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云南某奶牛场犊牛腹泻的病原学检测
被引量:
1
1
作者
陈茜
岳华
汤承
《四川畜牧兽医》
2022年第5期29-31,共3页
云南省某奶牛场1~3月龄犊牛暴发以腹泻为主要症状的疾病,本试验对该场送检的16份犊牛腹泻粪便样本进行牛A群轮状病毒(BRVA)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛冠状病毒(BCoV)、牛诺如病毒(BNoV)、牛凸隆病毒(BToV)、牛纽布病毒(BNeV)、沙门氏...
云南省某奶牛场1~3月龄犊牛暴发以腹泻为主要症状的疾病,本试验对该场送检的16份犊牛腹泻粪便样本进行牛A群轮状病毒(BRVA)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛冠状病毒(BCoV)、牛诺如病毒(BNoV)、牛凸隆病毒(BToV)、牛纽布病毒(BNeV)、沙门氏菌(Salmonella)、产肠毒素大肠杆菌(ETEC)、安氏隐孢子虫(C.andersoni)9种病原的PCR检测。结果得出:16份样本中BNeV、BRVA、BToV和BNoV的检出率分别为62.5%(10/16)、37.5%(6/16)、18.75%(3/16)和6.25%(1/16),其他病原体未检出。结合临床检查结果,可以确定BRVA、BNoV、BNeV和BToV这四种病原的混合感染是引起该养殖场犊牛腹泻的主要原因,本结果为该场犊牛腹泻疾病的针对性防控提供了依据。
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关键词
奶牛
BRVA
BNoV
BNeV
btov
PCR检测
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职称材料
牛环曲病毒云南株纤突蛋白基因分子特征及进化分析
2
作者
耿娟
曲伟杰
+10 位作者
张晓梅
魏志杰
钟德凯
王鑫文
李文贵
张双玲
李金存
张振兴
张以芳
郑锦玲
宋建领
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期4943-4955,共13页
【目的】了解牛环曲病毒(Bovine torovirus,BToV)在云南部分地区牛群中的流行及其S基因遗传进化情况。【方法】采集云南省内13个地区15个牛场不同年龄牛的粪便样品655份,利用RT-PCR方法检测BToV,并对其中6株BToV阳性样品进行S基因扩增...
【目的】了解牛环曲病毒(Bovine torovirus,BToV)在云南部分地区牛群中的流行及其S基因遗传进化情况。【方法】采集云南省内13个地区15个牛场不同年龄牛的粪便样品655份,利用RT-PCR方法检测BToV,并对其中6株BToV阳性样品进行S基因扩增、克隆、测序及遗传进化分析。【结果】RT-PCR检测结果显示,655份牛粪便样品检出71份BToV阳性,总阳性率为10.8%;其中腹泻样品阳性率为21.2%(59/278),非腹泻样品阳性率为3.2%(12/377);1周龄、1周龄~1月龄、1~6月龄和1岁及上样品的阳性率分别为15.0%(3/20)、17.7%(20/113)、14.0%(45/321)和1.5%(3/201)。相似性分析结果显示,6条BToV S基因序列相似性为96.0%~99.8%,且与原始毒株Breda1的相似性为94.7%~96.0%,与国内流行毒株的相似性为95.2%~99.7%。遗传进化分析结果显示,6条S基因均与原始毒株Breda1不在同一大分支,与国内四川、河南毒株及土耳其毒株形成一个大分支,表明云南省BToV毒株与目前国内流行毒株一致,亲缘关系近。氨基酸突变位点分析结果显示,S基因存在少量独特的氨基酸突变位点。重组分析结果显示,BTOV-China/YN03-2021、BTOV-China/YN01-2021和BTOV-China/YN06-2022为重组序列,其中重组序列BTOV-China/YN06-2022得分最高,重组区域为1438~1609 bp区间,主要亲本为BTOV-China/YN05-2021;重组序列BTOV-China/YN03-2021,重组区域位于1668~3569 bp区域,主要亲本为土耳其毒株BToV-HT2-TUR(MG957146.1);重组序列BTOV-China/YN01-2021,重组区域位于261~2552 bp,主要亲本为土耳其毒株BToV-HT2-TUR(MG957146.1)。基因选择压力分析结果显示,BToV S基因的进化方式主要以中性选择为主,但同时也存在净化选择和正向选择的压力影响。【结论】本研究揭示了BToV已存在于云南省部分地区牛群体中且防控形势较严峻,可为中国研究BToV流行病学和BToV S基因遗传进化关系提供参考,同时也为云南地区制定BToV感染的防控措施提供理论依据。
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关键词
牛环曲病毒(
btov
)
S基因
分子特征
进化分析
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职称材料
云南省部分地区牛环曲病毒检测及其HE基因多态性分析
3
作者
双玲
李金存
+7 位作者
班福泽
曲伟杰
王鑫文
张振兴
宋建领
柴俊
郑锦玲
张小苗
《中国动物检疫》
CAS
2024年第12期25-33,共9页
为了解云南省牛环曲病毒(BToV)的流行特点及遗传进化情况,2021-2023年在红河、大理、曲靖、楚雄等9个市13个县(区)15个牛场采集了655份粪便样品进行BToV核酸检测,并对部分BToV阳性样品进行了HE基因序列分析。核酸检测结果显示:BToV总阳...
