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水稻稻瘟病抗性基因Bsr-d1功能标记的开发和利用 被引量:17
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作者 王军 赵婕宇 +7 位作者 许扬 范方军 朱金燕 李文奇 王芳权 费云燕 仲维功 杨杰 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1612-1620,共9页
稻瘟病是危害水稻最严重的病害之一,选育抗病品种是防治该病害最有效的方法。Bsr-d1是对稻瘟病菌具有广谱抗性的一个重要基因。为提高Bsr-d1基因在育种中的选择效率,根据Bsr-d1与其感病等位基因bsr-d1在功能区域存在的单核苷酸差异,设... 稻瘟病是危害水稻最严重的病害之一,选育抗病品种是防治该病害最有效的方法。Bsr-d1是对稻瘟病菌具有广谱抗性的一个重要基因。为提高Bsr-d1基因在育种中的选择效率,根据Bsr-d1与其感病等位基因bsr-d1在功能区域存在的单核苷酸差异,设计和筛选出Bsr-d1基因不同类型的基因功能标记CAPs5-1和3Bsr-d1/3bsr-d1,结合测序分析验证,可准确鉴定出Bsr-d1的不同基因型。利用3Bsr-d1/3bsr-d1对34份籼稻品种、江苏历年来主要推广的110份粳稻品种、其他省份的13份粳稻品种、148份太湖流域地方粳稻资源和19份太湖流域地方籼稻资源进行了Bsr-d1基因型检测,筛选到携带Bsr-d1基因的籼型资源11份,271份粳型资源中均不携带Bsr-d1基因,这也说明Bsr-d1主要分布在籼型水稻资源中,在粳型资源中几乎不存在。本研究为Bsr-d1基因的育种利用和分子标记辅助选择奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 稻瘟病 bsr-d1 功能标记 CAPS 等位基因特异PCR
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聚合R基因Pigm和非R基因bsr-d1改良水稻稻瘟病抗性 被引量:2
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作者 王亚 王越涛 +4 位作者 申关望 王付华 王生轩 白涛 尹海庆 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2022年第5期157-165,共9页
综合利用CRISPR/Cas9基因编辑技术和基因芯片技术,聚合主效R基因Pigm和非R基因bsr-d1,以改良优良食味水稻品种水晶3号的稻瘟病抗性。首先利用CRISPR/Cas9基因编辑系统,以Bsr-d1为靶基因构建重组表达载体并通过农杆菌介导法转化水晶3号,... 综合利用CRISPR/Cas9基因编辑技术和基因芯片技术,聚合主效R基因Pigm和非R基因bsr-d1,以改良优良食味水稻品种水晶3号的稻瘟病抗性。首先利用CRISPR/Cas9基因编辑系统,以Bsr-d1为靶基因构建重组表达载体并通过农杆菌介导法转化水晶3号,筛选获得无T-DNA元件的bsr-d1纯合突变体,包括T插入、G插入、GA缺失、CGCA缺失和CGCAGA缺失5种突变类型。以无T-DNA成分的bsr-d1纯合突变体为母本、以携带Pigm基因的金玉1号为父本杂交、回交、自交,并利用分子育种芯片同时进行Pigm基因和背景辅助选择,最终获得抗病基因(同时携带bsr-d1和Pigm基因)纯合,且背景回复率均在96%以上的水晶3号改良株系(SJ3-G1、SJ3-G2、SJ3-G3、SJ3-G4、SJ3-G5)。稻瘟病抗性鉴定结果表明,各改良株系对稻瘟病生理小种GUY11的叶瘟抗性与野生型相比均显著提高;接种稻瘟病菌后,改良株系叶片中POD活性显著低于野生型对照,H_(2)O_(2)含量则显著高于野生型对照。通过CRISPR/Cas9基因编辑技术结合基因芯片技术获得了同时携带bsr-d1和Pigm基因的抗稻瘟病水晶3号改良系。 展开更多
关键词 水稻 Pigm bsr-d1 稻瘟病抗性 CRISPR/Cas9
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广谱抗稻瘟病基因BSR-d1在75份北方粳稻品种中的多态性分布与表达分析 被引量:1
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作者 陈晓军 惠建 +4 位作者 马洪文 白海波 马静 马斯霜 李树华 《种子》 北大核心 2021年第11期113-116,131,共5页
稻瘟病是危害水稻最严重的病害之一,利用分子标记选育抗病品种是防治该病害最有效、最经济的方法。BSR-d1基因是对稻瘟病菌具有广谱抗性的一个重要基因。本研究利用PCR直接扩增的方法,研究广谱抗稻瘟病基因BSR-d1启动子的序列结构变异,... 稻瘟病是危害水稻最严重的病害之一,利用分子标记选育抗病品种是防治该病害最有效、最经济的方法。BSR-d1基因是对稻瘟病菌具有广谱抗性的一个重要基因。本研究利用PCR直接扩增的方法,研究广谱抗稻瘟病基因BSR-d1启动子的序列结构变异,同时验证其变异对靶基因的调控。结果表明,在75份北方粳稻品种中,仅有3份粳稻品种有BSR-d1基因的有利等位基因分布,此基因的突变降低过氧化物酶前体Os05g04470,Os10g39170基因的表达。 展开更多
关键词 粳稻 稻瘟病 bsr-d1 多态 定量表达
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利用CRISPR/Cas9技术获得水稻恢复系Bsr-d1基因突变体 被引量:5
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作者 卿冬进 邓国富 +6 位作者 戴高兴 高利军 黄娟 高菊 潘英华 周维永 梁海福 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第16期5343-5350,共8页
