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双分子荧光互补技术(BiFC)分析玉米SSⅠ与PPDK1之间的蛋白互作 被引量:5
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作者 崔喜艳 张继晓 +3 位作者 窦瑶 孙小杰 尹悦佳 刘相国 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2013年第7期49-53,59,共6页
【目的】分析玉米胚乳可溶性淀粉合成酶(SSⅠ)与质体型糖酵解途径关键催化酶丙酮酸磷酸双激酶(PPDK1)的蛋白互作关系,揭示可能发生互作的亚细胞位置。【方法】采用酶切连接的方法构建326-CYCHA-ss1和326-CYNEE-ppdk1双分子荧光互补表达... 【目的】分析玉米胚乳可溶性淀粉合成酶(SSⅠ)与质体型糖酵解途径关键催化酶丙酮酸磷酸双激酶(PPDK1)的蛋白互作关系,揭示可能发生互作的亚细胞位置。【方法】采用酶切连接的方法构建326-CYCHA-ss1和326-CYNEE-ppdk1双分子荧光互补表达载体,转化农杆菌EHA105,瞬时浸染烟草叶片组织,激光共聚焦显微镜下观察SSⅠ和PPDK1相互作用产生的荧光信号。【结果】双酶切试验鉴定表明,326-CYCHA-ss1和326-CYNEE-ppdk1重组载体构建正确;PCR结果证实,植物表达载体成功转化到农杆菌EHA105中;双分子荧光互补试验中,可观测到SSⅠ和PP-DK1相互结合而产生的黄色荧光信号。【结论】证实SSⅠ和PPDK1能够在植物活体细胞内发生真实的蛋白互作。 展开更多
关键词 SSⅠ PPDK1 双分子荧光互补技术(bifc) 瞬时转化 蛋白质互作
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双分子荧光互补技术(BiFC)分析玉米MAPK5与bZIP72蛋白的相互作用 被引量:2
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作者 曹建美 《安徽农业科学》 CAS 2016年第14期152-154,161,共4页
[目的]分析玉米MAPK5与b ZIP72蛋白之间的相互作用。[方法]构建双分子荧光互补表达载体p N-MAPK5和p C-b ZIP72,应用基因枪轰击洋葱表皮细胞瞬时表达,在激光共聚焦显微镜下观察MAPK5与b ZIP72蛋白相互作用产生的荧光信号。[结果]ZmMAPK5... [目的]分析玉米MAPK5与b ZIP72蛋白之间的相互作用。[方法]构建双分子荧光互补表达载体p N-MAPK5和p C-b ZIP72,应用基因枪轰击洋葱表皮细胞瞬时表达,在激光共聚焦显微镜下观察MAPK5与b ZIP72蛋白相互作用产生的荧光信号。[结果]ZmMAPK5与Zmb ZIP72的Bi FC融合载体同时轰击洋葱表皮细胞,细胞核中能发出黄色荧光。[结论]Zm MAPK5与Zmb ZIP72在植物细胞核内相互作用。 展开更多
关键词 ZmMAPK5 ZmbZIP72 双分子荧光互补(bifc) 蛋白互作 ZmMAPK5 ZmbZIP72 Bimolecular FLUORESCENCE COMPLEMENTATION (bifc)
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ZmJAZ与ZmMYC2的BiFC互作研究 被引量:3
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作者 吕迪 陈茹梅 周晓今 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期77-85,共9页
JAZ(jasmonate ZIM-domain)蛋白是茉莉酸(jasmonic acid,JA)信号途径中关键的负调控因子,明确JAZ蛋白和MYC2之间的结合关系对整个JA信号通路至关重要。通过qRT-PCR筛选了在籽粒中较特异表达的ZmJAZ4、生殖器官中高表达的ZmJAZ8以及组成... JAZ(jasmonate ZIM-domain)蛋白是茉莉酸(jasmonic acid,JA)信号途径中关键的负调控因子,明确JAZ蛋白和MYC2之间的结合关系对整个JA信号通路至关重要。通过qRT-PCR筛选了在籽粒中较特异表达的ZmJAZ4、生殖器官中高表达的ZmJAZ8以及组成型表达的ZmJAZ12,利用玉米叶肉细胞原生质体瞬时表达体系,通过亚细胞定位和双分子荧光互作(bimolecular fluorescence complementation)研究了这些JAZ蛋白的定位以及是否可以与ZmMYC2相互作用。研究结果发现ZmJAZ4、ZmJAZ8和ZmJAZ12均定位于细胞核,同时BiFC结果显示这些JAZ蛋白都可与ZmMYC2在细胞核中相互作用,证实了ZmJAZ家族蛋白可与JA信号通路关键转录因子ZmMYC2结合的功能,提示它们可通过与ZmMYC2的结合影响其转录调控活性。 展开更多
关键词 茉莉酸 JAZ蛋白 MYC2转录因子 双分子荧光互作(bifc)
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基于Nimble Cloning的新型植物BiFC载体的构建和应用
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作者 曾妍静 沈文涛 +4 位作者 庹德财 黎小瑛 言普 高新征 周鹏 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第23期7757-7763,共7页