为了解云南省牛环曲病毒(BToV)的流行特点及遗传进化情况,2021-2023年在红河、大理、曲靖、楚雄等9个市13个县(区)15个牛场采集了655份粪便样品进行BToV核酸检测,并对部分BToV阳性样品进行了HE基因序列分析。核酸检测结果显示:BToV总阳性率为10.8%(71/655);扩增得到6条完整的BToV HE基因序列,分属于BToVⅡ型和BToVⅢ型,与40条参考序列的核苷酸同源性为69.1%~99.8%;基因重组分析结果显示:存在2个重组现象,其亲本均为BToVⅡ型毒株和青藏高原藏羚羊源毒株,重组区域位于凝集素结构域R;基因选择压力分析结果显示:BToVHE基因在宿主机体和生存环境中的进化趋势以中性选择为主。结果表明:云南省牛场存在BToV感染;流行毒株中存在重组毒株,其可能由国内奶牛BToV毒株重组而来,且出现跨物种重组现象,该重组事件可能对病毒与受体结合过程产生影响。
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关键词
牛环曲病毒
检测诊断
HE基因
多态性
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职称材料
题名
云南某奶牛场犊牛腹泻的病原学检测
被引量:
1
1
作者
陈茜
岳华
汤承
机构
西南民族大学畜牧兽医学院
出处
《四川畜牧兽医》
2022年第5期29-31,共3页
文摘
云南省某奶牛场1~3月龄犊牛暴发以腹泻为主要症状的疾病,本试验对该场送检的16份犊牛腹泻粪便样本进行牛A群轮状病毒(BRVA)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛冠状病毒(BCoV)、牛诺如病毒(BNoV)、牛凸隆病毒(BToV)、牛纽布病毒(BNeV)、沙门氏菌(Salmonella)、产肠毒素大肠杆菌(ETEC)、安氏隐孢子虫(C.andersoni)9种病原的PCR检测。结果得出:16份样本中BNeV、BRVA、BToV和BNoV的检出率分别为62.5%(10/16)、37.5%(6/16)、18.75%(3/16)和6.25%(1/16),其他病原体未检出。结合临床检查结果,可以确定BRVA、BNoV、BNeV和BToV这四种病原的混合感染是引起该养殖场犊牛腹泻的主要原因,本结果为该场犊牛腹泻疾病的针对性防控提供了依据。
关键词
奶牛
BRVA
BNoV
BNeV
btov
PCR检测
分类号
S858.234.43 [农业科学—临床兽医学]
在线阅读
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职称材料
题名
牛环曲病毒云南株纤突蛋白基因分子特征及进化分析
2
作者
耿娟
曲伟杰
张晓梅
魏志杰
钟德凯
王鑫文
李文贵
张双玲
李金存
张振兴
张以芳
郑锦玲
宋建领
机构
云南农业大学动物医学院
云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室
云南农业职业技术学院
云南省建水县临安镇农业综合服务中心
云南省寻甸县农业农村局
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期4943-4955,共13页
基金
云南省基础研究专项重点项目(202301AS070081)
云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室开放基金(2023RW001)
+1 种基金
云南省教育厅科学研究基金项目(2023 J1636)
云南省兽医公共卫生新兴专业建设项目。
文摘
【目的】了解牛环曲病毒(Bovine torovirus,BToV)在云南部分地区牛群中的流行及其S基因遗传进化情况。【方法】采集云南省内13个地区15个牛场不同年龄牛的粪便样品655份,利用RT-PCR方法检测BToV,并对其中6株BToV阳性样品进行S基因扩增、克隆、测序及遗传进化分析。【结果】RT-PCR检测结果显示,655份牛粪便样品检出71份BToV阳性,总阳性率为10.8%;其中腹泻样品阳性率为21.2%(59/278),非腹泻样品阳性率为3.2%(12/377);1周龄、1周龄~1月龄、1~6月龄和1岁及上样品的阳性率分别为15.0%(3/20)、17.7%(20/113)、14.0%(45/321)和1.5%(3/201)。相似性分析结果显示,6条BToV S基因序列相似性为96.0%~99.8%,且与原始毒株Breda1的相似性为94.7%~96.0%,与国内流行毒株的相似性为95.2%~99.7%。