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题名牛诺如病毒感染相关腹泻犊牛粪便菌群的特征分析
被引量：2
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作者
赵清梅
崔省委
郭仕辉
余永涛
梁泰宇
李欢语
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机构
北方民族大学生物科学与工程学院
宁夏大学动物科技学院
宁夏反刍动物分子细胞育种重点实验室
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出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期3484-3494,共11页
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基金
宁夏自然科学基金项目(2022AAC03231)
宁夏回族自治区重点研发计划项目(2021BEF02028、2021BEF01001)。
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文摘
[目的]比较哺乳期健康犊牛和感染牛诺如病毒(Bovine norovirus,BNoV)的腹泻犊牛粪便菌群多样性和物种组成,初步揭示BNoV感染的腹泻犊牛粪便菌群特征。[方法]首先应用PCR和RT-PCR法对健康和腹泻犊牛粪便中的腹泻相关病原进行检测,然后采用16S rRNA扩增子测序技术对病原检测阴性的健康犊牛粪便(H组)和仅BNoV检测阳性的腹泻犊牛粪便(BNoV组)的微生物多样性、菌群组成和功能进行比较分析。[结果]与H组相比,BNoV组粪便菌群操作分类单元(OTUs)数量和Chao1指数显著升高(P<0.05),Shannon和Simpson指数极显著降低(P<0.01)。与H组相比,BNoV组粪便变形菌门、埃希-志贺属、丁酸球菌属丰度极显著升高(P<0.01),放线菌门、柯林斯菌属、巨球型菌属、厄氏菌属、双歧杆菌属、粪杆菌属等丰度极显著或显著降低(P<0.01;P<0.05)。双歧杆菌属、柯林斯菌属、巨球型菌属、厄氏菌属、粪杆菌属等在H组显著富集,而丁酸球菌属、埃希-志贺属、脆弱拟杆菌、梭菌属等在BNoV组显著富集。与H组相比,BNoV组粪便菌群胞内过程和信号传导、脂质代谢、新陈代谢、异生物质生物降解与代谢、萜类和聚酮类化合物代谢等显著或极显著上调(P<0.05;P<0.01),而膜转运、复制与修复、翻译、核苷酸代谢、遗传信息处理等显著或极显著下调(P<0.05;P<0.01)。[结论]感染BNoV的腹泻犊牛粪便菌群丰富度、多样性、物种组成和功能与健康犊牛显著不同,提示BNoV感染犊牛处于肠道菌群紊乱状态。
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关键词
牛诺如病毒(bnov)
犊牛腹泻
粪便菌群
16S
rRNA扩增子测序
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Keywords
Bovine norovirus(bnov)
calf diarrhoea
fecal microbiota
16S rRNA amplicon sequencing
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分类号
S852.653
[农业科学—基础兽医学]
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题名云南某奶牛场犊牛腹泻的病原学检测
被引量：1
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作者
陈茜
岳华
汤承
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机构
西南民族大学畜牧兽医学院
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出处
《四川畜牧兽医》
2022年第5期29-31,共3页
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文摘
云南省某奶牛场1~3月龄犊牛暴发以腹泻为主要症状的疾病,本试验对该场送检的16份犊牛腹泻粪便样本进行牛A群轮状病毒(BRVA)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛冠状病毒(BCoV)、牛诺如病毒(BNoV)、牛凸隆病毒(BToV)、牛纽布病毒(BNeV)、沙门氏菌(Salmonella)、产肠毒素大肠杆菌(ETEC)、安氏隐孢子虫(C.andersoni)9种病原的PCR检测。结果得出:16份样本中BNeV、BRVA、BToV和BNoV的检出率分别为62.5%(10/16)、37.5%(6/16)、18.75%(3/16)和6.25%(1/16),其他病原体未检出。结合临床检查结果,可以确定BRVA、BNoV、BNeV和BToV这四种病原的混合感染是引起该养殖场犊牛腹泻的主要原因,本结果为该场犊牛腹泻疾病的针对性防控提供了依据。
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关键词
奶牛
BRVA
bnov
BNeV
BToV
PCR检测
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分类号
S858.234.43
[农业科学—临床兽医学]
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