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甜菜 BvHSP20 基因家族的鉴定与生物信息学分析
1
作者
仲维婷
王皓
+4 位作者
张琼
邢悦楠
兴旺
周远航
刘大丽
《分子植物育种》
北大核心
2026年第1期40-47,共8页
本研究通过Ensemble Plants及NCBI在线网站获取甜菜全基因组数据,利用生物信息学软件Cell-PLoc 2.0、ProtParam tool、MEGA11等对BvHSP20基因家族成员的理化性质等进行分析。共鉴定出41个甜菜BvHSP20基因家族成员,平均氨基酸数203.56,...
本研究通过Ensemble Plants及NCBI在线网站获取甜菜全基因组数据,利用生物信息学软件Cell-PLoc 2.0、ProtParam tool、MEGA11等对BvHSP20基因家族成员的理化性质等进行分析。共鉴定出41个甜菜BvHSP20基因家族成员,平均氨基酸数203.56,平均分子量22887.84 Da。蛋白多数为分布于叶绿体和细胞核上的不稳定亲水性蛋白。多序列比对发现BvHSP20基因家族中的基因相似性较高。顺式作用元件分析表明甜菜BvHSP20基因家族除包含响应光信号、能量信号的启动子外,还受脱落酸、水杨酸等激素信号诱导。根据结果预测BvHSP20基因家族广泛参与植物应激反应及生长发育。在顺式作用元件分析中发现该基因家族成员中包含与植物生长发育相关及响应非生物逆境胁迫相关的作用元件,推测其在响应应激反应时发挥一定功能。本研究为进一步探究甜菜BvHSP20基因家族的生物学功能提供基础。
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关键词
甜菜
bvhsp20
小分子热激蛋白
基因家族
生物信息学分析
原文传递
题名
甜菜 BvHSP20 基因家族的鉴定与生物信息学分析
1
作者
仲维婷
王皓
张琼
邢悦楠
兴旺
周远航
刘大丽
机构
黑龙江大学国家甜菜种质中期库
黑龙江大学现代农业与生态环境学院
新疆农业科学院玛纳斯农业试验站
出处
《分子植物育种》
北大核心
2026年第1期40-47,共8页
基金
国家糖料产业技术体系项目(甜菜种质资源鉴定与新种质创制)(CARS-170102)
内蒙古自治区“揭榜挂帅”项目“甜菜优异种质创制与适宜机械化作业品种选育”(2022JBGS0029)
黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划(UNPYSCT-2020014)共同资助。
文摘
本研究通过Ensemble Plants及NCBI在线网站获取甜菜全基因组数据,利用生物信息学软件Cell-PLoc 2.0、ProtParam tool、MEGA11等对BvHSP20基因家族成员的理化性质等进行分析。共鉴定出41个甜菜BvHSP20基因家族成员,平均氨基酸数203.56,平均分子量22887.84 Da。蛋白多数为分布于叶绿体和细胞核上的不稳定亲水性蛋白。多序列比对发现BvHSP20基因家族中的基因相似性较高。顺式作用元件分析表明甜菜BvHSP20基因家族除包含响应光信号、能量信号的启动子外,还受脱落酸、水杨酸等激素信号诱导。根据结果预测BvHSP20基因家族广泛参与植物应激反应及生长发育。在顺式作用元件分析中发现该基因家族成员中包含与植物生长发育相关及响应非生物逆境胁迫相关的作用元件,推测其在响应应激反应时发挥一定功能。本研究为进一步探究甜菜BvHSP20基因家族的生物学功能提供基础。
关键词
甜菜
bvhsp20
小分子热激蛋白
基因家族
生物信息学分析
Keywords
Beta vulgaris L.
bvhsp20
Small heat-shock protein(sHSP))
Gene family
Bioinformatics analysis
分类号
S566.3 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甜菜 BvHSP20 基因家族的鉴定与生物信息学分析
仲维婷
王皓
张琼
邢悦楠
兴旺
周远航
刘大丽
《分子植物育种》
北大核心
2026
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