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BioSun:计算机辅助分子生物学实验设计的软件系统 被引量:28
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作者 李伍举 应晓敏 《军事医学科学院院刊》 CSCD 北大核心 2004年第5期401-404,共4页
论述了我们自行研究与开发的分子生物学实验辅助设计的生物信息学软件系统BioSun。该系统运行于Windows环境 ,其主要功能有 :可视化的序列编辑、可接收多种序列格式 (EMBL ,GenBank和FastA)的数据库管理系统、多种方式的序列比较、多种... 论述了我们自行研究与开发的分子生物学实验辅助设计的生物信息学软件系统BioSun。该系统运行于Windows环境 ,其主要功能有 :可视化的序列编辑、可接收多种序列格式 (EMBL ,GenBank和FastA)的数据库管理系统、多种方式的序列比较、多种方式的抗原表位预测、基于多种算法的RNA二级结构预测、酶切位点分析及酶切图谱制作、PCR实验辅助设计、辅助寡核苷酸微阵列的探针设计、辅助cDNA微阵列的引物设计和原核系统外源基因高效表达设计等。BioSun系统使用图形用户界面方式 ,可实现对图形与文本文件的灵活管理 ,具有操作灵活、功能多样等特点 ,可用于分子生物学实验的辅助设计 ,对加快实验进程和提高实验的成功率具有重要意义。 展开更多
关键词 biosun 生物信息学 实验辅助设计 软件系统
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BioSun2.0:一个综合性的辅助分子生物学实验设计软件 被引量:2
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作者 查磊 应晓敏 +2 位作者 曹源 李华 李伍举 《军事医学科学院院刊》 CSCD 北大核心 2006年第5期461-464,共4页
我们曾于2004年推出了计算机辅助分子生物学实验设计的软件系统B ioSun 1.0,该系统提供了较为全面的数据处理与分析功能。为了更好地服务于生物医学工作者,我们对该软件系统进行了升级,推出了2.0版本,新增的功能主要有:基于B last的多... 我们曾于2004年推出了计算机辅助分子生物学实验设计的软件系统B ioSun 1.0,该系统提供了较为全面的数据处理与分析功能。为了更好地服务于生物医学工作者,我们对该软件系统进行了升级,推出了2.0版本,新增的功能主要有:基于B last的多种形式的序列比对、基于C lustalW的多序列比对与进化树构建、蛋白质三维结构展示、基于RNA fold的RNA二级结构预测和序列格式转换等。通过与商业化综合性的生物信息学软件系统DNA-SIS MAX 2.05、DNAStar 5.0、Vector NTI 9.1和B ioEd it 7.0的比较发现,B ioSun2.0具有操作简便、功能众多和性价比高等特点,能够满足生物医学实验室的常规需求。 展开更多
关键词 biosun 生物信息学 计算机辅助设计
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BioSun 3.0:一个综合性辅助分子生物学实验设计的软件系统
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作者 查磊 应晓敏 +1 位作者 曹源 李伍举 《科研信息化技术与应用》 2009年第3期30-36,共7页
本文介绍了一个综合性辅助分子生物学实验设计的软件系统BioSun。BioSun为一套辅助分子生物学实验设计软件,功能全面,并为生物学研究人员提供了易用的环境。使用BioSun分析数据和设计分子生物学实验可以加快实验进程,提高研究效率。
关键词 biosun 生物信息学 计算机辅助设计
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日本血吸虫病诊断分子B细胞表位的预测与鉴定 被引量:5
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作者 章辉 司进 +7 位作者 朱荫昌 赵松 王晓婷 殷旭仁 曹利民 华万全 徐明 梁幼生 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 2006年第1期19-24,共6页