Nimble Cloning是一项新型的分子克隆技术,具有操作简单、使用灵活、克隆效率高、标准化克隆等优点,但Nimble Cloning需要使用配套的表达载体。本研究将pDOE系列的4个整合型BiFC载体上的SfiI位点去除,然后在这4个载体的多克隆位点处插... Nimble Cloning是一项新型的分子克隆技术,具有操作简单、使用灵活、克隆效率高、标准化克隆等优点,但Nimble Cloning需要使用配套的表达载体。本研究将pDOE系列的4个整合型BiFC载体上的SfiI位点去除,然后在这4个载体的多克隆位点处插入NC克隆框,构建了一套适用于Nimble Cloning的新型植物BiFC表达载体,命名为pNC-BiFC-VD系列载体。将pNC-BiFC-VD载体应用到植物蛋白互作研究中,分析了番木瓜eIFiso4E和病毒PRSV的vpg蛋白之间的互作,结果表明番木瓜eIFiso4E和PRSV-vpg在细胞核发生互作。该套新型植物BiFC表达载体有望在植物蛋白互作研究中得到广泛应用。 展开更多
关键词 分子克隆 Nimble Cloning 双分子荧光互补(bifc) 蛋白互作
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利用BiFC技术研究柔嫩艾美耳球虫顶膜抗原1结构域Ⅰ与棒状体颈部蛋白2互作关系 被引量:4
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作者 严茗 黄兵 +6 位作者 赵其平 韩红玉 朱顺海 赵宗平 陈婷 吕凌 董辉 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2019年第4期32-38,共7页
为了验证柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella)顶膜抗原1结构域Ⅰ(apical membrance antigen 1 domain I,E tAMA1-DⅠ)与棒状体颈部蛋白2(rhoptry neck protein 2,EtRON2)的互作关系,以柔嫩艾美耳球虫子孢子cDNA为模板,PCR扩增出492 bp的E t... 为了验证柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella)顶膜抗原1结构域Ⅰ(apical membrance antigen 1 domain I,E tAMA1-DⅠ)与棒状体颈部蛋白2(rhoptry neck protein 2,EtRON2)的互作关系,以柔嫩艾美耳球虫子孢子cDNA为模板,PCR扩增出492 bp的E tAMA1-DⅠ片段和1395 bp的E tRON2片段,并与pGEM-T-easy载体连接构建相应重组质粒。获得的阳性重组质粒及双分子荧光互补技术的真核表达载体pBiFC-VN155和pBiFC-VC155用E c oRⅠ和B g I II进行双酶切,将E tAMA1-DⅠ、E tRON2分别与pBiFC-VN155、pBiFC-VC155连接,构建真核重组质粒pBiFC-VN155-E tAMA1-DⅠ和pBiFC-VC155-E tRON2。将2个真核重组质粒分别转染BHK细胞进行表达,经间接免疫荧光鉴定,可在BHK细胞中成功表达。将2个真核重组质粒共转染至BHK细胞中,同时将pBiFC-bJunVN155和pBiFC-bFos(deltaZIP)VC155、pBiFC-bJunVN155和pBiFC-bFos(delta)VC155共转染至细胞中分别作为阳性和阴性对照组。BiFC结果发现真核重组质粒共转染组和阳性对照组的BHK细胞均产生绿色荧光,而阴性对照组无荧光,表明E tAMA1-DⅠ与E tRON2蛋白之间存在互作关系。本研究结果为深入研究E tAMA1及E tRON2在球虫入侵过程中的功能与作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 柔嫩艾美耳球虫 顶膜抗原1 棒状体颈部蛋白2 双分子荧光互补技术 互作蛋白
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双分子荧光互补法(BiFC)精确MICOS复合物精细结构 被引量:1
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作者 刘文晓 闫朝君 宋质银 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期690-694,共5页
在真核细胞中,线粒体是能量合成与物质代谢的重要场所。线粒体是双层膜细胞器,内膜向内折叠形成嵴,其中MICOS复合物对于线粒体嵴的形成起着重要作用。Mic60、Mic19和Mic10是MICOS复合物核心组成蛋白。采用双分子荧光互补技术(BiFC,bimol... 在真核细胞中,线粒体是能量合成与物质代谢的重要场所。线粒体是双层膜细胞器,内膜向内折叠形成嵴,其中MICOS复合物对于线粒体嵴的形成起着重要作用。Mic60、Mic19和Mic10是MICOS复合物核心组成蛋白。采用双分子荧光互补技术(BiFC,bimolecular fluorescence complementation)方法在活细胞中直接观察研究MICOS复合物中各组成蛋白之间的相互作用关系。发现Mic60可以与Mic19发生较强的相互作用,而Mic60与Mic10的相互作用较弱。 展开更多
关键词 线粒体 MICOS复合物 双分子荧光互补
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玉米中ClassⅠ和ClassⅡNAS蛋白之间的BiFC互作研究
