遗传参考种群BXD小鼠在生物医学研究中的应用

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作者 胡兵 宫丽丽 +3 位作者 彭亮 张浩军 胡汉昆 刘丽宏 《世界临床药物》 2025年第2期188-195,共8页

BXD重组近交系小鼠系通过将雌性C57BL/6J与雄性DBA/2J小鼠杂交,并经过20代以上的兄弟姐妹交配培育而成,目前已超过150个品系,是世界上规模最大、遗传资料最为完善的哺乳动物重组近交系群体。这些小鼠展现出显著的遗传多样性和广泛的表... BXD重组近交系小鼠系通过将雌性C57BL/6J与雄性DBA/2J小鼠杂交,并经过20代以上的兄弟姐妹交配培育而成,目前已超过150个品系,是世界上规模最大、遗传资料最为完善的哺乳动物重组近交系群体。这些小鼠展现出显著的遗传多样性和广泛的表型多样性,并拥有丰富的基因型、表型及组学数据。这些特性使BXD小鼠成为研究复杂性状和疾病的宝贵资源,可用于疾病模型的构建、疾病机制的研究、药物靶点的发现以及药物的临床前评价。BXD小鼠的应用对于推动生物医学研究的进展、促进疾病的预防和治疗以及实现精准医疗具有重要意义。随着研究的深入,BXD小鼠在更多领域有望发挥更大的作用。 展开更多

关键词 遗传参考群体 bxd重组近交系小鼠 系统遗传学 精准医学 临床前研究

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利用BXD小鼠鉴定焦虑相关行为的QTL及关键基因

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作者 贺宏杰 刘慧 +2 位作者 杨春华 米佳 徐福意 《基因组学与应用生物学》 北大核心 2025年第10期1064-1080,共17页

本研究旨在解析焦虑相关行为的遗传基础。本研究利用60~95日龄BXD小鼠(Mus musculus)及其亲本在接受急性应激处理后,于高架零迷宫实验中评估所得的焦虑行为表型数据,采用哈雷-克诺特回归(Haley-Knott regression,H-K)和全基因组高效混... 本研究旨在解析焦虑相关行为的遗传基础。本研究利用60~95日龄BXD小鼠(Mus musculus)及其亲本在接受急性应激处理后,于高架零迷宫实验中评估所得的焦虑行为表型数据,采用哈雷-克诺特回归(Haley-Knott regression,H-K)和全基因组高效混合模型关联分析(genome-wide efficient mixed model association,GWEMA)两种方法,系统定位与焦虑行为相关的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)。共识别出22个显著关联的QTL,主要分布于第1、9、11号染色体,涉及多个焦虑行为表型。通过整合海马转录组与焦虑表型的相关性分析、表达数量性状基因座分析,以及表型组-转录组关联分析结果,并结合人类(Homo sapiens)与小鼠数据库注释信息进一步筛选关键候选基因,筛选出包括Cacna1e、Slc9a9、Gria1在内的12个焦虑相关关键基因。进一步结合这些基因的共表达网络、通路富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,初步揭示其可能参与调控焦虑行为的生物学机制。此外,定量PCR(quantitative PCR,qPCR)实验结果显示,候选基因中C6、Kdsr、Polr3e、Slc9a9、Sorcs2、Tnfaip3和Vps33a在焦虑样表现的小鼠海马组织中与对照组相比显著下调。本研究为焦虑行为的遗传调控提供系统性理论支持,并为关键基因的功能验证及靶向干预奠定潜在基础。 展开更多

关键词 bxd小鼠 焦虑行为 数量性状基因座(QTL) 关键基因

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Ptgs2基因在BXD重组近交系小鼠海马组织中的遗传基因组学分析 被引量：3

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作者 陈颖 张玉芳 +5 位作者 李奕 高银峰 陈雪 林巍巍 王晓冬 陆璐 《江苏医药》 CAS CSCD 北大核心 2011年第20期2363-2365,F0003,共4页