目的 应用生物信息学技术对日本血吸虫病常用诊断分子进行B细胞表位的预测,筛选出具有潜在诊断价值的表位分子,采用基因工程方法制备目的表位的融合蛋白并进行抗原性鉴定。方法 将日本血吸虫膜蛋白22kDa(Sj22)、膜蛋白23kDa(Sj23... 目的 应用生物信息学技术对日本血吸虫病常用诊断分子进行B细胞表位的预测,筛选出具有潜在诊断价值的表位分子,采用基因工程方法制备目的表位的融合蛋白并进行抗原性鉴定。方法 将日本血吸虫膜蛋白22kDa(Sj22)、膜蛋白23kDa(Sj23)、信号蛋白14—3—3(Sj14—3—3)、谷胱甘肽S转移酶(Sj26)分子的全基因序列输入BioSun软件的工作区,经多参数比较筛选可能的B细胞表位,克隆、表达预测表位,用表达的融合蛋白作为抗原与血吸虫病人血清反应,以筛选和鉴定具有抗原性的表位。结果 经预测分析,Sj22的B细胞表位可能在56~62位和127~133位氨基酸区域,Sj23的B细胞表位可能在149~156位和160~167位氨基酸区域,Sj14—3—3的B细胞表位可能在118~225位和130~137位氨基酸区域,Sj26的B细胞表位可能在143~149位和191~197位氨基酸区域。克隆、表达并纯化这8个表位的融合蛋白,经SDS—PAGE和Western blot检测抗原性,筛选出分别来自于Sj22、Sj14-3-3、Sj26的3条具有较强抗原性的表位片段。结论 生物信息学技术结合分子生物学方法可用于筛选具有潜在诊断价值的表位。 展开更多
关键词 biosun软件 预测 B细胞表位 克隆 表达 诊断
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计算机辅助设计改善重组人神经珠蛋白(hNGB)在E.coli中的表达 被引量:1
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作者 柳伟强 牛建章 +2 位作者 李晓霞 田侠 赵晓瑜 《河北大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2005年第6期639-643,共5页
人神经珠蛋白(hNGB)是新发现的人类脑特异的携氧蛋白.为对其结构和功能进行深入的研究,首先,利用分子生物学实验辅助设计软件BioSun1.0分析了hNGB基因与pBV221载体连接处的二级结构和hNGB基因的局部密码子偏爱性,并依据原核系统外源基... 人神经珠蛋白(hNGB)是新发现的人类脑特异的携氧蛋白.为对其结构和功能进行深入的研究,首先,利用分子生物学实验辅助设计软件BioSun1.0分析了hNGB基因与pBV221载体连接处的二级结构和hNGB基因的局部密码子偏爱性,并依据原核系统外源基因高效表达数学模型对hNGB基因进行了高效表达设计;其次,构建了hNGB基因编码区原核表达载体pBV221_hNGB;最后通过转化大肠杆菌JM109,热激诱导,获得了hNGB基因的高效表达.表达水平约为12%,从而为进一步研究hNGB基因的结构和功能奠定了重要基础. 展开更多
关键词 hNGB biosun 原核表达 优化
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蓝舌病病毒VP_7蛋白的B细胞表位预测
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作者 杜杰 尹惠琼 杨姝 《中国畜牧兽医文摘》 2013年第9期172-172,共1页
根据前期试验中测得的蓝舌病病毒VP7蛋白的基因序列和推导的氨基酸序列,利用DNAStar软件和Biosun软件进行生物信息学预测,以单参数(亲水性、可及性、柔韧性、抗原性)预测为基础,结合二级结构预测来综合分析蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞... 根据前期试验中测得的蓝舌病病毒VP7蛋白的基因序列和推导的氨基酸序列,利用DNAStar软件和Biosun软件进行生物信息学预测,以单参数(亲水性、可及性、柔韧性、抗原性)预测为基础,结合二级结构预测来综合分析蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞表位。 展开更多
关键词 VP7蛋白 蓝舌病病毒 B细胞表位 表位预测 biosun 二级结构预测 氨基酸序列 生物信息学
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专业仪器
7
《美容院》 2003年第5期123-123,共1页
关键词 美容仪器 产品介绍 L6俏脸重塑仪 biosun 活细胞极化光仪
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