为研究水稻抗稻瘟病基因Bsr-d1在杂交水稻恢复系中的功能,我们利用CRISPR/Cas9定点基因编辑方法,设计2个敲除靶标位点,构建了Bsr-d1基因编辑载体,并通过农杆菌介导的方法转化水稻恢复系品种‘GH998’,成功获得了转基因植株,并在T1代筛选... 为研究水稻抗稻瘟病基因Bsr-d1在杂交水稻恢复系中的功能,我们利用CRISPR/Cas9定点基因编辑方法,设计2个敲除靶标位点,构建了Bsr-d1基因编辑载体,并通过农杆菌介导的方法转化水稻恢复系品种‘GH998’,成功获得了转基因植株,并在T1代筛选到4个无转基因成分的纯合突变株系。纯合突变株系有4种突变类型,包括第199号碱基处缺失17个碱基、第212号碱基处缺失4个碱基、第216号碱基处插入1个碱基、第216号碱基处插入2个碱基突变类型。通过蛋白序列分析,发现纯合突变株系都存在移码现象导致氨基酸变化并提前终止翻译。本研究成功利用CRISPR/Cas9基因编辑方法敲除水稻恢复系‘GH998’中Bsr-d1基因,获得无转基因成分的纯合突变株系,为进一步研究Bsr-d1基因在杂交水稻上的功能提供了理论依据和品种资源。 展开更多
关键词 水稻 稻瘟病 bsr-d1 基因编辑技术 CRISPR/Cas9
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中国部分水稻品种Bsr-d1启动子稻瘟病持久抗性位点序列分析 被引量:1
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作者 刘畅媛 孙一丁 +3 位作者 马继琼 杨奕 郭怡卿 许明辉 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第13期4331-4337,共7页
为发掘稻瘟病种质资源持久抗性基因Bsr-d1,本研究对来源中国的210份稻种Bsr-d1基因启动子功能片段511个碱基序列进行了比对分析。结果发现品种间存在18个变异位点28个碱基的差异,根据差异所有品种可归为7种单倍型,其中H4和H6为优势单倍... 为发掘稻瘟病种质资源持久抗性基因Bsr-d1,本研究对来源中国的210份稻种Bsr-d1基因启动子功能片段511个碱基序列进行了比对分析。结果发现品种间存在18个变异位点28个碱基的差异,根据差异所有品种可归为7种单倍型,其中H4和H6为优势单倍型,分别占测试品种70.48%和23.81%;云南地方品种拥有H1、H2、H3、H4、H5、H6等6种单倍型,优势单倍型为H4(51.95%)、H6(35.06%);选育品种有3种单倍型,分别为H4、H6、H7、H6为优势单倍型,地方品种单倍型较选育品种丰富。其他地区品种仅发现H4(1.52%)和H6(98.48%)2种单倍型,云南省单倍型更为多样丰富。7种单倍型中仅H1单倍型(占1.43%)携带抗性位点,仅3个云南地方品种出现该单倍型,说明中国地方品种和选育品种中均缺乏Bsr-d1稻瘟病持久抗性基因。本研究结果为寻找和发掘持久抗稻瘟病基因Bsr-d1提供了线索。 展开更多
关键词 种质资源 bsr-d1 持久抗性 单倍型
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Molecular Evolution of Rice Blast Resistance Gene bsr-d1 被引量:3
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作者 LI Wei ZHANG Mengchen +3 位作者 YANG Yaolong WENG Lin HU Peisong WEI Xinghua 《Rice science》 SCIE CSCD 2024年第6期700-711,共12页
Rice blast,caused by the fungus Magnaporthe oryzae,reduces rice yields by 10%to 35%.Incorporating blast resistance genes into breeding programs is an effective strategy to combat this disease.Understanding the genetic... Rice blast,caused by the fungus Magnaporthe oryzae,reduces rice yields by 10%to 35%.Incorporating blast resistance genes into breeding programs is an effective strategy to combat this disease.Understanding the genetic variants that confer resistance is crucial to this strategy.The gene Bsr-d1 encodes a C2H2-like transcription factor,and its recessive allele confers broad-spectrum resistance against infections by various strains of M.oryzae.In this study,we investigated the molecular evolution of the rice blast resistance gene bsr-d1 in a representative population consisting of 827 cultivated and wild rice accessions.Our results revealed that wild rice exhibited significantly higher nucleotide diversity,with polymorphic regions primarily concentrated in the promoter region,in contrast to indica and japonica rice varieties.The Bsr-d1 gene