目的研究前列腺素内过氧化物合酶(Ptgs)2基因在BXD重组近交系(RI)小鼠海马组织中的基因表达变化及表达调控。方法使用基因芯片检测BXD RI小鼠海马组织的基因表达。应用遗传基因组学研究方法进行基因表达数量性状基因座(eQTL)定位分析,寻... 目的研究前列腺素内过氧化物合酶(Ptgs)2基因在BXD重组近交系(RI)小鼠海马组织中的基因表达变化及表达调控。方法使用基因芯片检测BXD RI小鼠海马组织的基因表达。应用遗传基因组学研究方法进行基因表达数量性状基因座(eQTL)定位分析,寻找Ptgs2基因的上游调控位点、下游调控基因以及协同作用的基因。结果 Ptgs2基因在BXD RI小鼠海马组织中特异性高表达,且控制该基因的eQTL为顺式eQTL,该区域同时还是反式eQTL的富集区,偏相关系数分析发现其中有8个基因为Ptgs2基因的下游调控候选基因。皮尔森相关系数分析显示,BXD RI小鼠基因组中有151个基因与Ptgs2密切相关,其中前20个基因与Ptgs2的遗传相关度到达0.59以上。结论遗传基因组学研究能够有效筛选出Ptgs2基因的上游调控位点、下游调节基因及与之高度协同作用的基因,这部分基因是深入研究Ptgs2基因在多种精神类疾病中分子机制的重要靶点。 展开更多

关键词 前列腺素内过氧化物合酶2 bxd重组近交系小鼠 基因表达数量性状基因座

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Gpnmb基因在BXD重组近交系小鼠眼组织的表达差异和基因调控网络分析

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作者 陆宏 张俊芳 +3 位作者 管怀进 胡楠 帅捷 陆璐 《江苏医药》 CAS 北大核心 2014年第2期138-140,I0001,共4页

目的研究色素播散综合征(PDS)和色素性青光眼(PG)致病基因糖蛋白神经调节肽B相关基因(Gpnmb)在BXD重组近交系(BXD RI)小鼠眼组织的表达差异及其基因调控网络。方法采用Affymetrix基因芯片检测确定68个品系的BXD RI小鼠眼组织中Gpnmb基... 目的研究色素播散综合征(PDS)和色素性青光眼(PG)致病基因糖蛋白神经调节肽B相关基因(Gpnmb)在BXD重组近交系(BXD RI)小鼠眼组织的表达差异及其基因调控网络。方法采用Affymetrix基因芯片检测确定68个品系的BXD RI小鼠眼组织中Gpnmb基因的表达差异。采用基因表达数量性状基因座(eQTL)分析方法,结合GeneNetwork网站上的在线分析工具,研究差异表达的特征,进而构建Gpnmb基因调控网络。结果 Gpnmb在BXD RI眼组织中平均表达水平为10.92,不同品系小鼠表达量存在差异。Gpnmb基因为顺式作用的eQTL,End3基因是其下游候选基因。基于和Gpnmb高度相关基因的基因网络得以构建。结论构建Gpnmb基因调控网络,为PDS和PG发病机制的深入研究提供线索。 展开更多

关键词 糖蛋白神经调节肽B相关基因 色素性青光眼 基因网络 bxd重组近交系小鼠

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Pax6基因在BXD重组近交系小鼠眼组织的差异表达及基因调控网络的构建

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作者 陆烨 杨勤 +2 位作者 叶辉 陆璐 陆宏 《江苏医药》 CAS 2016年第13期1431-1434,共4页