遗传进化分析结果显示,6条S基因均与原始毒株Breda1不在同一大分支,与国内四川、河南毒株及土耳其毒株形成一个大分支,表明云南省BToV毒株与目前国内流行毒株一致,亲缘关系近。氨基酸突变位点分析结果显示,S基因存在少量独特的氨基酸突变位点。重组分析结果显示,BTOV-China/YN03-2021、BTOV-China/YN01-2021和BTOV-China/YN06-2022为重组序列,其中重组序列BTOV-China/YN06-2022得分最高,重组区域为1438~1609 bp区间,主要亲本为BTOV-China/YN05-2021;重组序列BTOV-China/YN03-2021,重组区域位于1668~3569 bp区域,主要亲本为土耳其毒株BToV-HT2-TUR(MG957146.1);重组序列BTOV-China/YN01-2021,重组区域位于261~2552 bp,主要亲本为土耳其毒株BToV-HT2-TUR(MG957146.1)。基因选择压力分析结果显示,BToV S基因的进化方式主要以中性选择为主,但同时也存在净化选择和正向选择的压力影响。【结论】本研究揭示了BToV已存在于云南省部分地区牛群体中且防控形势较严峻,可为中国研究BToV流行病学和BToV S基因遗传进化关系提供参考,同时也为云南地区制定BToV感染的防控措施提供理论依据。
关键词
牛环曲病毒(
btov
)
S基因
分子特征
进化分析
Keywords
Bovine torovirus(
btov
)
S gene
molecular characterization
evolutionary analysis
分类号
S852.653 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
云南省部分地区牛环曲病毒检测及其HE基因多态性分析
3
作者
双玲
李金存
班福泽
曲伟杰
王鑫文
张振兴
宋建领
柴俊
郑锦玲
张小苗
机构
建水县临安镇农业综合服务中心
寻甸县农业农村局
云南农业大学动物医学院
云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室
云南农业职业技术学院
大理农林职业学院
出处
《中国动物检疫》
CAS
2024年第12期25-33,共9页
基金
云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室开放基金项目(2023RW001)
云南省教育厅科学研究基金项目(2023J1636)
+1 种基金
云南省基础研究专项(202301AS070081)
云南省科协农民院士科技服务站项目(A3012024011)。
文摘
为了解云南省牛环曲病毒(BToV)的流行特点及遗传进化情况,2021-2023年在红河、大理、曲靖、楚雄等9个市13个县(区)15个牛场采集了655份粪便样品进行BToV核酸检测,并对部分BToV阳性样品进行了HE基因序列分析。核酸检测结果显示:BToV总阳性率为10.8%(71/655);扩增得到6条完整的BToV HE基因序列,分属于BToVⅡ型和BToVⅢ型,与40条参考序列的核苷酸同源性为69.1%~99.8%;基因重组分析结果显示:存在2个重组现象,其亲本均为BToVⅡ型毒株和青藏高原藏羚羊源毒株,重组区域位于凝集素结构域R;基因选择压力分析结果显示:BToVHE基因在宿主机体和生存环境中的进化趋势以中性选择为主。结果表明:云南省牛场存在BToV感染;流行毒株中存在重组毒株,其可能由国内奶牛BToV毒株重组而来,且出现跨物种重组现象,该重组事件可能对病毒与受体结合过程产生影响。
关键词
牛环曲病毒
检测诊断
HE基因
多态性
Keywords
btov
detection and diagnosis
HE gene
polymorphism
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南某奶牛场犊牛腹泻的病原学检测
陈茜
岳华
汤承
《四川畜牧兽医》
2022
1
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职称材料
2
牛环曲病毒云南株纤突蛋白基因分子特征及进化分析
耿娟
曲伟杰
张晓梅
魏志杰
钟德凯
王鑫文
李文贵
张双玲
李金存
张振兴
张以芳
郑锦玲
宋建领
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
3
云南省部分地区牛环曲病毒检测及其HE基因多态性分析
双玲
李金存
班福泽
曲伟杰
王鑫文
张振兴
宋建领
柴俊
郑锦玲
张小苗
《中国动物检疫》
CAS
2024
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