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NetRD:一种利用Bing搜索结果补充文献挖掘证据集的工具
被引量:
1
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作者
邹熊峰
郑浩然
《北京生物医学工程》
2019年第4期377-383,共7页
目的当前生物文献挖掘工作的重心是改进各挖掘模块性能,以提升挖掘结果的可信度,但有很大比例的挖掘结果其文献证据很少,为此本文提出一个利用Bing搜索引擎从海量Web数据中为文献挖掘得到的生物实体关联对提供补充证据的工具系统。方法...
目的当前生物文献挖掘工作的重心是改进各挖掘模块性能,以提升挖掘结果的可信度,但有很大比例的挖掘结果其文献证据很少,为此本文提出一个利用Bing搜索引擎从海量Web数据中为文献挖掘得到的生物实体关联对提供补充证据的工具系统。方法利用现有文本挖掘技术从PubMed文献中挖掘一批生物实体关联对,引入BingWeb搜索模块,以生物实体名作为关键词从Web中利用Bing开放搜索API得到一批搜索结果,将这些结果整理成新的数据源,最终从该新的数据源中挖掘得到一批来自Web的补充证据。结果本系统(http://bioinfo.ustc.edu.cn/NetRD)对文献证据较少的生物实体关联对提供了有效的补充证据支持,丰富了文献挖掘结果最终的证据集。结论以Web数据作为补充数据源,能够有效地为文献证据很少的生物实体对提供证据补充,为相关研究者确认两个生物实体之间的关联提供重要参考。
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关键词
生物文献挖掘
bing
web
search
api
证据集
生物实体关联对
证据补充
暂未订购
题名
NetRD:一种利用Bing搜索结果补充文献挖掘证据集的工具
被引量:
1
1
作者
邹熊峰
郑浩然
机构
中国科学技术大学计算机科学与技术学院
出处
《北京生物医学工程》
2019年第4期377-383,共7页
基金
国家重点基础研究发展计划(2017YFA0505502)
安徽省自然科学基金(1508085MF128)资助
文摘
目的当前生物文献挖掘工作的重心是改进各挖掘模块性能,以提升挖掘结果的可信度,但有很大比例的挖掘结果其文献证据很少,为此本文提出一个利用Bing搜索引擎从海量Web数据中为文献挖掘得到的生物实体关联对提供补充证据的工具系统。方法利用现有文本挖掘技术从PubMed文献中挖掘一批生物实体关联对,引入BingWeb搜索模块,以生物实体名作为关键词从Web中利用Bing开放搜索API得到一批搜索结果,将这些结果整理成新的数据源,最终从该新的数据源中挖掘得到一批来自Web的补充证据。结果本系统(http://bioinfo.ustc.edu.cn/NetRD)对文献证据较少的生物实体关联对提供了有效的补充证据支持,丰富了文献挖掘结果最终的证据集。结论以Web数据作为补充数据源,能够有效地为文献证据很少的生物实体对提供证据补充,为相关研究者确认两个生物实体之间的关联提供重要参考。
关键词
生物文献挖掘
bing
web
search
api
证据集
生物实体关联对
证据补充
Keywords
biomedical literature mining
bing web search api
set of evidence sentences
associations between biomedical entities
supplement of evidence set
分类号
R318 [医药卫生—生物医学工程]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
NetRD:一种利用Bing搜索结果补充文献挖掘证据集的工具
邹熊峰
郑浩然
《北京生物医学工程》
2019
1
暂未订购
已选择
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参考文献
引证文献
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