目的探讨Pax6基因突变在某些先天性眼部疾病中可能的作用机制。方法采用Affymetrix基因芯片检测确定68个品系的BXD重组近交系(BXD RI)小鼠及其亲本C57BL/6J(B6)和DBA/2J(D2)小鼠、F1代眼组织中Pax6基因的差异表达。借助基因表达数量性... 目的探讨Pax6基因突变在某些先天性眼部疾病中可能的作用机制。方法采用Affymetrix基因芯片检测确定68个品系的BXD重组近交系(BXD RI)小鼠及其亲本C57BL/6J(B6)和DBA/2J(D2)小鼠、F1代眼组织中Pax6基因的差异表达。借助基因表达数量性状基因座(eQTL)分析方法,结合Gene Network网站的在线分析工具,研究Pax6基因表达上游调控基因,并进一步构建Pax6基因调控网络。结果 Pax6基因(1452526_a_at)在BXD RI小鼠的眼组织中呈高表达,不同品系小鼠表达量存在差异。Pax6基因具有1个显著性eQTL,位于19号染色体近测端,其似然比统计值达到15.80。磷酸肌醇4磷酸盐5激酶1α(Pip5k1a)是Pax6的上游调控候选基因。827个基因与Pax6基因具有高度遗传相关性(P<0.05)。结论 Pax6是一个反式调节基因;其表达量受上游调控候选基因Pip5k1a的调控。在Pax6基因突变导致先天性眼部疾病过程中涉及到细胞凋亡、脂质代谢、血管分化、细胞增殖和迁移等多种机制。 展开更多

关键词 基因组学 PAX6基因 基因网络 bxd重组近交系小鼠

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BXD果菜保鲜机问世

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《湖北农机化》 2002年第6期33-33,共1页

山西曲沃明通灭菌防腐器材厂日前研制出一种用于水果蔬菜贮藏保鲜的高科技新品——BXD型果菜保鲜机，现已投放市场。

关键词 bxd果菜保鲜机 bxd型果菜保鲜机 贮藏保鲜 山西曲沃明通灭菌防腐器材厂 水果蔬菜 高科技 问世 投放市场

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应用BXD小鼠鉴定肾脏发育相关QTLs

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作者 袁牡丹 张辉 +2 位作者 李小明 白晓平 徐福意 《生物技术》 CAS 2018年第6期585-591,共7页

[目的]利用BXD小鼠群体定位肾脏发育相关QTLs及筛选QTLs区段内的候选功能基因。[方法]高脂饲喂BXD小鼠29w龄后,获取各品系小鼠肾脏重量和体重,结合该小鼠群体基因型信息,利用webQTL定位肾重比相关QTLs。为进一步筛选QTLs区段内的功能基... [目的]利用BXD小鼠群体定位肾脏发育相关QTLs及筛选QTLs区段内的候选功能基因。[方法]高脂饲喂BXD小鼠29w龄后,获取各品系小鼠肾脏重量和体重,结合该小鼠群体基因型信息,利用webQTL定位肾重比相关QTLs。为进一步筛选QTLs区段内的功能基因,首先,通过皮尔逊相关性分析,鉴定肾脏mRNA表达水平与肾重比显著相关(P<0.05)的基因;其次,通过比较C57BL/6J和DBA/2J亲本品系的DNA序列信息,鉴定含有非同义突变的蛋白编码基因;最后,将上述基因导入到Phenolyzer在线分析数据库,并以“kidney”为表型关键词进行检索,优选QTLs区段内的候选功能基因。[结果]BXD小鼠肾重比存在显著差异。经QTL作图,在基因组上共鉴定3个与肾重比相关的QTLs,分别位于四号和X染色体上。在QTLs区段内,共发现45个基因的肾脏mRNA表达水平与肾重比显著相关(P<0.05),65个基因含有非同义突变,经Phenolyzer在线数据库分析,发现51个基因可能与肾脏发育或肾脏疾病相关。[结论]通过QTL作图,在小鼠基因组上鉴定了3个影响肾脏发育的QTLs,筛选了部分候选基因,后续可做进一步的功能验证来阐明其参与肾脏发育的调控机制。 展开更多

关键词 bxd小鼠 肾重比 QTL作图 候选基因

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BXD果菜保鲜机问世

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作者 张明海 《西南园艺》 2003年第2期42-42,共1页