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作者 肖克 周晓今 +1 位作者 陈茹梅 逄森 《生物技术进展》 2022年第5期728-736,共9页
烟草胺合成酶(nicotianamine synthase,NAS)能够催化合成植物体内铁运输所需的螯合物烟草胺(nicotianamine,NA),在植物维持铁稳态方面发挥重要的作用。玉米、小麦和大麦等禾本科植物的NAS蛋白进化为ClassⅠ和ClassⅡ两个亚家族,可能分... 烟草胺合成酶(nicotianamine synthase,NAS)能够催化合成植物体内铁运输所需的螯合物烟草胺(nicotianamine,NA),在植物维持铁稳态方面发挥重要的作用。玉米、小麦和大麦等禾本科植物的NAS蛋白进化为ClassⅠ和ClassⅡ两个亚家族,可能分别参与调节铁的吸收和运输,其家族成员之间蛋白序列同源性较高,ClassⅡNAS具有特异的N端可变结构域。通过进化分析分析玉米NAS的两个亚家族,以及建模预测两类亚家族代表基因ZmNAS1(ClassⅠ)和ZmNAS3(ClassⅡ)的蛋白结构,结果表明ZmNAS1和ZmNAS3的三维结构高度相似,推测可能通过同源或异源二聚体化发挥功能;进一步通过双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation,BiFC)分析ZmNAS1和ZmNAS3的相互作用,结果表明,ZmNAS1和ZmNAS3蛋白可以互作,删除N端可变结构域的ZmNAS3ΔN只能与ZmNAS3蛋白互作而不与ZmNAS1互作,推测ZmNAS可以形成同源二聚体,而形成异源二聚体需要ClassⅡ家族蛋白的N端可变结构域。研究结果揭示了玉米中ClassⅡNAS调控铁稳态的机制,其分子机制仍需进一步研究。 展开更多
关键词 玉米 烟草胺合成酶 N端可变结构域 双分子荧光互作
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BiFC-SUMO:人类SUMO化修饰位点及非共价结合底物的大规模筛选策略 被引量:1
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作者 蒋帅 梁嘉祺 +5 位作者 李嘉文 曾彦儒 谢晨恺 马文宾 谢宇斌 任间 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2024年第9期1663-1676,共14页
小泛素相关修饰(small ubiquitin-related modification,SUMO)是一种翻译后修饰,在多种生理病理过程中发挥关键作用.SUMO蛋白通过共价键和非共价键的方式与靶蛋白相互作用,分别称为SUMO化修饰和SUMO非共价结合.大多数研究关注SUMO化修饰... 小泛素相关修饰(small ubiquitin-related modification,SUMO)是一种翻译后修饰,在多种生理病理过程中发挥关键作用.SUMO蛋白通过共价键和非共价键的方式与靶蛋白相互作用,分别称为SUMO化修饰和SUMO非共价结合.大多数研究关注SUMO化修饰,而对于作用力弱且短暂的SUMO结合,特别是同时检测SUMO化修饰和SUMO结合的研究都十分缺乏.为了克服这一限制,我们基于双分子荧光互补实验(bimolecular fluorescence complementation,BiFC)和深度学习算法DeepSUMO,开发了一个同时鉴定SUMO化修饰和SUMO非共价结合靶蛋白的高通量流程.通过该流程,成功鉴定了1379个非共价和8457个共价SUMO调控靶蛋白,其中超过70%是首次鉴定到的.本研究结果突出了SUMO化修饰和SUMO非共价结合的关键调控作用,可为未来SUMO作用的研究提供宝贵的资源.DeepSUMO已被开发为一个在线工具(http://deepsumo.renlab.org)供研究者使用. 展开更多
关键词 SUMO 双分子荧光互补 深度学习 翻译后修饰
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盐胁迫下细叶百合酵母文库构建及LpNAC14互作蛋白筛选
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作者 刘同非 李徐斐 +1 位作者 车海涛 张彦妮 《西北林学院学报》 北大核心 2025年第1期32-41,共10页
本研究旨在探索细叶百合NAC转录因子LpNAC14应答盐胁迫的信号通路,分析其互作蛋白,奠定相关基因功能研究基础。利用盐胁迫下细叶百合的叶片和根,通过Gateway法构建了酵母双杂交cDNA文库,使用2个无自激活活性的LpNAC14基因片段构建诱饵载... 本研究旨在探索细叶百合NAC转录因子LpNAC14应答盐胁迫的信号通路,分析其互作蛋白,奠定相关基因功能研究基础。利用盐胁迫下细叶百合的叶片和根,通过Gateway法构建了酵母双杂交cDNA文库,使用2个无自激活活性的LpNAC14基因片段构建诱饵载体,分别与文库质粒共转化筛选互作蛋白,对筛选到的结果进行回转验证和GO富集分析,选取其中一个转录因子LpDi19-2与LpNAC14进行BiFC验证。结果表明,构建细叶百合酵母文库容量1.12×10^(7) CFU,重组率100%,插入片段平均长度1 000 bp以上。文库共转化初步筛选到19个与LpNAC14互作的蛋白。BiFC验证LpDi19-2与LpNAC14体内互作。研究表明盐胁迫下细叶百合酵母文库质量较高,符合筛选标准,筛选结果可靠性较高,为探究LpNAC14响应盐胁迫机制提供新方向。 展开更多
关键词 细叶百合 cDNA文库 NAC转录因子 盐胁迫 bifc
