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基于XcmⅠ的T载体及其在合成生物学中的应用
1
作者
段仰凯
梁飞燕
+1 位作者
谈晓明
吕雪峰
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第7期956-965,共10页
为了节约成本和提高实验效率,以商用p MD18-T载体为基础,构建获得了p FL-XS-T载体,其具有符合Biobrick标准的串联XbaⅠ-XcmⅠ-XcmⅠ-SpeⅠ克隆序列,通过对XcmⅠ的酶切处理即可以通过TA克隆方便地克隆PCR片段。克隆验证实验结果表明,经Xc...
为了节约成本和提高实验效率,以商用p MD18-T载体为基础,构建获得了p FL-XS-T载体,其具有符合Biobrick标准的串联XbaⅠ-XcmⅠ-XcmⅠ-SpeⅠ克隆序列,通过对XcmⅠ的酶切处理即可以通过TA克隆方便地克隆PCR片段。克隆验证实验结果表明,经XcmⅠ处理的该载体可以与PCR片段进行TA连接,连接效率及阳性率均可以满足实验室要求并且可以得到Biobrick标准质粒。此外,该载体不仅可以与其余Biobrick标准元件进行串联,还可以作为功能DNA元件的筛选载体。
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关键词
Biobrick标准
TA克隆
合成生物学
原文传递
运用BioBrick组装策略共表达CYP108N7及其氧化还原伴侣
2
作者
丁照云
郭超
+1 位作者
刘艳
吴中柳
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期466-471,共6页
细胞色素P450单加氧酶(简称P450,CYP)是功能强大的单加氧酶超家族,可以催化多种化学法难以实现的氧化反应.实验室前期挖掘的P450新酶CYP108N7,能够利用菠菜铁氧化还原蛋白(Fdx)和铁氧化还原蛋白还原酶(FdR)作为非天然氧化还原伴侣进行...
细胞色素P450单加氧酶(简称P450,CYP)是功能强大的单加氧酶超家族,可以催化多种化学法难以实现的氧化反应.实验室前期挖掘的P450新酶CYP108N7,能够利用菠菜铁氧化还原蛋白(Fdx)和铁氧化还原蛋白还原酶(FdR)作为非天然氧化还原伴侣进行电子传递,并在双质粒系统中实现共表达.本研究拟简化表达体系,重新构建单个质粒的全细胞表达系统.利用BioBrick组装策略,将CYP108N7、Fdx和FdR基因模块化并排列重组,成功构建了编码上述3条基因的、6种排列结构的表达质粒,将其在大肠杆菌中异源表达后获得全细胞催化剂.这6种全细胞的粗酶液的CO差谱都显示出P450酶的典型吸收特征;全细胞在催化苯甲硫醚不对称氧化反应时,都能以优异的立体选择性得到S-苯甲亚砜(>99%ee).其中,催化效率最高全细胞来自以Fdx-FdR-CYP108N7方式排列的质粒N7S6.本研究应用BioBrick组装策略极大地简化了多组分CYP108N7酶的共表达质粒的构建和优化工作,可为后续该酶的分子进化奠定基础.(图6表1参31)
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关键词
BioBrick
细胞色素P450
硫醚氧化
不对称催化
共表达
原文传递
类食品乳杆菌LBM 12001基于CRISPR/Cas9技术多基因编辑平台的构建
3
作者
黄宗潇
侯倩
+2 位作者
徐岩
黄卫宁
穆晓清
《食品与发酵工业》
2026年第3期11-19,共9页
作为传统发酵食品的核心功能菌株,类食品乳杆菌(Lactobacillus paralimentarius)的代谢调控网络解析常受限于低效的遗传操作体系。该研究旨在开发一种高效、无痕的CRISPR/Cas9基因编辑平台,以解决类食品乳杆菌多基因编辑的技术瓶颈。通...