关键词 bxd果菜保鲜机 贮藏 保鲜 水果 蔬莱

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BXD果菜保鲜机

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作者 张明海 《农业装备技术》 2003年第1期38-38,共1页

山西曲沃明通灭菌防腐器材厂最近研制出一种用于水果蔬菜贮藏保鲜的高科技新产品--BXD型果菜保鲜机,现已投放市场。

关键词 产品性能 新产品 技术开发 bxd果菜保鲜机

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BXD果菜保鲜机

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作者 张明海 《农村新技术》 2003年第2期43-43,共1页

山西曲沃明通灭菌防腐器材厂研制出一种用于水果蔬菜贮藏保鲜的高科技产品——BXD型果菜保鲜机,现已投放市场。

关键词 营养成分 色泽风味 功率 bxd果菜保鲜机

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BXD果菜保鲜机

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作者 张海明 《四川农机》 2003年第4期28-28,共1页

关键词 bxd果菜保鲜机 产品特点 消毒杀菌 营养成分 色泽风味

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BXD型果菜保鲜机

12

作者 周良墉 《南方农机》 2003年第1期26-26,共1页

关键词 bxd型果菜保鲜机 微电脑控制 特点

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BXD果菜保鲜机问世

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作者 张明海 《河北农业》 2003年第8期25-25,共1页

目前山西曲沃明通灭菌防腐器材厂已研制出一种用于水果蔬菜贮藏保鲜的高科技新产品——BXD型果菜保鲜机,并已投放市场。 这种新型的电子果菜保鲜机,适用于国内南北方各种水果蔬菜的贮藏保鲜,除可保持原有的营养成分和色泽风味外,还可在... 目前山西曲沃明通灭菌防腐器材厂已研制出一种用于水果蔬菜贮藏保鲜的高科技新产品——BXD型果菜保鲜机,并已投放市场。 这种新型的电子果菜保鲜机,适用于国内南北方各种水果蔬菜的贮藏保鲜,除可保持原有的营养成分和色泽风味外,还可在一般普通房间或窖洞内每立方米空间可贮藏果蔬100公斤左右。 展开更多

关键词 bxd果菜保鲜机 高科技产品 产品性状 贮藏效果

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BXD果蔬保鲜机问世

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作者 张明海 《新农业》 2003年第8期57-57,共1页

关键词 bxd果蔬保鲜机 山西曲沃明通灭菌防腐器材厂 研制 微电脑控制 适用范围

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BXD型果菜保鲜机

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作者 张明海 《湖南农业》 2002年第22期16-,共1页

山西省曲沃明通灭菌防腐器材厂,前不久研制生产出一种用于水果蔬菜贮藏保鲜的高科技新产品——BXD型果菜保鲜机,并已投放市场。 这种新型的电子果菜保鲜机,采用先进的微电脑控制,通过对果菜的消毒杀菌、抑制呼吸,使其处于休眠状态而保鲜。

关键词 果菜 bxd 贮藏保鲜

全文增补中

BXD系列病毒消杀机

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作者 刘建军 《中国科技成果》 2004年第5期50-50,共1页

关键词 bxd系列 病毒消杀机 空气净化 杀毒

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BXD果菜保鲜机

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作者 张明海 《农民科技培训》 2003年第1期27-27,共1页

山西曲沃明通灭菌防腐器材厂日前研制出一种用于水果蔬菜贮藏保鲜的高科技新品——BXD型果菜保鲜机,现已投放市场。 这种新型的电子果菜保鲜机,适用于我国南北方各种水果蔬菜的贮藏保鲜,保持了原有的营养成分和色泽风味。在一般普通房... 山西曲沃明通灭菌防腐器材厂日前研制出一种用于水果蔬菜贮藏保鲜的高科技新品——BXD型果菜保鲜机,现已投放市场。 这种新型的电子果菜保鲜机,适用于我国南北方各种水果蔬菜的贮藏保鲜,保持了原有的营养成分和色泽风味。在一般普通房间或窑洞内使用,不用化学药剂,安全高效、管理方便。使用普通照明电,功率100瓦,每天工作10小时。 展开更多