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GmSZFP互作蛋白的筛选及GmERF7在大豆抵抗SMV侵染过程中的功能分析
10
作者 齐梦楠 赵玎玲 +6 位作者 张雪妍 张玉洁 王荣纳 刘兵强 闫龙 张洁 王冬梅 《中国农业科学》 北大核心 2025年第14期2739-2750,共12页
【目的】大豆作为一种重要的经济和油料作物,其产量和品质常受大豆花叶病毒病的严重威胁,大豆花叶病毒病由大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV)引发。实验室前期筛选到一个差异表达的C2H2型单锌指蛋白基因GmSZFP,在大豆抵抗SMV侵染... 【目的】大豆作为一种重要的经济和油料作物,其产量和品质常受大豆花叶病毒病的严重威胁,大豆花叶病毒病由大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV)引发。实验室前期筛选到一个差异表达的C2H2型单锌指蛋白基因GmSZFP,在大豆抵抗SMV侵染过程中发挥正调控作用。利用酵母双杂交文库筛选其互作蛋白,并探究互作蛋白在大豆与SMV互作过程中的功能,为进一步解析大豆抵御SMV侵染过程中转录因子的调控网络提供理论依据。【方法】以大豆品种冀豆7号、SMV毒株SC-8和N3组成的亲和、不亲和组合为试验材料,利用酵母双杂交文库筛选GmSZFP的潜在互作蛋白,借助酵母双杂交技术(Y2H)和双分子荧光互补试验(BiFC)验证二者的互作关系。运用实时荧光定量PCR(qPCR)和烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)介导的基因沉默技术(TRV-VIGS)分析潜在互作蛋白基因的表达特征及其在大豆与SMV互作过程中的功能。【结果】利用酵母双杂交文库筛选到GmSZFP的潜在互作靶蛋白GmERF7,Y2H和BiFC试验证明二者存在互作关系。GmERF7全长393个AA,包含一个AP2/ERF结构域和2个核定位(NLS)结构域;qPCR结果表明,在亲和组合中,GmERF7在接种病毒后4、12和24 h的表达水平显著高于不亲和组合,且在24 h时表达量达到峰值;利用VIGS技术沉默GmERF7,在亲和组合中,大豆叶片的接种部位有明显的胼胝质积累,而对照中几乎看不到胼胝质荧光;并且在接种后14 d,在基因沉默植株的上位叶中未检测到SMV外壳蛋白基因CP的表达,叶片未出现感染SMV症状,而在对照组中检测到CP的表达,并出现花叶、失绿等感病症状。以上结果表明,沉默GmERF7降低了SMV对大豆植株的侵染能力,增强了大豆对SMV的抗性,说明GmERF7负调控大豆的抗病性。【结论】ERF类转录因子GmERF7能够与锌指蛋白GmSZFP互作,在大豆与SMV互作过程中负调控大豆对SMV的抗性。 展开更多
关键词 大豆花叶病毒 GmSZFP GmERF7 互作蛋白 酵母双杂交文库 双分子荧光互补试验
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调控棘孢木霉几丁质酶Tachi2基因的转录因子和蛋白的互作研究
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作者 曲珊 赵月 +2 位作者 李雅华 郑桂玲 咸洪泉 《生物技术通报》 北大核心 2025年第5期310-319,共10页
【目的】生防菌棘孢木霉(Trichoderma asperellum)TD3104产生的几丁质酶Tachi2在植物病害防治过程中发挥重要作用,47号转录因子作用于特异响应几丁质诱导的Tachi2基因启动子顺式作用元件。探究47号转录因子与一种新调控蛋白H63的互作关... 【目的】生防菌棘孢木霉(Trichoderma asperellum)TD3104产生的几丁质酶Tachi2在植物病害防治过程中发挥重要作用,47号转录因子作用于特异响应几丁质诱导的Tachi2基因启动子顺式作用元件。探究47号转录因子与一种新调控蛋白H63的互作关系,为解析几丁质诱导调控基因转录表达机制提供科学依据。【方法】利用酵母双杂交系统对棘孢木霉几丁质酶基因Tachi2中47号转录因子的候选互作蛋白H63进行体内点对点互作鉴定;采用大肠杆菌表达系统分别对H63蛋白与47号转录因子基因进行原核诱导表达,利用亲和层析技术纯化融合蛋白,通过GST pull-down实验进行体外蛋白互作检测;利用农杆菌介导的洋葱表皮细胞亚细胞定位技术和BiFC实验进一步检测细胞内蛋白的相互作用。【结果】H63蛋白与47号转录因子在酵母细胞内存在互作关系;原核表达的重组H63蛋白、47号转录因子大小分别为36 kD和18 kD,二者在体外存在互作关系;成功构建了双分子荧光互补载体,证实H63蛋白与47号转录因子在洋葱内表皮细胞中存在相互作用,并且互作发生在细胞核内。【结论】证实H63蛋白与47号转录因子在细胞内外均存在相互作用,为解析真菌几丁质酶基因的表达调控、几丁质酶在农业和生物医药领域的开发利用奠定理论基础。 展开更多
关键词 棘孢木霉 几丁质酶 转录因子 基因表达 互作蛋白 酵母双杂交 GSTPull-down 双分子荧光互补
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水稻草状矮化病毒外壳蛋白CP自身互作研究
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作者 胡昱颛 程淑媛 +6 位作者 王全兴 杜磊 张金艺 高欣语 刘冰 蒋军喜 熊桂红 《江西农业大学学报》 北大核心 2025年第1期32-40,共9页