作为传统发酵食品的核心功能菌株,类食品乳杆菌(Lactobacillus paralimentarius)的代谢调控网络解析常受限于低效的遗传操作体系。该研究旨在开发一种高效、无痕的CRISPR/Cas9基因编辑平台,以解决类食品乳杆菌多基因编辑的技术瓶颈。通过优化质粒大小以及引入λ-Red重组酶辅助同源重组,构建了双质粒系统(pCRI01/pCRI02)。实验结果表明,该系统显著提升了转化效率[单基因敲除转化子达(63±11)个,阳性突变率75%],并实现了三基因同步敲除[转化子(57±8)个,突变率(46±7)%]。创新性整合BioBricks模块化组装、温度敏感型复制子及自靶向诱导型sgRNA技术,使多基因编辑周期缩短40%以上。该体系突破了传统方法的效率限制,成功实现多基因无痕编辑,为构建类食品乳杆菌高效细胞工厂提供了关键性技术支撑。
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关键词
类食品乳杆菌
CRISPR/Cas9
多基因编辑
λ-Red重组酶
biobricks
组装
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职称材料
题名
基于XcmⅠ的T载体及其在合成生物学中的应用
1
作者
段仰凯
梁飞燕
谈晓明
吕雪峰
机构
中国科学院大学
中国科学院青岛生物能源与过程研究所中国科学院生物燃料重点实验室
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第7期956-965,共10页
基金
山东省自然科学基金(No.ZR2013CQ045)资助~~
文摘
为了节约成本和提高实验效率,以商用p MD18-T载体为基础,构建获得了p FL-XS-T载体,其具有符合Biobrick标准的串联XbaⅠ-XcmⅠ-XcmⅠ-SpeⅠ克隆序列,通过对XcmⅠ的酶切处理即可以通过TA克隆方便地克隆PCR片段。克隆验证实验结果表明,经XcmⅠ处理的该载体可以与PCR片段进行TA连接,连接效率及阳性率均可以满足实验室要求并且可以得到Biobrick标准质粒。此外,该载体不仅可以与其余Biobrick标准元件进行串联,还可以作为功能DNA元件的筛选载体。
关键词
Biobrick标准
TA克隆
合成生物学
Keywords
Biobrick standard
TA cloning
synthetic biology
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
运用BioBrick组装策略共表达CYP108N7及其氧化还原伴侣
2
作者
丁照云
郭超
刘艳
吴中柳
机构
中国科学院成都生物研究所
中国科学院大学
出处
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期466-471,共6页
基金
国家自然科学基金项目(21572220,21708038)资助。
文摘
细胞色素P450单加氧酶(简称P450,CYP)是功能强大的单加氧酶超家族,可以催化多种化学法难以实现的氧化反应.实验室前期挖掘的P450新酶CYP108N7,能够利用菠菜铁氧化还原蛋白(Fdx)和铁氧化还原蛋白还原酶(FdR)作为非天然氧化还原伴侣进行电子传递,并在双质粒系统中实现共表达.本研究拟简化表达体系,重新构建单个质粒的全细胞表达系统.利用BioBrick组装策略,将CYP108N7、Fdx和FdR基因模块化并排列重组,成功构建了编码上述3条基因的、6种排列结构的表达质粒,将其在大肠杆菌中异源表达后获得全细胞催化剂.这6种全细胞的粗酶液的CO差谱都显示出P450酶的典型吸收特征;全细胞在催化苯甲硫醚不对称氧化反应时,都能以优异的立体选择性得到S-苯甲亚砜(>99%ee).其中,催化效率最高全细胞来自以Fdx-FdR-CYP108N7方式排列的质粒N7S6.本研究应用BioBrick组装策略极大地简化了多组分CYP108N7酶的共表达质粒的构建和优化工作,可为后续该酶的分子进化奠定基础.(图6表1参31)
关键词
BioBrick
细胞色素P450
硫醚氧化
不对称催化
共表达
Keywords
BioBrick
cytochrome P450
sulfoxidation
asymmetric catalysis
co-expression
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
类食品乳杆菌LBM 12001基于CRISPR/Cas9技术多基因编辑平台的构建
3
作者
黄宗潇
侯倩
徐岩
黄卫宁
穆晓清
机构
江南大学生物工程学院
出处
《食品与发酵工业》
2026年第3期11-19,共9页
基金
优质高效“微生物制造”技术研发项目(2022YFD2101201)。
文摘
作为传统发酵食品的核心功能菌株,类食品乳杆菌(Lactobacillus paralimentarius)的代谢调控网络解析常受限于低效的遗传操作体系。该研究旨在开发一种高效、无痕的CRISPR/Cas9基因编辑平台,以解决类食品乳杆菌多基因编辑的技术瓶颈。通过优化质粒大小以及引入λ-Red重组酶辅助同源重组,构建了双质粒系统(pCRI01/pCRI02)。实验结果表明,该系统显著提升了转化效率[单基因敲除转化子达(63±11)个,阳性突变率75%],并实现了三基因同步敲除[转化子(57±8)个,突变率(46±7)%]。创新性整合BioBricks模块化组装、温度敏感型复制子及自靶向诱导型sgRNA技术,使多基因编辑周期缩短40%以上。该体系突破了传统方法的效率限制,成功实现多基因无痕编辑,为构建类食品乳杆菌高效细胞工厂提供了关键性技术支撑。
关键词
类食品乳杆菌
CRISPR/Cas9
多基因编辑
λ-Red重组酶
biobricks
组装
Keywords
Lactobacillus paralimentarius
CRISPR/Cas9
multigene editing
λ-Red recombinase
biobricks
modular assembly
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程]
Q78 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于XcmⅠ的T载体及其在合成生物学中的应用
段仰凯
梁飞燕
谈晓明
吕雪峰
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
原文传递
2
运用BioBrick组装策略共表达CYP108N7及其氧化还原伴侣
丁照云
郭超
刘艳
吴中柳
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
原文传递
3
类食品乳杆菌LBM 12001基于CRISPR/Cas9技术多基因编辑平台的构建
黄宗潇
侯倩
徐岩
黄卫宁
穆晓清
《食品与发酵工业》
2026
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