关键词 研制 微电脑控制 bxd果菜保鲜机

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遗传基因组学方法对Myoc基因调控网络的研究 被引量：2

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作者 陆宏 陆璐 +4 位作者 管怀进 陈辉 张俊芳 胡楠 帅捷 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期851-854,共4页

背景原发性开角型青光跟（POAG）和高度近视的发病机制复杂，可能有较多致病基因及致病相关基因参与，构建基因调控网络有助于揭示发病机制。目的采用遗传基因组学方法研究Myoc基因的调控网络，探索其在POAG中的可能作用机制。方法Affym... 背景原发性开角型青光跟（POAG）和高度近视的发病机制复杂，可能有较多致病基因及致病相关基因参与，构建基因调控网络有助于揭示发病机制。目的采用遗传基因组学方法研究Myoc基因的调控网络，探索其在POAG中的可能作用机制。方法Affymetrix基因芯片用于检测确定68个品系的BXD重组近交系（BXDRI）小鼠及其亲本C57BL／6J（B6）小鼠和DBA／2J（D2）小鼠、F1代小鼠眼组织中Myoc基因的差异表达。借助基因表达的数量性状分析（eQTL）方法，结合GeneNetwork网站（WWW．genenetwork．org）的在线分析工具，研究基因的作用特征，进而构建Myoc基因调控网络。结果Myoc基因在BXDRI小鼠眼组织中平均表达水平为10．83，不同品系小鼠表达量存在差异，其中B6小鼠表达量最高，达到11．43，BXD55小鼠表达量最低，为8．39。基因表达的eQTL分析结果显示，Myoc基因具有一个显著性QTL，其似然比统计量（LRS）达到21．78。该QTL位于2号染色体，与位于1号染色体的Myoc基因在不同的染色体，说明Myoc是反式调节基因。生物信息学分析方法进一步筛选结果提示，Olfml2a是Mroc的上游调控游候选基因。基于和Myoc高度相关基因的基因网络得以构建。结论本研究探索了Myoc的基因调控网络，显示遗传基因组学对复合性疾病发病机制的探索具有重要的指导作用。 展开更多

关键词 基因组学 Myoc基因 网络 原发性开角型青光眼 高度近视 bxd RI小鼠

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从“脾主运化”探讨半夏泻心汤对PCOS大鼠肠道菌群以及糖脂代谢的影响 被引量：5

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作者 赵粉琴 安明霞 +3 位作者 赵艳 苟雅姣 刘洁颖 那丽华 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1850-1855,共6页

目的探讨半夏泻心汤对PCOS模型大鼠血清性激素水平和肠道菌群以及糖脂代谢的影响。方法将SD大鼠随机分成对照组、模型组(来曲唑1 mg·kg^(-1)·d^(-1))、达英-35组(0.18 mg·kg^(-1)·d^(-1))、二甲双胍组(0.135 g·... 目的探讨半夏泻心汤对PCOS模型大鼠血清性激素水平和肠道菌群以及糖脂代谢的影响。方法将SD大鼠随机分成对照组、模型组(来曲唑1 mg·kg^(-1)·d^(-1))、达英-35组(0.18 mg·kg^(-1)·d^(-1))、二甲双胍组(0.135 g·kg^(-1)·d^(-1))、半夏泻心汤组(5.31 g·kg^(-1)·d^(-1))以及半夏泻心汤+二甲双胍+达英-35(3种药物合用)组,每组10只,灌胃28天,检测大鼠体重,用ELISA法检测血清性激素水平、血糖(FBG)、胰岛素指数(HOMA-IR)、总胆固醇(TG)和甘油三酯(TC)变化以及用16s rDNA扩增子焦磷酸测序肠道菌群变化。结果半夏泻心汤明显减低PCOS模型大鼠体重,血清促黄体生成素(LH)和睾酮(T)水平,HOMA-IR、TG和TC水平表达,增加肠道菌数量、多样性以及菌群均匀度,门水平增加拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)相对丰度,降低厚壁菌门(Firmicutes);在属水平上增加有益菌:拟杆菌属(Bacteroides)、萨特氏菌属(Sutterella)、乳酸菌属(Lactoba⁃cillus)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)和艾克曼菌属(Akkermansia muciniphila)相对丰度,而降低致病菌:普氏菌属(Prevotel⁃la)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、颤螺菌属(Oscillospira)和厌氧菌属(Anaeroplasma)相对丰度。结论半夏泻心汤降低P⁃COS大鼠血清高雄激素和高胰岛素血症的作用机制,可能与提高肠道有益菌相对丰度、降低致病菌相对丰度有关。 展开更多