【目的】明确水稻草状矮化病毒(Rice grassy stunt virus,RGSV)外壳蛋白CP的自身互作,为揭示CP蛋白在RGSV侵染中的功能提供理论依据。【方法】利用酵母双杂交(Y2H)技术鉴定RGSV CP与CP蛋白之间的互作。提取感染RGSV水稻叶片的总RNA,通过... 【目的】明确水稻草状矮化病毒(Rice grassy stunt virus,RGSV)外壳蛋白CP的自身互作,为揭示CP蛋白在RGSV侵染中的功能提供理论依据。【方法】利用酵母双杂交(Y2H)技术鉴定RGSV CP与CP蛋白之间的互作。提取感染RGSV水稻叶片的总RNA,通过RT-PCR扩增得到CP基因。将CP基因分别构建到酵母表达载体pGBKT7和pGADT7上,利用菌液PCR鉴定阳性克隆。将酵母质粒组合pGBKT7-CP/pGADT7、pGBKT7-CP/pGADT7-CP、阳性对照pGADT7-T/pGBKT7-53、阴性对照pGADT7-T/pGBKT7-Lam分别转化到酵母感受态细胞Y2HGold中,先后涂布于缺陷型培养基SD/-Leu/-Trp和SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-α-gal上。通过观察酵母细胞在缺陷培养基上的生长和显色情况鉴定CP蛋白的毒性、自激活活性和自身互作关系。利用亚细胞定位和双分子荧光互补(BiFC)鉴定CP在本氏烟中的定位及互作。将CP构建到植物瞬时表达载体pEarleyGate101(101)、pEarleyGate202-YN(YN)、pEarleyGate202-YC(YC)上,并利用菌液PCR鉴定阳性克隆。将阳性克隆101-CP、YN-CP、YC-CP、空载体YN、YC分别转化到农杆菌GV3101中。将含阳性质粒101-CP的农杆菌单独注射本氏烟叶片;将含阳性质粒YN-CP/YC-CP、阴性对照YN-CP/YC、YN/YC-CP的农杆菌共注射本氏烟叶片;利用激光共聚焦显微镜观察融合蛋白的发光和定位。【结果】RT-PCR扩增得到CP基因,其大小为978bp。成功构建酵母表达载体pGBKT7-CP和pGADT7-CP。含质粒pGBKT7-CP/pGADT7、pGBKT7-CP/pGADT7-CP、阳性对照和阴性对照的酵母菌均能在缺陷培养基SD/-Leu/-Trp平板上生长,且含质粒pGBKT7-CP/pGADT7的酵母菌的生长情况与对照一致,说明CP蛋白对酵母菌无毒性。但仅含质粒pGBKT7-CP/pGADT7-CP的酵母菌和阳性对照可在缺陷培养基SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-α-gal平板上生长并显色,表明CP蛋白无自激活活性,且CP蛋白在酵母细胞中能够自身互作。成功构建CP基因的植物表达载体;亚细胞定位结果显示,CP蛋白主要定位于本氏烟细胞的细胞核和细胞膜上。BiFC结果显示CP存在自身互作,且互作也定位于本氏烟细胞的细胞核和细胞膜。【结论】水稻草状矮化病是由水稻草状矮化病毒引起的,给粮食产量造成了严重威胁。RGSVCP是该病毒的外壳蛋白,可能在病毒复制、装配、侵染等过程中发挥着重要的作用。通过亚细胞定位、Y2H和BiFC鉴定了RGSVCP的定位和自身互作,为CP蛋白的功能研究提供参考,为解析RGSV的致病机制提供依据。 展开更多
关键词 水稻草状矮化病毒 外壳蛋白 载体构建 酵母双杂交 亚细胞定位 双分子荧光互补 蛋白互作
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DdSOC1基因调控德阳柿成花分子机制
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作者 万建琦 丁瑜 +4 位作者 任晗 李雯霞 杨勇 黄金盟 关长飞 《果树学报》 北大核心 2025年第2期276-287,共12页
【目的】探究DdSOC1基因调控德阳柿(Diospyros deyangensis)成花的分子机制。【方法】通过生物信息学、基因表达量分析、酵母双杂筛库和双杂互作验证等方法,解析DdSOC1基因在调控成花中的功能。【结果】德阳柿DdSOC1序列和君迁子DlSOC1... 【目的】探究DdSOC1基因调控德阳柿(Diospyros deyangensis)成花的分子机制。【方法】通过生物信息学、基因表达量分析、酵母双杂筛库和双杂互作验证等方法,解析DdSOC1基因在调控成花中的功能。【结果】德阳柿DdSOC1序列和君迁子DlSOC1序列遗传距离较近;在成花诱导过程中,DdSOC1在茎、叶、芽中随开花进程出现差异表达;基于柿酵母文库,筛选获得7个DdSOC1的互作蛋白(MIOX、AGL14、JOINTLESS、GL2、NOVEIN、NBS、UBC7),酵母双杂交和双分子荧光互补试验表明,DdSOC1和上述7个蛋白均互作;qRT-PCR结果显示,一年生已开花的德阳柿SOC1、AGL14、JOINTLESS、NOVEIN、GL2、UBC7、NBS的表达量,幼叶高于成龄叶;二年生实生苗中,SOC1表达量差异不大,而AGL14、JOINTLESS、GL2、UBC7、MIOX表达量在开花实生苗中的表达量高于未开花实生苗。【结论】DdSOC1及其互作蛋白在德阳柿成花转变中发挥着重要作用,为探究德阳柿短童期分子调控网络提供了更多理论依据。 展开更多
关键词 德阳柿 DdSOC1 互作蛋白 酵母双杂交 双分子荧光互补 实时荧光定量分析
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SSR4蛋白特征的分析及其与猪非典型瘟病毒云南株Mut蛋白的互作
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作者 田鑫 王雯 +4 位作者 钱友俊 刘千歆 邹子恒 杨玉艾 孙永科 《中国兽医学报》 北大核心 2025年第8期1593-1600,1623,共9页