displayed significant differentiation between indica and japonica rice varieties,with the bsr-d1 resistance allele being unique to indica rice.Haplotype network and phylogenetic analyses suggested that the bsr-d1 resistance allele most likely originated from Oryza nivara in the region adjacent to the Indian Peninsula and the Indochina Peninsula.Moreover,we explored the utilization of bsr-d1 resistance alleles in China and designed a pair of DNA primers based on the polymorphic sites for the detection of the bsr-d1 resistance gene.In summary,our study uncovering the origin and evolution of bsr-d1 will enhance our understanding of resistance gene variation and expedite the resistance breeding process. 展开更多
关键词 broad-spectrum resistance bsr-d1 gene evolution Magnaporthe oryzae resistance breeding
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A natural allele of Bsr-d1 in rice confers broad-spectrum blast resistance
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《Science Foundation in China》 CAS 2017年第3期7-7,共1页
Subject Code:C14With support from the National Natural Science Foundation of China,a collaborative research group led by Prof.Chen Xuewei(陈学伟)of the Rice Research Institute,Sichuan Agricultural University,published... Subject Code:C14With support from the National Natural Science Foundation of China,a collaborative research group led by Prof.Chen Xuewei(陈学伟)of the Rice Research Institute,Sichuan Agricultural University,published an article entitled“A natural allele of a transcription factor in rice confers broad-spectrum 展开更多
关键词 A natural allele of bsr-d1 in rice confers broad-spectrum blast resistance
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棉花四个C2H2锌指蛋白基因的克隆与表达分析 被引量:3
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作者 周垚均 任艳萍 +3 位作者 代培红 刘超 刘晓东 李月 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第13期4216-4223,共8页
水稻广谱抗病基因Bsr-d1编码C2H2型锌指蛋白,本研究基于此通过RT-PCR技术从棉花中克隆4个与水稻Bsr-d1同源的C2H2型锌指蛋白基因并对其进行了生物信息学分析和表达分析,结果表明这些基因氨基酸序列与Bsr-d1的一致性为25%-35.7%,故命名为... 水稻广谱抗病基因Bsr-d1编码C2H2型锌指蛋白,本研究基于此通过RT-PCR技术从棉花中克隆4个与水稻Bsr-d1同源的C2H2型锌指蛋白基因并对其进行了生物信息学分析和表达分析,结果表明这些基因氨基酸序列与Bsr-d1的一致性为25%-35.7%,故命名为GhBsr-d1L1-GhBsr-d1L4;GhBsr-d1Ls基因的开放阅读框大小为663-813 bp,编码的氨基酸数为220-270,蛋白质分子量为23.82-28.64 kD,理论等电点为7.22-8.56,不稳系数为47.7-67.17,亲水平均数为-0.755--0.544,无信号肽和跨膜结构域;GhBsr-d1Ls均定位于细胞核,编码N端的保守L-box结构域,C2H2型锌指结构域以及C端的转录抑制结构域EAR/DLN-box,属于陆地棉中第Ⅱ类C2H2型锌指蛋白亚家族。系统发育树分析表明,GhBsr-d1L1与GhBsr-d3L3的遗传距离最近,GhBsr-d1L2与大豆SCOF-1遗传距离最近,GhBsr-d1L4与长果种黄麻的同源基因遗传距离最近。荧光定量PCR分析表明,GhBsr-d1Ls基因在根、下胚轴及真叶中均表达,但表达量各有差异,同时在不同程度上GhBsr-d1Ls均受到大丽轮枝菌的诱导。推测GhBsr-d1Ls基因可能在棉花响应大丽轮枝菌时起重要作用。 展开更多
关键词 棉花 bsr-d1 C2H2锌指蛋白 基因克隆 表达分析
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