5p及其靶基因的表达量;利用生物信息学软件对miR-96-5p进行保守性分析、靶基因预测、GO功能和KEGG信号通路富集分析.【结果】miR-96-5p成熟体序列在不同物种间高度保守;预测到靶基因179个;预测获得与免疫炎症反应相关的信号通路有ErbB和MAPK;筛选到与仔猪抵抗C型产气荚膜梭菌感染相关的靶基因有FOXO1、MAP2K1;RT-qPCR结果显示,miR-96-5p在回肠组织中高表达,且其在IC、IS、IR组回肠组织中的表达量与高通量测序结果趋势一致,其靶基因FOXO1、MAP2K1在IR和IS组的表达量均极显著低于IC组(P<0.01),IS组极显著低于IR组(P<0.01).【结论】miR-96-5p可能靶向调控FOXO1、MAP2K1参与仔猪感染C型产气荚膜梭菌性腹泻的过程.展开更多
文摘【目的】在前期感染C型产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens type C,C.perfringens type C)攻毒组及对照组仔猪回肠组织高通量测序结果的基础上,为研究猪miR-96-5p在不同组织中的表达,分析其关键靶基因在仔猪感染C型产气荚膜梭菌导致腹泻过程中的调控作用.【方法】采用RT-qPCR方法检测miR-96-5p在仔猪各组织的表达量,构建组织表达谱,并检测对照组(IC)、易感组(IS)和耐受组(IR)回肠组织中miR-96-5p及其靶基因的表达量;利用生物信息学软件对miR-96-5p进行保守性分析、靶基因预测、GO功能和KEGG信号通路富集分析.【结果】miR-96-5p成熟体序列在不同物种间高度保守;预测到靶基因179个;预测获得与免疫炎症反应相关的信号通路有ErbB和MAPK;筛选到与仔猪抵抗C型产气荚膜梭菌感染相关的靶基因有FOXO1、MAP2K1;RT-qPCR结果显示,miR-96-5p在回肠组织中高表达,且其在IC、IS、IR组回肠组织中的表达量与高通量测序结果趋势一致,其靶基因FOXO1、MAP2K1在IR和IS组的表达量均极显著低于IC组(P<0.01),IS组极显著低于IR组(P<0.01).【结论】miR-96-5p可能靶向调控FOXO1、MAP2K1参与仔猪感染C型产气荚膜梭菌性腹泻的过程.