为了研究猪非典型瘟病毒(atypical porcine pestivirus,APPV)云南株关键变异基因(APPV-YN-Mut)蛋白与宿主蛋白信号序列受体蛋白4(signal sequence receptor subunit 4,SSR4)之间是否存在直接相互作用,利用ProtParam、PredictProtein、TM... 为了研究猪非典型瘟病毒(atypical porcine pestivirus,APPV)云南株关键变异基因(APPV-YN-Mut)蛋白与宿主蛋白信号序列受体蛋白4(signal sequence receptor subunit 4,SSR4)之间是否存在直接相互作用,利用ProtParam、PredictProtein、TMHMM等在线软件对SSR4基因表达蛋白的理化性质、空间结构、亚细胞定位等进行分析预测;通过构建重组载体pCMV-Tag4A-SSR4和pET-GST-Mut在体外进行GST pull-down试验;构建重组载体pBiFC-VN173-SSR4和pBiFC-VC155-Mut在细胞内进行双分子荧光互补试验(BiFC),验证APPV-YN-Mut与宿主蛋白SSR4之间是否存在体外和细胞内的直接相互作用。结果显示,SSR4蛋白是疏水性稳定蛋白,无跨膜结构,有信号肽,二级结构主要以无规则卷曲为主,三级结构稳定,主要位于内质网中;GST pull-down和BiFC试验结果显示,APPV-YN-Mut与宿主蛋白SSR4在体外和细胞内都存在直接相互作用。 展开更多
关键词 猪非典型瘟病毒 蛋白互作 双分子荧光互补 GST pull-down
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木薯花叶病毒AC4蛋白与AtPARN互作研究 被引量:3
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作者 刘琳玉 赵平娟 +3 位作者 符艳 刘志昕 任艳利 张秀春 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期197-204,共8页
木薯(Manihot esculenta Crantz)作为重要的热带作物,是全球六大粮食作物之一,并为全球近七亿人口提供主粮,然而病毒侵染引起的病害在全球范围内严重威胁木薯产业的发展。木薯花叶病毒病(cassava mosaic disease,CMD)是最有威胁的病害之... 木薯(Manihot esculenta Crantz)作为重要的热带作物,是全球六大粮食作物之一,并为全球近七亿人口提供主粮,然而病毒侵染引起的病害在全球范围内严重威胁木薯产业的发展。木薯花叶病毒病(cassava mosaic disease,CMD)是最有威胁的病害之一,造成严重的经济损失。斯里兰卡木薯花叶病毒(SriLankancassavamosaicvirus,SLCMV)是引发木薯花叶病的病原物之一,SLCMV是典型的双组分双生病毒,其基因组由DNA-A和DNA-B两个环状组分组成。无义介导的mRNA降解(nonsense-mediatedmRNAdecay,NMD)是真核细胞mRNA降解的主要途径之一,也是真核生物普遍存在的抗病毒防御机制。越来越多的研究显示,NMD不仅是真核生物重要的mRNA数量、质量调控机制,还与转录后基因沉默(post transcriptional gene silencing,PTGS)同样能降解病毒RNA,是真核生物普遍存在的抗病毒防御机制。NMD的mRNA衰减过程包括PTC的识别、脱腺苷酸、脱帽和最后的核酸外切酶降解4个过程,UPF1、PARN、DCP2和XRN4分别是上述4个过程中的关键蛋白。病毒是专性寄生生物,必须逃避或耐受寄主细胞的降解,才能成功感染。聚腺苷酸特异性核糖核酸酶[poly(A)-specific ribonuclease,PARN]是NMD信号通路的一个关键因子。目前,关于SLCMV抵御寄主NMD的分子机制尚不明确。本研究采用酵母双杂交(yeast two-hybrid system)和荧光双分子互补(bimolecular fluorescence complementation,BiFC)试验证明斯里兰卡木薯花叶病毒(SLCMV)编码的沉默抑制子AC4与拟南芥PARN相互作用。据此推测SLCMV AC4蛋白可能通过与AtPARN相互作用而抑制寄主NMD的病毒防御功能帮助病毒逃避或耐受寄主细胞的降解。研究结果为阐明木薯花叶病毒调控寄主NMD抗病毒防御功能的分子机理奠定基础。 展开更多
关键词 斯里兰卡木薯花叶病毒(SLCMV) AC4蛋白 聚腺苷酸特异性核糖核酸酶(PARN) 酵母双杂交(Y2H) 荧光双分子互补(bifc)
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空肠弯曲菌双分子荧光互补系统构建及其在蛋白质互作研究中的应用
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作者 郭嘉乐 任方哲 +3 位作者 李晓飞 郭长彬 焦新安 黄金林 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS 北大核心 2024年第4期1-10,共10页