关键词 多囊卵巢综合征 胰岛素抵抗(IR) 肠道菌群 半夏泻心汤(bxd)

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甲型H1N1流感病毒感染致病候选基因的鉴定

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作者 刘慧 焦芹芹 +5 位作者 贺宏杰 韩哲 袁牡丹 张辉 徐福意 董浩 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期481-488,共8页

目的通过C57BL/6J(B6)和DBA/2J(D2)亲本品系小鼠流感感染后相关表型及杂交子代BXD小鼠肺脏转录本数据的系统性分析进行基因筛选,以找到在流感病毒感染中发挥作用的候选基因.方法共选取41个BXD小鼠及亲本品系B6和D2的雌性小鼠,在8~12周... 目的通过C57BL/6J(B6)和DBA/2J(D2)亲本品系小鼠流感感染后相关表型及杂交子代BXD小鼠肺脏转录本数据的系统性分析进行基因筛选,以找到在流感病毒感染中发挥作用的候选基因.方法共选取41个BXD小鼠及亲本品系B6和D2的雌性小鼠,在8~12周龄之间给予流感病毒甲型鼠肺适应株(H1N1,PR8M)得到相关表型及基因表达量数据,对基因表达量进行聚类分析及加权基因共表达网络分析,构建模块特征值与小鼠病毒载量的相关性,经表达数量性状座位分析,皮尔逊相关性分析,结合全基因组关联研究(GWAS)、小鼠基因组信息学(MGI)、国际小鼠表型联合会(IMPC)三个基因数据库中的信息分析筛选流感病毒感染相关的候选功能基因及确定该基因的遗传调控方式;最后将挑选出的基因进行通路富集分析.结果通过聚类分析和加权基因共表达网络分析,将24219个基因分为23个模块;通过模块与表型的相关性分析,发现MEred、MEgreen、MEma-genta模块与感染密切相关,将其作为核心模块;对核心模块基因通过KEGG和MPO富集分析,结果显示流感病毒相关基因显著参与MAPK信号通路、TNF信号通路等多个细胞免疫相关通路;对核心模块内基因与BXD小鼠流感病毒感染的3种表型(体质量减轻,平均死亡时间和感染后体质量减轻中位数)进行相关性分析,共发现21个基因的肺mRNA表达水平与3种表型均相关(P<0.05);进一步通过GeneNetwork中GEMMA算法对这21个基因行表达数量性状座位分析,结果表明Acpl2受顺式遗传调控,Dusp12、Ovol2、Catsper4、Tmc5、Acsm 1、Fam81a、Rtn4、Rhpn1受反式遗传调控;通过结合MGI,IMPC,GWAS三个基因数据库中的信息分析发现部分基因在免疫通路方面发挥作用.结论通过系统遗传学分析,在小鼠基因组上鉴定了影响流感病毒感染相关的21个候选基因,后续可做进一步的功能验证来阐明其参与流感病毒感染的遗传调控机制. 展开更多

关键词 流感病毒 bxd小鼠 Reg3g 候选基因

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