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苏云金芽胞杆菌BkdR和CcpA对bkd基因簇的转录调控
1
作者 温继龙 彭琦 +2 位作者 赵欣 张杰 宋福平 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期2229-2239,共11页
【目的】通过分析苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis,Bt)转录调控因子BkdR和多效调控因子CcpA对亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸代谢基因簇bkd的转录调控,明确bkd基因簇的转录调控机制。【方法】通过β-半乳糖苷酶活性测定分析bkd基因簇... 【目的】通过分析苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis,Bt)转录调控因子BkdR和多效调控因子CcpA对亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸代谢基因簇bkd的转录调控,明确bkd基因簇的转录调控机制。【方法】通过β-半乳糖苷酶活性测定分析bkd基因簇启动子的诱导转录活性,采用同源重组技术敲除Bt HD73菌株的ccpA基因,通过融合His标签的方法在大肠杆菌中表达纯化BkdR和CcpA蛋白,通过凝胶阻滞实验明确BkdR和CcpA蛋白与bkd基因簇启动子的结合作用。【结果】亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸可诱导bkd基因簇启动子Pptb的转录活性。Pptb的诱导活性在bkdR突变体中明显降低,而在ccpA突变体中明显上升。BkdR和CcpA蛋白与Pptb均有结合作用。【结论】bkd基因簇的转录活性受BkdR正调控,而受CcpA负调控。 展开更多
关键词 苏云金芽胞杆菌 bkdr CCPA 转录调控
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苏云金芽胞杆菌HD-73菌株sigL基因突变体的特性分析 被引量：4
2
作者 彭琦 朱莉 +3 位作者 宋福平 张杰 高继国 黄大昉 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1147-1153,共7页
【目的】通过分析苏云金芽胞杆菌sigL基因突变体的特征,进一步明确sigL基因在苏云金芽胞杆菌中的功能。【方法】测定了苏云金芽胞杆菌HD-73菌株,sigL基因缺失突变菌株和互补菌株在不同营养成分的培养基中的生长曲线以及在不同氮源条件... 【目的】通过分析苏云金芽胞杆菌sigL基因突变体的特征,进一步明确sigL基因在苏云金芽胞杆菌中的功能。【方法】测定了苏云金芽胞杆菌HD-73菌株,sigL基因缺失突变菌株和互补菌株在不同营养成分的培养基中的生长曲线以及在不同氮源条件下的生长情况。分别将调控aco操纵子(编码3-羟基丁酮脱氢酶系统)的转录调节基因acoR和调控bkd操纵子(编码催化支链脂肪酸合成的酶系统)的转录调节基因bkdR的启动子与lacZ基因融合,并转入出发菌株和sigL突变体中,测定β-半乳糖苷酶的活性。【结果】sigL突变体不能利用精氨酸、脯氨酸、缬氨酸、异亮氨酸、谷氨酰胺、苯丙氨酸、蛋氨酸、色氨酸为唯一的氮源;β-半乳糖苷酶的活性分析表明:在sigL突变体中acoR基因和bkdR基因的启动子活性降低。序列比对分析表明:Bt中的AcoR和BkdR的蛋白结构域与依赖于σL的转录调节因子的保守序列相似。【结论】苏云金芽胞杆菌中sigL基因的缺失可能阻碍了某些重要碳、氮源参与的代谢途径。在Bt中AcoR和BkdR是依赖于σL的转录调节因子。 展开更多
关键词 苏云金芽胞杆菌 sigL基因突变体 代谢途径 转录调节因子AcoR、bkdr
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基于Heritrix的网络爬虫研究与应用 被引量：4
3
作者 刘高军 夏景隆 《软件导刊》 2013年第5期123-125,共3页
主要介绍了主题搜索引擎、网络爬虫的基本概念和Heritrix系统的体系结构,分析了Heritrix的工作流程,在Heritrix框架的基础上进行扩展和优化。通过一个实例,实现了对京东网图书信息的抓取,为建立面向图书信息的垂直搜索引擎提供了网页信... 主要介绍了主题搜索引擎、网络爬虫的基本概念和Heritrix系统的体系结构,分析了Heritrix的工作流程,在Heritrix框架的基础上进行扩展和优化。通过一个实例,实现了对京东网图书信息的抓取,为建立面向图书信息的垂直搜索引擎提供了网页信息资源。 展开更多
关键词 网络爬虫 主题搜索引擎 HERITRIX URL地址去重 bkdrHash算法
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苏云金芽胞杆菌bkd基因簇的转录调控 被引量：3
4
作者 王冠男 彭琦 +3 位作者 郑庆云 李杰 张杰 宋福平 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1129-1137,共9页
【目的】通过分析苏云金芽胞杆菌bkd基因簇的转录调控和bkdR突变体的表型特征,明确bkdR所在基因簇的转录调控机制和对Cry蛋白产量的影响。【方法】通过生物信息学方法分析bkdR所在基因簇的结构,RT-PCR分析基因簇的转录单元,采用同源重... 【目的】通过分析苏云金芽胞杆菌bkd基因簇的转录调控和bkdR突变体的表型特征,明确bkdR所在基因簇的转录调控机制和对Cry蛋白产量的影响。【方法】通过生物信息学方法分析bkdR所在基因簇的结构,RT-PCR分析基因簇的转录单元,采用同源重组技术敲除苏云金芽胞杆菌HD73菌株的bkdR基因,利用启动子融合lacZ的方法分析启动子的转录活性。利用总蛋白定量确定Cry1Ac蛋白产量。【结果】bkd基因簇由8个基因组成,其中ptb-bkdB7个基因组成1个转录单元。ptb基因的启动子转录活性在sigL和bkdR突变体中均明显降低。bkdR基因的缺失对菌体生长、芽胞形成率和Cry1Ac蛋白产量无影响,但使运动能力减弱。【结论】bkd操纵子受Sigma 54控制,并由BkdR激活,bkdR基因的缺失对Cry蛋白产量无影响,对菌株的运动能力有影响。 展开更多
关键词 苏云金芽胞杆菌 增强子结合蛋白(Enhancer BINDING Proteins 简称EBPs) bkdr基因 转录起始因子Sigma54
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