为研究空肠弯曲菌中蛋白质的相互作用,建立适合于该菌稳定高效表达的双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation,BiFC)系统,通过构建基于基因启动子、荧光蛋白以及基因回补方式等不同条件的重组载体,分别导入空肠弯曲菌... 为研究空肠弯曲菌中蛋白质的相互作用,建立适合于该菌稳定高效表达的双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation,BiFC)系统,通过构建基于基因启动子、荧光蛋白以及基因回补方式等不同条件的重组载体,分别导入空肠弯曲菌进行荧光数值比较分析,确定荧光表达最优的参数,建立以porA启动子和Venus荧光蛋白的质粒回补的BiFC体系。用该体系探究空肠弯曲菌鞭毛表达蛋白的互作。结果表明:已知flhF与flhG互作的BiFC-flhF-flhG载体在菌体内表达的荧光值显著高于阴性对照载体,而BiFC-flhF-fliM和BiFC-flhF-fliG与阴性对照无差异,说明BiFC体系建立成功,且flhF与fliG、fliM不存在互作关系。综上,本研究建立了适用于空肠弯曲菌的BiFC体系,可为该菌蛋白质互作研究提供高效便捷的方法。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 bifc 荧光值 蛋白质互作
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木薯MDH互作蛋白的筛选及验证
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作者 王冠琦 白若宇 周萌萌 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第14期4560-4565,共6页
苹果酸脱氢酶(malate dehydrogenase,MDH)在植物生长发育过程中发挥着至关重要的作用,然而在植物免疫中的作用,仍然是难以捉摸的。本研究在木薯中发现了一个MeMDH1基因,以MeMDH1为诱饵蛋白构建载体p GADT7-Me MDH1,从木薯cDNA文库筛选... 苹果酸脱氢酶(malate dehydrogenase,MDH)在植物生长发育过程中发挥着至关重要的作用,然而在植物免疫中的作用,仍然是难以捉摸的。本研究在木薯中发现了一个MeMDH1基因,以MeMDH1为诱饵蛋白构建载体p GADT7-Me MDH1,从木薯cDNA文库筛选互作蛋白。得到一个候选基因MeLSD3,研究报道LSD在细胞程序性死亡以及植物光合作用和生长等生物过程中发挥重要作用。我们通过酵母双杂交(Yeast two-hybrid,Y2H)和双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation,BiFC)实验验证了MeLSD3和MeMDH1在木薯体内体外的互作。为进一步探究木薯苹果酸脱氢酶在植物抗病反应中的功能及其调控的分子机制提供理论基础。 展开更多
关键词 木薯(Manihot esculenta Crantz) 苹果酸脱氢酶 酵母双杂交 互作蛋白 bifc
原文传递
Screening, Validation and Functional Research of Arabidopsis TIR-NBS 2 Interaction Proteins
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作者 Jianzhong Huang Zhuojun Li +4 位作者 Hongbin Zhang Xiuying Guan Xiaoju Zhong Peng Jia Kai Chen 《American Journal of Plant Sciences》 2024年第12期1091-1099,共9页
The TIR-NBS 2 (TN2) gene from Arabidopsis thaliana (Arabidopsis), which encodes a TIR (the Toll and Interleukin-1 Receptor)-type of nucleotide binding site (NBS) receptor protein (TIR-NBS) that can cause cell death in... The TIR-NBS 2 (TN2) gene from Arabidopsis thaliana (Arabidopsis), which encodes a TIR (the Toll and Interleukin-1 Receptor)-type of nucleotide binding site (NBS) receptor protein (TIR-NBS) that can cause cell death in the model plant Nicotiana benthamiana (N. benthamiana). Nevertheless, the mechanism of TN2 signal initiation is still unclear. This research performed yeast two-hybrid and bimolecular fluorescence complementation (BIFC) assays to investigate interactions between proteins of TN2, and analyzed the influences of these interactors on TN2 function using N. benthamiana. EXO70B1, SOC3 and CPK5-VK were identified as interacting proteins of TN2 based on yeast two-hybrid and BIFC methods. Functional annotations of these interacting proteins indicate their involvement in multiple pathways, including exocytosis, positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway, regulation of stomatal closure, response to water deprivation, defense response, signal transduction and intracellular signal transduction. The transient assay results proclaimed that EXO70B1 can suppress cell death triggered by TN2 and TN2-TIR. These outcomes suggest that TN2 receptor may be participated in various pathways, and the protein level and activity are strictly controlled at multiple aspects, providing novel clues for elucidating the molecular mechanism of TN2 immune receptor in Arabidopsis resistance. 展开更多
关键词 TIR-NBS Yeast Two-Hybrid bifc Cell Death N. benthamiana
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橡胶树HbPIP2;3的亚细胞定位与多聚化分析 被引量:4
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作者 邹智 乔雪莹 +1 位作者 郑玉皎 阳江华 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第3期443-449,共7页
水通道蛋白是一类高效转运水分子的膜内在蛋白,其在生物膜上以四聚体的形式起作用。天然橡胶在橡胶树的乳管细胞中特异合成,并在割胶过程以胶乳的形式被排出。胶乳系乳管细胞的胞质成分,其含水量高达70%,水分通过调节胶乳的粘稠度和乳... 水通道蛋白是一类高效转运水分子的膜内在蛋白,其在生物膜上以四聚体的形式起作用。天然橡胶在橡胶树的乳管细胞中特异合成,并在割胶过程以胶乳的形式被排出。胶乳系乳管细胞的胞质成分,其含水量高达70%,水分通过调节胶乳的粘稠度和乳管膨压进而影响橡胶树的产排胶能力,是决定胶乳产量的关键因素。前期研究显示,橡胶树乳管的水分平衡主要由质膜内在蛋白(plasma membrane intrinsic protein,PIP)特别是HbPIP2;3介导。为揭示HbPIP2;3调控乳管水分平衡的分子机制,本研究采用RT-PCR技术对其861 bp的编码区进行分离。序列分析显示:HbPIP2;3预测编码286个氨基酸,理论分子量为30.58 kDa,等电点为8.50,不稳定系数为31.68,总平均疏水指数为0.449,为稳定的疏水型碱性蛋白;该蛋白含有保守的MIP结构域,其中包括6个典型的跨膜螺旋和2个半螺旋;基于同源建模的3D结构预测显示其可以形成同源四聚体。生物信息学预测和在烟草叶片中的亚细胞定位分析显示,HbPIP2;3定位在细胞膜,这同时也得到了双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation,BiFC)实验的证实。BiFC实验显示,HbPIP2;3可在细胞膜上形成同源四聚体,这进一步得到酵母双杂交结果的验证。本研究结果表明,HbPIP2;3可通过同源四聚体的方式调控乳管的水分平衡,但是否存在异源互作模式还有待进一步研究。 展开更多
关键词 乳管 水通道蛋白 亚细胞定位 双分子荧光互补 酵母双杂交
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橡胶树水通道蛋白HbPIP2;7的亚细胞定位与多聚化分析 被引量:2
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作者 邹智 郑玉皎 +1 位作者 乔雪莹 阳江华 《西南林业大学学报(自然科学)》 CAS 北大核心 2024年第1期1-6,共6页
天然橡胶在橡胶树的乳管细胞中特异性合成。用于割胶的成熟乳管与邻近的薄壁细胞之间不存在胞间连丝,故乳管的水分转入只能通过细胞膜定位的PIP水通道蛋白来实现。为探讨乳管水分平衡的分子机制,研究对1个高丰度表达的PIP基因HbPIP2;7... 天然橡胶在橡胶树的乳管细胞中特异性合成。用于割胶的成熟乳管与邻近的薄壁细胞之间不存在胞间连丝,故乳管的水分转入只能通过细胞膜定位的PIP水通道蛋白来实现。为探讨乳管水分平衡的分子机制,研究对1个高丰度表达的PIP基因HbPIP2;7进行了克隆,在此基础上对其编码蛋白的亚细胞定位和多聚化特性进行了分析。结果表明:HbPIP2;7的编码区全长837 bp,预测编码278 AA,理论分子量为29.56 kDa、等电点为9.11、不稳定系数为29.89、总平均疏水指数为0.526,含有1个保守的MIP结构域及6个典型的跨膜螺旋,预测以四聚体的形式起作用。生物信息学预测和在烟草中的亚细胞定位分析均显示,HbPIP2;7定位在细胞膜。双分子荧光互补和酵母双杂交实验均表明,HbPIP2;7不能形成同源多聚体,推测HbPIP2;7主要通过异源互作的方式参与橡胶树乳管的水分平衡。 展开更多
关键词 橡胶树 乳管 水通道蛋白 亚细胞定位 双分子荧光互补 酵母双杂交
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